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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
28/07/2015 |
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Data da última atualização: |
03/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CARMO, C. D.; SANTOS, D. B.; ALVES, L. B.; OLIVEIRA, G. A. F.; OLIVEIRA, E. J. de. |
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Afiliação: |
C. D. CARMO, UFRB; D. B. SANTOS, UFRB; L. B. ALVES, UFRB; G. A. F. OLIVEIRA, UFRB; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
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Título: |
Development of TRAP (Target Region Amplification Polymorphism) as New Tool for Molecular Genetic Analysis in Cassava. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Molecular Biology Reporte, 18 April 2015. |
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Páginas: |
14P. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Cassava (Manihot esculenta Crantz) lacks molecular studies for use in breeding and germplasm bank maintenance. This work aimed to develop and validate TRAP (target region amplification olymorphism) markers for cassava and evaluate their potential for structuring the genetic diversity of this species. Preliminary analyses with 396 combinations found 64%of combinations with a good amplification pattern and polymorphism. The 69 most polymorphic TRAP combinations were used to characterize 46 cassava genotypes, from which 606 alleles (range 3 to 18 with a mean of 8.8 alleles per combination) were identified. The polymorphic information content (PIC) ranged from 0.03 to 0.38 (average 0.23), while 31 combinations showed a PIC >0.25. The resolving power (Rp) parameter ranged from 0.10 to 6.30 (average 3.21). The primers that were related to starch and carotenoid biosynthesis, cyanogenic compounds, post-harvest physiological deterioration, root formation, and defense responses were the most polymorphic (>70 % of polymorphic fragments, PIC>0.25, and Rp>3.21). A total of 37 private alleles were identified in 20 accessions. Bayesian clustering as implemented in STRU CTURE revealed the presence of two major clusters (K=2) and four subclusters (K=4). The group differentiation based on the molecular variance analysis (AMOVA) showed that most of the genetic variation is within groups but with significant differences between groups. Therefore, TRAP primers have a high polymorphism for use as a molecular tool in cassava, in addition to the association with genetic regions that may increase the chances of obtaining functional markers. MenosCassava (Manihot esculenta Crantz) lacks molecular studies for use in breeding and germplasm bank maintenance. This work aimed to develop and validate TRAP (target region amplification olymorphism) markers for cassava and evaluate their potential for structuring the genetic diversity of this species. Preliminary analyses with 396 combinations found 64%of combinations with a good amplification pattern and polymorphism. The 69 most polymorphic TRAP combinations were used to characterize 46 cassava genotypes, from which 606 alleles (range 3 to 18 with a mean of 8.8 alleles per combination) were identified. The polymorphic information content (PIC) ranged from 0.03 to 0.38 (average 0.23), while 31 combinations showed a PIC >0.25. The resolving power (Rp) parameter ranged from 0.10 to 6.30 (average 3.21). The primers that were related to starch and carotenoid biosynthesis, cyanogenic compounds, post-harvest physiological deterioration, root formation, and defense responses were the most polymorphic (>70 % of polymorphic fragments, PIC>0.25, and Rp>3.21). A total of 37 private alleles were identified in 20 accessions. Bayesian clustering as implemented in STRU CTURE revealed the presence of two major clusters (K=2) and four subclusters (K=4). The group differentiation based on the molecular variance analysis (AMOVA) showed that most of the genetic variation is within groups but with significant differences between groups. Therefore, TRAP primers have a high polymorphism for use as... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Marcador molelular. |
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Thesagro: |
Mandioca; Marcador genético. |
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Thesaurus Nal: |
Cassava; Genetic markers. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Florestas; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
27/04/2018 |
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Data da última atualização: |
12/03/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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Autoria: |
CUADRA, S. V.; HEINEMANN, A. B.; SANTOS, P. M.; OLIVEIRA, P. P. A.; KEMENES, A.; GUIMARÃES, L. J. M.; MAGALHÃES, C. A. de S.; CAMARGO, L. S. de A.; ANGELOTTI, F.; PETRERE, V. G.; ANDRADE, C. de L. T. de; PEREIRA, L. G. R.; STEINMETZ, S.; PACKER, A. P. C.; HIGA, R. C. V.; MONTEIRO, J. E. B. de A.; RAMOS, N. P.; SAMPAIO, F. G.; NECHET, K. de L.; ANDRADE, C. A. de; BATISTA, E. R.; PELLEGRINO, G. Q. |
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Afiliação: |
SANTIAGO VIANNA CUADRA, CPACT; ALEXANDRE BRYAN HEINEMANN, CNPAF; PATRICIA MENEZES SANTOS, CPPSE; PATRICIA PERONDI ANCHAO OLIVEIRA, CPPSE; ALEXANDRE KEMENES, CPAMN; LAURO JOSE MOREIRA GUIMARAES, CNPMS; CIRO AUGUSTO DE SOUZA MAGALHAES, CPAMT; LUIZ SERGIO DE ALMEIDA CAMARGO, CNPGL; FRANCISLENE ANGELOTTI, CPATSA; VANDERLISE GIONGO, CPATSA; CAMILO DE LELIS TEIXEIRA DE ANDRADE, CNPMS; LUIZ GUSTAVO RIBEIRO PEREIRA, CNPGL; SILVIO STEINMETZ, CPACT; ANA PAULA CONTADOR PACKER, CNPMA; ROSANA CLARA VICTORIA HIGA, CNPF; JOSE EDUARDO B DE ALMEIDA MONTEIRO, CNPTIA; NILZA PATRICIA RAMOS, CNPMA; FERNANDA GARCIA SAMPAIO, CNPMA; KATIA DE LIMA NECHET, CNPMA; CRISTIANO ALBERTO DE ANDRADE, CNPMA; EUNICE REIS BATISTA, CNPMA; GIAMPAOLO QUEIROZ PELLEGRINO, CNPTIA. |
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Título: |
Resiliência e adaptação da agropecuária às mudanças climáticas. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CUADRA, S. V.; HEINEMANN, A. B.; BARIONI, L. G.; MOZZER, G. B.; BERGIER, I. (Ed.). Ação contra a mudança global do clima: contribuições da Embrapa. Brasília, DF: Embrapa, 2018. Cap. 3, p. 31-47. |
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Descrição Física: |
E-book. |
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Série: |
(Objetivos de Desenvolvimento Sustentável, 13). |
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ISBN: |
978-85-7035-793-9 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Adaptação às mudanças climáticas na agropecuária. Tecnologias, produtos e serviços para a adaptação da agropecuária. Alternativas de manejo para reforçar a resiliência. Melhoramento genético de plantas. Produção animal. Sistemas intensivos e integrados de produção. Sistemas ecológicos. Piscicultura. Impactos indiretos. Considerações finais. |
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Palavras-Chave: |
Objetivo de desenvolvimento sustentável; Selo ODS 13; Sustentabilidade. |
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Thesagro: |
Clima; Efeito estufa; Mudança Climática. |
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Thesaurus NAL: |
Climate; Climate change; Global warming; Greenhouse gas emissions. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/184191/1/Livro-Santiago-Cuadra-33-49.pdf
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Marc: |
LEADER 02041naa a2200529 a 4500
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490 $a(Objetivos de Desenvolvimento Sustentável, 13).
520 $aAdaptação às mudanças climáticas na agropecuária. Tecnologias, produtos e serviços para a adaptação da agropecuária. Alternativas de manejo para reforçar a resiliência. Melhoramento genético de plantas. Produção animal. Sistemas intensivos e integrados de produção. Sistemas ecológicos. Piscicultura. Impactos indiretos. Considerações finais.
650 $aClimate
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650 $aClima
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653 $aSelo ODS 13
653 $aSustentabilidade
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700 1 $aGUIMARÃES, L. J. M.
700 1 $aMAGALHÃES, C. A. de S.
700 1 $aCAMARGO, L. S. de A.
700 1 $aANGELOTTI, F.
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700 1 $aANDRADE, C. de L. T. de
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700 1 $aNECHET, K. de L.
700 1 $aANDRADE, C. A. de
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700 1 $aPELLEGRINO, G. Q.
773 $tIn: CUADRA, S. V.; HEINEMANN, A. B.; BARIONI, L. G.; MOZZER, G. B.; BERGIER, I. (Ed.). Ação contra a mudança global do clima: contribuições da Embrapa. Brasília, DF: Embrapa, 2018. Cap. 3, p. 31-47.
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Registro original: |
Embrapa Clima Temperado (CPACT) |
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