| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Soja. Para informações adicionais entre em contato com valeria.cardoso@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
|
Data corrente: |
05/01/2012 |
|
Data da última atualização: |
19/07/2024 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
KULCHESKI, F. R.; OLIVEIRA, L. F. V.; MOLINA, L. G.; ALMERAO, M. P.; RODRIGUES, F. A.; MARCOLINO, J.; BARBOSA, J. F.; STOLF-MOREIRA, R.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; MARGIS, R. |
|
Afiliação: |
FRANCELI R. KULCHESKI, UFRGS; LUIZ F. V. DE OLIVEIRA, UFRGS; LORRAYNE G. MOLINA, UFRGS; MAURÍCIO P. ALMERÃO, UFRGS; FABIANA A. RODRIGUES; JULIANA MARCOLINO; JOICE F. BARBOSA; RENATA STOLF MOREIRA; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, SRI; FRANCISMAR CORREA MARCELINO GUIMARÃES, CNPSO; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; LEANDRO C. NASCIMENTO, UNICAMP; MARCELO F. CARAZZOLLE, UNICAMP; GONÇALO A. G. PEREIRA, UNICAMP; ROGÉRIO MARGIS, UFRGS. |
|
Título: |
Identification of novel soybean microRNAs involved in abiotic and biotic stresses. |
|
Ano de publicação: |
2011 |
|
Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 12, article 307, jun. 2011. |
|
Páginas: |
17 p. |
|
DOI: |
10.1186/1471-2164-12-307 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Background: Small RNAs (19-24 nt) are key regulators of gene expression that guide both transcriptional and posttranscriptional silencing mechanisms in eukaryotes. Current studies have demonstrated that microRNAs (miRNAs) act in several plant pathways associated with tissue proliferation, differentiation, and development and in response to abiotic and biotic stresses. In order to identify new miRNAs in soybean and to verify those that are possibly water deficit and rust-stress regulated, eight libraries of small RNAs were constructed and submitted to Solexa sequencing. Results: The libraries were developed from drought-sensitive and tolerant seedlings and rust-susceptible and resistant soybeans with or without stressors. Sequencing the library and subsequent analyses detected 256 miRNAs. From this total, we identified 24 families of novel miRNAs that had not been reported before, six families of conserved miRNAs that exist in other plants species, and 22 families previously reported in soybean. We also observed the presence of several isomiRNAs during our analyses. To validate novel miRNAs, we performed RT-qPCR across the eight different libraries. Among the 11 miRNAs analyzed, all showed different expression profiles during biotic and abiotic stresses to soybean. The majority of miRNAs were up-regulated during water deficit stress in the sensitive plants. However, for the tolerant genotype, most of the miRNAs were down regulated. The pattern of miRNAs expression was also different for the distinct genotypes submitted to the pathogen stress. Most miRNAs were down regulated during the fungus infection in the susceptible genotype; however, in the resistant genotype, most miRNAs did not vary during rust attack. A prediction of the putative targets was carried out for conserved and novel miRNAs families. Conclusions: Validation of our results with quantitative RT-qPCR revealed that Solexa sequencing is a powerful tool for miRNA discovery. The identification of differentially expressed plant miRNAs provides molecular evidence for the possible involvement of miRNAs in the process of water deficit- and rust-stress responses. MenosBackground: Small RNAs (19-24 nt) are key regulators of gene expression that guide both transcriptional and posttranscriptional silencing mechanisms in eukaryotes. Current studies have demonstrated that microRNAs (miRNAs) act in several plant pathways associated with tissue proliferation, differentiation, and development and in response to abiotic and biotic stresses. In order to identify new miRNAs in soybean and to verify those that are possibly water deficit and rust-stress regulated, eight libraries of small RNAs were constructed and submitted to Solexa sequencing. Results: The libraries were developed from drought-sensitive and tolerant seedlings and rust-susceptible and resistant soybeans with or without stressors. Sequencing the library and subsequent analyses detected 256 miRNAs. From this total, we identified 24 families of novel miRNAs that had not been reported before, six families of conserved miRNAs that exist in other plants species, and 22 families previously reported in soybean. We also observed the presence of several isomiRNAs during our analyses. To validate novel miRNAs, we performed RT-qPCR across the eight different libraries. Among the 11 miRNAs analyzed, all showed different expression profiles during biotic and abiotic stresses to soybean. The majority of miRNAs were up-regulated during water deficit stress in the sensitive plants. However, for the tolerant genotype, most of the miRNAs were down regulated. The pattern of miRNAs expression was also di... Mostrar Tudo |
|
Thesagro: |
Deficiência hídrica; Gene marcador; Soja. |
|
Thesaurus Nal: |
Gene expression; Soil water deficit; Soybeans. |
|
Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
|
Marc: |
LEADER 03244naa a2200385 a 4500
001 1911802
005 2024-07-19
008 2011 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1186/1471-2164-12-307$2DOI
100 1 $aKULCHESKI, F. R.
245 $aIdentification of novel soybean microRNAs involved in abiotic and biotic stresses.$h[electronic resource]
260 $c2011
300 $a17 p.
520 $aBackground: Small RNAs (19-24 nt) are key regulators of gene expression that guide both transcriptional and posttranscriptional silencing mechanisms in eukaryotes. Current studies have demonstrated that microRNAs (miRNAs) act in several plant pathways associated with tissue proliferation, differentiation, and development and in response to abiotic and biotic stresses. In order to identify new miRNAs in soybean and to verify those that are possibly water deficit and rust-stress regulated, eight libraries of small RNAs were constructed and submitted to Solexa sequencing. Results: The libraries were developed from drought-sensitive and tolerant seedlings and rust-susceptible and resistant soybeans with or without stressors. Sequencing the library and subsequent analyses detected 256 miRNAs. From this total, we identified 24 families of novel miRNAs that had not been reported before, six families of conserved miRNAs that exist in other plants species, and 22 families previously reported in soybean. We also observed the presence of several isomiRNAs during our analyses. To validate novel miRNAs, we performed RT-qPCR across the eight different libraries. Among the 11 miRNAs analyzed, all showed different expression profiles during biotic and abiotic stresses to soybean. The majority of miRNAs were up-regulated during water deficit stress in the sensitive plants. However, for the tolerant genotype, most of the miRNAs were down regulated. The pattern of miRNAs expression was also different for the distinct genotypes submitted to the pathogen stress. Most miRNAs were down regulated during the fungus infection in the susceptible genotype; however, in the resistant genotype, most miRNAs did not vary during rust attack. A prediction of the putative targets was carried out for conserved and novel miRNAs families. Conclusions: Validation of our results with quantitative RT-qPCR revealed that Solexa sequencing is a powerful tool for miRNA discovery. The identification of differentially expressed plant miRNAs provides molecular evidence for the possible involvement of miRNAs in the process of water deficit- and rust-stress responses.
650 $aGene expression
650 $aSoil water deficit
650 $aSoybeans
650 $aDeficiência hídrica
650 $aGene marcador
650 $aSoja
700 1 $aOLIVEIRA, L. F. V.
700 1 $aMOLINA, L. G.
700 1 $aALMERAO, M. P.
700 1 $aRODRIGUES, F. A.
700 1 $aMARCOLINO, J.
700 1 $aBARBOSA, J. F.
700 1 $aSTOLF-MOREIRA, R.
700 1 $aNEPOMUCENO, A. L.
700 1 $aMARCELINO-GUIMARÃES, F. C.
700 1 $aABDELNOOR, R. V.
700 1 $aNASCIMENTO, L. C.
700 1 $aCARAZZOLLE, M. F.
700 1 $aPEREIRA, G. A. G.
700 1 $aMARGIS, R.
773 $tBMC Genomics$gv. 12, article 307, jun. 2011.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 40 | |
| 1. |  | SOUSA, H. N.; BAIOCCHI, M. V.; COHEN, K. O.; AMORIM, E. P.; PAES, N. S.; SILVA, S. O. Atividade antioxidante em genótipos de bananeira visando subsidiar programas de melhoramento com foco em funcionalidade. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 122. p.172.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|   |
| 2. | | BAIOCCHI, M. V.; SOUSA, H. N.; COHEN, K. O.; AMORIM, E. P.; PAES, N. S.; SILVA, S. O. Avaliação de compostos fenólicos em genótipos de bananeira visando subsidiar programas de melhoramento com foco em funcionalidade. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 123. p.173.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 3. | | COHEN, K. de O.; AMORIM, E. P.; PAES, N. S.; SILVA, S. de O. e; SOUSA, H. N. e. Quantificação de teor de polifenóis totais em genótipos de banana. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável: anais. Vitória: INCAPER: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 4. | | COHEN, K. de O.; AMORIM, E. P.; PAES, N. S.; SILVA, S. de O. e; SOUSA, H. N. e. Quantificação de teor de polifenóis totais em genótipos de banana. IN: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória, ES. Anais... Caçador, SC: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008. 1 DVD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 5. | | SOUSA, H. N.; BAIOCCHI, M. V.; CHISTÉ, R. C.; COHEN, K. O.; PAES, N. S.; OLIVEIRA, M. S. P. Compostos nutricionais e funcionais da cultivar de açaizeiro BRS-Pará. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 124.. p.174.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|  |
| 6. | | AMORIM, E. P.; COHEN, K. de O.; AMORIM, V. B. de O.; PAES, N. S.; SOUSA, H. N. e; SEREJO, J. A. dos S. Caracterização de acessos de bananeira com base na concentração de compostos funcionais. Ciência Rural, Santa Maria, v. 41, n. 4, p. 592-598, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|  |
| 7. | | COHEN, K. de O.; AMORIM, E. P.; GUIMARAES, T. G.; PAES, N. S.; KISHI, S. M.; BAIOCCHI, M. DO V.; SOUSA, H. N. E. Avaliação física e físico-química de hídridos de bananeira em dois ciclos de produção. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GASTRONOMIA, 3.; SIMPÓSIO REGIONAL DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA, 1., 2010, Brasília, DF. Alimentos: da alquimia à ciência: anais. Brasília, DF: UNB: CET; SBCTA, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 8. | | COHEN, K. de O.; TUPINAMBA, D. D.; COSTA, A. M.; JUNQUEIRA, N. T. V.; FALEIRO, F. G.; SOUSA, H. N. e; BAIOCCHI, M. do V. Compostos fenólicos e vitamina C na polpa extraída dos frutos do híbrido de maracujazeiro azedo BRS Ouro Vermelho. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 5 p. (Embrapa Cerrados. Comunicado Técnico, 156).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 9. | | COHEN, K. de O.; COSTA, A. M.; TUPINAMBA, D. D.; SOUSA, H. N.; PAES, N. S.; BRANDÃO, L. S.; VICENTINI, G. C. Compostos funcionais e atividade antioxidante da passiflora tenuifila. In: SIMPÓSIO LATINO AMERICANO DE CIÊNCIA DE ALIMENTOS, 8., 2009, Campinas. Anais: ciência de alimentos no mundo globalizado: novos desafios, novas perspectivas. Campinas: Unicamp, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 10. | | COHEN, K. de O.; COSTA, A. M.; TUPINAMBÁ, D. D.; JUNQUEIRA, N. T. V.; FALEIRO, F. G.; BAIOCCHI, M. do V.; SOUSA, H. N. e. Compostos funcionais na polpa dos frutos do híbrido de maracujazeiro-azedo BRS Sol do Cerrado. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. (Embrapa Cerrados. Comunicado Técnico, 157).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 11. | | COHEN, K. de O.; COSTA, A. M.; GUIMARÃES, T. G.; AMORIM, E. P.; SILVA, S. de O. e; BAIOCCHI, M. do V.; SOUSA, H. N. e. Cultivares de banana no bioma cerrado: características físicas e físico-químicas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. 1 CD-ROM. pdf 2612| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 12. | | COHEN, K. de O.; COSTA, A. M.; GUIMARAES, T. G.; AMORIM, E. P.; SILVA, S. de O. e; BAIOCCHI, M. do V.; SOUSA, H. N. e. Cultivares de banana no bioma cerrado: características físicas e físico-químicas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari, ES. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: SBMP: Incaper, 2009. (Incaper. Documentos, 11). 4 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 13. | | COHEN, K. de O.; AMORIM, E. P.; PAES, N. S.; SILVA, S. de O. e.; BAIOCCHI, M. do V.; SOUSA, H. N. e. Vitamina C, carotenóides, compostos fenólicos e atividade antioxidante em genótipos de banana. Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, 2009. 4 p. (Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical. Comunicado técnico, 129).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 14. | | COHEN, K. de O.; AMORIM, E. P.; PAES, N. S.; SILVA, S. de O. e; BAIOCCHI, M. do V.; SOUSA, H. N. e. Vitamina C, carotenóides, compostos fenólicos e atividade antioxidante em genótipos de banana. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari, ES. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: SBMP: Incaper, 2009. (Incaper. Documentos, 11). 4 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 15. | | BALOCCHI, M. V.; SOUSA, H. N.; COHEN, K. O.; COSTA, A. M.; TUPINAMBÁ, D. D.; BRANDÃO, L. S.; FARIA, D. A.; SANTOS, A. L. B.; JUNQUEIRA, N. T. V. Estudo do potencial funcional do híbrido BRS Ouro Vermelho (Passiflora edulis) em diferentes sistemas de cultivo. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 16. | | BAIOCCHI, M. V.; SOUSA, H. N.; COHEN, K. O.; COSTA, A. M.; TUPINAMBÁ, D. D.; BRANDÃO, L. S.; FARIA, D. A.; SANTOS, A. L. B.; JUNQUEIRA, N. T. V. Estudo do potencial funcional do hidrido BRS Ouro Vermelho (Passiflora edulis) em diferentes sistemas de cultivo. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 136. p. 186.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 17. | | COSTA, A. M.; CAMPOS, A. V. S.; COHEN, K. de O.; TUPINAMBÁ, D. D.; PAES, N. S.; SOUSA, H. N. e; SANTOS, A. L. de B.; SILVA, K. N. da; FARIA, D. A.; JUNQUEIRA, N. T. V.; FALEIRO, F. G. Características físico-química-funcional da polpa de Passiflora setacea recém processada e congelada. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 1 folder.| Tipo: Folder/Folheto/Cartilha |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 18. | | COSTA, A. M.; CAMPOS, A. V. S.; COHEN, K. de O.; TUPINAMBA, D. D.; PAES, N. S.; SOUSA, H. N. e; SANTOS, A. L. de B.; SILVA, K. N. da; FARIA, D. A.; JUNQUEIRA, N. T. V.; FALEIRO, F. G. Características físico-química-funcional da polpa de passiflora setacea recém processada e congelada. In: SIMPÓSIO NACIONAL CERRADO, 9.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SAVANAS TROPICAIS, 2., 2008, Brasília, DF. Desafios e estratégias para o equilíbrio entre sociedade, agronegócio e recursos naturais: anais. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 7 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 19. | | COHEN, K. de O.; PAES, N. S.; COSTA, A. M.; TUPINAMBÁ, D. D.; SOUSA, H. N. e; CAMPOS, A. V. S.; SANTOS, A. L. B.; SILVA, K. N. da; FALEIRO, F. G.; FARIA, D. A. Características físico-químicas e compostos funcionais da polpa da Passiflora alata. In: SIMPÓSIO NACIONAL CERRADO, 9.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SAVANAS TROPICAIS, 2., 2008, Brasília, DF. Desafios e estratégias para o equilíbrio entre sociedade, agronegócio e recursos naturais: anais... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 20. | | COHEN, K. de O.; PAES, N. S.; COSTA, A. M.; TUPINAMBÁ, D. D.; SOUSA, H. N. e; CAMPOS, A. V. S.; SANTOS, A. L. B.; SILVA, K. N. da; FALEIRO, F. G.; FARIA, D. A. Características físico-químicas e compostos funcionais da polpa da Passiflora alata. In: SIMPÓSIO NACIONAL CERRADO, 9.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SAVANAS TROPICAIS, 2., 2008, Brasília, DF. Desafios e estratégias para o equilíbrio entre sociedade, agronegócio e recursos naturais: anais... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 1 CD-ROM. Organizado por Fábio Gelape Faleiro e Austeclínio Lopes de Farias Neto.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| Registros recuperados : 40 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
