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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
12/02/2008 |
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Data da última atualização: |
24/07/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BERGER, I. J.; FREITAS-ÁSTUA, J.; REIS, M. S.; TARGON, M. L. P. N.; MACHADO, M. A. |
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Afiliação: |
Irving J. Berger, APTA; Juliana Freitas-Astúa, CNPMF; Marcelo S. Reis, APTA; Maria Luísa P.N. Targon, APTA; Marcos A. Machado, APTA. |
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Título: |
In silico prediction of gene expression patterns in Citrus flavedo. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 752-760, 2007. |
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ISSN: |
1415-4757 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Out of the 18,942 flavedo expressed sequences (clusters plus singletons) in Citrus sinensis from the Citrus EST Project (CitEST), 25 were statistically supported to be differentially expressed in this tissue after a double in silico hybridization strategy against leaf-, flower-, and bark-derived ESTs. Five of them, two terpene synthases and three O-methyltransferases, are absent in the other citrus tissues with concomitant 2x2 statistics, supporting the hypothesis that they are putative flavedo-specific expressed sequences. The pattern of these differentially expressed sequences during fruit development suggests that most of them are developmentally regulated. Some expressed gene products, including a putative germin-like protein highly expressed in flavedo, are shown to be promising candidates for further characterization. In addition to promoter seeking, this kind of analysis can lead to gene discovery, tissue-specific and tissue-enriched expression pattern predictions (as shown herein) and can also be adopted as an in silico first, and probably reliable approach, for detecting expression profiles from EST sequencing efforts before experimental validation is available or for heuristically guiding that validation. |
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Palavras-Chave: |
EST; Fruit; Orange; Tissue-specific. |
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Thesaurus Nal: |
gene expression. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 11 | |
| 3. |  | SOUZA, A. P. de S. B. e; BOMFIM, M. R.; TRINDADE, A. V.; GRAZZIOTTO, P. H.; MUCHOVEJ, R. M. C. Efeito de lodo de esgoto sobre o desenvolvimento do milho inoculado com fungos micorrízicos arbusculares. In: SEMINÁRIO DE PESQUISA DO RECÔNCAVO DA BAHIA, 2.; SEMINÁRIO ESTUDANTIL DE PESQUISA DA UFRB, 2.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA UFRB, 2., 2008, Cruz das Almas, BA. Sustentabilidade ambiental e qualidade de vida. Cruz das Almas: Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 4. | | CERQUEIRA-SILVA, C.S B. M.; FALEIRO, F. G.; JESUS, O. N. de; SANTOS, E. S. L. dos; SOUZA, A. P. de. The genetic diversity, conservation, and use of passion fruit (Passiflora spp.). In: AHUJA, M. R.; JAIN, S. M. (ed.). Genetic divesity and erosion in plants: case histories. Cham: Springer, 2016. p. 215-231. il. (Sustainable Development and Biodiversity, v. 2).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 5. | | SOUZA, A. P. de S. B. e; BOMFIM, M. R.; BOECHAT, C. L.; TRINDADE, A. V.; MUCHOVEJ, R. M. C.; GRAZZIOTTI, P. H. Efeito do lodo de esgoto sobre o desenvolvimento do milho inoculado com fungos microrrizicos arbuscalares. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios:anais. Fortaleza: SBCS: UFC, 2009. 1 CD-ROM. Trabalho 2758.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 7. | | BOMFIM, M. R.; SILVA, E. de J. da; COUTO, J. L.; SOUZA, A. P. de S.; MONTEIRO, J. A.; CONCEIÇÃO, A. M. da S. B.; CARVALHO, Z. S. de; GONZAGA, J. A.; SOUZA, L. da S. Comportamento da curva de compactação de três solos numa topossequência em Tabuleiros Costeiros no Recôncavo da Bahia. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios: anais. Fortaleza: SBCS: UFC, 2009. 1 CD-ROM. Trabalho 2061.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 8. | | SOUZA, A. P. de S. B. e; BOMFIM, M. R.; COUTO, J. L. do; SILVA, E. de J.; LIMA, J. A. M. de C.; BASTOS, A. M. da S.; SANTOS, J. A. G.; SOUZA, L. da S.; TRINDADE, A. V. Qualidade do solo em uma topossequência sob cultivo de citrus avaliada através de atributos microbiológicos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios:anais. Fortaleza: SBCS: UFC, 2009. 1 CD-ROM. Trabalho 2539.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 9. | | LIMA, J. A. M. de C.; CONCEIÇÃO, A. M. da S. B.; COUTO, J. L. do; SILVA, E. de J. da; MATIAS, M. I. de A. S.; SOUZA, A. P. de S. B. e; BOMFIM, M. R.; SANTOS, J. A. G.; SOUZA, L. da S. Avaliação da qualidade de solos para o suprimento de nutrientes em uma topossequência cultivada com citrus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios: anais. Fortaleza: SBCS: UFC, 2009. 1 CD-ROM. Trabalho 3102.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 10. | | SILVA, E. de J. da; BOMFIM, M. R.; COUTO, J. L. do; SOUZA, A. P. de S. B. e; LIMA, J. A. M. de C.; CONCEIÇÃO, A. M. da S. B.; CARVALHO, Z. S. de; SANTOS, J. A. G.; SOUZA, L. da S. Atributos físicos na determinação do índice de qualidade de solo em uma topossequência cultivada com citros. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios: anais. Fortaleza: SBCS: UFC, 2009. 1 CD-ROM. Trabalho 3147.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 11. | | COUTO, J. L do; SILVA, E. de J.; BONFIM, M. R.; SOUZA, A. P. de S. B. e; LIMA, J. A. M. de C.; CONCEIÇÃO, A. M. da S. B.; SANTOS, J. A. G.; SOUZA, L. da S.; TRINDADE, A. V. Determinação do intervalo hídrico ótimo em três solos numa topossequência cultivada com citros. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios:anais. Fortaleza: SBCS: UFC, 2009. 1 CD-ROM. Trabalho 1355.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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