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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
27/09/2023 |
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Data da última atualização: |
27/09/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOUZA, I. P. de; AZEVEDO, B. R. de; COELHO, A. S. G.; SOUZA, T. L. P. O. de; VALDISSER, P. A. M. R.; GOMES-MESSIAS, L. M.; FUNICHELI, B. W.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. |
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Afiliação: |
ISABELA PAVANELLI DE SOUZA, bolsista CNPAF; BEATRIZ ROSA DE AZEVEDO, bolsista CNPAF; ALEXANDRE SIQUEIRA GUEDES COELHO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; THIAGO LIVIO PESSOA OLIV DE SOUZA, CNPAF; PAULA ARIELLE M RIBEIRO VALDISSER, CNPAF; LUCAS MATIAS GOMES-MESSIAS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; BRENO OSVALDO FUNICHELI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO CARLOS; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
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Título: |
Whole-genome resequencing of common bean elite breeding lines. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 13, 12721, 2023. |
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ISSN: |
2045-2322 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-023-39399-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The expansion of bean genome technologies has prompted new perspectives on generating resources and knowledge essential to research and implementing biotechnological tools for the practical operations of plant breeding programs. This study aimed to resequence the entire genome (whole genome sequencing?WGS) of 40 bean genotypes selected based on their significance in breeding programs worldwide, with the objective of generating an extensive database for the identification of single nucleotide polymorphisms (SNPs). Over 6 million SNPs were identified, distributed across the 11 bean chromosomes. After quality variant filtering, 420,509 high-quality SNPs were established, with an average of 38,228 SNPs per chromosome. These variants were categorized based on their predicted effects, revealing that the majority exerted a modifier impact on non-coding genome regions (94.68%). Notably, a significant proportion of SNPs occurred in intergenic regions (62.89%) and at least one SNP was identified in 58.63% of the genes annotated in the bean genome. Of particular interest, 7841 SNPs were identified in 85% of the putative plant disease defense-related genes, presenting a valuable resource for crop breeding efforts. These findings provide a foundation for the development of innovative and broadly applicable technologies for the routine selection of superior genotypes in global bean improvement and germplasm characterization programs. |
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Thesagro: |
Feijão; Genoma; Melhoramento. |
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Thesaurus Nal: |
Beans; Breeding; Breeding lines; Genome; Genotype; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1156925/1/sr-2023.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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| Registros recuperados : 8.765 | |
| 101. |  | SANTOS, G. R. M.; FERNANDES, S. S. L.; MOITINHO, M.; PADOVAN, M. P.; SILVA, G. B. F.; XAVIER, G. R.; GUERRA, J. G. M.; ESPINDOLA, J. A. A.; ARAÚJO, E. da S. Avaliação de estirpes de rizóbio, pré-selecionadas, quanto à produção de biomassa de feijão de porco em Dourados, MS. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROECOLOGIA, 6.; CONGRESSO LATINO AMERICANO DE AGROECOLOGIA, 2., 2009, Curitiba. Agricultura familiar e camponesa experiências passadas e presentes construindo um futuro sustentável: anais. Curitiba: ABA: SOCLA, 2009. p. 01619-01623 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 104. | | CARVALHO, M. da C. S.; FERREIRA, G. B.; MUTADIUA, C. A. P.; DENARDIN, J. E.; MIRANDA, C. H. B.; FAVARO, S. P.; SILVA, H. R. da; MELO, L. C.; SILVA FILHO, P. M. da; NEUMAIER, N.; CRUZ, I.; ROCHA, M. de M.; ALMEIDA, R. P. de; MUSSA, V.; DAMBA, G.; KAUNDA, J. B. Adubação do feijão-vulgar com fósforo e potássio em Lichinga, Niassa, Moçambique: resultados de duas campanhas agrícolas e recomendações preliminares. In: SEMINÁRIO DE DIVULGAÇÃO DE RESULTADOS DA INVESTIGAÇÃO AGRÁRIA NO CORREDOR DE NACALA, 2., 2015, Lichinga, Moçambique. Anais... Lichinga, Moçambique: Instituto de Investigação Agrária de Moçambique, 2015. Editado por Fernando João Sualei, Oscar Chichongue, Guilhermino Boina, Simone Palma Favaro, Cesar Heraclides Behling Miranda. p. 280-290.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 105. | | OLIVEIRA, C. R. R. de; BARROS, G. B.; FREIRE FILHO, F. R.; RAMOS, S. R. R.; ROCHA, M. de M.; SITTOLIN, I. M.; RIBEIRO, V. Q. Análise discriminante em populações F4 de feijão-caupi com base em descritores morfoagronômicos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lurenço. Anais... São Lourenço: UFLA, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 106. | | CORREA, C. M. de A.; CORREA, A. M.; ABOT, A. R.; NASCIMENTO, J. N. do; RODRIGUES, S. R.; OLIVEIRA, H. N. de. Avaliação dos danos do complexo de lagartas-das- vagens em genótipos de feijão-caupi (Vigna unguiculata), em Aquidauana, MS In: SEMANA AGRONÔMICA, 6.; ENCONTRO TÉCNICO-CIENTÍFICO, 1., 2009, Aquidauana. [Resumos...]. Aquidauana: UEMS, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 107. | | BENKO-ISEPPON, A. M.; KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; BARBOSA, P. K. A; BELARMINO, L. C.; MONTE, S. J. H. do; BRANDÃO, R. M. S. de; ARAUJO, A. de S.; CASTRO, J. A. F. de; SOARES-CAVALCANTI, N. da M.; SILVA, A. R. da; CALSA JUNIOR, T.; ROCHA, M. de M.; WINTER, P.; KAHL, G.; ROTTER, B.; HORRES, R.; MOLINA, C.; JUNGMANN, R.; AMORIM, L. L. B.; ONOFRE, A. V. C.; FERREIRA-NETO, J. R. C.; GRANJEIRO, T. B.; LIMA, A. S.; LOBO, M. D. P.; HOULLOU-KIDO, L. M.; CARVALHO, R. de; WANDERLEY-NOGUEIRA, A. C.; BARROS, P. dos S.; VIEIRA-MELLO, G. S.; BRASILEIRO-VIDAL, A. C.; BORTOLETI, K. C. de A.; PEDROSA-HARAND, A.; ANDRADE, P. P. de; ANDRADE, G. P. de; PIO-RIBEIRO, G.; SITTOLIN, I. M.; FREIRE FILHO, F. R. Brazilian cowpea transcriptome project: over 20 million expressed sequence tags to understand salinity and virus resistance. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010. Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 97-98.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 108. | | SANTOS, J. O.; RAMOS, S. R. R.; ROCHA, M. de M.; SOBRAL, P. V. C.; FREIRE FILHO, F. R.; BARROS, G. B.; MEIRELLES, A. C. S.; HENRIQUE, J. M.; WETZEL, M. M. V. S. Caracterização morfológica de acessos de feijão-mungo-verde do banco ativo de germoplasma da Embrapa Meio-Norte com base em descritores qualitativos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE OLERICULTURA, 47.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE CUCURBITÁCEAS, 4., 2007, Porto Seguro. Resgatando e valorizando as hortaliças subutilizadas. Porto Seguro: Associação Brasileira de Horticultura, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 111. | | SILVA, J. G. da; WANDER, A. E. Colheita do feijão. In: CARNEIRO, J. E. de S.; PAULA JÚNIOR, T. J. de; BORÉM, A. (Ed.). Feijão: do plantio à colheita. Viçosa, MG: Ed. UFV, 2015. p. 327-355.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 114. | | MENDES, I. de C.; HUNGRIA, M.; STRALLIOTO, R.; REIS JUNIOR, F. B. Bean response to reinoculation with Rhizobium strains in brazilian cerrados soils. In: LATIN-AMERICAN CONFERENCE ON RHIZOBIOLOGY, 22.; BRAZILIAN CONFERENCE ON BIOLOGICAL NITROGEN FIXATION, 1., 2004, Miguel Pereira. Programme and Abstracts. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2004. p. 114. Editado por Veronica Massena Reis, Marta Bahia.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 115. | | RIBEIRO JUNIOR, C. A. L.; RIBEIRO, T. F. L.; COSTA, J. G. da; ZARBIN, P. H. G.; GOULART, M. O. F.; SANTANA, A. E. G. de. Behavioral, electrophysiological and cromatographic studies evidences mediation by semiochemicals in chemmical communication of bean weviel, Zabrotes subfasciatus (Boheman, 1838) (Coleoptera: Brucidae). In: LATIN AMERICAN MEETING OF CHEMICAL ECOLOGY, 2., 2012, Huerta Grande. Abstracts... Huerta Grande: Latin American Association of Chemical Ecology, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 116. | | LIMA, F. de; DANIELSKI, G. M.; ADAMOSKI, D.; KAVA, V. M.; TERASAWA, L. V. G.; HUNGRIA, M. Bioprospecting of bacteria present in common bean nodules (Phaseolus vulgaris L.). In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 66.; SIMPÓSIO DE CITOGENÉTICA E GENÉTICA DE PEIXES, 19.; REUNIÃO DE GENÉTICA DE MICRORGANISMOS, 32.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE GENÉTICA PARA CONSERVAÇÃO, 2., 2021, online. Abstracts... Ribeirão Preto: SBG, 2021. e-book. p. 362.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 118. | | SOBRAL, P. V. C.; RAMOS, S. R. R.; ROCHA, M. de M.; FREIRE FILHO, F. R.; SANTOS, J. O.; MEIRELLES, A. C. de S.; BARROS, G. de B. Caracterização agronômica de variedades tradicionais de feijão-caupi do banco ativo de germoplasma da Embrapa Meio-Norte. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE OLERICULTURA, 47.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE CUCURBITÁCEAS, 4., 2007, Porto Seguro. Resgatando e valorizando as hortaliças subutilizadas. Porto Seguro: Associação Brasileira de Horticultura, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 119. | | GUZZO, E. C.; VERDRAMIM, J. D.; CHIORATO, A. F.; LOURENCAO, A. L.; CARBONELL, S. A. M.; CORREA, O. M. B. No Correlation of Morpho-Agronomic Traits of Phaseolus vulgaris (Fabaceae) Genotypes and Resistance to Acanthoscelides obtectus (Say) and Zabrotes subfasciatus (Boheman) (Coleoptera: Chrysomelidae). Neotropical Entomology, Londrina, v. 44, p. 619-625, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 120. | | CORREA, C. M. de A.; CORREA, M. A.; NASCIMENTO, J. N. do; NASCIMENTO, S. R. do; OLIVEIRA, H. N. de. Avaliação da produtividade do feijão-caupi, Vigns unguiculata, em Aquidauana, MS. In: SEMANA AGRONÔMICA, 6.; ENCONTRO TÉCNICO-CIENTÍFICO, 1., 2009, Aquidauana. [Resumos...]. Aquidauana: UEMS, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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