| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
|
Data corrente: |
14/04/2009 |
|
Data da última atualização: |
30/05/2018 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
COELHO, M. R. R.; MARRIEL, I. E.; JENKINS, S. N.; LANYON, C. V.; SELDIN, L.; O'DONNELL, A. G. |
|
Afiliação: |
Márcia R. R. Coelho, UFRJ; IVANILDO EVODIO MARRIEL, CNPMS; Sasha N. Jenkins, Newcastle University; Clare V. Lanyon, Newcastle University; Lucy Seldin, UFRJ; Anthony G. O'Donnell, Newcastle University. |
|
Título: |
Molecular detection and quantification of nifH gene sequences in the rhizosphere of sorghum (Sorghum bicolor) sown with two levels of nitrogen fertilizer. |
|
Ano de publicação: |
2009 |
|
Fonte/Imprenta: |
Applied Soil Ecology, Amsterdam, v. 42, n. 1, p. 48-53, 2009. |
|
DOI: |
10.1016/j.apsoil.2009.01.010 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and SYBR Green I quantitative real-time PCR (qPCR) approaches were used to assess respectively the molecular diversity and the quantity of the nifH gene sequences in the rhizospheres of two cultivars of sorghum sown in Cerrado soil with contrasting levels of nitrogen fertilizer. DGGE fingerprinting showed that for both cultivars the presumptive nitrogen-fixing populations in the rhizospheres were more diverse than in bulk soil. Sequencing of nifH gene fragments obtained from DGGE bands revealed that members of the order Rhizobiales were prevalent among the dominant diazotrophs. Discriminant analysis of DGGE profiles resulted into three groups formed by (i) cultivar BRS 308 sown with high level of nitrogen, (ii) cultivar BRS 308 sown with low level of nitrogen and cultivar BRS 310 sown either with low or high levels of nitrogen and (iii) bulk soil, showing that the nitrogen fertilization influenced the nifH gene sequence diversity only in the rhizosphere of cultivar BRS 308. When the quantity of the nifH gene sequences was determined by q-PCR, 2.4 x105 to 1.3 x 107 copies/g of soil were detected. The highest number of nifH gene copies was observed in the rhizosphere of cultivar BRS 308 treated with low amount of fertilizer, and a reduction in nifH density was observed in the rhizospheres of both sorghum cultivars when high levels of nitrogen were applied. Thus, both the amount of nitrogen fertilizer and the cultivar are important factors influencing the structure and amount of diazotrophs in sorghum. MenosDenaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and SYBR Green I quantitative real-time PCR (qPCR) approaches were used to assess respectively the molecular diversity and the quantity of the nifH gene sequences in the rhizospheres of two cultivars of sorghum sown in Cerrado soil with contrasting levels of nitrogen fertilizer. DGGE fingerprinting showed that for both cultivars the presumptive nitrogen-fixing populations in the rhizospheres were more diverse than in bulk soil. Sequencing of nifH gene fragments obtained from DGGE bands revealed that members of the order Rhizobiales were prevalent among the dominant diazotrophs. Discriminant analysis of DGGE profiles resulted into three groups formed by (i) cultivar BRS 308 sown with high level of nitrogen, (ii) cultivar BRS 308 sown with low level of nitrogen and cultivar BRS 310 sown either with low or high levels of nitrogen and (iii) bulk soil, showing that the nitrogen fertilization influenced the nifH gene sequence diversity only in the rhizosphere of cultivar BRS 308. When the quantity of the nifH gene sequences was determined by q-PCR, 2.4 x105 to 1.3 x 107 copies/g of soil were detected. The highest number of nifH gene copies was observed in the rhizosphere of cultivar BRS 308 treated with low amount of fertilizer, and a reduction in nifH density was observed in the rhizospheres of both sorghum cultivars when high levels of nitrogen were applied. Thus, both the amount of nitrogen fertilizer and the cultivar are important... Mostrar Tudo |
|
Thesagro: |
Sorgo. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/53597/1/Molecular-detection.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02260naa a2200205 a 4500
001 1491948
005 2018-05-30
008 2009 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1016/j.apsoil.2009.01.010$2DOI
100 1 $aCOELHO, M. R. R.
245 $aMolecular detection and quantification of nifH gene sequences in the rhizosphere of sorghum (Sorghum bicolor) sown with two levels of nitrogen fertilizer.$h[electronic resource]
260 $c2009
520 $aDenaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and SYBR Green I quantitative real-time PCR (qPCR) approaches were used to assess respectively the molecular diversity and the quantity of the nifH gene sequences in the rhizospheres of two cultivars of sorghum sown in Cerrado soil with contrasting levels of nitrogen fertilizer. DGGE fingerprinting showed that for both cultivars the presumptive nitrogen-fixing populations in the rhizospheres were more diverse than in bulk soil. Sequencing of nifH gene fragments obtained from DGGE bands revealed that members of the order Rhizobiales were prevalent among the dominant diazotrophs. Discriminant analysis of DGGE profiles resulted into three groups formed by (i) cultivar BRS 308 sown with high level of nitrogen, (ii) cultivar BRS 308 sown with low level of nitrogen and cultivar BRS 310 sown either with low or high levels of nitrogen and (iii) bulk soil, showing that the nitrogen fertilization influenced the nifH gene sequence diversity only in the rhizosphere of cultivar BRS 308. When the quantity of the nifH gene sequences was determined by q-PCR, 2.4 x105 to 1.3 x 107 copies/g of soil were detected. The highest number of nifH gene copies was observed in the rhizosphere of cultivar BRS 308 treated with low amount of fertilizer, and a reduction in nifH density was observed in the rhizospheres of both sorghum cultivars when high levels of nitrogen were applied. Thus, both the amount of nitrogen fertilizer and the cultivar are important factors influencing the structure and amount of diazotrophs in sorghum.
650 $aSorgo
700 1 $aMARRIEL, I. E.
700 1 $aJENKINS, S. N.
700 1 $aLANYON, C. V.
700 1 $aSELDIN, L.
700 1 $aO'DONNELL, A. G.
773 $tApplied Soil Ecology, Amsterdam$gv. 42, n. 1, p. 48-53, 2009.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 17 | |
| 1. |  | COELHO, M. R. R.; VOS, M.; CARNEIRO, N. P.; MARRIEL, I. E.; PAIVA, E.; SELDIN, L. Diversidade molecular de bactérias diazotróficas presentes na rizosfera de sorgo plantado em condições contrastantes de adubo nitrogenado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 24.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBACTÉRIAS, 12.; SIMPÓSIO DE COLEÇÕES DE CULTURA, 2.; ENCONTRO DE ENSINO EM MICROBIOLOGIA, 4., 2007, Brasília, DF. Anais. [São Paulo]: SBM, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
| 4. | | DONAGEMMA, G. K.; VIANA, J. H. M.; FONTANA, A.; COELHO, M. R.; LUMBRERAS, J. F.; GARRITANO, F. Avaliação do fracionamento da fração areia para a separação de solos arenosa. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 5. | | COELHO, M. R. R.; MOTA, F. F.; PAIVA, E.; MARRIEL, I. E.; ROSADO, A. S.; SELDIN, L.; CARNEIRO, N. P. Diversidade de Paenibacillus spp. na rizosfera de quatro cultivares de sorgo plantados em solo de cerrado sob condições contrastantes de nitrogênio. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 2.; SIMPÓSIO SOBRE COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, 1., 2006, Belo Horizonte. Inovação para sistemas integrados de produção: trabalhos apresentados. [Sete Lagoas]: ABMS, 2006. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 6. | | COELHO, M. R. R.; VOS, M. de; CARNEIRO, N. P.; MARRIEL, I. E.; PAIVA, E.; SELDIN, L. Diversity of nifH gene pools in the rhizosphere of two cultivars of sorghum (Sorghum bicolor) treated with contrasting levels of nitrogen fertilizer. FEMS Microbiology Letters, Amsterdam, v. 279, n. 1, p. 15-22, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|  |
| 7. | | COELHO, M. R. R.; MARRIEL, I. E.; JENKINS, S. N.; LANYON, C. V.; SELDIN, L.; O'DONNELL, A. G. Molecular detection and quantification of nifH gene sequences in the rhizosphere of sorghum (Sorghum bicolor) sown with two levels of nitrogen fertilizer. Applied Soil Ecology, Amsterdam, v. 42, n. 1, p. 48-53, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 8. | | SPERA, S. T.; DONAGEMMA, G. K.; VIANA, J. H. M.; MAGALHÃES, C. A. de S.; COELHO, M. R.; COUTO, E. G. Atributos, uso e manejo de solos de textura leve do sudeste do estado de Mato Grosso. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SOLOS ARENOSOS, 3., 2019, Campo Grande, MS. Intensificação agropecuária sustentável em solos arenosos: anais... Brasília, DF: Embrapa, 2019. E-book.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Solos. |
|  |
| 9. | | COELHO, M. M.; GONÇALVES, L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; KELLER, K. M.; ANJOS, G. V. de S. dos; OTTONI, D.; MICHEL, P. H. F.; JAYME, D. G. Chemical characteristics, aerobic stability, and microbiological counts in corn silage re-ensiled with bacterial inoculant. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 9, p. 1045-1052, Sept. 2018. Título em português: Características químicas, estabilidade aeróbia e contagem microbiológica de silagens de milho reensiladas com inoculante bacteriano.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 10. | | COELHO, M. R. R.; MOTA, F. F. da; CARNEIRO, N. P.; MARRIEL, I. E.; PAIVA, E.; ROSADO, A. S.; SELDIN, L. Diversity of Paenibacillus spp. in the rhizosphere of four sorghum (Sorghum bicolor) cultivars sown with two contrasting levels of nitrogen fertilizer assessed by rpoB-Based PCR-DGGE and sequencing analysis. Journal of Microbiology and Biotechnology, v. 17, n. 5, p. 753-760, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 11. | | ANJOS, C. V. S. dos; GONÇALVES, L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; KELLER, K. M.; COELHO, M. M.; MICHEL, P. H. F.; OTTONI, D.; JAYME, D. G. Effect of re-ensiling on the quality of sorghum silage. Journal of Dairy Science, v. 101, p. 1-8, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 12. | | MAY, A.; CAMPANHA, M. M.; SILVA, A. F. da; COELHO, M. A. de O.; PARRELLA, R. A. da C.; SCHAFFERT, R. E.; PEREIRA FILHO, I. A. Variedades de sorgo sacarino em diferentes espaçamentos e população de plantas. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 11, n. 3, p. 278-290, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 13. | | SPERA, S. T.; DONAGEMMA, G. K.; VIANA, J. H. M.; COELHO, M. R.; MAGALHÃES, C. A. de S.; LEITE SOBRINHO, J. B. P.; TORRES, G. N. Solos de textura leve no Mato Grosso: desafios na agropecuária. In: FARIAS NETO, A. L. de; NASCIMENTO, A. F. do; ROSSONI, A. L.; MAGALHÃES, C. A. de S.; ITUASSU, D. R.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; IKEDA, F. S.; FERNANDES JUNIOR, F.; FARIA, G. R.; ISERNHAGEN, I.; VENDRUSCULO, L. G.; MORALES, M. M.; CARNEVALLI, R. A. (Ed.). Embrapa Agrossilvipastoril: primeiras contribuições para o desenvolvimento de uma agropecuária sustentável. Brasília, DF: Embrapa, 2019. pt. 1, cap. 5, p. 52-60.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Solos. |
| |
| 14. | | MAY, A.; CAMPANHA, M. M.; ABREU, M. C.; BERTOLINO, K. M.; SILVA, A. F. da; COELHO, M.; PARRELLA, R. A. da C.; SCHAFFERT, R. E.; PEREIRA FILHO, I. A. Influência do arranjo de plantas no desempenho produtivo de sorgo sacarino (Sorghum bicolor (L.) Moench), em Sete Lagoas-MG. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovações na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2012. p. 2282-2289. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 15. | | CARNEIRO, J. E. de S.; ABREU, A. de F. B.; RAMALHO, M. A. P.; PAULA JÚNIOR, T. J. de; DEL PELOSO, M. J.; MELO, L. C.; PEREIRA, H. S.; PEREIRA FILHO, I. A.; MARTINS, M.; VIEIRA, R. F.; MARTINS, F. A. D.; COELHO, M. A. de O.; CARNEIRO, P. C. S. de; MOREIRA, J. A. A.; SANTOS, J. B. dos; FARIA, L. C. de; COSTA, J. G. C. da; TEIXEIRA, H. BRSMG Madrepérola: common bean cultivar with late-darkening Carioca grain. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 12, n. 4, p. 281-284, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 16. | | MELO, L. C.; ABREU, A. de F. B.; RAMALHO, M. A. P.; CARNEIRO, J. E. de S.; PAULA JUNIOR, T. J. de; DEL PELOSO, M. J.; PEREIRA, H. S.; FARIA, L. C. de; PEREIRA FILHO, I. A.; MOREIRA, J. A. A.; MARTINS, M.; VIEIRA, R. F.; MARTINS, F. A. D.; COELHO, M. A. de O.; COSTA, J. G. C. da; WENDLAND, A.; SANTOS, J. B. dos; CABRERA DIAZ, J. L.; CARNEIRO, P. C. de S.; DEL GIÚDICE, M. P.; FARIA, J. C. de. BRSMG Realce: common bean cultivar with striped grains for the state of Minas Gerais. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 14, n. 1, p. 61-64, mar. 2014. Cultivar release.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 17. | | RAMALHO, M. A. P.; ABREU, A. de F. B.; SANTOS, J. B. dos; CARNEIRO, J. E. de S.; MELO, L. C.; PAULA JÚNIOR, T. J. de; PEREIRA, H. S.; DEL PELOSO, M. J.; MARTINS, M.; PEREIRA FILHO, I. A.; MARTINS, F. A. D.; COELHO, M. A. de O.; MOREIRA, J. A. A.; DEL GIÚDICE, M. P.; VIEIRA, R. F.; FARIA, L. C. de; TEIXEIRA, H.; CARNEIRO, P. C. de S. BRSMG União: common bean cultivar with jalo grain for the State of Minas Gerais. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 12, n. 4, p. 285-288, Dec. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| Registros recuperados : 17 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
