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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Acre. |
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Data corrente: |
03/05/2018 |
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Data da última atualização: |
24/08/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
SOUZA, C. S. de. |
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Afiliação: |
Clemeson Silva de Souza, Universidade Federal do Acre (Ufac). |
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Título: |
Caracterização da diversidade genética de acessos do banco de germoplasma de seringueira. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
2018. |
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Páginas: |
64 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Dissertação (Mestrado em Ciências e Inovação Tecnológica) - Programa de Pós-graduação em Ciência, Inovação e Tecnologia para a Amazônia, Universidade Federal do Acre, Rio Branco. Orientador: Tatiana de Campos. |
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Conteúdo: |
A seringueira (Hevea brasiliensis) é uma planta popularmente conhecida por ser a principal fonte de borracha natural. Assim, é fundamental que este recurso genético esteja devidamente avaliado e caracterizado. O objetivo desse trabalho foi caracterizar por meio de marcadores microssatélites a diversidade genética de acessos do banco de germoplasma de seringueira da Embrapa Amazônia Ocidental, Embrapa Amazônia Oriental e Embrapa Cerrados. Foram amostrados 318 acessos, pertencentes às espécies Hevea brasiliensis, Hevea pauciflora, Hevea rigidifolia e híbridos interespecíficos. Foram testados 10 marcadores microssatélites. Os produtos amplificados foram genotipados em sequenciador automático. As estimativas genéticas estimadas foram: heterozigosidade esperada (HE) e observada (HO), número de alelos por loco e conteúdo de informação polimórfica (PIC). Os dados genéticos foram utilizados para verificar a estruturação dos genótipos, agrupamento pelo método de Neighbor-Joining, dispersão por coordenadas principais e formação de uma coleção nuclear. Os dez locos microssatélites revelaram 348 alelos. As médias de HE, HO e PIC foram de 0,86, 0,63 e 0,86, respectivamente. Os marcadores microssatélites de H. brasiliensis foram potencialmente transferíveis para H. pauciflora e H. rigidifolia. As distâncias genéticas entre o acesso de Hevea spp. variaram de 0,16 a 0,94. A coleção nuclear formada por 59 genótipos representou 85% da diversidade alélica total. Conclui-se que o polimorfismo foi alto entre os genótipos avaliados. As espécies de Hevea compartilham homologias em regiões flanqueadoras de microssatélites. As distâncias genéticas demonstraram alta variabilidade entre os acessos amostrados. A coleção nuclear constituiu-se de 19% do número total de acessos. The rubber tree (Hevea brasiliensis) is a plant popularly known for being the main source of natural rubber. It is therefore essential that this genetic resource is properly evaluated and characterized. The objective of this work was to evaluate by microsatellite markers the genetic diversity of accesses of the rubber germplasm bank of Embrapa Amazônia Ocidental, Embrapa Amazonia Oriental and Embrapa Cerrados. It was used 318 accessions, belonging to the species Hevea brasiliensis, Hevea pauciflora, Hevea rigidifolia and interspecific hybrids. Ten microsatellite markers were tested. The amplified products were genotyped in an automated sequencer. The estimated genetic estimates were: expected heterozygosity (HE) and observed (HO), number of alleles per locus and content of polymorphic information (PIC). Genetic data were used to verify the structure of the genotypes, grouping by the Neighbor-Joining method, dispersion by main coordinates and formation of a nuclear collection. The ten microsatellite loci revealed 348 alleles. The mean values of HE, HO and PIC were 0.86, 0.63 and 0.86, respectively. The microsatellites markers of H. brasiliensis were potentially transferable to H. pauciflora and H. rigidifolia. The genetic distances between the access of Hevea spp. ranged from 0.16 to 0.94. The nuclear collection of 59 genotypes represented 85% of the total allelic diversity. It was concluded that the polymorphism was high among the evaluated genotypes. Hevea species share homologies in microsatellite flanking regions. The genetic distances showed high variability among the accessions sampled. The nuclear collection constituted 19% of the total number of accesses. MenosA seringueira (Hevea brasiliensis) é uma planta popularmente conhecida por ser a principal fonte de borracha natural. Assim, é fundamental que este recurso genético esteja devidamente avaliado e caracterizado. O objetivo desse trabalho foi caracterizar por meio de marcadores microssatélites a diversidade genética de acessos do banco de germoplasma de seringueira da Embrapa Amazônia Ocidental, Embrapa Amazônia Oriental e Embrapa Cerrados. Foram amostrados 318 acessos, pertencentes às espécies Hevea brasiliensis, Hevea pauciflora, Hevea rigidifolia e híbridos interespecíficos. Foram testados 10 marcadores microssatélites. Os produtos amplificados foram genotipados em sequenciador automático. As estimativas genéticas estimadas foram: heterozigosidade esperada (HE) e observada (HO), número de alelos por loco e conteúdo de informação polimórfica (PIC). Os dados genéticos foram utilizados para verificar a estruturação dos genótipos, agrupamento pelo método de Neighbor-Joining, dispersão por coordenadas principais e formação de uma coleção nuclear. Os dez locos microssatélites revelaram 348 alelos. As médias de HE, HO e PIC foram de 0,86, 0,63 e 0,86, respectivamente. Os marcadores microssatélites de H. brasiliensis foram potencialmente transferíveis para H. pauciflora e H. rigidifolia. As distâncias genéticas entre o acesso de Hevea spp. variaram de 0,16 a 0,94. A coleção nuclear formada por 59 genótipos representou 85% da diversidade alélica total. Conclui-se que o polimorfismo f... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Árbol de goma; Fitomejoramiento; Hevea pauciflora; Hevea rigidifolia; Marcador microssatélite; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; Ruber tree; Variación genética. |
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Thesagro: |
Genótipo; Hevea Brasiliensis; Marcador Genético; Melhoramento Genético Vegetal; Polimorfismo Genético; Seringueira; Variação Genética. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic markers; Genetic polymorphism; Genetic variation; Genotype; Microsatellite repeats; Plant breeding. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/176243/1/26609.pdf
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Marc: |
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520 $aA seringueira (Hevea brasiliensis) é uma planta popularmente conhecida por ser a principal fonte de borracha natural. Assim, é fundamental que este recurso genético esteja devidamente avaliado e caracterizado. O objetivo desse trabalho foi caracterizar por meio de marcadores microssatélites a diversidade genética de acessos do banco de germoplasma de seringueira da Embrapa Amazônia Ocidental, Embrapa Amazônia Oriental e Embrapa Cerrados. Foram amostrados 318 acessos, pertencentes às espécies Hevea brasiliensis, Hevea pauciflora, Hevea rigidifolia e híbridos interespecíficos. Foram testados 10 marcadores microssatélites. Os produtos amplificados foram genotipados em sequenciador automático. As estimativas genéticas estimadas foram: heterozigosidade esperada (HE) e observada (HO), número de alelos por loco e conteúdo de informação polimórfica (PIC). Os dados genéticos foram utilizados para verificar a estruturação dos genótipos, agrupamento pelo método de Neighbor-Joining, dispersão por coordenadas principais e formação de uma coleção nuclear. Os dez locos microssatélites revelaram 348 alelos. As médias de HE, HO e PIC foram de 0,86, 0,63 e 0,86, respectivamente. Os marcadores microssatélites de H. brasiliensis foram potencialmente transferíveis para H. pauciflora e H. rigidifolia. As distâncias genéticas entre o acesso de Hevea spp. variaram de 0,16 a 0,94. A coleção nuclear formada por 59 genótipos representou 85% da diversidade alélica total. Conclui-se que o polimorfismo foi alto entre os genótipos avaliados. As espécies de Hevea compartilham homologias em regiões flanqueadoras de microssatélites. As distâncias genéticas demonstraram alta variabilidade entre os acessos amostrados. A coleção nuclear constituiu-se de 19% do número total de acessos. The rubber tree (Hevea brasiliensis) is a plant popularly known for being the main source of natural rubber. It is therefore essential that this genetic resource is properly evaluated and characterized. The objective of this work was to evaluate by microsatellite markers the genetic diversity of accesses of the rubber germplasm bank of Embrapa Amazônia Ocidental, Embrapa Amazonia Oriental and Embrapa Cerrados. It was used 318 accessions, belonging to the species Hevea brasiliensis, Hevea pauciflora, Hevea rigidifolia and interspecific hybrids. Ten microsatellite markers were tested. The amplified products were genotyped in an automated sequencer. The estimated genetic estimates were: expected heterozygosity (HE) and observed (HO), number of alleles per locus and content of polymorphic information (PIC). Genetic data were used to verify the structure of the genotypes, grouping by the Neighbor-Joining method, dispersion by main coordinates and formation of a nuclear collection. The ten microsatellite loci revealed 348 alleles. The mean values of HE, HO and PIC were 0.86, 0.63 and 0.86, respectively. The microsatellites markers of H. brasiliensis were potentially transferable to H. pauciflora and H. rigidifolia. The genetic distances between the access of Hevea spp. ranged from 0.16 to 0.94. The nuclear collection of 59 genotypes represented 85% of the total allelic diversity. It was concluded that the polymorphism was high among the evaluated genotypes. Hevea species share homologies in microsatellite flanking regions. The genetic distances showed high variability among the accessions sampled. The nuclear collection constituted 19% of the total number of accesses.
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Registro original: |
Embrapa Acre (CPAF-AC) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
14/12/2012 |
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Data da última atualização: |
14/12/2012 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
DIAS, A. C. F.; TAKETANI, R. G.; ANDREOTE, F. D.; LUVIZOTTO, D. M.; SILVA, J. L. da; NASCIMENTO, R. dos S.; MELO, I. S. de. |
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Afiliação: |
ARMANDO CAVALCANTE FRANCO DIAS, CENA-USP; RODRIGO GOUVEA TAKETANI; FERNANDO DINI ANDREOTE, ESALQ-USP; DANICE MAZZER LUVIZOTTO, ESALQ-USP; JOAO LUIZ DA SILVA, CNPMA; ROSELY DOS SANTOS NASCIMENTO, CNPMA; ITAMAR SOARES DE MELO, CNPMA. |
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Título: |
Interspecific variation of the bacterial community structure in the Phyllosphere of the three major plant components of mangrove forests. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Brazilian Journal of Microbiology, São Paulo, v. 43, n. 2, p. 653-660, 2012. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
ABSTRACT: Mangrove forests encompass a group of trees species that inhabit the intertidal zones, where soil is characterized by the high salinity and low availability of oxygen. The phyllosphere of these trees represent the habitat provided on the aboveground parts of plants, supporting in a global scale, a large and complex microbial community. The structure of phyllosphere communities reflects immigration, survival and growth of microbial colonizers, which is influenced by numerous environmental factors in addition to leaf physical and chemical properties. Here, a combination of culture-base methods with PCR-DGGE was applied to test whether local or plant specific factors shape the bacterial community of the phyllosphere from three plant species (Avicenia shaueriana, Laguncularia racemosa and Rhizophora mangle), found in two mangroves. The number of bacteria in the phyllosphere of these plants varied between 3.62 x 104 in A. schaeriana and 6.26 x 103 in R. mangle. The results obtained by PCR-DGGE and isolation approaches were congruent and demonstrated that each plant species harbor specific bacterial communities in their leaves surfaces. Moreover, the ordination of environmental factors (mangrove and plant species), by redundancy analysis (RDA), also indicated that the selection exerted by plant species is higher than mangrove location on bacterial communities at phyllosphere. |
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Palavras-Chave: |
Culture-independent profiling; Plant genotype; Surface leaves. |
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Thesagro: |
Bactéria; Mangue; Planta. |
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Thesaurus NAL: |
Mangrove forests; Phyllosphere. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/72394/1/2012AP51.pdf
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Marc: |
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245 $aInterspecific variation of the bacterial community structure in the Phyllosphere of the three major plant components of mangrove forests.$h[electronic resource]
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520 $aABSTRACT: Mangrove forests encompass a group of trees species that inhabit the intertidal zones, where soil is characterized by the high salinity and low availability of oxygen. The phyllosphere of these trees represent the habitat provided on the aboveground parts of plants, supporting in a global scale, a large and complex microbial community. The structure of phyllosphere communities reflects immigration, survival and growth of microbial colonizers, which is influenced by numerous environmental factors in addition to leaf physical and chemical properties. Here, a combination of culture-base methods with PCR-DGGE was applied to test whether local or plant specific factors shape the bacterial community of the phyllosphere from three plant species (Avicenia shaueriana, Laguncularia racemosa and Rhizophora mangle), found in two mangroves. The number of bacteria in the phyllosphere of these plants varied between 3.62 x 104 in A. schaeriana and 6.26 x 103 in R. mangle. The results obtained by PCR-DGGE and isolation approaches were congruent and demonstrated that each plant species harbor specific bacterial communities in their leaves surfaces. Moreover, the ordination of environmental factors (mangrove and plant species), by redundancy analysis (RDA), also indicated that the selection exerted by plant species is higher than mangrove location on bacterial communities at phyllosphere.
650 $aMangrove forests
650 $aPhyllosphere
650 $aBactéria
650 $aMangue
650 $aPlanta
653 $aCulture-independent profiling
653 $aPlant genotype
653 $aSurface leaves
700 1 $aTAKETANI, R. G.
700 1 $aANDREOTE, F. D.
700 1 $aLUVIZOTTO, D. M.
700 1 $aSILVA, J. L. da
700 1 $aNASCIMENTO, R. dos S.
700 1 $aMELO, I. S. de
773 $tBrazilian Journal of Microbiology, São Paulo$gv. 43, n. 2, p. 653-660, 2012.
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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