| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
|
Data corrente: |
24/09/2018 |
|
Data da última atualização: |
05/02/2019 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
OLIVEIRA, A. A. de; PASTINA, M. M.; SOUZA, V. F. de; PARRELLA, R. A. da C.; NODA, R. W.; SIMEONE, M. L. F.; SCHAFFERT, R. E.; MAGALHAES, J. V. de; DAMASCENO, C. M. B.; MARGARIDO, G. R. A. |
|
Afiliação: |
Amanda Avelar de Oliveira; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS; Vander Filipe de Souza; RAFAEL AUGUSTO DA COSTA PARRELLA, CNPMS; ROBERTO WILLIANS NODA, CNPMS; MARIA LUCIA FERREIRA SIMEONE, CNPMS; ROBERT EUGENE SCHAFFERT, CNPMS; JURANDIR VIEIRA DE MAGALHAES, CNPMS; CYNTHIA MARIA BORGES DAMASCENO, CNPMS; Gabriel Rodrigues Alves Margarido. |
|
Título: |
Genomic prediction applied to high-biomass sorghum for bioenergy production. |
|
Ano de publicação: |
2018 |
|
Fonte/Imprenta: |
Molecular Breeding, v. 38, n. 49, p. 1-16, 2018. |
|
DOI: |
10.1007/s11032-018-0802-5 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
The increasing cost of energy and finite oil and gas reserves have created a need to develop alternative fuels from renewable sources. Due to its abiotic stress tolerance and annual cultivation, high-biomass sorghum (Sorghum bicolor L. Moench) shows potential as a bioenergy crop. Genomic selection is a useful tool for accelerating genetic gains and could restructure plant breeding programs by enabling early selection and reducing breeding cycle duration. This work aimed at predicting breeding values via genomic selection models for 200 sorghum genotypes comprising landrace accessions and breeding lines from biomass and saccharine groups. These genotypes were divided into two sub-panels, according to breeding purpose. We evaluated the following phenotypic biomass traits: days to flowering, plant height, fresh and dry matter yield, and fiber, cellulose, hemicellulose, and lignin proportions. Genotyping by sequencing yielded more than 258,000 single-nucleotide polymorphism markers, which revealed population structure between subpanels. We then fitted and compared genomic selection models BayesA, BayesB, BayesC?, BayesLasso, Bayes Ridge Regression and random regression best linear unbiased predictor. The resulting predictive abilities varied little between the different models, but substantially between traits. Different scenarios of prediction showed the potential of using genomic selection results between sub-panels and years, although the genotype by environment interaction negatively affected accuracies. Functional enrichment analyses performed with the marker-predicted effects suggested several interesting associations, with potential for revealing biological processes relevant to the studied quantitative traits. This work shows that genomic selection can be successfully applied in biomass sorghum breeding programs. MenosThe increasing cost of energy and finite oil and gas reserves have created a need to develop alternative fuels from renewable sources. Due to its abiotic stress tolerance and annual cultivation, high-biomass sorghum (Sorghum bicolor L. Moench) shows potential as a bioenergy crop. Genomic selection is a useful tool for accelerating genetic gains and could restructure plant breeding programs by enabling early selection and reducing breeding cycle duration. This work aimed at predicting breeding values via genomic selection models for 200 sorghum genotypes comprising landrace accessions and breeding lines from biomass and saccharine groups. These genotypes were divided into two sub-panels, according to breeding purpose. We evaluated the following phenotypic biomass traits: days to flowering, plant height, fresh and dry matter yield, and fiber, cellulose, hemicellulose, and lignin proportions. Genotyping by sequencing yielded more than 258,000 single-nucleotide polymorphism markers, which revealed population structure between subpanels. We then fitted and compared genomic selection models BayesA, BayesB, BayesC?, BayesLasso, Bayes Ridge Regression and random regression best linear unbiased predictor. The resulting predictive abilities varied little between the different models, but substantially between traits. Different scenarios of prediction showed the potential of using genomic selection results between sub-panels and years, although the genotype by environment interaction n... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Genotipagem. |
|
Thesagro: |
Bioenergia; Biomassa. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/183412/1/Genomic-prediction.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02655naa a2200277 a 4500
001 2096210
005 2019-02-05
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1007/s11032-018-0802-5$2DOI
100 1 $aOLIVEIRA, A. A. de
245 $aGenomic prediction applied to high-biomass sorghum for bioenergy production.$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aThe increasing cost of energy and finite oil and gas reserves have created a need to develop alternative fuels from renewable sources. Due to its abiotic stress tolerance and annual cultivation, high-biomass sorghum (Sorghum bicolor L. Moench) shows potential as a bioenergy crop. Genomic selection is a useful tool for accelerating genetic gains and could restructure plant breeding programs by enabling early selection and reducing breeding cycle duration. This work aimed at predicting breeding values via genomic selection models for 200 sorghum genotypes comprising landrace accessions and breeding lines from biomass and saccharine groups. These genotypes were divided into two sub-panels, according to breeding purpose. We evaluated the following phenotypic biomass traits: days to flowering, plant height, fresh and dry matter yield, and fiber, cellulose, hemicellulose, and lignin proportions. Genotyping by sequencing yielded more than 258,000 single-nucleotide polymorphism markers, which revealed population structure between subpanels. We then fitted and compared genomic selection models BayesA, BayesB, BayesC?, BayesLasso, Bayes Ridge Regression and random regression best linear unbiased predictor. The resulting predictive abilities varied little between the different models, but substantially between traits. Different scenarios of prediction showed the potential of using genomic selection results between sub-panels and years, although the genotype by environment interaction negatively affected accuracies. Functional enrichment analyses performed with the marker-predicted effects suggested several interesting associations, with potential for revealing biological processes relevant to the studied quantitative traits. This work shows that genomic selection can be successfully applied in biomass sorghum breeding programs.
650 $aBioenergia
650 $aBiomassa
653 $aGenotipagem
700 1 $aPASTINA, M. M.
700 1 $aSOUZA, V. F. de
700 1 $aPARRELLA, R. A. da C.
700 1 $aNODA, R. W.
700 1 $aSIMEONE, M. L. F.
700 1 $aSCHAFFERT, R. E.
700 1 $aMAGALHAES, J. V. de
700 1 $aDAMASCENO, C. M. B.
700 1 $aMARGARIDO, G. R. A.
773 $tMolecular Breeding$gv. 38, n. 49, p. 1-16, 2018.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 63 | |
| 21. |  | TORRES, T. B. C. F.; PARRELLA, R. A. da C.; PARRELLA, N. L. D.; PORTUGAL, A. F.; SOUZA, V. F. de; SCHAFFERT, R. E. Caracterização de cultivares de sorgo sacarino no norte de Minas Gerais visando a produção de etanol. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 5., 2013, Sete Lagoas. [Trabalhos apresentados]. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2013. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
| 22. | | SOUZA, R. S. e; SOUZA, V. F. de; MACHADO, P. H. B.; SILVA, M. J. da; PARRELLA, R. A.; PARRELLA, N. N. L. D.; SCHAFFERT, R. E. Curvas de maturação de cultivares de sorgo sacarino. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE BIOENERGIA, 9., 2014. São Paulo. Anais... Curitiba: Porths Eventos, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 23. | | SOUZA, L. F. de; PARRELLA, R. A. da C.; SANTOS, C. V. dos; SOUZA, V. F. de; PARRELLA, N. N. L. D.; SCHAFFERT, R. E. Desempenho produtivo de híbridos de sorgo biomassa em diferentes ambientes. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 31., 2016, Bento Gonçalves. Milho e sorgo: inovações, mercados e segurança alimentar: anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2016.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 24. | | CARDINALI, A. F.; RODRIGUES, J. A. S.; RESENDE, A. V. de; SOUZA, V. F. de; ANDRADE, L. C. de; ABREU, A. L. de. Produtividade de sorgo forrageiro em resposta a níveis de nitrogênio e potássio na adubação de cobertura. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 25. | | MOURA, S. M.; FRANÇA, A. E. D. de; SILVA, M. J. da; SOUZA, V. F. de; PARRELLA, R. A. da C.; SCHAFFERT, R. E. Estudo do perfilho do sorgo sacarino em diferentes densidades de semeadura. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 26. | | SANTOS, A. de O.; VON PINHO, R. G.; SOUZA, V. F. de; GUIMARAES, L. J. M.; BALESTRE, M.; PIRES, L. P. M.; SILVA, C. P. da. Grain yield, anthesis-silking interval and drought tolerance indices of tropical maize hybrids. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 20, n. 1, e176020110, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 27. | | SILVA, M. J. da; FRANÇA, A. E. D.; PARRELLA, R. A. da C.; OLIVEIRA, P. C. de; SOUZA, V. F. de; MOURA, S. M. Estimativa da diversidade genética de sorgo sacarino via descritores morfo-agronômicos. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 28. | | SOUZA, V. F. de; PARRELLA, R. A. da C.; MENEZES, C. B. de; TARDIN, F. D.; MAY, A.; EMYGDIO, B. M.; DAMASCENO, C. M. B.; SCHAFFERT, R. E. Influência da correção de estande na adaptabilidade e estabilidade de sorgo biomassa. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 13, n. 3, p. 371-381, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 29. | | FRANÇA, A. E. D. de; PARRELLA, R. A. da C.; SOUZA, V. F. de; BASTOS, G. Q.; NUNES, J. A. R.; SCHAFFERT, R. E. Seleção simultânea em progênies de sorgo-sacarino por meio de índices de seleção. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 51, n. 10, p. 1737-1743, out. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 30. | | SILVA, K. J. da; MENEZES, C. B. de; TARDIN, F. D.; EMYGDIO, B. M.; SOUZA, V. F. de; CARVALHO, G. A. de; SILVA, M. J. da. Seleção de hibridos de sorgo granífero cultivados no verão em três localidades. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 12, n. 1, p. 44-53, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 31. | | SANTOS, C. V. dos; PARRELLA, R. A. da C.; SCHAFFERT, R. E.; SOUZA, V. F. de; SILVA, R. A. da; OLIVEIRA, P. C. de; SILVA, K. J. da; BERNARDINO, K. da C. Avaliação de correlações genotípicas de cultivares de sorgo sacarino, em ensaio de valor de cultivo e uso. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE BIOENERGIA, 9., 2014. São Paulo. Anais... Curitiba: Porths Eventos, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 32. | | SILVA, K. J. da; SILVA, C. B. da; TARDIN, F. D.; GUIMARAES, C. M.; SILVA, A. R. da; SOUZA, V. F. de; SANTOS, C. V. dos; MOURAO, C. S.; SANTOS, G. M. dos; MACHADO, P. H. B.; OLIVEIRA, M. S. Avaliação do potencial agronômico de híbridos de sorgo granífero para tolerância à seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013. p. 3370-3372.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 33. | | SILVA, R. A. da; PARRELLA, R. A. da C.; SOUZA, V. F. de; SANTOS, C. V. dos; RIBEIRO, P. C. de O.; SILVA, M. J. da; BERNARDINO, K. da C.; SCHAFFERT, R. E.; RABELO, M. M.; OLIVEIRA, M. S. de. Avaliação do desempenho agronômico de híbridos experimentais de sorgo biomassa. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE BIOENERGIA, 9., 2014. São Paulo. Anais... Curitiba: Porths Eventos, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 34. | | RABELO, M. M.; PARRELLA, R. A. da C.; NETTO, D. A. M.; SCHAFFERT, R. E.; SOUZA, V. F. de; FRANÇA, A. E. D.; SILVA, M. J. da; OLIVEIRA, M. S. Avaliação de sorgo biomassa visando a produção de bioenergia. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE BIOENERGIA, 9., 2014. São Paulo. Anais... Curitiba: Porths Eventos, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 35. | | SOUZA, V. F. de; SILVA, M. J. da; FRANÇA, A. E. D.; OLIVEIRA, P. C. de; SOUZA, R. S. e; BERNARDINO, K. da C.; PARRELLA, R. A. da C.; DAMASCENO, C. M. B.; PASTINA, M. M.; SCHAFFERT, R. E. Adaptabilidade e estabilidade de cultivares de sorgo sacarino via modelos mistos. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE BIOENERGIA, 9., 2014. São Paulo. Anais... Curitiba: Porths Eventos, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 36. | | SILVA, K. J. da; SOUZA, V. F. de; SILVA, M. J. da; TARDIN, F. D.; MENEZES, C. B. de; SANTOS, C. V. dos; COSTA, R. K.; TORRES, T. B. C. F.; MOURÃO, c. s.; PEREIRA, G. de A. Capacidade combinatória de linhagens e potencial agronômico de híbridos de sorgo granífero. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovação na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: ABMS, 2012. p. 2915-2921. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 37. | | TORRES, T. B. C. F.; PARRELLA, R. A. da C.; PARRELLA, N. N. L. D.; PORTUGAL, A. F.; SOUZA, V. F. de; SCHAFFERT, R. E.; SILVA, K. J. da; SANTOS, C. V. dos. Caracterização de cultivares de sorgo sacarino no Norte de Minas Gerais visando a produção de etanol. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovações na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2012. p. 2942-2948. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 38. | | BERNARDINO, K. da C.; SOUZA, V. F. de; CARVALHO JUNIOR, G. A. de; MOURAO, C. S.; SILVA, K. J. da; SANTOS, C. V. dos; COSTA, R. K.; PARRELLA, R. A. da C.; SCHAFFERT, R. E. Caracterização de cultivares de sorgo sacarino visando a produção de etanol de primeira e segunda geração. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovações na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2012. p. 3169-3175. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 39. | | SILVA, R. A. da; OLIVEIRA, I. C. M.; SOUZA, V. F. de; CARNEIRO, V. A.; PARRELLA, R. A. da C.; OLIVEIRA, N. A. de; PARRELLA, N. N. L. D. Desempenho produtivo de híbridos de sorgo biomassa em diferentes ambientes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 40. | | SENA, F. M.; MOURA, S. M.; SANTOS, C. V. dos; ABREU, A. L. de; ANDRADE, L. C. de; FERREIRA, A. G.; SOUZA, V. F. de; PARRELLA, R. A. da C.; MENEZES, C. B. de; SCHAFFERT, R. E. Distribuição e acumulação de açúcares nos entrenós de dois genótipos de sorgo sacarino sensíveis ao fotoperiodismo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013. p. 3417-3420.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| Registros recuperados : 63 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
