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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
09/02/2009 |
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Data da última atualização: |
06/07/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OLIVEIRA, E. J.; VIEIRA, M. L. C.; GARCIA, A. A. F.; MUNHOZ, C. F.; MARGARIDO, G. R. A.; CONSOLI, L.; MATTA, F. P.; MORAES, M. C.; ZUCCHI, M. I.; FUNGARO, M. H. P. |
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Afiliação: |
Eder Jorge de Oliveira, CNPMF; Maria Lucia C. Vieira, ESALQ/USP; Antônio Augusto F. Garcia, ESALQ/USP; Carla F. Munhoz, ESALQ/USP; Gabriel R. A. Margarido, ESALQ/USP; Luciano Consoli, ESALQ/USP; Frederico P. Matta, ESALQ/USP; Michel C. Moraes, ESALQ/USP; Maria I. Zucchi, IAC; Maria Helena P. Fungaro, UEL. |
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Título: |
An integrated molecular map yellow passion fruit based on simultaneous maximum-likelihood estimation of linkage and linkage phases. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of the American Society Horticultural Science, Mount Vernon, v. 133, n. 1, p. 35-41, jan. 2008. |
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Descrição Física: |
il. |
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ISSN: |
0003-1062 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The development of genetic maps for auto-incompatible species, such as the yellow passion fruit (Passiflora edulis Sims f. flavicarpa Deg.) is restricted due to the unfeasibility of obtaining traditional mapping populations based on inbred lines. For this reason, yellow passion fruit linkage maps were generally constructed using a strategy known as two-way pseudo-testcross, based on monoparental dominant markers segregating in a 1:1 fashion. Due to the lack of information from these markers in one of the parents, two individual (parental) maps were obtained. However, integration of these maps is essential, and biparental markers can be used for such an operation. The objective of our study was to construct an integrated molecular map for a full-sib population of yellow passion fruit combining different loci configuration generated from amplified fragment length polymorphisms (AFLPs) and microsatellite markers and using a novel approach based on simultaneous maximum-likelihood estimation of linkage and linkage phases, specially designed for outcrossing species. Of the total number of loci, 76%, 21%, 0.7%, and 2.3% did segregate in 1:1, 3:1, 1:2:1, and 1:1:1:1 ratios, respectively. Ten linkage groups (LGs) were established with a logarithm of the odds (LOD) score 5.0 assuming a recombination fraction 0.35. On average, 24 markers were assigned per LG, representing a total map length of 1687 cM, with a marker density of 6.9 cM. No markers were placed as accessories on the map as was done with previously constructed individual maps. MenosThe development of genetic maps for auto-incompatible species, such as the yellow passion fruit (Passiflora edulis Sims f. flavicarpa Deg.) is restricted due to the unfeasibility of obtaining traditional mapping populations based on inbred lines. For this reason, yellow passion fruit linkage maps were generally constructed using a strategy known as two-way pseudo-testcross, based on monoparental dominant markers segregating in a 1:1 fashion. Due to the lack of information from these markers in one of the parents, two individual (parental) maps were obtained. However, integration of these maps is essential, and biparental markers can be used for such an operation. The objective of our study was to construct an integrated molecular map for a full-sib population of yellow passion fruit combining different loci configuration generated from amplified fragment length polymorphisms (AFLPs) and microsatellite markers and using a novel approach based on simultaneous maximum-likelihood estimation of linkage and linkage phases, specially designed for outcrossing species. Of the total number of loci, 76%, 21%, 0.7%, and 2.3% did segregate in 1:1, 3:1, 1:2:1, and 1:1:1:1 ratios, respectively. Ten linkage groups (LGs) were established with a logarithm of the odds (LOD) score 5.0 assuming a recombination fraction 0.35. On average, 24 markers were assigned per LG, representing a total map length of 1687 cM, with a marker density of 6.9 cM. No markers were placed as accessories on the map as... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
AFLP; flavicarpa; Linkage map integration; Microsatellite; Multipoint distance; Outcrossing specie; Passiflora edulis f. |
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Thesagro: |
Maracujá; Marcador Molecular. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
null
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 5 | |
| 1. |  | FREITAS, D. R.; SILVA, A. V.; FERNANDES, P. C. C.; PEIXOTO, T. C. S.; LEITE, A. R. P. Estrutura familiar e geração de renda em assentamentos rurais que desenvolvem atividade pecuária em Tomé-Açu e Paragominas no nordeste e sudeste paraense. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 17.; CONGRESSO INTERNACIONAL DE ZOOTECNIA, 4.; REUNIÃO NACIONAL DE ENSINO DE ZOOTECNIA, 13.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNIA, 30.; FÓRUM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTECNIA DAS UNIVERSIDADES BRASILEIRAS, 3.; FÓRUM DE ESTUDANTES DE CURSOS DE ZOOTECNIA DAS UNIVERSIDADES BRASILEIRAS, 3., 2007, Londrina. A Zootecnia frente a novos desafios: anais. Londrina: UEL: ABZ, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 2. | | NASCIMENTO, E. T. do; SOUZA, A. R. de; VIEIRA, J. M.; LEITE, A. R.; GIUSTOLIN, T. A.; ALVARENGA, C. D.; SILVA, R. B. Q. da. Parasitóides (Insecta, Hymenoptera) em algodão cultivado sob diferentes sistemas de consórcio no Norte de Minas Gerais. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Entomologia: Emparn, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 3. | | VIEIRA, J. M.; SOUZA, A. R.; NASCIMENTO, E. T.; LEITE, A. R.; BARBOSA, P. R. P.; CAMPOS, R. G. C.; SILVA, R. B. Q. da; ALVARENGA, C. D.; GIUSTOLIN, T. A.; ZUCCHI, R. A. Parasitóides de ovos de Antichloris eriphias ( Lepidoptera: artiidae) coletados em bananeiras no semi-árido de Minas Gerais. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 10., Brasília, DF, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 4. | | DAMASCENO, M. R. A.; LEITE, A. R.; GIUSTOLIN, T. A.; NAVIA, D.; FLECHTMANN, C. H. W.; ALVARENGA, C. D.; SPÍNOLA, P. R. de C.; SILVA, R. B. Q. da; MEIRA, F. S. Primeiro relato da ocorrência do ácaro tetraniquíneo Oligonychus annonicus (Mcgregor) no Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 22., 2008, Uberlândia. Ciência, tecnologia e inovação: anais. Viçosa, MG: UFV, 2008. 1 CD-ROM. ResumoID:1416-1.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 5. | | DAMASCENO, M. R. A.; NÁVIA, D.; FLECHTMANN, C. H. W.; GIUSTOLIN, T. A.; LEITE, A. R.; SPINOLA FILHO, P. R. de C.; SILVA, R. B. Q. da; ALVARENGA, C. D. Nova espécie de ácaro fitófago associado à cultura da mandioca no Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 22., 2008, Uberlândia. Ciência, tecnologia e inovação: anais. Viçosa, MG: UFV, 2008. 1 CD-ROM. ResumoID:1419-1.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Registros recuperados : 5 | |
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| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
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