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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
27/09/2022 |
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Data da última atualização: |
27/09/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FERREIRA, N. dos S.; GONIGLIO, A.; PUENTE, M.; SANTANNA, F. H.; MARONICHE, G.; GARCIA, J.; MOLINA, R.; NIEVAS, S.; VOLPIANO, C. G.; AMBROSINI, A.; PASSAGLIA, L. M. P.; PEDRAZA, R. O.; REIS, V. M.; ZILLI, J. E.; CASSAN, F. |
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Afiliação: |
NATÁLIA DOS SANTOS FERREIRA, UFRRJ; ANAHÍ CONIGLIO, Universidad Nacional de Río Cuarto; MARIANA PUENTE, INTA; FERNANDO HAYASHI SANT'ANNA, PROAD-SUS; GUILLERMO MARONICHE, Universidad Nacional de Mar del Plata; JULIA GARCÍA, INTA; ROMINA MOLINA, UNIVERSIDAD NACIONAL DE RIO CUARTO; SOFIA NIEVAS, UNIVERSIDAD NACIONAL DE RIO CUARTO; CAMILA GAZOLLA VOLPIANO, UFGRS; ADRIANA AMBROSINI, UFRGS; LUCIANE M P PASSAGLIA, UFRGS; RAUL O. PEDRAZA, Universidad Nacional de Tucumán; VERONICA MASSENA REIS, CNPAB; JERRI EDSON ZILLI, CNPAB; FABRICIO CASSAN, Universidad Nacional de Río Cuarto. |
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Título: |
Genome-based reclassification of Azospirillum brasilense Az39 as the type strain of Azospirillum argentinense sp. nov. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 72, n. 8, aug. 2022. |
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ISSN: |
1466-5034 |
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DOI: |
0.1099/ijsem.0.005475 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Strain Az39T of Azospirillum is a diazotrophic plant growth-promoting bacterium isolated in 1982 from the roots of wheat plants growing in Marcos Juárez, Córdoba, Argentina. It produces indole-3-acetic acid in the presence of l-tryptophan as a precursor, grows at 20-38 °C (optimal 38 °C), and the cells are curved or spiral-shaped, with diameters ranging from 0.5-0.9 to 1.8-2.2 µm. They contain C16 : 0, C18 : 0 and C18 : 1 ω7c/ω6c as the main fatty acids. Phylogenetic analysis of its 16S rRNA gene sequence confirmed that this strain belongs to the genus Azospirillum, showing a close relationship with Azospirillum baldaniorum Sp245T, Azospirillum brasilense Sp7T and Azospirillum formosense CC-Nfb-7T. Housekeeping gene analysis revealed that Az39T, together with five strains of the genus (Az19, REC3, BR 11975, MTCC4035 and MTCC4036), form a cluster apart from A. baldaniorum Sp245T, A. brasilense Sp7T and A. formosense CC-Nfb-7T. Average nucleotide identity (ANI) and digital DNA-DNA hybridization (dDDH) between Az39T and the aforementioned type strains revealed values below 96 %, the circumscription limit for the species delineation (ANI: 95.3, 94.1 and 94.0 %; dDDH: 62.9, 56.3 and 55.6 %). Furthermore, a phylogeny evaluation of the core proteome, including 809 common shared proteins, showed an independent grouping of Az39T, Az19, REC3, BR 11975, MTCC4035 and MTCC4036. The G+C content in the genomic DNA of these six strains varied from 68.3 to 68.5 %. Based on the combined phylogenetic, genomic and phenotypic characterization presented here, we consider that strain Az39T, along with strains Az19, REC3, BR 11975, MTCC4035 and MTCC4036, are members of a new Azospirillum species, for which the name Azospirillum argentinense sp. nov. is proposed. The type strain is Az39T (=LBPCV39T=BR 148428T=CCCT 22.01T). MenosStrain Az39T of Azospirillum is a diazotrophic plant growth-promoting bacterium isolated in 1982 from the roots of wheat plants growing in Marcos Juárez, Córdoba, Argentina. It produces indole-3-acetic acid in the presence of l-tryptophan as a precursor, grows at 20-38 °C (optimal 38 °C), and the cells are curved or spiral-shaped, with diameters ranging from 0.5-0.9 to 1.8-2.2 µm. They contain C16 : 0, C18 : 0 and C18 : 1 ω7c/ω6c as the main fatty acids. Phylogenetic analysis of its 16S rRNA gene sequence confirmed that this strain belongs to the genus Azospirillum, showing a close relationship with Azospirillum baldaniorum Sp245T, Azospirillum brasilense Sp7T and Azospirillum formosense CC-Nfb-7T. Housekeeping gene analysis revealed that Az39T, together with five strains of the genus (Az19, REC3, BR 11975, MTCC4035 and MTCC4036), form a cluster apart from A. baldaniorum Sp245T, A. brasilense Sp7T and A. formosense CC-Nfb-7T. Average nucleotide identity (ANI) and digital DNA-DNA hybridization (dDDH) between Az39T and the aforementioned type strains revealed values below 96 %, the circumscription limit for the species delineation (ANI: 95.3, 94.1 and 94.0 %; dDDH: 62.9, 56.3 and 55.6 %). Furthermore, a phylogeny evaluation of the core proteome, including 809 common shared proteins, showed an independent grouping of Az39T, Az19, REC3, BR 11975, MTCC4035 and MTCC4036. The G+C content in the genomic DNA of these six strains varied from 68.3 to 68.5 %. Based on the comb... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Proteome core. |
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Thesaurus Nal: |
Azospirillum; Phylogeny. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 3. | | RICALDE, M. P.; NAVA, D. E.; LOECK, A. E.; COUTINHO, E. F.; GARCIA, R. M. Occurrence of Caterpillar of the Olive Tree, Palpita forficifera (Lepidoptera: Pyralidae) in Olive Groves in the State of Rio Grande do Sul. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON OLIVE GROWING, 7., 2012, San Juan, Argentina, Anais... San Juan: ISHS, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 5. | | RICALDE, M. P.; NAVA, D. E.; LOECK, A. E.; COUTINHO, E. F.; BISOGNIN, A.; GARCIA, R. M. Occurrence of Scale Insects in OliveGroves in the State of Rio Grande do Sul, Brazil. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON OLIVE GROWING, 7., 2012, San Juan, Argentina, Anais... San Juan: ISHS, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 9. | | CAMPOS JUNIOR, P. H. A.; ASSUNÇÃO, C. M.; CARVALHO, B. C. de; BATISTA, R. I. T. P.; GARCIA, R. M. G.; VIANA, J. H. M. Follicular populations, recruitment and atresia in the ovaries of different strains of mice. Reproductive Biology, v. 12, n. 1. p. 41-55, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 10. | | GRAZIA, J. G. V.; WOHLRES-VIANA, S.; GARCIA, R. M. G.; MACHADO, M. A.; CAMARGO, L. S. de A.; VIANA, J. H. M. Gene expression in co-cultured granulosa cells from taurine and zebu cattle with high or low rates of in vitro embryo production. Animal Reproduction, v. 11, n. 3, p. 428, 2014. Edição dos proceedings do 28º Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society, 2014, Natal.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 11. | | GARCIA, R. M.; RATTES, J. F.; GARCIA, I. M.; RODRIGUES, M. A. F.; MARQUES, A. F.; SILVA, C. M.; SOUZA, C. R. de; NASCIMENTO, P. R.; CASTRO, D. F. de; RIBEIRO, J. S.; MARINHO, J. A. A. Eficácia do Zetacipermetrina e Bifentrina no controle do Bicudo-do-Algodoeiro (Anthonomus grandis) na região Sudoeste do Estado de Goiás In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Resumos... Uberlândia, 2007. p. 1-4 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 20. | | RATTES, J. F.; GARCIA, R. M.; GARCIA, I. M.; RODRIGUES, M. A. F.; MARQUES, A. F.; CASTRO, D. F. de; SILVA, C. M.; SOUZA, C. R. de; ARANTES, O. F.; FONSECA, R. F.; VANCIN, D. R. da; MARINHO, J. A. A. Eficácia do Zetacipermetrina e Bifentrina no controle da Lagarta Curuquerê (Alabama argillacea) na cultura do algodoeiro na região Sudoeste do Estado de Goiás. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Resumos... Uberlândia, 2007. p. 1-4 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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