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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
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Data corrente: |
16/12/2013 |
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Data da última atualização: |
10/12/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PEREIRA, G. S.; NUNES, E. S.; LAPERUTA, L. D. C.; BRAGA, M. F.; PENHA, H. A.; DINIZ, A. L.; MUNHOZ, C. F.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; VIEIRA, M. L. C. |
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Afiliação: |
ESALQ/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; MARCELO FIDELES BRAGA, CPAC; ESALQ/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP. |
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Título: |
Molecular polymorphism and linkage analysis in sweet passion fruit, an outcrossing species. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Annals of Applied Biology, v. 162, n. 3, p. 347-361, 2013. |
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ISSN: |
0003-4746 |
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DOI: |
10.1111/aab.12028 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
One of the current challenges of tropical fruit crop improvement is to incorporate molecular marker-based approaches into conventional breeding programmes. This study was designed to build an integrated genetic map of the sweet passion fruit (Passiflora alata), a diploid (2n = 18) outcrossing species which is greatly appreciated for in natura consumption, and reported to inspire cosmetic and pharmaceutical companies to create plant-derived compounds. With this in mind, a full-sib family of 180 individuals was genotyped using different molecular marker types, such as amplified fragment length polymorphisms (AFLP), microsatellite-AFLP (M-AFLP), simple sequence repeats (SSR), resistance gene analogues (RGA) and target region amplification polymorphism (TRAP). On average, the rate of polymorphism between the parental genotypes was 20.3%. We also searched for single nucleotide polymorphisms (SNPs) in some AFLP bands and in seven gene fragments, and found one SNP every 87 bp. All SNPs were biallelic and occurred most frequently in putative gene fragments (81.5%) rather than in AFLP bands (60.0%) analyzed. Excellent gel profiles were obtained allowing the recognition of all types of segregation expected for a progeny of an outcrossing species. Multipoint linkage analysis was performed using OneMap software, with logarithm of the odds (LOD) score ≥ 5.6 and recombination fraction <0.5. The resulting integrated map consists of 549 markers, 2.0% of which fit a segregation ratio of 1:1:1:1, 1.3% a ratio of 1:2:1, 27.3% a ratio of 3:1 and 69.4% a ratio of 1:1. The map spanned a total of 2073.0 cM, with an average distance between adjacent markers of 3.8 cM. This is the first linkage study on sweet passion fruit and should prove useful for quantitative trait loci mapping. MenosOne of the current challenges of tropical fruit crop improvement is to incorporate molecular marker-based approaches into conventional breeding programmes. This study was designed to build an integrated genetic map of the sweet passion fruit (Passiflora alata), a diploid (2n = 18) outcrossing species which is greatly appreciated for in natura consumption, and reported to inspire cosmetic and pharmaceutical companies to create plant-derived compounds. With this in mind, a full-sib family of 180 individuals was genotyped using different molecular marker types, such as amplified fragment length polymorphisms (AFLP), microsatellite-AFLP (M-AFLP), simple sequence repeats (SSR), resistance gene analogues (RGA) and target region amplification polymorphism (TRAP). On average, the rate of polymorphism between the parental genotypes was 20.3%. We also searched for single nucleotide polymorphisms (SNPs) in some AFLP bands and in seven gene fragments, and found one SNP every 87 bp. All SNPs were biallelic and occurred most frequently in putative gene fragments (81.5%) rather than in AFLP bands (60.0%) analyzed. Excellent gel profiles were obtained allowing the recognition of all types of segregation expected for a progeny of an outcrossing species. Multipoint linkage analysis was performed using OneMap software, with logarithm of the odds (LOD) score ≥ 5.6 and recombination fraction <0.5. The resulting integrated map consists of 549 markers, 2.0% of w... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Maracujá; Marcador genético; Marcador molecular; Melhoramento genético vegetal; Polimorfismo Genético. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic improvement; Genetic markers; Genetic polymorphism; Passiflora alata; Passion fruits. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
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| Registros recuperados : 23 | |
| 13. |  | SILVA, P. V. da S. e; LEAO, N. V. M.; FREITAS, A. D. D. de; BRIENZA JUNIOR, S. Avaliação da fenologia reprodutiva e qualidade fisiológica da sementes de joão mole (Neea oppositifolia) em Igarapé-Açu - Pará. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 54.; REUNIÃO AMAZÔNICA DE BOTÂNICA, 3., 2003, Belém, PA. Botânica: desafios da botânica brasileira no novo milênio: inventário, sistematização, conservação e uso da diversidade vegetal: resumos. Belém, PA: Sociedade Botânica do Brasil: UFRA: Museu Paraense Emílio Goeldi: Embrapa Amazônia Oriental, 2003.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 14. | | REIS, A. R. S.; LEÃO, N. V. M.; FREITAS, A. D. D. de; MEURER, J. de S. Aspectos tecnológicos e morfológicos de fruto, sementes e plântulas de amarelão (Apuleia leiocarpa (vogel) J.F. Macbr. - Fabaceae). In: SEMANA DE INTEGRAÇÃO DAS CIÊNCIAS AGRÁRIAS, 11., 2011, Altamira. Otimização dos sistemas de produção agrícola e florestal frente aos novos desafios do território da Transamazônica e Xingu. Belém, PA: Banco da Amazônia, 2011. p. 137-141. SICA.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 15. | | SANTOS, A. P. F. dos; PESSOA, B. de O.; SOUZA, A. S. de; FREITAS, A. D. D.; CELESTINO FILHO, P. Caracterização dendrológica de uma vegetação secundária sucedida de plantação de cacau no campo experimental da Embrapa, Km 23 - Altamira-PA. In: SEMANA DE INTEGRAÇÃO DAS CIÊNCIAS AGRÁRIAS, 11., 2011, Altamira. Otimização dos sistemas de produção agrícola e florestal frente aos novos desafios do território da Transamazônica e Xingu. Belém, PA: Banco da Amazônia, 2011. p. 72-75.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 16. | | FREITAS, A. D. D. de; LEAO, N. V. M.; SILVA, P. V. da S. e; BRIENZA JUNIOR, S. Fenologia reprodutiva e estudos de tecnologia de sementes da espécie inga thibaudiana em Igarapé-Açu (PA). In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 54.; REUNIÃO AMAZÔNICA DE BOTÂNICA, 3., 2003, Belém, PA. Botânica: desafios da botânica brasileira no novo milênio: inventário, sistematização, conservação e uso da diversidade vegetal: resumos. Belém, PA: Sociedade Botânica do Brasil: UFRA: Museu Paraense Emílio Goeldi: Embrapa Amazônia Oriental, 2003. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 17. | | REIS, A. R. S.; FREITAS, A. D. D. de; LEÃO, N. V. M.; SANTOS FILHO, B. G. dos. Morphological aspects of fruits, seeds, and seedlings, and anatomy of seedlings of apuleia molaris spruce ex benth. Journal of Seed Science, v. 38, n. 2, p. 118-128, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 18. | | CARVALHO, J. C. de; REIS, L. P.; REIS, J. da S. F.; FREITAS, A. D. D. de F.; CELESTINO FILHO, P. Análise das principais características dendrológicas de espécies arbóreas encontradas em capoeira de dez anos, Município de Altamira. In: SEMANA DE INTEGRAÇÃO DAS CIÊNCIAS AGRÁRIAS, 11., 2011, Altamira. Otimização dos sistemas de produção agrícola e florestal frente aos novos desafios do território da Transamazônica e Xingu. Belém, PA: Banco da Amazônia, 2011. p. 103-106.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 20. | | FREITAS, A. D. D. de; SANTOS FILHO, B. G. dos; LEAO, N. V. M.; REIS, A. R. de S.; LEAL, A. P. C. Biometria dos frutos e sementes de Dalbergia spruceana Benth. In: SEMANA DE INTEGRAÇÃO DAS CIÊNCIAS AGRÁRIAS, 11., 2011, Altamira. Otimização dos sistemas de produção agrícola e florestal frente aos novos desafios do território da Transamazônica e Xingu. Belém, PA: Banco da Amazônia, 2011. p. 134-137.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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