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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
25/11/2019 |
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Data da última atualização: |
23/08/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DIAS, K. O. G.; PIEPHO, H. P.; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARAES, P. E. de O.; PARENTONI, S. N.; PINTO, M. de O.; NODA, R. W.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T.; GARCIA, A. A. F.; PASTINA, M. M. |
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Afiliação: |
Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz; University of Hohenheim; LAURO JOSE MOREIRA GUIMARAES, CNPMS; PAULO EVARISTO DE O GUIMARAES, CNPMS; SIDNEY NETTO PARENTONI, CNPMS; MARCOS DE OLIVEIRA PINTO, CNPMS; ROBERTO WILLIANS NODA, CNPMS; JURANDIR VIEIRA DE MAGALHAES, CNPMS; CLAUDIA TEIXEIRA GUIMARAES, CNPMS; Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS. |
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Título: |
Novel strategies for genomic prediction of untested single-cross maize hybrids using unbalanced historical data. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Theoretical and Applied Genetics, v. 133, p. 443-455, 2020. |
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DOI: |
10.1007/s00122-019-03475-1 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Publicado online em 22 nov. 2019. |
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Conteúdo: |
Predicting the performance of untested single-cross hybrids through genomic prediction (GP) is highly desirable to increase genetic gain. Here, we evaluate the predictive ability (PA) of novel genomic strategies to predict single-cross maize hybrids using an unbalanced historical dataset of a tropical breeding program. Field data comprised 949 single-cross hybrids evaluated from 2006 to 2013, representing eight breeding cycles. Hybrid genotypes were inferred based on their parents? genotypes (inbred lines) using single-nucleotide polymorphism markers obtained via genotyping-by-sequencing. GP analyses were fitted using genomic best linear unbiased prediction via a stage-wise approach, considering two distinct cross-validation schemes. Results highlight the importance of taking into account the uncertainty regarding the adjusted means at each step of a stage-wise analysis, due to the highly unbalanced data structure and the expected heterogeneity of variances across years and locations of a commercial breeding program. Further, an increase in the size of the training set was not always advantageous even in the same breeding program. The use of the two cycles preceding predictions achieved optimal PA of untested single-cross hybrids in a forward prediction scenario, which could be used to replace the first step of field screening. Finally, in addition to the practical and theoretical results applied to maize hybrid breeding programs, the stage-wise analysis performed in this study may be applied to any crop historical unbalanced data. MenosPredicting the performance of untested single-cross hybrids through genomic prediction (GP) is highly desirable to increase genetic gain. Here, we evaluate the predictive ability (PA) of novel genomic strategies to predict single-cross maize hybrids using an unbalanced historical dataset of a tropical breeding program. Field data comprised 949 single-cross hybrids evaluated from 2006 to 2013, representing eight breeding cycles. Hybrid genotypes were inferred based on their parents? genotypes (inbred lines) using single-nucleotide polymorphism markers obtained via genotyping-by-sequencing. GP analyses were fitted using genomic best linear unbiased prediction via a stage-wise approach, considering two distinct cross-validation schemes. Results highlight the importance of taking into account the uncertainty regarding the adjusted means at each step of a stage-wise analysis, due to the highly unbalanced data structure and the expected heterogeneity of variances across years and locations of a commercial breeding program. Further, an increase in the size of the training set was not always advantageous even in the same breeding program. The use of the two cycles preceding predictions achieved optimal PA of untested single-cross hybrids in a forward prediction scenario, which could be used to replace the first step of field screening. Finally, in addition to the practical and theoretical results applied to maize hybrid breeding programs, the stage-wise analysis performed in this st... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Genoma; Hibrido; Melhoramento Vegetal; Milho. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/215380/1/Novel-strategies.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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| Registros recuperados : 171 | |
| 141. |  | GUIMARAES, C. T.; SOUSA, S. M. de; VASCONCELOS, M. J. V. de; BELICUAS, S. N. J.; GOMES, E. A.; SOUZA, F. A. de; PARENTONI, S. N.; SCHAFFERT, R. E.; ALVES, V. M. C.; MAGALHAES, J. V. de. Mecanismos de tolerância ao alumínio e eficiência na aquisição de fósforo. In: SOUZA, F. H. D. de; MATTA, F. de P.; FAVERO, A. P. (Ed.). Construção de ideótipos de gramíneas para usos diversos. Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 103-123.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 142. | | JARDIM, S. N.; LANA, U. G. P.; PAIXÃO, W. M.; ALVES, V. M. C.; SANTOS, F. R.; MAGALHAES, J. V. de; SCHAFFERT, R. E.; PARENTONI, S. N.; GUIMARAES, C. T.; PAIVA, E. Mapping aluminum tolerance QTL in maize. In: GRANTEE CONFERENCE FROM PARTNERSHIPS TO COMMUNITY: THE ARC OF CHANGE IN THE CCRP, 2004, Vaals, The Netherlands. [Proceedings]. [Minneapolis]: The McKnight Foundation, 2004.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 144. | | MAGALHAES, J. V. de; KOCHIAN, L.; LIU, J.; GUIMARAES, C.; LANA, U.; ALVES, V.; WANG, Y.; SCHAFFERT, R. E.; HOEKENGA, O.; PINEROS, M.; SHAFF, J.; KLEIN, P.; CARNEIRO, N.; COELHO, C.; TRICK, H.; CANIATO, F.; KRESOVICH, S.; MITCHELL, S. Positional cloning and association analysis of a mate gene that confers aluminum tolerance in sorghum via the AltSB locus. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 16., 2008, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2008. p. 13.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 145. | | MAGALHAES, J. V. de; LIU, J.; ALVES, V. M. C.; GUIMARAES, C. T.; WANG, Y.; LANA, U. G. de P.; SCHAFFERT, R. E.; KLEIN, P.; HOEKENGA, O.; PINEROS, M.; KOCHIAN, L. Positional cloning and characterization of AltSB, a major aluminum tolerance gene in sorghum: toward the identification of the molecular and physiological basis of allelic effects. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 15., 2007, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 146. | | BERNARDELI, A.; DAMASCENO, C. M. B.; MAGALHAES, J. V. de; SOUZA, V. F. de; MELO, J. de O.; OLIVEIRA, A. A. de; SIMEONE, M. L. F.; BORÉM, A.; SCHAFFERT, R. E.; PARRELLA, R. A. da C.; PASTINA, M. M. Population genomics and molecular breeding of sorghum. In: RAJORA, O. M. (ed.). Population genomics: crop plants, population genomics. Switzerland: Springer Nature, 2022. p. 1-52.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 147. | | PENA, G. C.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, A. A.; CARNEIRO, N. P.; BELICUAS, S. N. J.; MAGALHAES, J. V. de; LANA, U. G. de P.; TINOCO, C. F. da S.; GUIMARAES, C. T. Retrocruzamento assistido por marcadores moleculares para introgressão do gene AltSB em milho. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 4., 2012, Sete Lagoas. [Trabalhos apresentados]. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 148. | | LIVIO, D. F.; FIGUEIREDO JÚNIOR, J. M. M. de; PINTO, M. de O.; MAGALHAES, J. V. de; MENEZES, C. B. de; GUIMARÃES, C. T.; COTA, L. V.; DAMASCENO, C. M. B.; SILVA, D. D. da; SCHAFFERT, R. E. Seleção de fontes de resistência ao míldio, à helmintosporiose e de tolerância ao alumínio em sorgo. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2019. 14 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Documentos, 244).| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 149. | | PARENTONI, S. N.; ALVES, V. M. C.; GAMA, E. E. G. e; COELHO, A. M.; GUIMARAES, C. T.; PACHECO, C. A. P.; MAGALHAES, J. V. de; MEIRELLES, W. F. Seleção para tolerância ao alumínio e eficiência de utilização do fósforo na Embrapa Milho e Sorgo. In: SIMPÓSIO SOBRE ATUALIZAÇÃO EM GENÉTICA E MELHORAMENTO DE PLANTAS, 10., 2006, Lavras. Melhoramento de plantas visando a tolerância a estresses abiótiicos: anais. Lavras: UFLA, 2006. p. 23-28.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 150. | | PALHARES, P. L. S.; LOPES, S. da S.; LANA, U. G. de P.; ALVES, M. de C.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T.; CARNEIRO, A. A.; SOUSA, S. M. de. Superexpressão do gene Phosphorus Starvation Tolerance 1 de arroz (osPSTOL1) em tabaco. Cadernos Saberes, Sete Lagoas, n. 3, p. 106-111, 2017. Trabalhos de conclusão de curso de graduação e trabalhos do mestrado.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 151. | | LOPES, S. da S.; PALHARES, P. L. S.; LANA, U. G. de P.; ALVES, M. de C.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARAES, C. T.; CARNEIRO, A. A.; SOUSA, S. M. de. Superexpressão em tabaco do gene Pstol1 de arroz e de seus homólogos em milho e sorgo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 31., 2016, Bento Gonçalves. Milho e sorgo: inovações, mercados e segurança alimentar: anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2016.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 152. | | GUIMARÃES, C. T.; MAGALHAES, J. V. de; ANDRADE, C. de L. T. de; MENEZES, C. B. de; GUIMARAES, L. J. M.; MAGALHAES, P. C.; OLIVEIRA, A. C. de; MARTINS, M. Tolerância ao alumínio conferida por genes MATE garante estabilidade de produção em híbridos de sorgo e de milho sob deficiência hídrica. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2023. 11 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Circular Técnica, 286).| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 153. | | VASCONCELLOS, R. C. C.; MENDES, F. F.; OLIVEIRA, A. C. de; GUIMARAES, L. J. M.; ALBUQUERQUE, P. E. P. de; PINTO, M. de O.; BARROS, B. de A.; PASTINA, M. M.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T. ZmMATE1 improves grain yield and yield stability in maize cultivated on acid soil. Crop Science, v. 61. n. 5, p. 3497-3506, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 154. | | NODA, R. W.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E. A.; CARNEIRO, N. P.; LANA, U. G. de P.; MAGALHAES, J. V. de; COSTA, M. M. do C.; SILVA, F. R. D.; BRAMMER, S. P.; LÂNGARO, N. C.; CARVALHO, L. J. C. B.; BEVITORI, R.; PURCINO, A. A. C. Aluminum-induced genes in grass species. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 185. AB3C X-meeting 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 155. | | MATONYEI, T. K.; BARROS, B. de A.; GUIMARÃES, R. G. N.; OUMA, E. O.; CHEPROT, R. K.; APOLINÁRIO, L. C.; LIGEYO, D. O.; COSTA, M. B. R.; WERE, B. A.; KISINYO, P. O.; ONKWARE, A. O.; NODA, R. W.; GUDU, S. O.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T. Aluminum tolerance mechanisms in Kenyan maize germplasm are independent from the citrate transporter ZmMATE1. Scientific Reports, v. 10, article 7320, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 156. | | RIBEIRO, A. P.; VINECKY, F.; DUARTE, K. E.; SANTIAGO, T. R.; CASARI, R. A. das C. N.; HELL, A. F.; DIAS, B. B. A.; MARTINS, P. K.; CENTENO, D. da C.; OLIVEIRA, P. A. de; CANÇADO, G. M. de A.; MAGALHAES, J. V. de; KOBAYASHI, A. K.; SOUZA, W. R. de; MOLINARI, H. B. C. Enhanced aluminum tolerance in sugarcane: evaluation of SbMATE overexpression and genome-wide identification of ALMTs in Saccharum spp. BMC Plant Biology, v. 21, p. 1-15, 2021. Article number: 300.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Agroenergia; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 157. | | PARENTONI, S. N.; SOUZA JUNIOR, C. L. de; ALVES, V. M. C.; GAMA, E. E. G. e; COELHO, A. M.; OLIVEIRA, A. C. de; GUIMARAES, P. E. de O.; GUIMARAES, C. T.; VASCONCELOS, M. J. V. de; PACHECO, C. A. P.; MEIRELLES, W. F.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARAES, L. J. M.; SILVA, A. R. da; MENDES, F. F.; SCHAFFERT, R. E. Inheritance and breeding strategies for phosphorus efficiency in tropical maize (Zea mays L.). Maydica, Bergamo, v. 55, n. 1, p. 1-15, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 158. | | DIAS, K. O. das G.; GEZAN, S. A.; GUIMARÃES, C. T.; NAZARIAN, A.; SILVA, L. da C. e; PARENTONI, S. N.; GUIMARAES, P. E. de O.; ANONI, C. de O.; PÁDUA, J. M. V.; PINTO, M. de O.; NODA, R. W.; RIBEIRO, C. A. G.; MAGALHAES, J. V. de; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, J. C. de; GUIMARAES, L. J. M.; PASTINA, M. M. Improving accuracies of genomic predictions for drought tolerance in maize by joint modeling of additive and dominance effects in multi-environment trials. Heredity, London, v. 121, n. 1, p. 24-37, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 159. | | PARENTONI, S. N.; SOUZA JUNIOR, C. L. de; ALVES, V. M. C.; GUIMARAES, C.; COELHO, A. M.; PACHECO, C. A. P.; GUIMARAES, P. E. O.; MEIRELLES, W. F.; GUIMARAES, L. J. M.; SILVA, A. R. da; VASCONCELOS, M. J.; MAGALHAES, J. V. de; OLIVEIRA, A. C.; SCHAFFERT, R. E. Eficiência de aquisição e utilização interna de fósforo em milho tropical: importância relativa e critérios de seleção. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 27.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 3.; WORKSHOP SOBRE MANEJO E ETIOLOGIA DA MANCHA BRANCA DO MILHO, 2008, Londrina. Agroenergia, produção de alimentos e mudanças climáticas: desafios para milho e sorgo: trabalhos e palestras. [Londrina]: IAPAR; [Sete Lagoas]: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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