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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
17/09/2012 |
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Data da última atualização: |
25/05/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FEDERICI, M. T.; PICCHI, S. C.; STUCHI, E. S.; FADEL, A. L.; LAIA, M. L.; LEMOS, M. V. F.; LEMOS, E. G. M. |
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Afiliação: |
MARÍA TERESA FEDERICI, INIA; SIMONE CRISTINA PICCHI, UNESP; EDUARDO SANCHES STUCHI, CNPMF; ANDRÉ LUIZ FADEL, ESALQ; MARCELO LUIZ LAIA, UFVJM; MANOEL VICTOR FRANCO LEMOS, UNESP; ELIANA GERTRUDES MACEDO LEMOS, UNESP. |
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Título: |
Xylella fastidiosa: An in vivo system to study possible survival strategies within citrus xylem vessels based on global gene expression analysis. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Electronic Journal of Biotechnology, 2012. |
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ISSN: |
0717-3458 |
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DOI: |
10.2225/vol15-issue3-fulltext-4 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Xylella fastidiosa inhabits the plant xylem, a nutrient-poor environment, so that mechanisms to sense and respond to adverse environmental conditions are extremely important for bacterial survival in the plant host. Although the complete genome sequences of different Xylella strains have been determined, little is known about stress responses and gene regulation in these organisms. In this work, a DNA microarray was constructed containing 2,600 ORFs identified in the genome sequencing project of Xylella fastidiosa 9a5c strain, and used to check global gene expression differences in the bacteria when it is infecting a symptomatic and a tolerant citrus tree. Different patterns of expression were found in each variety, suggesting that bacteria are responding differentially according to each plant xylem environment. The global gene expression profile was determined and several genes related to bacterial survival in stressed conditions were found to be differentially expressed between varieties, suggesting the involvement of different strategies for adaptation to the environment. The expression pattern of some genes related to the heat shock response, toxin and detoxification processes, adaptation to atypical conditions, repair systems as well as some regulatory genes are discussed in this paper. DNA microarray proved to be a powerful technique for global transcriptome analyses. This is one of the first studies of Xylella fastidiosa gene expression in vivo which helped to increase insight into stress responses and possible bacterial survival mechanisms in the nutrient-poor environment of xylem vessels. MenosXylella fastidiosa inhabits the plant xylem, a nutrient-poor environment, so that mechanisms to sense and respond to adverse environmental conditions are extremely important for bacterial survival in the plant host. Although the complete genome sequences of different Xylella strains have been determined, little is known about stress responses and gene regulation in these organisms. In this work, a DNA microarray was constructed containing 2,600 ORFs identified in the genome sequencing project of Xylella fastidiosa 9a5c strain, and used to check global gene expression differences in the bacteria when it is infecting a symptomatic and a tolerant citrus tree. Different patterns of expression were found in each variety, suggesting that bacteria are responding differentially according to each plant xylem environment. The global gene expression profile was determined and several genes related to bacterial survival in stressed conditions were found to be differentially expressed between varieties, suggesting the involvement of different strategies for adaptation to the environment. The expression pattern of some genes related to the heat shock response, toxin and detoxification processes, adaptation to atypical conditions, repair systems as well as some regulatory genes are discussed in this paper. DNA microarray proved to be a powerful technique for global transcriptome analyses. This is one of the first studies of Xylella fastidiosa gene expression in vivo which helped to increas... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Microarray. |
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Thesagro: |
Xylella Fastidiosa. |
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Thesaurus Nal: |
Citrus. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Registro |
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| Registros recuperados : 34 | |
| 1. |  | FERNANDES, M. S.; ARRÉLAGA, L. E.; SANTOS, G. de A. Fontes de nitrogênio, absorção e distribuição de fósforo em milho. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 15, n. 1, p. 79-84, jan. 1980 Título em inglês: Different nitrogen sources on the absorption and distribution of phosphorus in corn.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 4. | | GUERRA, J. G. M.; SANTOS, G. de A. Métodos químicos e físicos. 2. ed. rev. atual. ampl. In: SANTOS, G. de A.; SILVA, L. S. da; CANELLAS, L. P.; CAMARGO, F. A. O. (Ed.). Fundamentos da matéria orgânica do solo: ecossistemas tropicais & subtropicais. Porto Alegre: Metrópole, 2008. p. 185-199. Parceria: UFRRJ.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 5. | | BRANCHER, A.; CAMARGO, F. A. de O.; SANTOS, G. de A. Adubação orgânica e mineral e calagem influenciando o rendimento do arroz irrigado. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 33, n. 4, p. 397-403, abr. 1998 Título em inglês: Organic materials, mineral fertilizer and liming effects on yield of flooded rice.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 6. | | CANELLAS, L. P.; SANTOS, G. de A.; RUMJANEK, V. M.; MORAES, A. A.; GURIDI, F. Distribuição da matéria orgânica e características de ácidos húmicos em solos com adição de resíduos de origem urbana. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 36, n. 12, p. 1529-1538, dez. 2001 Título em inglês: Distribution of the organic matter and humic acid characteristic in soils with addition of residues of urban origin.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 8. | | GUERRA, J. G. M.; ALMEIDA, D. L. de; SANTOS, G. de A.; FERNANDES, M. S. Conteúdo de fósforo orgânico em amostras de solos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 31, n. 4, p. 291-299, abr. 1996. Título em inglês: Organic phosphorus content in soil samples.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 10. | | CAMARGO, F. A. de O.; SANTOS, G. de A.; ROSSIELLO, R. O. P.; ZONTA, E. Incorporação de palha de arroz em um gleissolo e efeitos no rendimento da cultura do arroz irrigado. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 30, n. 7, p. 983-987, jul. 1995. Título em inglês: Rice Straw incorporation in a gleysol and effects on rice yield.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 14. | | CUNHA, T. J. F.; MADARI, B.; BENITES, V. de M.; SANTOS, G. de A.; CANELLAS, L. P.; MARTIN NETO, L. Some characteristics of the humic acids of the Amazonian Dark Earth Soils. In: INTERNATIONAL MEETING OF IHSS- HUMIC SUSBSTANCES AND SOIL AND WATER ENVIRONMENT, 12., 2004, São Pedro. Proceedings... São Carlos: Embrapa Instrumentação Agropecuária, 2004. p. 419-421.| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 15. | | CUNHA, T. J.; MADARI, B.; BENITES, V. de M.; SANTOS, G. de A.; CANELLAS, L. P.; MARTIN-NETO, L. Some characteristics of the humic acids of the amazonian dark earth soils. In: MARTIN-NETO, L.; MILORI, D.M.B.P.; SILVA, W.T.L. (Ed.). Humic substances and soil and water environment: International Meeting of IHSS, 12. São Carlos : Embrapa Instrumentação Agropecuária, 2004. p. 419-421. CLASSIFICAÇÃO CDD: 630| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 16. | | DEMÉTRIO, R.; GUERRA, J. G. M.; SANTOS, G. de A.; ALMEIDA, D. L. de; DE POLLI, H.; CAMARGO, F. A. de O. Absorção de nitrogênio do solo pelo milho influenciada pela adição de diferentes resíduos de culturas. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 33, n. 4, p. 481-486, abr. 1998 Título em inglês: Soil nitrogen absorption by corn as affected by crop residues addition.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 17. | | GALETI, H. V. A.; MILORI, D. M. B. P.; CUNHA, T. J. F.; MARTIN-NETO, L.; MADARI, B.; BENITES, V. de M.; SANTOS, G. de A. Analysis of concentration effect on laser-induced fluorescece of humic acids in solid samples. In: MARTIN-NETO, L.; MILORI, D.M.B.P.; SILVA, W.T.L. (Ed.). Humic substances and soil and water environment: International Meeting of IHSS, 12. São Carlos : Embrapa Instrumentação Agropecuária, 2004. p. 332-334. CLASSIFICAÇÃO CDD: 630| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 18. | | MILORI, D. M. B. P.; MARTIN-NETO, L.; GALETI, H. V. A.; BENITES, V. DE M.; MADARI, B.; CUNHA, T. J. F.; SANTOS, G. DE A. Analysis of concentration effect on laser-induced fluorescence of humic acids in solid samples. In: INTERNATIONAL MEETING OF INTERNATIONAL HUMIC SUBSTANCES SOCIETY. -- IHSS, 12, São Pedro, SP, 2004. Humic substances and soil and water environment. Abstracts...[São Carlos], SP: Embrapa Instrumentação Agropecuária, 2004. p. 57.| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 19. | | CUNHA, T. J. F.; MADARI, B. E.; BENITES, V. de M.; CANELLAS, L. P.; NOVOTNY, E. H.; MOUTTA, R. de O.; TROMPOWSKY, P. M.; SANTOS, G. de A. Fracionamento químico da matéria orgânica e características de ácidos húmicos de solos com horizonte a antrópico da Amazônia (Terra Preta). Acta Amazonica, Manaus, v. 37, n. 1, p. 91-98, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Semiárido; Embrapa Solos. |
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| 20. | | CUNHA, T. J. F.; NOVOTNY, E. H.; MADARI, B. E.; BENITES, V. de M.; MARTIN NETO, L.; SANTOS, G. de A. O carbono pirogênico. In: TEIXEIRA, W. G.; KERN, D. C.; MADARI, B. E.; LIMA, H. N.; WOODS, W. (Ed.). As terras pretas de índio da Amazônia : sua caracterização e uso deste conhecimento na criação de novas áreas. Manaus: Embrapa Amazônia Ocidental, 2009. p. 263-285.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Instrumentação; Embrapa Semiárido; Embrapa Solos. |
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