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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
12/02/2008 |
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Data da última atualização: |
24/07/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
TARGON, M. L. P. N.; TAKITA, M. A.; AMARAL, A. M. do; SOUZA, A. A. de; LOCALI-FABRIS, E. C.; DORTA, S. de O.; BORGES, K. M.; SOUZA, J. M. de; RODRIGUES, C. M.; LUCHETA, A. R.; FREITAS-ÁSTUA, J.; MACHADO, M. A. |
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Afiliação: |
Maria Luísa P. Natividade Targon, APTA; Marco Aurélio Takita, APTA; Alexandre M. do Amaral, CENARGEN; Alessandra A. de Souza, APTA; Eliane Cristina Locali-Fabris, APTA; Sílvia de Oliveira Dorta, APTA; Kleber Martins Borges, APTA; Juliana Mendonça de Souza, APTA; Carolina Munari Rodrigues, APTA; Adriano Reis Lucheta, APTA; Juliana Freitas-Astúa, CNPMF; Marcos Antonio Machado, APTA. |
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Título: |
CitEST libraries. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 1019-1023, 2007. |
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ISSN: |
1415-4757 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
In order to obtain a better understanding of what is citrus, 33 cDNA libraries were constructed from different citrus species and genera. Total RNA was extracted from fruits, leaves, flowers, bark, seeds and roots, and subjected or not to different biotic and abiotic stresses (pathogens and drought) and at several developmental stages. To identify putative promoter sequences, as well as molecular markers that could be useful for breeding programs, one shotgun library was prepared from sweet orange (Citrus sinensis var. Olimpia). In addition, EST libraries were also constructed for a citrus pathogen, the oomycete Phythophthora parasitica in either virulent or avirulent form. A total of 286,559 cDNA clones from citrus were sequenced from their 5 end, generating 242,790 valid reads of citrus. A total of 9,504 sequences were produced in the shotgun library and the valid reads were assembled using CAP3. In this procedure, we obtained 1,131 contigs and 4,083 singletons. A total of 19,200 cDNA clones from P. parasitica were sequenced, resulting in 16,400 valid reads. The number of ESTs generated in this project is, to our knowledge, the largest citrus sequence database in the world. |
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Palavras-Chave: |
ESTs; Phytopathogen; Shotgun. |
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Thesaurus Nal: |
Citrus. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 17 | |
| 3. |  | MAFRA, V.; MARTINS, P. K.; FRANSCISCO, C. S.; RIBEIRO-ALVES, M.; ASTUA, J. de F.; MACHADO, M. A. Candidatus Liberibacter americanus induces significant reprogramming of the transcriptome of the susceptible citrus genotype. In; INTERNATIONAL RESEARCH CONFERENCE ON HUANGLONGBING , 3., 2013, Orlando, Flórida, USA. IRC HLB III. Proceedings. Orlando, Flórida, USA, 2013, (online).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 5. | | SILVA, M. F. e; MIROLI, D. M. B. P.; CARDINALI, M. C. B.; MASCARENHAS, Y. P.; MARTINS, P. K.; FREITAS ASTUA, J. de; MACHADO, M. A. Application of fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) for early diagnosis of citrus greening disease. In: CONFERENCE INTERNATIONAL ORGANIZATION CITRUS VIROLOGISTS, 18., Campinas, SP, 2010. Proceedings... Campinas: IOCV, 2010. 1 CD-ROM. 120_PS2
Publicado também em: Citrus Research & Technology, Cordeirópolis, v. 31, Suplemento, 2010| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 6. | | LOCALI-FABRIS, E. C.; MAFRA, V. S.; MARTINS, P. K.; RIBEIRO- ALVES, M.; FRANCISCO, C. S.; FREITAS ASTUA, J. de; KISHI, L. T.; MACHADO, M. A. Gene set enrichment analysis in sweet orange plants infected by Candidatus Liberibacter americanus. In: CONFERENCE INTERNATIONAL ORGANIZATION CITRUS VIROLOGISTS, 18., Campinas, SP, 2010. Proceedings... Campinas: IOCV, 2010. 1 CD-ROM. 0058 PSO
Publicado também em: Citrus Research & Technology, Cordeirópolis, v. 31, Suplemento, 2010| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 7. | | PEREIRA, F. M. V.; MILORI, D. M. B. P.; PEREIRA-FILHO, E. R.; VENANCIO, A. L.; RUSSO, M. de S. T.; MARTINS, P. K.; FREITAS-ASTUA, J. Fluorescence images combined to statistic test for fingerprinting of citrus plants after bacterial infection. Analytical methods, [S. l.], v. 3, p. 552-556, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 8. | | PEREIRA, F. M. V.; MILORI, D. M. B. P.; VENANCIO, A. L.; RUSSO, M. de S. T.; MARTINS, P. K.; FREITAS-ASTÚA, J. Evaluations of the effects of candidatus liberibacter asiaticus on inoculated citrus plants using laser-induced breakdown spectroscopy and chemometric tools. Citrus research & technology, Cordeirópolis, v. 31, suplemento, p. 95, 2010. Proceedings of the 18 conference international organization citrus virologists, 2010, Campinas. 1CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 9. | | CARDINALI, M. C. B.; VENÂNCIO, A. L.; KUBOTA, T. M. K.; MILORI, D. M. B. P.; FERREIRA, E. J.; MARTINS, P. K.; FREITAS-ASTÚA, J. Evaluation of early diagnosis of citrus greening using laser-induced fluorescence spectroscopy. Citrus research & technology, Cordeirópolis, v. 31, suplemento, p. 108, 2010. Proceedings of the 18 conference international organization citrus virologists, 2010, Campinas. 1CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 10. | | PEREIRA, F. M. V.; MILORI, D. M. B. P.; VENANCIO, A. L.; RUSSO, M. de S. T.; MARTINS, P. K.; ASTUA, J. de F. Evaluation of the effects of Candidatus Liberibacter asiaticus on inoculated citrus plants using laser-induced breakdown spectroscopy (LIBS) and chemometrics tools. Talanta, Oxford, v. 83, n. 2, p. 351-356, dez. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 11. | | CORREA, P. H.; MARTINS, P. K.; ARENA, G. D.; MIGUEL, M. C.; MUTTI, H. S.; MACHADO, M. A.; FREITAS-ASTUA, J. Diagnóstico molecular de huanglongbing dos citros, via qPCR, em mudas de valência sobre Swingle. In:CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. pdf 1867| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 12. | | RUSSO, M. S. T.; CARDINALI, M.; MILORI, D. M. B. P.; PEREIRA, F. M. V.; MARTINS, P. K.; FREITAS-ASTÚA, J. Study of laser-induced fluorescence imaging in asymptomatic leaves from citrus plants inoculated with candidatus liberibacter. Citrus research & technology, Cordeirópolis, v. 31, suplemento, p. 122, 2010. Proceedings of the 18 conference international organization citrus virologists, 2010, Campinas.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 13. | | ASTUA, J. de F.; MARTINS, P. K.; MAFRA, V. S.; BALBINOTTE, J.; LOPES, J. R. S.; PONTES, R. G. M. S. de; MACHADO, M. A. Uso de ferramentas biotecnológicas para o manejo do HLB dos citros. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 22., 2012, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: SBF, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 14. | | PEREIRA, F. M. V.; MILORI, D. M. B. P.; PEREIRA-FILHO, E. R.; VENÂNCIO, A. L.; RUSSO, M. DE S. T.; CARDINALI, M. DO B.; MARTINS, P. K.; ASTUA, J. de F. Laser-induced fluorescence imaging method to monitor citrus greening disease. Computers and Electronics in Agriculture, v. 79, n. 12, p. 90-93, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 15. | | MILORI, D. M. B. P.; BOAS, P. R. V.; VEMÂNCIO, A. L.; CARDINALI, M. C. B.; FERREIRA, E. J.; MARTINS, P. K.; ASTUA, J. de F.; MELO, J. D. B. Diagnóstico de Citrus Greening (HLB) utilizando espectroscopia de fluorescência induzida por laser (LIFS). In: INAMASU, R. Y.; NAIME, J. de M.; RESENDE, A. V. de; BASSOI, L. H.; BERNARDI, A. C. de C. (Ed.). Agricultura de precisão: um novo olhar. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2011. 334 p. il.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 16. | | MILORI, D. M. B. P.; PEREIRA, F. M. V.; VILLAS-BOAS, P. R.; CARDINALI, M. C. do B.; MARTIN-NETO, L.; FERREIRA, E. J.; MARTINS, P. K.; ASTUA, J. de F. Diagnóstico do HLB por técnicas fotônicas. In: ANDRADE, D. J.; FERREIRA, M. da C.; MARTINELLI, N. M. (Ed.). Aspectos da fitossanidade em citros. Jaboticabal: Cultura Acadêmica, 2014. p. 143-180.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 17. | | PEREIRA, F. M. V.; MILORI, D. M. B. P.; CARDINALI, M. C. do B.; BOAS, P. R. V.; VENÂNCIO, A. L.; RUSSO, M. de S. T.; MARTINS, P. K.; ASTUA, J. de F. Métodos analíticos desenvolvidos para o monitoramento da doença citrus greening em laranja doce: imagens de fluorescência e espectroscopia de emissão óptica com plasma induzido por laser (LIBS). São Carlos: Embrapa Instrumentação, 2011. 43 p. il. (Embrapa Instrumentação. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 35).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
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