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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
17/09/2014 |
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Data da última atualização: |
26/05/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OLIVEIRA, E. J. de; FERREIRA, C. F.; SANTOS, V. da S.; OLIVEIRA, G. A. F. |
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Afiliação: |
EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF; CLAUDIA FORTES FERREIRA, CNPMF; VANDERLEI DA SILVA SANTOS, CNPMF; G.A.F. OLIVEIRA, UFRB. |
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Título: |
Development of a cassava core collection based on single nucleotide polymorphism markers. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v.13, n.3, p. 6472-85, August, 2014. |
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ISSN: |
1676-5680 |
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DOI: |
10.4238/2014. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Single nucleotide polymorphism (SNP) markers were used in the largest cassava (Manihot esculenta Crantz) germplasm collection from Brazil to develop core collections based on the maximization strategy. Subsets with 61, 64, 84, 128, 256, and 384 cassava accessions were selected and named PoHEU, MST64, PoRAN, MST128, MST256, and MST384, respectively. All the 798 alleles identified by 402 SNP markers in the entire collection were captured in all core collections. Only small alterations in the diversity parameters were observed for the different core collections compared with the complete collection. Because of the optimal adjustment of the validation parameters representative of the complete collection, the absence of genotypes with high genetic similarity and the maximization of the genetic distances between accessions of the PoHEU core collection, which contained 4.7% of the accessions of the complete collection, maximized the genetic conservation of this important cassava collection. Furthermore, the development of this core collection will allow concentrated efforts toward future characterization and agronomic evaluation of accessions to maximize the diversity and genetic gains in cassava breeding programs. |
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Thesagro: |
Mandioca; Marcador genético; Marcador molecular; Polimorfismo genético. |
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Thesaurus Nal: |
Cassava; Genetic markers; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 02035naa a2200265 a 4500
001 1995194
005 2023-05-26
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a1676-5680
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100 1 $aOLIVEIRA, E. J. de
245 $aDevelopment of a cassava core collection based on single nucleotide polymorphism markers.$h[electronic resource]
260 $c2014
520 $aSingle nucleotide polymorphism (SNP) markers were used in the largest cassava (Manihot esculenta Crantz) germplasm collection from Brazil to develop core collections based on the maximization strategy. Subsets with 61, 64, 84, 128, 256, and 384 cassava accessions were selected and named PoHEU, MST64, PoRAN, MST128, MST256, and MST384, respectively. All the 798 alleles identified by 402 SNP markers in the entire collection were captured in all core collections. Only small alterations in the diversity parameters were observed for the different core collections compared with the complete collection. Because of the optimal adjustment of the validation parameters representative of the complete collection, the absence of genotypes with high genetic similarity and the maximization of the genetic distances between accessions of the PoHEU core collection, which contained 4.7% of the accessions of the complete collection, maximized the genetic conservation of this important cassava collection. Furthermore, the development of this core collection will allow concentrated efforts toward future characterization and agronomic evaluation of accessions to maximize the diversity and genetic gains in cassava breeding programs.
650 $aCassava
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650 $aSingle nucleotide polymorphism
650 $aMandioca
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700 1 $aFERREIRA, C. F.
700 1 $aSANTOS, V. da S.
700 1 $aOLIVEIRA, G. A. F.
773 $tGenetics and Molecular Research$gv.13, n.3, p. 6472-85, August, 2014.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Origem |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 34 | |
| 7. |  | OLIVEIRA, G. A. F.; DANTAS, J. L. L.; OLIVEIRA, E. J. de. Desenvolvimento de SNP (Single-Nucleotide Polymorphism) para estudos de variação genética e estabelecimento de coleção nuclear em mamoeiro (Carica papayaL.). In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 8., 2014, Cruz das Almas, Ba. Pesquisa: despertando mentes para a inovação e transformando o futuro :[anais]. Cruz das Almas, Ba, Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 14. | | COSTA, J. L. C.; OLIVEIRA, E. J. de; OLIVEIRA, G. A. F.; SILVA, A. dos S.; YAMAGISHI, M. E. B. Minissatélites: novas ferramentas moleculares para o mamoeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. pdf 915| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 15. | | COSTA, J. L.; OLIVEIRA, E. J. de; OLIVEIRA, G. A. F.; CARVALHO, F. M. de; DANTAS, J. L. L. Otimização de locos de microssatélites para diferentes espécies de Passiflora. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 4., 2010, Cruz das Almas. [Anais...] Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2010. (Embrapa Mandioca e Fruticultura. Documentos, 190). 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 17. | | OLIVEIRA, G. A. F.; OLIVEIRA, H. B.; BARBOSA, C. de J.; HADDAD, F.; JESUS, O. N. de; OLIVEIRA, E. J. de. Avaliação da resistência do maracujazeiro à fusariose em condições de campo. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 6., 2012, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 18. | | CONCEIÇÃO, J. Q. da; LEDO, C. A. da S.; OLIVEIRA, G. A. F.; SANTOS, E. A.; CONCEIÇÃO, A. L. da S. Caracterização físico-química de frutos de mamoeiro com base em descritores quantitativos e qualitativos. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 10., 2016: Cruz das Almas, BA. Traduzindo ciência para o mundo : resumos. Brasília, DF : Embrapa, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 19. | | COSTA, J. L.; OLIVEIRA, E. J. de; JESUS, O. N. de; OLIVEIRA, G. A. F.; NEVES, C. G.; CASTRO, J. A. Estudo de diversidade genética em Passiflora edulis Sims com o uso de marcadores ISSR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. pdf 913| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 20. | | OLIVEIRA, G. A. F.; OLIVEIRA, E. J. de; CARVALHO, F. M. de C.; SILVA, A. dos S.; COSTA, J. L; DANTAS, J. L. L. Identificação de genótipos com alto nível de homozigosidade visando à obtenção de linhagens de mamoeiro por seleção assistida por marcadores microssatélites. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 4., 2010, Cruz das Almas. [Anais...] Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2010. (Embrapa Mandioca e Fruticultura. Documentos, 190).1 CD-ROM. PDF. 014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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