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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
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Data corrente: |
22/08/2023 |
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Data da última atualização: |
19/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ABREU, C. G. de; ROESCH, L. F. W.; ANDREOTE, F. D.; SILVA, S. R.; MORAES, T. S. J. de; ZIED, D. C.; SIQUEIRA, F. G. de; DIAS, E. S.; VARANI, A. M.; PYLRO, V. S. |
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Afiliação: |
CARLOS GODINHO DE ABREU, FEDERAL UNIVERSITY OF LAVRAS; LUIZ FERNANDO WURDIG ROESCH, UNIVERSITY OF FLORIDA; FERNANDO DINI ANDREOTE, “LUIZ DE QUEIROZ” COLLEGE OF AGRICULTURE, UNIVERSITY OF SÃO PAULO; SAURA RODRIGUES SILVA, UNIVERSITY OF FLORIDA; TATIANA SILVEIRA JUNQUEIRA DE MORAES, FEDERAL UNIVERSITY OF LAVRAS; DIEGO CUNHA ZIED, SÃO PAULO STATE UNIVERSITY (UNESP); FELIX GONCALVES DE SIQUEIRA, CNPAE; EUSTÁQUIO SOUZA DIAS, FEDERAL UNIVERSITY OF LAVRAS; ALESSANDRO M. VARANI, SÃO PAULO STATE UNIVERSITY (UNESP); VICTOR SATLER PYLRO, FEDERAL UNIVERSITY OF LAVRAS. |
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Título: |
Decoding the chromosome-scale genome of the nutrient-rich Agaricus subrufescens: A Resource for fungal biology and biotechnology. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Research in Microbiology, v. 174, n. 8, 104116, 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.resmic.2023.104116 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Agaricus subrufescens, also known as the "sun mushroom," has significant nutritional 27 and medicinal value. However, its short shelf life due to the browning process results 28 in post-harvest losses unless it's quickly dehydrated. This restricts its availability to 29 consumers in the form of capsules. A genome sequence of A. subrufescens may lead 30 to new cultivation alternatives or the application of gene editing strategies to delay the 31 browning process. We assembled a chromosome-scale genome using a hybrid 32 approach combining Illumina and Nanopore sequencing. The genome was assembled 33 into 13 chromosomes and 31 unplaced scaffolds, totaling 44.5 Mb with 96.5% 34 completeness and 47.24% GC content. 14,332 protein-coding genes were identified, 35 with 64.6% of the genome covered by genes and 23.41% transposable elements. The mitogenome was circularized and encoded fourteen typical mitochondrial genes. Four polyphenol oxidase (PPO) genes and the Mating-type locus were identified. Phylogenomic analysis supports the placement of A. subrufescens in the Agaricomycetes clade. This is the first available genome sequence of a strain of the "sun mushroom." Results are available through a Genome Browser (https://plantgenomics.ncc.unesp.br/gen.php?id=Asub) and can support further fungal biological and genomic studies. |
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Thesaurus Nal: |
Agaricus subrufescens. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
null
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 1 | |
| 1. |  | RANCAN, D. C.; ALVES, R. B. N.; KRAHO, A. Y.; KRAHO, O. K.; KRAHO, J. M.; ZARUR, S. B. B. C.; DIAS, T. A. B. Cultivo de roças na aldeia Pedra Branca, Tocantins-uma visão etnobiológica. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 7., 2002, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2002. p. 102.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Registros recuperados : 1 | |
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