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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
19/11/2013 |
Data da última atualização: |
05/02/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
UTSUNOMIYA, Y. T.; CARMO, A. S. do; CARVALHEIRO, R.; NEVES, H. H. R.; MATOS, M. C.; ZAVAREZ, L. B.; O'BRIEN, A. M. P.; SÖLKNER, J.; McEWAN, J. C.; COLE, J. B.; TASSEL, C. P. V.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B.; PORTO NETO, L. R.; SONSTEGARD, T. S.; GARCIA, J. F. |
Afiliação: |
YURI T. UTSUNOMIYA, UNESP; ADRIANA S. DO CARMO, UNESP; ROBERTO CARVALHEIRO, GenSys Consultores Associados; HAROLDO H. R. NEVES, UNESP; MÁRCIA C. MATOS, UNESP; LUDMILLA B. ZAVAREZ, UNESP; ANA M. PÉREZ O'BRIEN, University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna; JOHANN SÖLKNER, University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna; JOHN C. McEWAN, Centre for Reproduction and Genomics, AgResearch, Mosgiel, New Zealand; JOHN B. COLE, ARS-USDA, USA; CURTIS P. VAN TASSEL, ARS-USDA, USA; FLÁVIO S. SCHENKEL, University of Guelph, Canada; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; LAERCIO R. PORTO NETO, University of Queensland, Australia; University of New England, Australia; TAD S. SONSTEGARD, ARS-USDA, USA; JOSÉ F. GARCIA, UNESP. |
Título: |
Genome-wide association study for birth weight in Nellore cattle points to previously described orthologous genes affecting human and bovine height. |
Ano de publicação: |
2013 |
Fonte/Imprenta: |
BMC Genetics, London, v. 14, article 52, 2013. |
DOI: |
https://doi.org/10.1186/1471-2156-14-52 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Background - Birth weight (BW) is an economically important trait in beef cattle, and is associated with growth- and stature-related traits and calving difficulty. One region of the cattle genome, located on Bos primigenius taurus chromosome 14 (BTA14), has been previously shown to be associated with stature by multiple independent studies, and contains orthologous genes affecting human height. A genome-wide association study (GWAS) for BW in Brazilian Nellore cattle (Bos primigenius indicus) was performed using estimated breeding values (EBVs) of 654 progeny-tested bulls genotyped for over 777,000 single nucleotide polymorphisms (SNPs). Results - The most significant SNP (rs133012258, PGC = 1.34 × 10-9), located at BTA14:25376827, explained 4.62% of the variance in BW EBVs. The surrounding 1 Mb region presented high identity with human, pig and mouse autosomes 8, 4 and 4, respectively, and contains the orthologous height genes PLAG1, CHCHD7, MOS, RPS20, LYN, RDHE2 (SDR16C5) and PENK. The region also overlapped 28 quantitative trait loci (QTLs) previously reported in literature by linkage mapping studies in cattle, including QTLs for birth weight, mature height, carcass weight, stature, pre-weaning average daily gain, calving ease, and gestation length. Conclusions- This study presents the first GWAS applying a high-density SNP panel to identify putative chromosome regions affecting birth weight in Nellore cattle. These results suggest that the QTLs on BTA14 associated with body size in taurine cattle (Bos primigenius taurus) also affect birth weight and size in zebu cattle (Bos primigenius indicus). MenosBackground - Birth weight (BW) is an economically important trait in beef cattle, and is associated with growth- and stature-related traits and calving difficulty. One region of the cattle genome, located on Bos primigenius taurus chromosome 14 (BTA14), has been previously shown to be associated with stature by multiple independent studies, and contains orthologous genes affecting human height. A genome-wide association study (GWAS) for BW in Brazilian Nellore cattle (Bos primigenius indicus) was performed using estimated breeding values (EBVs) of 654 progeny-tested bulls genotyped for over 777,000 single nucleotide polymorphisms (SNPs). Results - The most significant SNP (rs133012258, PGC = 1.34 × 10-9), located at BTA14:25376827, explained 4.62% of the variance in BW EBVs. The surrounding 1 Mb region presented high identity with human, pig and mouse autosomes 8, 4 and 4, respectively, and contains the orthologous height genes PLAG1, CHCHD7, MOS, RPS20, LYN, RDHE2 (SDR16C5) and PENK. The region also overlapped 28 quantitative trait loci (QTLs) previously reported in literature by linkage mapping studies in cattle, including QTLs for birth weight, mature height, carcass weight, stature, pre-weaning average daily gain, calving ease, and gestation length. Conclusions- This study presents the first GWAS applying a high-density SNP panel to identify putative chromosome regions affecting birth weight in Nellore cattle. These results suggest that the QTLs on BTA14 associated with ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Bos primigenius indicus; GWAS; Nellore cattle; Stature. |
Thesaurus Nal: |
birth weight. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
Marc: |
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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ID |
Origem |
Tipo/Formato |
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URL |
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Registros recuperados : 16 | |
7. |  | SOSA-GÓMEZ, D. R.; ROSADO NETO, G.; SILVA, J. J.; BORGES, E.; CORONEL, N.; SALAS, H. Sternechus pinguis, a missidentification of Sternechus subsignatus (Coleoptera: Curculionidae) in Argentina. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 20., 2004, Gramado. Programa e resumos. Gramado: Sociedade Entomológica do Brasil, 2004. p. 635.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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8. |  | SOSA-GOMEZ, D. R.; CORONEL, N.; BINNECK, E.; ZUCCHI, M. I.; ROSADO-NETO, G. RAPD and mitochondrial DNA analysis of the soybean stalk weevil, Sternechus subsignatus (Coleoptera: Curculionidae. Bulletin of Entomological Research, Cambridge, v. 98, n. 5, p. 475-481, June 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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10. |  | SANTANA, D. L. Q.; PASSOS, E. E. M.; WARWICK, D. R. N.; MOURA, J. I. L.; ROSADO NETO, G. H. Ocorrência de Plectrophoroides incertus voss (Coleoptera: Curculionidae) em coqueiro no Estado do Sergipe. Anais da Sociedade Entomológica do Brasil, Jaboticabal, v. 25, n. 1, p. 145-146, 1996.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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12. |  | ANDRADE, D. P. de; QUEIROZ, E. C. de; ROSADO-NETO, G. H.; SANTOS, A. F. dos; QUEIROZ, D. L. de. Ocorrência de três espécies de coleoptera do gênero Homalinotus (Curculionidae: Molytinae) em pupunha (Bactris gasipaes). In: EVENTO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA FLORESTAS, 8., 2009, Colombo. Anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2009. 1 CD-ROM. (Embrapa Florestas. Documentos, 186). EVINCI. Resumo.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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14. |  | THOMAZ, D. T.; SANTANA, D. L. de Q.; ROSADO-NETO, G. H.; MEDEIROS, A. C. de S.; ABREU, D. C. A. de; WINK, C.; ROVEDO, S. F. Herbivoria de insetos (Coleoptera: Curculionidae) em frutos, sementes e plântulas de guaçatonga (Casearia lasiophylla Eichl), na Região Metropolitana de Curitiba, Paraná, Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 21., 2006, Recife. Entomologia: da academia à transferência de tecnologia: resumos. Recife: Sociedade Entomológica do Brasil, 2006. CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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15. |  | MARSARO JÚNIOR, A. L.; PEREIRA, P. R. V. da S.; ROSADO NETO, G. H.; KAMINSKI, P. E.; AGUIAR, R. M. de; OLIVEIRA, L. O. Primeiros registros de Sitophilus linearis Herbst e Lonchophorus chevrolati Gyllenhal (Coleoptera: Curculionidae) para o estado de Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Entomologia: Emparn, 2010. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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16. |  | MARSARO JUNIOR, A. L.; PEREIRA, P. R. V. da S.; ROSADO NETO, G. H.; KAMINSKI, P. E.; AGUIAR, R. M. de; OLIVEIRA, L. O. Primeiros registros de Sitophilus linearis herbst e Lonchophorus chevrolati gyllenhal (Coleoptera: Curculionidae) para o estado de Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Entomologia: Emparn, 2010. 1 CD-ROMTipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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Registros recuperados : 16 | |
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