|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
07/12/2015 |
Data da última atualização: |
17/11/2023 |
Autoria: |
OLIVEIRA, G. A. F. |
Afiliação: |
GILMARA ALVARENGA FACHARDO OLIVEIRA, UFRB. |
Título: |
Identificação, caracterização e validação de marcadores minissatélltes para o mamoeiro. |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
Dissertação (Mestrado em Recursos Genéticos Vegetais) - Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, Cruz das Almas, 2015. |
Páginas: |
99f. |
Descrição Física: |
il. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Orientador: Prof. Dr. Jorge Luiz Loyola Dantas, CNPMF; Coorientador: Prof. Dr. Eder Jorge De Oliveira. Pesquisador aposentado CNPMF. |
Conteúdo: |
Identificação de polimorfismos em espécies com baixa variabilidade molecular como o mamoeiro (Carica papaya L.) é um desafio para a pesquisa.Assim, o objetivo desse estudo foi identificar, caracterizar e validar o polimorfismode marcadores minissatélites visando o manejo, conservação e uso dos recursosgenéticos do mamoeiro. O genoma depositado no banco de dados foi utilizadopara identificação de locos minissatélites com motivos de6 a 500 pares de bases(pb). Foram identificados 1.730 minissatélites com no mínimo seis repetições(média de 1 a cada 156Kb), cujo conteúdo médio de GC foi de 28,84% e médiade 9,27 repetições por loco. Motivos com até 20 bases foram os mais frequentes(71,5%). O polimorfismo de 82 minissatélites foi avaliado em 24 acessos demamoeiro e comparado com marcadores microssatélites, cujos resultadosdemostraram a presença de 3,10 e 3,57 alelos por loco, respectivamente. Maior heterozigosidade esperada (He=0,52), observada (Ho=0,16), conteúdo deinformação polimórfica (PIC=0,47) e diversidade de Shannon-Wiener (H=1, 10) foi verificada nos microssatélites em comparação com os minissatélites (He=0,42, Ho=O,11, PIC=0,38 e H=0,85, respectivamente), possivelmente em função dohermafroditismo da maioria dos acessos avaliados. Contudo, a probabilidade de exclusão de paternidade e de identidade foi elevada para ambos os marcadores. Com relação à estrutura populacional, ambos marcadores indicaram a organização do germoplasma em dois grupos (K=2), embora os minissatélites tenham apontado a presença de uma subestrutura (K=4). Este é um dos primeiros trabalhos relacionado ao desenvolvimento de minissatélites para o mamoeiro, cujo menor polimorfismo em comparação com os microssatélites pode ser compensado pelo melhor poder de discriminação dos alelos e maior acurácia na identificação genotípica dos indivíduos. MenosIdentificação de polimorfismos em espécies com baixa variabilidade molecular como o mamoeiro (Carica papaya L.) é um desafio para a pesquisa.Assim, o objetivo desse estudo foi identificar, caracterizar e validar o polimorfismode marcadores minissatélites visando o manejo, conservação e uso dos recursosgenéticos do mamoeiro. O genoma depositado no banco de dados foi utilizadopara identificação de locos minissatélites com motivos de6 a 500 pares de bases(pb). Foram identificados 1.730 minissatélites com no mínimo seis repetições(média de 1 a cada 156Kb), cujo conteúdo médio de GC foi de 28,84% e médiade 9,27 repetições por loco. Motivos com até 20 bases foram os mais frequentes(71,5%). O polimorfismo de 82 minissatélites foi avaliado em 24 acessos demamoeiro e comparado com marcadores microssatélites, cujos resultadosdemostraram a presença de 3,10 e 3,57 alelos por loco, respectivamente. Maior heterozigosidade esperada (He=0,52), observada (Ho=0,16), conteúdo deinformação polimórfica (PIC=0,47) e diversidade de Shannon-Wiener (H=1, 10) foi verificada nos microssatélites em comparação com os minissatélites (He=0,42, Ho=O,11, PIC=0,38 e H=0,85, respectivamente), possivelmente em função dohermafroditismo da maioria dos acessos avaliados. Contudo, a probabilidade de exclusão de paternidade e de identidade foi elevada para ambos os marcadores. Com relação à estrutura populacional, ambos marcadores indicaram a organização do germoplasma em dois grupos (K=2), embora os minissatélites... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Carica Papaya; Mamão; Marcador molecular; Melhoramento vegetal. |
Thesaurus Nal: |
Breeding; Genetic markers. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
Marc: |
LEADER 02679nam a2200205 a 4500 001 2030804 005 2023-11-17 008 2015 bl uuuu m 00u1 u #d 100 1 $aOLIVEIRA, G. A. F. 245 $aIdentificação, caracterização e validação de marcadores minissatélltes para o mamoeiro. 260 $aDissertação (Mestrado em Recursos Genéticos Vegetais) - Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, Cruz das Almas$c2015 300 $a99f.$cil. 500 $aOrientador: Prof. Dr. Jorge Luiz Loyola Dantas, CNPMF; Coorientador: Prof. Dr. Eder Jorge De Oliveira. Pesquisador aposentado CNPMF. 520 $aIdentificação de polimorfismos em espécies com baixa variabilidade molecular como o mamoeiro (Carica papaya L.) é um desafio para a pesquisa.Assim, o objetivo desse estudo foi identificar, caracterizar e validar o polimorfismode marcadores minissatélites visando o manejo, conservação e uso dos recursosgenéticos do mamoeiro. O genoma depositado no banco de dados foi utilizadopara identificação de locos minissatélites com motivos de6 a 500 pares de bases(pb). Foram identificados 1.730 minissatélites com no mínimo seis repetições(média de 1 a cada 156Kb), cujo conteúdo médio de GC foi de 28,84% e médiade 9,27 repetições por loco. Motivos com até 20 bases foram os mais frequentes(71,5%). O polimorfismo de 82 minissatélites foi avaliado em 24 acessos demamoeiro e comparado com marcadores microssatélites, cujos resultadosdemostraram a presença de 3,10 e 3,57 alelos por loco, respectivamente. Maior heterozigosidade esperada (He=0,52), observada (Ho=0,16), conteúdo deinformação polimórfica (PIC=0,47) e diversidade de Shannon-Wiener (H=1, 10) foi verificada nos microssatélites em comparação com os minissatélites (He=0,42, Ho=O,11, PIC=0,38 e H=0,85, respectivamente), possivelmente em função dohermafroditismo da maioria dos acessos avaliados. Contudo, a probabilidade de exclusão de paternidade e de identidade foi elevada para ambos os marcadores. Com relação à estrutura populacional, ambos marcadores indicaram a organização do germoplasma em dois grupos (K=2), embora os minissatélites tenham apontado a presença de uma subestrutura (K=4). Este é um dos primeiros trabalhos relacionado ao desenvolvimento de minissatélites para o mamoeiro, cujo menor polimorfismo em comparação com os microssatélites pode ser compensado pelo melhor poder de discriminação dos alelos e maior acurácia na identificação genotípica dos indivíduos. 650 $aBreeding 650 $aGenetic markers 650 $aCarica Papaya 650 $aMamão 650 $aMarcador molecular 650 $aMelhoramento vegetal
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 34 | |
8. | | OLIVEIRA, G. A. F.; DANTAS, J. L. L.; OLIVEIRA, E. J. de. Desenvolvimento de SNP (Single-Nucleotide Polymorphism) para estudos de variação genética e estabelecimento de coleção nuclear em mamoeiro (Carica papayaL.). In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 8., 2014, Cruz das Almas, Ba. Pesquisa: despertando mentes para a inovação e transformando o futuro :[anais]. Cruz das Almas, Ba, Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
14. | | COSTA, J. L.; OLIVEIRA, E. J. de; OLIVEIRA, G. A. F.; CARVALHO, F. M. de; DANTAS, J. L. L. Otimização de locos de microssatélites para diferentes espécies de Passiflora. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 4., 2010, Cruz das Almas. [Anais...] Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2010. (Embrapa Mandioca e Fruticultura. Documentos, 190). 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
15. | | COSTA, J. L. C.; OLIVEIRA, E. J. de; OLIVEIRA, G. A. F.; SILVA, A. dos S.; YAMAGISHI, M. E. B. Minissatélites: novas ferramentas moleculares para o mamoeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. pdf 915Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
17. | | CONCEIÇÃO, J. Q. da; LEDO, C. A. da S.; OLIVEIRA, G. A. F.; SANTOS, E. A.; CONCEIÇÃO, A. L. da S. Caracterização físico-química de frutos de mamoeiro com base em descritores quantitativos e qualitativos. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 10., 2016: Cruz das Almas, BA. Traduzindo ciência para o mundo : resumos. Brasília, DF : Embrapa, 2016.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
18. | | OLIVEIRA, G. A. F.; OLIVEIRA, H. B.; BARBOSA, C. de J.; HADDAD, F.; JESUS, O. N. de; OLIVEIRA, E. J. de. Avaliação da resistência do maracujazeiro à fusariose em condições de campo. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 6., 2012, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2012.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
19. | | OLIVEIRA, E. J. de; SANTOS, V. da S.; FERREIRA, C. F.; OLIVEIRA, G. A. F.; SILVA, M. S. da; AGUILAR-VILDOSO, C. I. Seleção de SNP (Single-Nucleotide Polymorphism) informativos para integração de análises moleculares em mandioca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MANDIOCA, 14.; FEIRA BRASILEIRA DA MANDIOCA, 1., 2011, Maceió. Mandioca: fonte de alimento e energia: anais. Maceió: ABAM: SBM, 2011. 1 CD ROM. Biotecnologia. Resumo 250.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
20. | | COSTA, J. L.; OLIVEIRA, E. J. de; JESUS, O. N. de; OLIVEIRA, G. A. F.; NEVES, C. G.; CASTRO, J. A. Estudo de diversidade genética em Passiflora edulis Sims com o uso de marcadores ISSR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. pdf 913Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
Registros recuperados : 34 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|