| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
|
Data corrente: |
04/08/2005 |
|
Data da última atualização: |
17/01/2020 |
|
Autoria: |
MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, A.; DOMINIQUINI, F.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; TOGAWA, R. C.; NESHICH, G. |
|
Afiliação: |
ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; Cenargen; CNPTIA; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ROBERTO COITI TOGAWA, Cenargen; GORAN NESIC, CNPTIA. |
|
Título: |
Sting contacts: a web-based application for identification and analysis of amino acid contacts within protein structure and across protein interfaces. |
|
Ano de publicação: |
2004 |
|
Fonte/Imprenta: |
Bioinformatics, v. 20, n. 13, p. 2145-2147, 2004. |
|
DOI: |
10.1093/bioinformatics/bth203 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
Na publicação: P. R. Kuser. |
|
Conteúdo: |
Amino acid contacts in terms of atomic interactions are essential factors to be considered in the analysis of the structure of a protein and its complexes. Consequently, molecular biologists do require specific tools for the identification and visualization of all such contacts. Graphical contacts (GC) and interface forming residue graphical contacts (IFRgc) presented here, calculate atomic contacts among amino acids based on a table of predefined pairs of the atom types and their distances, and then display them using number of different forms. The inventory of currently listed contact types by GC and IFRgc include hydrogen bonds (in nine different flavors), hydrophobic interactions, charge?charge interactions, aromatic stacking and disulfide bonds. Such extensive catalog of the interactions, representing the forces that govern protein folding, stability and binding, is the key feature of these two applications. GC and IFRgc are part of STING Millennium Suite. |
|
Palavras-Chave: |
Sting Millennium Suite. |
|
Thesagro: |
Aminoácido; Proteina. |
|
Thesaurus Nal: |
Amino acids; Proteins. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 01880naa a2200289 a 4500
001 1009086
005 2020-01-17
008 2004 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1093/bioinformatics/bth203$2DOI
100 1 $aMANCINI, A. L.
245 $aSting contacts$ba web-based application for identification and analysis of amino acid contacts within protein structure and across protein interfaces.$h[electronic resource]
260 $c2004
500 $aNa publicação: P. R. Kuser.
520 $aAmino acid contacts in terms of atomic interactions are essential factors to be considered in the analysis of the structure of a protein and its complexes. Consequently, molecular biologists do require specific tools for the identification and visualization of all such contacts. Graphical contacts (GC) and interface forming residue graphical contacts (IFRgc) presented here, calculate atomic contacts among amino acids based on a table of predefined pairs of the atom types and their distances, and then display them using number of different forms. The inventory of currently listed contact types by GC and IFRgc include hydrogen bonds (in nine different flavors), hydrophobic interactions, charge?charge interactions, aromatic stacking and disulfide bonds. Such extensive catalog of the interactions, representing the forces that govern protein folding, stability and binding, is the key feature of these two applications. GC and IFRgc are part of STING Millennium Suite.
650 $aAmino acids
650 $aProteins
650 $aAminoácido
650 $aProteina
653 $aSting Millennium Suite
700 1 $aHIGA, R. H.
700 1 $aOLIVEIRA, A.
700 1 $aDOMINIQUINI, F.
700 1 $aFALCAO, P. R. K.
700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B.
700 1 $aTOGAWA, R. C.
700 1 $aNESHICH, G.
773 $tBioinformatics$gv. 20, n. 13, p. 2145-2147, 2004.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 6 | |
| 2. |  | SCHULTZ, J. G.; GUTKOSKI, L. C.; DORO, C. T.; REIS, E. M.; BOZZETO, D. J.; DUARTE, L. F. R. Desenvolvimento de novas tecnologias em beneficiamento de erva-mate. In: CONGRESSO SUL-AMERICANO DA ERVA-MATE, 1.; REUNIAO TECNICA DO CONE SUL SOBRE A CULTURA DA ERVA-MATE, 2., 1997, Curitiba. Anais. Colombo: EMBRAPA-CNPF, 1997. p.414. (EMBRAPA-CNPF. Documentos, 33).| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
|   |
| 3. | | NUNES, H. C. A.; HELM, C. V.; SILVA, P. R.; HEINZ, K. G. H.; PAZZAN, A. M.; SCHOEN, C.; ANDRADE, D. R. M.; SCHULTZ, J. Pré-tratamento e hidrólise enzimática de biomassas agroindustriais. In: MOSTRA INTEGRADA DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 7., 2013, Blumenau. Anais. Blumenau: FURB, 2013. Resumo. Disponível online. MIPE.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
|  |
| 4. | | SILVA, F. A. L. S. da; BITTENCOURT, R.; FERREIRA, D. K.; SCHULTZ, J.; FERNANDES, C. D.; MONTAGNA, T.; REIS, M. S. dos. Variabilidade genética em progênies maternas de Araucaria angustifolia (Bert.) O. Kuntze procedentes de Painel (SC). In: SEMINÁRIO DE PESQUISA DA FLORESTA NACIONAL DE TRÊS BARRAS, 1., 2009, Três Barras. Uso múltiplo e sustentável dos recursos florestais e conservação da natureza: anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2009. 1 CD-ROM. Resumo expandido.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| 5. | | SIMINSKI, A.; RUSCHEL, A. R.; FERREIRA, D. K.; BITTENCOURT, R.; MARIOT, A.; MATTOS, A. G.; SILVA, C. V. da; SILVA, J. Z. da; SCHULTZ, J.; MARQUES, A. da C.; REIS, M. S. dos. Caracterização da cobertura vegetal nativa da Floresta Nacional de Três Barras, SC. In: SEMINÁRIO DE PESQUISA DA FLORESTA NACIONAL DE TRÊS BARRAS, 1., 2009, Três Barras. Uso múltiplo e sustentável dos recursos florestais e conservação da natureza: anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2009. 1 CD-ROM. Resumo expandido.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| 6. | | SIMINSKI, A.; RUSCHEL, A. R.; FERREIRA, D. K.; BITTENCOURT, R.; MARIOT, A.; MATTOS, A. G.; SILVA, C. V. da; SILVA, J. Z. da; SCHULTZ, J.; MARQUES, A. da C.; REIS, M. S. dos. Caracterização da cobertura vegetal nativa da Floresta Nacional de Três Barras, SC. In: SEMINÁRIO DE PESQUISA DA FLORESTA NACIONAL DE TRÊS BARRAS, 1., 2009, Três Barras. Uso múltiplo e sustentável dos recursos florestais e conservação da natureza: anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2009. 1 CD-ROM. Resumo expandido.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
|  |
| Registros recuperados : 6 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
