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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
28/03/2014 |
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Data da última atualização: |
06/08/2025 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
TIMBÓ, R. V.; QUEIROZ, P. R. M.; SUJII, E. R.; BRÍGIDO, M. de M.; VOGLER, A. P.; PAULA, D. P. |
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Afiliação: |
EDISON RYOITI SUJII, CENARGEN; DEBORA PIRES PAULA, CENARGEN. |
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Título: |
Estudo das teias tróficas do predador Hippodamia convergens (Coleoptera: Coccinellidae) pela análise metagenômica do DNA mitocondrial presente no conteúdo gastrointestinal. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 13., 2013, Bonito, MS. Faça bonito: use controle biológico: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2013. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O objetivo geral desse trabalho consiste na identificação de presas de agentes de controle biológico para comparação de suas teias tróficas em fazendas em diferentes estágios de manejo agroecológico no Distrito Federal. Desenvolvemos um experimento-piloto para avaliar o potencial de utilizarmos a ferramenta molecular metagenômica para identificação de espécies pela analise do DNA mitocondrial até então ainda não aplicada a esse tipo de estudo ecológico, sendo o coccinelídeo Hippodamia convergens o primeiro predador a ter o DNA do conteúdo gastrointestinal sequenciado, dada a sua abundancia nas áreas. As amostragens ocorreram quinzenalmente entre 10-12/2012 (captura manual entre 9 e 12:00 h) e os espécimens foram imediatamente preservados em etanol 100% e, 4h após a captura, armazenados a -20ºC. Fez-se a dissecção do trato gastrointestinal de seis espécimens (de mesma data e local) e a extração do DNA total para construção da biblioteca TruSeq (1μg de DNA) e sequenciamento em Illumina MiSeq (inserto 600 pb, paired-end, 250 bases forward e reverse, 1 lane, cobertura 20 X). Foram obtidas 1.443.651 reads (Phred20), as quais fez-se o alinhamento (BLASTn, cut-off: e-value ≤e -100, identidade ≥90% em fragmento de 240-250 b) com o banco de dados contendo 386 mitogenômas da ordem Insecta (GenBank), 7 mitogenômas parciais e genes COI e CtyB de 20 potenciais presas (incluindo predadores intraguilda e H. convergens) do agroecossistema em estudo. Pode-se verificar que 7% do material genético detectado foi mtDNA da ordem Insecta, do qual 98,8% correspondeu ao mtDNA do próprio predador e 1,2% de 10 espécies pertencentes a quatro ordens (Hemiptera: Aphis sp., Orius sp., Thrips sp., Euschistus sp.; Lepidoptera: Spodoptera sp., Helicoverpa sp.; Coleoptera: Coleomegilla sp., Hippodamia sp., Harmonia sp. e Hymenoptera), incluindo predadores intraguilda. Comprovou-se que a metagenômica do mtDNA é uma ferramenta molecular promissora para estudos de Ecologia de Insetos. MenosO objetivo geral desse trabalho consiste na identificação de presas de agentes de controle biológico para comparação de suas teias tróficas em fazendas em diferentes estágios de manejo agroecológico no Distrito Federal. Desenvolvemos um experimento-piloto para avaliar o potencial de utilizarmos a ferramenta molecular metagenômica para identificação de espécies pela analise do DNA mitocondrial até então ainda não aplicada a esse tipo de estudo ecológico, sendo o coccinelídeo Hippodamia convergens o primeiro predador a ter o DNA do conteúdo gastrointestinal sequenciado, dada a sua abundancia nas áreas. As amostragens ocorreram quinzenalmente entre 10-12/2012 (captura manual entre 9 e 12:00 h) e os espécimens foram imediatamente preservados em etanol 100% e, 4h após a captura, armazenados a -20ºC. Fez-se a dissecção do trato gastrointestinal de seis espécimens (de mesma data e local) e a extração do DNA total para construção da biblioteca TruSeq (1μg de DNA) e sequenciamento em Illumina MiSeq (inserto 600 pb, paired-end, 250 bases forward e reverse, 1 lane, cobertura 20 X). Foram obtidas 1.443.651 reads (Phred20), as quais fez-se o alinhamento (BLASTn, cut-off: e-value ≤e -100, identidade ≥90% em fragmento de 240-250 b) com o banco de dados contendo 386 mitogenômas da ordem Insecta (GenBank), 7 mitogenômas parciais e genes COI e CtyB de 20 potenciais presas (incluindo predadores intraguilda e H. convergens) do agroecossistema em estudo. Pode-se verificar que 7% do material gené... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Metagenômica; MtDNA; Teias tróficas. |
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Categoria do assunto: |
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Marc: |
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520 $aO objetivo geral desse trabalho consiste na identificação de presas de agentes de controle biológico para comparação de suas teias tróficas em fazendas em diferentes estágios de manejo agroecológico no Distrito Federal. Desenvolvemos um experimento-piloto para avaliar o potencial de utilizarmos a ferramenta molecular metagenômica para identificação de espécies pela analise do DNA mitocondrial até então ainda não aplicada a esse tipo de estudo ecológico, sendo o coccinelídeo Hippodamia convergens o primeiro predador a ter o DNA do conteúdo gastrointestinal sequenciado, dada a sua abundancia nas áreas. As amostragens ocorreram quinzenalmente entre 10-12/2012 (captura manual entre 9 e 12:00 h) e os espécimens foram imediatamente preservados em etanol 100% e, 4h após a captura, armazenados a -20ºC. Fez-se a dissecção do trato gastrointestinal de seis espécimens (de mesma data e local) e a extração do DNA total para construção da biblioteca TruSeq (1μg de DNA) e sequenciamento em Illumina MiSeq (inserto 600 pb, paired-end, 250 bases forward e reverse, 1 lane, cobertura 20 X). Foram obtidas 1.443.651 reads (Phred20), as quais fez-se o alinhamento (BLASTn, cut-off: e-value ≤e -100, identidade ≥90% em fragmento de 240-250 b) com o banco de dados contendo 386 mitogenômas da ordem Insecta (GenBank), 7 mitogenômas parciais e genes COI e CtyB de 20 potenciais presas (incluindo predadores intraguilda e H. convergens) do agroecossistema em estudo. Pode-se verificar que 7% do material genético detectado foi mtDNA da ordem Insecta, do qual 98,8% correspondeu ao mtDNA do próprio predador e 1,2% de 10 espécies pertencentes a quatro ordens (Hemiptera: Aphis sp., Orius sp., Thrips sp., Euschistus sp.; Lepidoptera: Spodoptera sp., Helicoverpa sp.; Coleoptera: Coleomegilla sp., Hippodamia sp., Harmonia sp. e Hymenoptera), incluindo predadores intraguilda. Comprovou-se que a metagenômica do mtDNA é uma ferramenta molecular promissora para estudos de Ecologia de Insetos.
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