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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
19/12/2007 |
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Data da última atualização: |
25/05/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
COELHO, M. R. R.; MOTA, F. F. da; CARNEIRO, N. P.; MARRIEL, I. E.; PAIVA, E.; ROSADO, A. S.; SELDIN, L. |
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Afiliação: |
Marcia Reed Rodrigues Coelho, UFRJ; Fabio Faria da Mota, UFRJ; NEWTON PORTILHO CARNEIRO, CNPMS; IVANILDO EVODIO MARRIEL, CNPMS; EDILSON PAIVA, CNPMS; Alexandre Soares Rosado, UFRJ; Lucy Seldin, UFRJ. |
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Título: |
Diversity of Paenibacillus spp. in the rhizosphere of four sorghum (Sorghum bicolor) cultivars sown with two contrasting levels of nitrogen fertilizer assessed by rpoB-Based PCR-DGGE and sequencing analysis. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Microbiology and Biotechnology, v. 17, n. 5, p. 753-760, 2007. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The diversity of Paenibacillus species was assessed in the rhizospheres of four cultivars of sorghum sown in Cerrado soil amended with two level of nitrogen fertilizer (12 and 120 kg/ha). Two cuItivars (IS 5322.C and IS 6320) demanded the higher amount of nitrogen to grow, whereas the other two (FBS 8701.9 and IPA 1011) did not. Using the DNA extracted from the rhizospheres, a Paenibacillus-specific PCR system based ou the RNA polymerase gene (rpoB) was chosen for the molecular analyses. The resulting PCR products were separated into çommunity fingerprints by DGGE and the results showed a clear distinction between cultivars. In addition, clone libraries were generated from the rpoB fragments of two cultivars (IPA 1011 and IS 5322.C) using both fertilization conditions, and 318 selected clones were sequenced. Analyzed sequences were grouped into 14 Paenibacillus species. A greater diversity of Paenibacillus species was observed in cultivar IPA 1011 compared with cultivar IS 5322.C, Moreover, statistical analyses of the sequences showed that the bacterial diversity was more influenced by cultivar type than nitrogen fertilízation, corroborating the DGGE results. Thus, the sorghum cultivar type was the oveniding determiinative factor that influenced the community structures of the Paenibacillus communities in the habitats investigated. |
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Palavras-Chave: |
Molecular ecology; rpoB gene. |
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Thesagro: |
Sorghum Bicolor. |
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Thesaurus Nal: |
nitrogen fixation; Paenibacillus. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
25/07/2012 |
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Data da última atualização: |
14/08/2012 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
TORRES, A. R.; GRUNVALD, A. K.; MARTINS, T. B.; SANTOS, M. A.; LEMOS, N. G.; SILVA, L. A. S.; HUNGRIA, M. |
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Afiliação: |
CNPq - RHAE Bolsista; CNPq - RHAE Bolsista; CNPq - DTI; CNPq - RHAE; CNPq - RHAE; Soytech Seeds; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO. |
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Título: |
Inferência sobre a estrutura populacional da soja comercializada no Brasil, usando dados genotípicos, para uso no mapeamento associativo de alto teor de proteína e maior eficiência na fixação biológica de nitrogênio. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2012. |
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Páginas: |
4 p. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Uma dificuldade encontrada nos programas de melhoramento de soja é a de aumentar o teor de proteína sem reduzir a produtividade de grãos. Para contornar essa dificuldade, uma alternativa seria melhorar a eficiência da fixação biológica de nitrogênio (FBN). A associação simbiótica entre a soja e bactérias das espécies Bradyrhizobium japonicum e B. elkanii tem importância mundial para a cultura. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a estrutura populacional das principais cultivares de soja comercializadas no Brasil, usando dados genotípicos, para uso no mapeamento associativo de alto teor de proteína e maior eficiência na FBN. O experimento foi realizado no Laboratório de Biotecnologia do Solo da Embrapa Soja. Um total de 192 cultivares de soja foram genotipadas com 21 marcadores SSR relacionados a QTLs que controlam teor de proteína em soja. A genotipagem foi feita em geis de poliacrilamida a 10% e oito marcadores não ligados foram selecionados para análise de estrutura populacional com o software Structure. Foi testada a hipótese de 1 a 10 subpopulações, com mistura e frequências alélicas correlacionadas. O número de alelos na população variou entre 2 e 11, com uma média de 4,3 alelos por lócus. Somente dois marcadores não revelaram polimorfismo. Os resultados mostraram que a população está estruturada, com três subpopulações distintas entre as cultivares. |
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Thesagro: |
Soja. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/62362/1/274-s301.pdf
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Marc: |
LEADER 02236nam a2200205 a 4500
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245 $aInferência sobre a estrutura populacional da soja comercializada no Brasil, usando dados genotípicos, para uso no mapeamento associativo de alto teor de proteína e maior eficiência na fixação biológica de nitrogênio.
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520 $aUma dificuldade encontrada nos programas de melhoramento de soja é a de aumentar o teor de proteína sem reduzir a produtividade de grãos. Para contornar essa dificuldade, uma alternativa seria melhorar a eficiência da fixação biológica de nitrogênio (FBN). A associação simbiótica entre a soja e bactérias das espécies Bradyrhizobium japonicum e B. elkanii tem importância mundial para a cultura. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a estrutura populacional das principais cultivares de soja comercializadas no Brasil, usando dados genotípicos, para uso no mapeamento associativo de alto teor de proteína e maior eficiência na FBN. O experimento foi realizado no Laboratório de Biotecnologia do Solo da Embrapa Soja. Um total de 192 cultivares de soja foram genotipadas com 21 marcadores SSR relacionados a QTLs que controlam teor de proteína em soja. A genotipagem foi feita em geis de poliacrilamida a 10% e oito marcadores não ligados foram selecionados para análise de estrutura populacional com o software Structure. Foi testada a hipótese de 1 a 10 subpopulações, com mistura e frequências alélicas correlacionadas. O número de alelos na população variou entre 2 e 11, com uma média de 4,3 alelos por lócus. Somente dois marcadores não revelaram polimorfismo. Os resultados mostraram que a população está estruturada, com três subpopulações distintas entre as cultivares.
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700 1 $aSILVA, L. A. S.
700 1 $aHUNGRIA, M.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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