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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
Data corrente: |
25/09/2017 |
Data da última atualização: |
22/12/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MOREIRA, E. C. O.; PINHEIRO, D. G.; GORDO, S. M. C.; RODRIGUES, S. de M.; PESSOA, E.; SCHALLER, H.; LEMOS, O. F. de; SILVA, A.; SCHNEIDER, H.; SILVA JUNIOR, W. A.; SAMPAIO, I.; DARNET, S. |
Afiliação: |
Edith C. O. Moreira, UFPA; Daniel G. Pinheiro, USP/UNESP; Sheila M. C. Gordo, UFPA; SIMONE DE MIRANDA RODRIGUES, CPATU; Elaine Pessoa, UFPA / Laboratoire International Associe PALMHEAT CNRS/ UFPA, Recherche et Cooperation Internationale (DERCI); Hubert Schaller, Universite de Strasbourg / Laboratoire International Associe PALMHEAT CNRS/ UFPA, Recherche et Cooperation Internationale (DERCI); ORIEL FILGUEIRA DE LEMOS, CPATU; Artur Silva, UFPA; Horacio Schneider, UFPA; Wilson A. Silva Jr., USP; Iracilda Sampaio, UFPA; Sylvain Darnet, UFPA / Laboratoire International Associe PALMHEAT CNRS/ UFPA, Recherche et Cooperation Internationale (DERCI). |
Título: |
Transcriptional profiling by RNA sequencing of black pepper (Piper nigrum L.) roots infected by Fusarium solani f. sp. piperis. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
Acta Physiologiae Plantarum, v. 39, n. 10, article 239, Oct. 2017. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Black pepper (Piper nigrum L.) is the most traded spice worldwide and therefore has great economic value. One of the major limitations of its production is yield losses in fields due to root rot, a disease caused by Fusarium solani f. sp. piperis. This soil-borne pathogen disseminates rapidly in tropical countries. Biotechnological breeding is often presented as an efficient tool to produce resistant pepper cultivars. An RNA-sequencing experiment was used to take a snapshot of the root transcriptome 60 days after infection by the pathogen. The mapping of 67 million SOLiD single-end reads to the Fusarium genome identified many fungal transcripts coding constitutive proteins and two proteins involved in virulence and conidial formation. The annotation of black pepper transcripts obtained by de novo assembly predicted three proteins restricted to this species. While these transcripts were upregulated in infected roots, the corresponding predicted proteins had no hit in databases. A global analysis of differentially expressed black pepper genes, using terms of gene ontology, has demonstrated an enrichment of genes involved in proteolysis, plastid degradation, cell-wall remodeling and secondary metabolism, consistent with toxicity and necrotrophic fungal interactions that force plants to collaborate at the metabolic level. Detailed descriptions of up- or downregulated genes associated with plant defense suggested several genes implied in the biosynthesis of isoprenoids, especially for an upregulated terpene synthase, a putative geranylgeranyl diphosphate synthase, and a downregulated brassinosteroid signaling component (BAK1). These results provide new clues for investigating further target genes and biotechnological approaches for breeding black pepper resistance to Fusarium. MenosBlack pepper (Piper nigrum L.) is the most traded spice worldwide and therefore has great economic value. One of the major limitations of its production is yield losses in fields due to root rot, a disease caused by Fusarium solani f. sp. piperis. This soil-borne pathogen disseminates rapidly in tropical countries. Biotechnological breeding is often presented as an efficient tool to produce resistant pepper cultivars. An RNA-sequencing experiment was used to take a snapshot of the root transcriptome 60 days after infection by the pathogen. The mapping of 67 million SOLiD single-end reads to the Fusarium genome identified many fungal transcripts coding constitutive proteins and two proteins involved in virulence and conidial formation. The annotation of black pepper transcripts obtained by de novo assembly predicted three proteins restricted to this species. While these transcripts were upregulated in infected roots, the corresponding predicted proteins had no hit in databases. A global analysis of differentially expressed black pepper genes, using terms of gene ontology, has demonstrated an enrichment of genes involved in proteolysis, plastid degradation, cell-wall remodeling and secondary metabolism, consistent with toxicity and necrotrophic fungal interactions that force plants to collaborate at the metabolic level. Detailed descriptions of up- or downregulated genes associated with plant defense suggested several genes implied in the biosynthesis of isoprenoids, especiall... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Melhoramento genético. |
Thesagro: |
Doença; Pimenta. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
Marc: |
LEADER 02668naa a2200289 a 4500 001 2076203 005 2021-12-22 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aMOREIRA, E. C. O. 245 $aTranscriptional profiling by RNA sequencing of black pepper (Piper nigrum L.) roots infected by Fusarium solani f. sp. piperis.$h[electronic resource] 260 $c2017 520 $aBlack pepper (Piper nigrum L.) is the most traded spice worldwide and therefore has great economic value. One of the major limitations of its production is yield losses in fields due to root rot, a disease caused by Fusarium solani f. sp. piperis. This soil-borne pathogen disseminates rapidly in tropical countries. Biotechnological breeding is often presented as an efficient tool to produce resistant pepper cultivars. An RNA-sequencing experiment was used to take a snapshot of the root transcriptome 60 days after infection by the pathogen. The mapping of 67 million SOLiD single-end reads to the Fusarium genome identified many fungal transcripts coding constitutive proteins and two proteins involved in virulence and conidial formation. The annotation of black pepper transcripts obtained by de novo assembly predicted three proteins restricted to this species. While these transcripts were upregulated in infected roots, the corresponding predicted proteins had no hit in databases. A global analysis of differentially expressed black pepper genes, using terms of gene ontology, has demonstrated an enrichment of genes involved in proteolysis, plastid degradation, cell-wall remodeling and secondary metabolism, consistent with toxicity and necrotrophic fungal interactions that force plants to collaborate at the metabolic level. Detailed descriptions of up- or downregulated genes associated with plant defense suggested several genes implied in the biosynthesis of isoprenoids, especially for an upregulated terpene synthase, a putative geranylgeranyl diphosphate synthase, and a downregulated brassinosteroid signaling component (BAK1). These results provide new clues for investigating further target genes and biotechnological approaches for breeding black pepper resistance to Fusarium. 650 $aDoença 650 $aPimenta 653 $aMelhoramento genético 700 1 $aPINHEIRO, D. G. 700 1 $aGORDO, S. M. C. 700 1 $aRODRIGUES, S. de M. 700 1 $aPESSOA, E. 700 1 $aSCHALLER, H. 700 1 $aLEMOS, O. F. de 700 1 $aSILVA, A. 700 1 $aSCHNEIDER, H. 700 1 $aSILVA JUNIOR, W. A. 700 1 $aSAMPAIO, I. 700 1 $aDARNET, S. 773 $tActa Physiologiae Plantarum$gv. 39, n. 10, article 239, Oct. 2017.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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Registros recuperados : 17 | |
2. |  | FERREZINI, J.; SCHIAVONE, D. C.; BRITO, L. G.; OLIVEIRA, M. C. de S.; CHAGAS, A. C. de S. Diagnóstico da resistência de Rhipicephalus (Boophilus) microplus a carrapaticidas no rebanho bovino da Embrapa Pecuária Sudeste. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUDESTE, 2., 2007, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2007. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 76).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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3. |  | CHAGAS, A. C. de S.; OLIVEIRA, M. C. de S.; CARVALHO, C.; GEORGETTI, C.; SCHIAVONE, D.; FERREZINI, J. Otimização da eclodibilidade larvar no egg hatch test. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 15.; SEMINÁRIO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA DOS PAÍSES DO MERCUSUL, 2., 2008, Curitiba. Anais... Curitiba: CBPV, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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4. |  | ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, M. C. de S.; CHAGAS, A. C. de S.; SCHIAVONE, D. C.; FERREZINI, J. Estudo da infestação artificial de carrapatos Riphicephalus (Boophilus) microplus em fêmeas bovinas Nelore, Angus x Nelore e Senepol x Nelore. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 7., 2008, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SBMA, 2008. 1 CD-ROM p.1. 1 CD-ROMTipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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5. |  | SCHIAVONE, D.; GIGLIOTI, R.; CARVALHO, C. O. de; FERREZINI, J.; CHAGAS, A. C. de S.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, M. C. de S. Avaliação da resistência de bovinos de diferentes grupos genéticos aos nematódeos gastrintestinais. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUDESTE, 2008, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2008. p. 2 (Documentos / Embrapa Pecuária Sudeste; 79) Editado por Marco Aurélio C.M. Bergamaschi e Patricia Menezes SantosTipo: Resumo em Anais de Congresso |
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6. |  | CARVALHO, C. O.; GIGLIOTI, R.; GIGLIOTI, C.; SCHIAVONE, D.; FREITAS, A. R. de; ESTEVES, S. N.; OLIVEIRA, M. C. de S.; CHAGAS, A. C. de S. Correlação entre o Método Famacha e hematócrito no rebanho ovino da Embrapa Pecuária Sudeste. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUDESTE, 2006, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2006.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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7. |  | GIGLIOTI, C.; GIGLIOTI, R.; SCHIAVONE, D.; CARVALHO, C. O. de; FERREZINI, J.; CHAGAS, A. C. de S.; ESTEVES, S. N.; OLIVEIRA, M. C. de S. Avaliação de vermifugação seletiva em ovelhas criadas na região de São Carlos, SP. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUDESTE, 2008, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2008. p. 4. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 79).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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8. |  | CHAGAS, A. C. de S.; OLIVEIRA, M. C. de S.; ESTEVES, S. N.; OLIVEIRA, H.; GIGLIOTI, R.; GIGLIOTI, C.; CARVALHO, C.; FERREZINI, J.; SCHIAVONE, D. Parasitismo por nematóides gastrintestinais em matrizes e cordeiros criados em São Carlos, São Paulo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 15.; SEMINÁRIO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA DOS PAÍSES DO MERCUSUL, 2., 2008, Curitiba. Anais... Curitiba: CBPV, 2008.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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9. |  | CARVALHO, C. O.; CHAGAS, A. C. de S.; GIGLIOTE, R.; SCHIAVONE, D.; OLIVEIRA, M. C. de S.; FREITAS, A. R. de; ESTEVES, S. N. Eficiência do método famacha em relação ao hematócrito na detecçãodo grau de anemia em ovinos. In: CONGRESSO BRASILEIRA DE VETERINÁRIA, 34., 2007, Santos. Anais... São Paulo: Sociedade Paulista de Medicina Veterinária, 2007. 1 CD-ROMTipo: Resumo em Anais de Congresso |
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10. |  | FERREZINI, J.; SCHIAVONE, D.; CARVALHO, C. O. de; FREITAS, A. R. de; CHAGAS, A. C. de S.; OLIVEIRA, M. C. de S. Efeito acaricida in vitro do extrato bruto de sementes de Neem sobre Rhipicephalus microplus. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUDESTE, 2008, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2008. p. 7. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 79).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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11. |  | GIGLIOTI, C.; GIGLIOTI, R.; SCHIAVONE, D.; CARVALHO, C. O.; FREITAS, A. R. de; CHAGAS, A. C. de S.; ESTEVES, S. N.; OLIVEIRA, M. C. de S. Epidemiologia das helmintoses gastrintestinais de ovinos criados na região de São Carlos-SP. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUDESTE, 2006, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2006. 1p.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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12. |  | OLIVEIRA, M. C. de S.; CHAGAS, A. C. de S.; ALENCAR, M. M. de; BARIONE JÚNIOR, W.; SCHIAVONE, D. C.; GIGLIOTI, R.; FERREZINI, J. Infecção por hemintos gastrintestinais em bovinos de diferentes grupos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 15.; SEMINÁRIO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA DOS PAÍSES DO MERCUSUL, 2., 2008, Curitiba. Anais... Curitiba: CBPV, 2008.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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13. |  | SCHIAVONE, D. C.; GIGLIOTI, R.; GIGLIOTI, C.; FREITAS, A. R. de; ALENCAR, M. M. de; CHAGAS, A. C. de S.; OLIVEIRA, M. C. de S. Suscetibilidade de bovinos de diferentes grupos genéticos aos helmintos gastrintestinais: resultados preliminares. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUDESTE, 2006, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2006.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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14. |  | SCHIAVONE, D. C.; GIGLIOTI, R.; GIGLIOTI, C.; FERREZINI, J.; ALENCAR, M. M. de; CHAGAS, A. C. de S.; OLIVEIRA, M. C. de S. Suscetibilidade à infecção por nematódeos gastrintestinais em bovinos de corte de três grupos genéticos. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUDESTE, 2., 2007, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2007. (Documentos / Embrapa Pecuária Sudeste; 76).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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15. |  | OLIVEIRA, M. C. de S.; CHAGAS, A. C. de S.; ESTEVES, S. N.; OLIVEIRA, H. N.; GIGLIOTI, C.; GIGLIOTI, R.; FERRENZEINI, J.; CARVALHO, C. de O.; SCHIAVONE, D. Uso de tratamento seletivo contra nematódeos gastrintestinais em ovelhas criadas em São Carlos, SP. São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2008. 24p. (Embrapa Pecuária Sudeste. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 17)Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
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16. |  | OLIVEIRA, M. C. de S.; CHAGAS, A. C. de S.; FREITAS, A. R. de; GIGLIOTI, R.; SCHIAVONE, D.; FERREZINI, J.; CARVALHO, C. O. Utilização de vermifugação seletiva no controle dos nematódeos gastrointestinais. Em ovinos de corte. In: REUNION ASOCIACION LATINOAMERICANA DE PRODUCCION ANIMAL, 20.; REUNION ASOCIACION PERUANA DE PRODUCCION ANINAL, 30.; CONGRESSO INTERNACIONAL DE GANDEIRA DE DOBLE PROPOSTO, 5., 2007, Cuzco, Perú. Annales... Cuzco: ALPA: APPA, 2007. 1 CD-ROM. Resumos na seguinte fonte: Archivos Latinoamericano de Produccion Animal, v. 15, (Supl.1), p. 489-490, 2007.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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17. |  | CHAGAS, A. C. de S.; OLIVEIRA, M. C. de S.; ESTEVES, S. N.; OLIVEIRA, H. N. DE; GIGLIOTI, R.; GIGLIOTI, C.; CARVALHO, C. DE O.; FERREZINI, J.; SCHIAVONE, D. C. Parasitismo por nematóides gastrintestinais em matrizes e cordeiros criados em São Carlos, São Paulo. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, v. 17, Supl. 1, p. 126-132, 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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