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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Café. Para informações adicionais entre em contato com biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
27/08/2024 |
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Data da última atualização: |
27/05/2025 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, L. de F.; LEICHTWEIS, B. G.; SILVA, A. C. A.; ROCHA, R. B.; TEIXEIRA, A. L.; CAIXETA, E. T. |
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Afiliação: |
LETÍCIA DE FARIA SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; BRUNO GRESPAN LEICHTWEIS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; ANA CAROLINA ANDRADE SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; RODRIGO BARROS ROCHA, CNPCA; ALEXSANDRO LARA TEIXEIRA, CNPCA; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA MOURA, CNPCA. |
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Título: |
Fingerprinting Amazonian coffees: assessing diversity through molecular markers. |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
Euphytica, v. 220, n. 28, 2024. |
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Páginas: |
17 p. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Characterization of genetic resources is a prerequisite for plant breeding and germplasm management. In this context, the use of molecular markers for validation of genetic passports based on DNA analyses is crucial for identification of cultivars and traceability in coffee breeding programs. A total of 96 Coffea canephora genotypes cultivated in the Western Amazonia were evaluated, including plants of the botanical varieties Conilon, Robusta, and hybrids from the germplasm bank of the Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa), as well as clones in the public domain coming from growers in the state. The germplasm was evaluated with 12 simple sequence repeat (SSR) marker to quantify the genetic diversity also considering the discrimination power of these markers. Were identified 96 unique fingerprint profiles and a set of primers of higher efficiency for discrimination C. canephora genotypes. The genetic relationships illustrated by hierarchical clusterings and discriminant analyses showed distinction between the botanical varieties Conilon and Robusta and higher diversity in the Robusta variety. The set of molecular markers allowed to identify hybrid genotypes that were misclassified in populations of Conilon and Robusta botanical varieties as well as genealogy mistakes. Unique genetic profiles were detected for each clone in the public domain of the state. Previously unknown, these genotypes were classified according to their phenotypic similarities with each other and with the Conilon, Robusta, and hybrid accessions. These results are valuable for future management of the Amazonian coffee and useful to assist and accelerate the selection and crosses in the genetic breeding program. MenosCharacterization of genetic resources is a prerequisite for plant breeding and germplasm management. In this context, the use of molecular markers for validation of genetic passports based on DNA analyses is crucial for identification of cultivars and traceability in coffee breeding programs. A total of 96 Coffea canephora genotypes cultivated in the Western Amazonia were evaluated, including plants of the botanical varieties Conilon, Robusta, and hybrids from the germplasm bank of the Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa), as well as clones in the public domain coming from growers in the state. The germplasm was evaluated with 12 simple sequence repeat (SSR) marker to quantify the genetic diversity also considering the discrimination power of these markers. Were identified 96 unique fingerprint profiles and a set of primers of higher efficiency for discrimination C. canephora genotypes. The genetic relationships illustrated by hierarchical clusterings and discriminant analyses showed distinction between the botanical varieties Conilon and Robusta and higher diversity in the Robusta variety. The set of molecular markers allowed to identify hybrid genotypes that were misclassified in populations of Conilon and Robusta botanical varieties as well as genealogy mistakes. Unique genetic profiles were detected for each clone in the public domain of the state. Previously unknown, these genotypes were classified according to their phenotypic similarities with each ot... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Coffea Canephora. |
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Thesaurus Nal: |
Germplasm; Plant breeding. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
null
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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| Registros recuperados : 637 | |
| 3. |  | GOMES, A.; TADINI, A. M.; MILORI, D. M. B. P. Análise de ácidos húmicos da Amazônia por fluorescência 2D e 3D. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 13., 2021, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação, 2021. Editores técnicos: Alexandre Berndt, Ana Rita de Araujo Nogueira, Lea Chapaval Andri, Marcelo Mattos Cavallari, Manuel Antonio Chagas Jacinto. 51| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 4. | | MILORI, D. M. B. P.; VILLAS-BOAS, P. R. Avaliação da idade de solos usando a técnica LIBS. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA, 2014, São Carlos, SP Anais do SIAGRO: ciência, inovação e mercado 2014. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2014. p. 585-588. Editores: Carlos Manoel Pedro Vaz, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Silvio Crestana.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 13. | | ARAUJO, R. R.; MILORI, D. M. B. P. Otimização da porcentagem de ligante para análise de metais por DP-LIBS das amostras de solo e sedimento do pantanal mato-grossense. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA, 4., 2019, São Carlos, SP. Ciência, inovação e mercado: anais. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2019. Editores: Paulino Ribeiro Villas-Boas, Maria Alice Martins, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Ladislau Martin Neto. SIAGRO 2019. 28-32| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 18. | | GUALDANI, B. A.; XAVIER, A. A. P.; MILORI, D. M. B. P. Análise do impacto da aquicultura na quantidade de carbono e na humificação do solo ao redor dos tanques de criação. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA, 4., 2019, São Carlos, SP. Ciência, inovação e mercado: anais. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2019. Editores: Paulino Ribeiro Villas-Boas, Maria Alice Martins, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Ladislau Martin Neto. SIAGRO 2019. 366-369| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 19. | | SEGNINI, A.; POSADAS, A.; MILORI, D. M. B. P.; VAZ, C. M. P.; MARTIN NETO, L. Aplicação da instrumentação espectroscópica para avaliação da humificação da matéria orgânica em solos dos Andes peruanos. In: JORNADA CIENTÍFICA-EMBRAPA SÃO CARLOS, 2009, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação Agropecuária, 2009. p. 84 (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 90)| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 20. | | KUBOTA, T. M. K.; MILORI, D. M. B. P.; BOAS, P. R. V. Acompanhamento de árvores de citros no campo utilizando Photon-Citrus para avaliação de precocidade de diagnóstico de HLB (Greening). In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 144. Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Lucimara Aparecida Forato, Maria Alice Martins, Ladislau Marcelino Rabello, Rubens Bernardes Filho. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56)| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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