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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
18/02/2011 |
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Data da última atualização: |
28/02/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
VIDAL, R. O.; MONDEGO, J. M. C.; POT, D.; AMBRÓSIO, A. B.; ANDRADE, A. C.; PEREIRA, L. F. P.; COLOMBO, C. A.; VIEIRA, L. G. E.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G. |
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Afiliação: |
RAMON OLIVEIRA VIDAL, UNICAMP/Instituto de Biologia; JORGE MAURÍCIO COSTA MONDEGO, Instituto Agronômico de Campinas; DAVID POT, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement; ALINNE BATISTA AMBRÓSIO, UNICAMP/Instituto de Biologia; ALAN CARVALHO ANDRADE, CENARGEN; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC; CARLOS AUGUSTO COLOMBO, Instituto Agronômico de Campinas; LUIZ GONZAGA ESTEVES VIEIRA, Instituo Agronômico do Pará; MARCELO FALSARELLA CARAZZOLLE, UNICAMP/Instituto de Biologia; GONÇALO AMARANTE GUIMARÃES PEREIRA, UNICAMP/Instituto de Biologia. |
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Título: |
A high-throughput data mining of single nucleotide polymorphisms in Coffea species expresed sequence tags suggests differential homeologous gene expression in the allotetrapoloid Coffea arabica. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
PLANT PHYSIOLOGY, v. 154, p. 1053-1066. 2010. |
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Páginas: |
1053-1066 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Polyploidization constitutes a common mode of evolution in flowering plants. This event provides the raw material for the divergence of function in homeologous genes, leading to phenotypic novelty that can contribute to the success of polyploids in nature or their selection for use in agriculture. Mounting evidence underlined the existence of homeologous expression biases in polyploid genomes; however, strategies to analyze such transcriptome regulation remained scarce. Important factors regarding homeologous expression biases remain to be explored, such as whether this phenomenon influences specific genes, how paralogs are affected by genome doubling, and what is the importance of the variability of homeologous expression bias to genotype differences. This study reports the expressed sequence tag assembly of the allopolyploid Coffea arabica and one of its direct ancestors, Coffea canephora. The assembly was used for the discovery of single nucleotide polymorphisms through the identification of high-quality discrepancies in overlapped expressed sequence tags and for gene expression information indirectly estimated by the transcript redundancy. Sequence diversity profiles were evaluated within C. arabica (Ca) and C. canephora (Cc) and used to deduce the transcript contribution of the Coffea eugenioides (Ce) ancestor. The assignment of the C. arabica haplotypes to the C. canephora (CaCc) or C. eugenioides (CaCe) ancestral genomes allowed us to analyze gene expression contributions of each subgenome in C. arabica. In silico data were validated by the quantitative polymerase chain reaction and allele-specific combination TaqMAMA-based method. The presence of differential expression of C. arabica homeologous genes and its implications in coffee gene expression, ontology, and physiology are discussed. MenosPolyploidization constitutes a common mode of evolution in flowering plants. This event provides the raw material for the divergence of function in homeologous genes, leading to phenotypic novelty that can contribute to the success of polyploids in nature or their selection for use in agriculture. Mounting evidence underlined the existence of homeologous expression biases in polyploid genomes; however, strategies to analyze such transcriptome regulation remained scarce. Important factors regarding homeologous expression biases remain to be explored, such as whether this phenomenon influences specific genes, how paralogs are affected by genome doubling, and what is the importance of the variability of homeologous expression bias to genotype differences. This study reports the expressed sequence tag assembly of the allopolyploid Coffea arabica and one of its direct ancestors, Coffea canephora. The assembly was used for the discovery of single nucleotide polymorphisms through the identification of high-quality discrepancies in overlapped expressed sequence tags and for gene expression information indirectly estimated by the transcript redundancy. Sequence diversity profiles were evaluated within C. arabica (Ca) and C. canephora (Cc) and used to deduce the transcript contribution of the Coffea eugenioides (Ce) ancestor. The assignment of the C. arabica haplotypes to the C. canephora (CaCc) or C. eugenioides (CaCe) ancestral genomes allowed us to analyze gene expression contribut... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Coffea Arábica. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/29342/1/A-high-throughput.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrossilvipastoril. |
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Data corrente: |
26/01/2018 |
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Data da última atualização: |
29/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
BOURSCHEIDT, M. L. B.; ZANETTE, M. C.; DEVENS, J.; SILVA, D. S. M.; TESK, C. R. M.; DOMICIANO, L. F.; PEREIRA, D. H.; PEDREIRA, B. C. e. |
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Afiliação: |
MAIRA LAÍS BOTH BOURSCHEIDT, UFMT-SINOP; MARÍLIA CRISTINA ZANETTE, UFMT-SINOP; JOSIANE DEVENS, UFMT-SINOP; DÉBORA SAMARA MORAES SILVA, UFMT-SINOP; CÁTIA REGINA MACAGNAN TESK, UFMT-SINOP; LEANDRO FERREIRA DOMICIANO, UFMT-CUIABA; DALTON HENRIQUE PEREIRA, UFMT-SINOP; BRUNO CARNEIRO E PEDREIRA, CPAMT. |
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Título: |
Massa de resíduo e de raiz em pastagens de capim-ipyporã. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPOSIO MATOGROSSENSE DE BOVINOCULTURA DE CORTE, 4., 2017, Cuiabá. Anais... Cuiabá: SIMBOV, 2017. Não paginado. |
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ISSN: |
2447-0368 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
PT-BR: O uso de fertilizantes nitrogenados e a fixação biológica de nitrogênio (FBN) são formas importantes para a reposição de nitrogênio (N) em pastagens. O objetivo com este trabalho foi avaliar a massa de resíduo e de raiz em pastagens de capim-ipyporã sob diferentes aportes nitrogenados. O delineamento foi em blocos completos casualizados com 3 tratamentos e 3 repetições: 1. Pastagens de capim-ipyporã (Brachiaria spp.) sem fertilização mineral de N; 2. Pastagens de capim-ipyporã adubados com 80 kg N.ha-1.ano-1; 3. Pastagens de capim-ipyporã em consórcio com amendoim forrageiro (Arachis pintoi cv. Mandobi). No verão de 2017, após o corte do capim a 12 cm do solo, foram coletadas duas touceiras por unidade experimental para quantificação de massa de resíduo e raiz do dossel forrageiro. Observou-se que o capim-ipyporã com fertilizante mineral e em consórcio com amendoim forrageiro não diferiram entre si, contudo apresentaram maior massa de raiz (1.444 kg MS.ha-1, respectivamente) quando comparado as pastagens sem fertilização (1.021 kg MS.ha-1). Na avaliação de massa de resíduo, capim-ipyporã com fertilização nitrogenada não diferiu daquele em consórcio com amendoim forrageiro, porém foi maior (7.084 kg MS.ha-1) quando comparado aquele sem aporte nitrogenado (4.641 kg MS.ha- 1). Os aportes nitrogenados por fertilização mineral e consórcio com amendoim forrageiro cv. Mandobi proporcionaram maior massa de raiz e resíduo quando comparado ao capim-ipyporã sem aporte de nitrogênio. | EN: The use of nitrogen fertilizers and biological nitrogen fixation (BNF) are important ways to replenish nitrogen (N) in pastures. The objective with this work was to evaluate root and stubble mass in pastures of Ipyporã grass under different nitrogenous inputs. The design was in a randomized complete block with 3 treatments and 3 replicates: 1. Pastures of Ipyporã grass (Brachiaria spp.) without N fertilization; 2. Pastures of Ipyporã grass fertilized with 80 kg N.ha-1.ano-1; 3. Pastures of Ipyporã grass in consortium with forage peanuts (Arachis pintoi cv. Mandobi). In the summer of 2017, in a post-harvest (12 cm from the soil), two tussocks were collected per experimental unit to quantify the root and stubble mass in the pastures. It was observed that Ipyporã grass with mineral fertilizer and in consortium with forage peanut did not differ among them, however they presented a larger root mass (1.444 kg DM.ha-1, respectively) when compared to the no fertilizer pastures (1.021 kg DM.ha-1). In the evaluation of stubble mass, Ipyporã grass with nitrogen fertilization did not differ from that in a consortium with forage peanuts, but was higher (7.084 kg DM.ha-1) when compared to that without nitrogen fertilization (4.641 kg DM.ha-1). The nitrogen fertilization by mineral fertilization and consortium with forage peanut cv. Mandobi provided higher root and stubble mass when compared to Ipyporã grass without nitrogen input. MenosPT-BR: O uso de fertilizantes nitrogenados e a fixação biológica de nitrogênio (FBN) são formas importantes para a reposição de nitrogênio (N) em pastagens. O objetivo com este trabalho foi avaliar a massa de resíduo e de raiz em pastagens de capim-ipyporã sob diferentes aportes nitrogenados. O delineamento foi em blocos completos casualizados com 3 tratamentos e 3 repetições: 1. Pastagens de capim-ipyporã (Brachiaria spp.) sem fertilização mineral de N; 2. Pastagens de capim-ipyporã adubados com 80 kg N.ha-1.ano-1; 3. Pastagens de capim-ipyporã em consórcio com amendoim forrageiro (Arachis pintoi cv. Mandobi). No verão de 2017, após o corte do capim a 12 cm do solo, foram coletadas duas touceiras por unidade experimental para quantificação de massa de resíduo e raiz do dossel forrageiro. Observou-se que o capim-ipyporã com fertilizante mineral e em consórcio com amendoim forrageiro não diferiram entre si, contudo apresentaram maior massa de raiz (1.444 kg MS.ha-1, respectivamente) quando comparado as pastagens sem fertilização (1.021 kg MS.ha-1). Na avaliação de massa de resíduo, capim-ipyporã com fertilização nitrogenada não diferiu daquele em consórcio com amendoim forrageiro, porém foi maior (7.084 kg MS.ha-1) quando comparado aquele sem aporte nitrogenado (4.641 kg MS.ha- 1). Os aportes nitrogenados por fertilização mineral e consórcio com amendoim forrageiro cv. Mandobi proporcionaram maior massa de raiz e resíduo quando comparado ao capim-ipyporã sem aporte de nitrogê... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Amendoim forrageiro; Consórcio; FBN; Mandobi; Peanut forage. |
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Thesagro: |
Amendoim; Fixação de Nitrogênio. |
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Thesaurus NAL: |
Peanuts. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/171728/1/2017-cpamt-bruno-pedreira-massa-residuo-raiz-capim-ipypora.pdf
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Marc: |
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520 $aPT-BR: O uso de fertilizantes nitrogenados e a fixação biológica de nitrogênio (FBN) são formas importantes para a reposição de nitrogênio (N) em pastagens. O objetivo com este trabalho foi avaliar a massa de resíduo e de raiz em pastagens de capim-ipyporã sob diferentes aportes nitrogenados. O delineamento foi em blocos completos casualizados com 3 tratamentos e 3 repetições: 1. Pastagens de capim-ipyporã (Brachiaria spp.) sem fertilização mineral de N; 2. Pastagens de capim-ipyporã adubados com 80 kg N.ha-1.ano-1; 3. Pastagens de capim-ipyporã em consórcio com amendoim forrageiro (Arachis pintoi cv. Mandobi). No verão de 2017, após o corte do capim a 12 cm do solo, foram coletadas duas touceiras por unidade experimental para quantificação de massa de resíduo e raiz do dossel forrageiro. Observou-se que o capim-ipyporã com fertilizante mineral e em consórcio com amendoim forrageiro não diferiram entre si, contudo apresentaram maior massa de raiz (1.444 kg MS.ha-1, respectivamente) quando comparado as pastagens sem fertilização (1.021 kg MS.ha-1). Na avaliação de massa de resíduo, capim-ipyporã com fertilização nitrogenada não diferiu daquele em consórcio com amendoim forrageiro, porém foi maior (7.084 kg MS.ha-1) quando comparado aquele sem aporte nitrogenado (4.641 kg MS.ha- 1). Os aportes nitrogenados por fertilização mineral e consórcio com amendoim forrageiro cv. Mandobi proporcionaram maior massa de raiz e resíduo quando comparado ao capim-ipyporã sem aporte de nitrogênio. | EN: The use of nitrogen fertilizers and biological nitrogen fixation (BNF) are important ways to replenish nitrogen (N) in pastures. The objective with this work was to evaluate root and stubble mass in pastures of Ipyporã grass under different nitrogenous inputs. The design was in a randomized complete block with 3 treatments and 3 replicates: 1. Pastures of Ipyporã grass (Brachiaria spp.) without N fertilization; 2. Pastures of Ipyporã grass fertilized with 80 kg N.ha-1.ano-1; 3. Pastures of Ipyporã grass in consortium with forage peanuts (Arachis pintoi cv. Mandobi). In the summer of 2017, in a post-harvest (12 cm from the soil), two tussocks were collected per experimental unit to quantify the root and stubble mass in the pastures. It was observed that Ipyporã grass with mineral fertilizer and in consortium with forage peanut did not differ among them, however they presented a larger root mass (1.444 kg DM.ha-1, respectively) when compared to the no fertilizer pastures (1.021 kg DM.ha-1). In the evaluation of stubble mass, Ipyporã grass with nitrogen fertilization did not differ from that in a consortium with forage peanuts, but was higher (7.084 kg DM.ha-1) when compared to that without nitrogen fertilization (4.641 kg DM.ha-1). The nitrogen fertilization by mineral fertilization and consortium with forage peanut cv. Mandobi provided higher root and stubble mass when compared to Ipyporã grass without nitrogen input.
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700 1 $aPEDREIRA, B. C. e
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Agrossilvipastoril (CPAMT) |
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