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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
09/07/2009 |
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Data da última atualização: |
14/06/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
KUBO, K. S.; STUART, R. M.; FREITAS-ASTÚA, J.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; LOCALI-FABRIS, E. C.; COLETTA-FILHO, H. D.; MACHADO, M. A.; KITAJIMA, E. W. |
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Afiliação: |
Karen Sumire Kubo, APTA; R. M. Stuart, APTA; Juliana Freitas-Ástua, CNPMF; Renata Antonioli-Luizon, APTA; Eliane Cristina Locali-Fabris, APTA; Helvecio Della Coletta-Filho, APTA; Marcos Antonio Machado, APTA; Elliot Watanabe Kitajima, ESALQ. |
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Título: |
Evaluation of the genetic variability of orchid fleck virus by single-strand conformational polymorphism analysis and nucleotide sequencing of a fragment from the nucleocapsid. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
Archives of Virology, v. 154, n. 6, p. 1009-1014, mai. 2009. |
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ISSN: |
0304-8608 |
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DOI: |
DOI 10.1007/s00705-009-0395-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The variability of a fragment of the nucleocapsid gene of orchid fleck virus (OFV) was investigated by single-strand conformational polymorphism (SSCP) analysis and nucleotide sequencing. Forty-eight samples of 18 genera of orchids were collected from Brazil, Costa Rica and Australia. The SSCP analysis yielded six different band patterns, and phylogenetic analysis based on the nucleotide fragment sequence obtained in this work and six available in GenBank showed two different groups, one with isolates 023Germany and So-Japan, and other with the rest of the isolates. None of the analyses showed geographic correlation among the Brazilian strains. The data obtained in this study showed a low genetic variation in this region of the genome; the dN/dS ratio of 0.251-0.405 demonstrated a negative selective pressure that maintains the stability of the analyzed fragments. |
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Palavras-Chave: |
Nuclear type. |
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Thesaurus Nal: |
Orchid fleck virus. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 15 | |
| 2. |  | SIMON, E. D. T. Caracterização de genótipos crioulos de cana-de-açúcar. 2015. 69 f. Dissertação (Mestrado) - Programa de Pós-Graduação em Sistemas de Produção Agrícola Familiar. Universidade Federal de Pelotas, Pelotas. Orientador: Sérgio Delmar dos Anjos e Silva; Co-orientador: Luís Antônio Veríssimo Corrêa.| Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 9. | | SIMON, E. D. T.; VERÍSSIMO, M. A. A.; HÄRTER, A.; UENO, B. Doenças da Cana-de-açúcar. In: SILVA, S. D. dos A. e; MONTERO, C. R. S.; SANTOS, R. C. dos.; NAVA, D. E.; GOMES, C. B.; ALMEIDA, I. R. de (Ed.). Sistema de produção de cana-de-açúcar no Rio Grande do Sul. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2016. 247 p. (Embrapa Clima Temperado. Sistemas de produção, 23.) p. 104-112| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 10. | | SIMON, E. D. T.; HÄRTER, A.; ANUNES, W. R.; UENO, B.; SILVA, S. D. dos A. e. Avaliação de doenças em genótipos crioulos de cana-de-açúcar no município de Pelotas, RS, safra 2012/2013. In: SIMPÓSIO ESTADUAL DE AGROENERGIA; REUNIÃO TÉCNICA DE AGROENERGIA - RS, 5.; ENCONTRO DE ENERGIAS RENOVÁVEIS NA AGRICULTURA FAMILIAR, 2., Pelotas, 2014. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2014. 1 pen card.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 11. | | SILVA, M. T. da; MARCO, E. de; SILVA, S. D. dos A. e; EICHOLZ, E. D.; SIMON, E. D. T. Crescimento vegetativo de mamona sob crescentes doses de lodo de esgoto. In: SIMPÓSIO ESTADUAL DE AGROENERGIA; REUNIÃO TÉCNICA DE AGROENERGIA - RS, 5.; ENCONTRO DE ENERGIAS RENOVÁVEIS NA AGRICULTURA FAMILIAR, 2., Pelotas, 2014. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2014. 1 pen card.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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