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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
15/10/2015 |
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Data da última atualização: |
15/03/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GODOY, T. F.; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; GHEYAS, A. A.; GASPARIN, G.; PADUAN, M.; ANDRADE, S. C. S.; MONTENEGRO, H.; BURT, D. W.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
THAYS FERNANDA GODOY, ESALQ; GABRIEL COSTA MONTEIRO MOREIRA, ESALQ; CLARISSA BOSCHIERO, ESALQ; ALMAS A. GHEYAS, University of Edinburgh; GUSTAVO GASPARIN, ESALQ; MARCELA PADUAN, ESALQ; SONIA CRISTINA DA SILVA ANDRADE, ESALQ; HORACIO MONTENEGRO, ESALQ; DAVID W. BURT, University of Edinburgh; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA; LUIZ LEHMANN COUTINHO, ESALQ. |
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Título: |
SNP and INDEL detection in a QTL region on chicken chromosome 2 associated with muscle deposition. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Animal Genetics, v. 6, n. 2, p. 158-163, 2015. |
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DOI: |
10.1111/age.12271 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genetic improvement is important for the poultry industry, contributing to increased efficiency of meat production and quality. Because breast muscle is the most valuable part of the chicken carcass, knowledge of polymorphisms influencing this trait can help breeding programs. Therefore, the complete genome of 18 chickens from two different experimental lines (broiler and layer) from EMBRAPA was sequenced, and SNPs and INDELs were detected in a QTL region for breast muscle deposition on chicken chromosome 2 between microsatellite markers MCW0185 and MCW0264 (105 849?112 649 kb). Initially, 94 674 unique SNPs and 10 448 unique INDELs were identified in the target region. After quality filtration, 77% of the SNPs (85 765) and 60% of the INDELs (7828) were retained. The studied region contains 66 genes, and functional annotation of the filtered variants identified 517 SNPs and three INDELs in exonic regions. Of these, 357 SNPs were classified as synonymous, 153 as nonsynonymous, three as stopgain, four INDELs as frameshift and three INDELs as nonframeshift. These exonic mutations were identified in 37 of the 66 genes from the target region, three of which are related to muscle development (DTNA, RB1CC1 and MOS). Fifteen non-tolerated SNPs were detected in several genes (MEP1B, PRKDC, NSMAF, TRAPPC8, SDR16C5, CHD7, ST18 and RB1CC1). These loss-of-function and exonic variants present in genes related to muscle development can be considered candidate variants for further studies in chickens. Further association studies should be performed with these candidate mutations as should validation in commercial populations to allow a better explanation of QTL effects. MenosGenetic improvement is important for the poultry industry, contributing to increased efficiency of meat production and quality. Because breast muscle is the most valuable part of the chicken carcass, knowledge of polymorphisms influencing this trait can help breeding programs. Therefore, the complete genome of 18 chickens from two different experimental lines (broiler and layer) from EMBRAPA was sequenced, and SNPs and INDELs were detected in a QTL region for breast muscle deposition on chicken chromosome 2 between microsatellite markers MCW0185 and MCW0264 (105 849?112 649 kb). Initially, 94 674 unique SNPs and 10 448 unique INDELs were identified in the target region. After quality filtration, 77% of the SNPs (85 765) and 60% of the INDELs (7828) were retained. The studied region contains 66 genes, and functional annotation of the filtered variants identified 517 SNPs and three INDELs in exonic regions. Of these, 357 SNPs were classified as synonymous, 153 as nonsynonymous, three as stopgain, four INDELs as frameshift and three INDELs as nonframeshift. These exonic mutations were identified in 37 of the 66 genes from the target region, three of which are related to muscle development (DTNA, RB1CC1 and MOS). Fifteen non-tolerated SNPs were detected in several genes (MEP1B, PRKDC, NSMAF, TRAPPC8, SDR16C5, CHD7, ST18 and RB1CC1). These loss-of-function and exonic variants present in genes related to muscle development can be considered candidate variants for further studies i... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Músculo de peito; SNPs. |
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Thesagro: |
Frango; Melhoramento genético animal; Mutação. |
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Thesaurus Nal: |
Animal genetics; Breast muscle; Broiler chickens; Genetic polymorphism; Quantitative trait loci; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02784naa a2200385 a 4500
001 2026548
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 26 | |
| 1. |  | PENA, H. C.; MACHADO, F. S.; CAMPOS, M. M.; TOMICH, T. R.; PEREIRA, L. G. R.; JAYME, C. G. Predição do peso vivo a partir de medidas corporais em animais Girolando. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 15., 2015, Juiz de Fora, MG Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2015. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 176.). 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 2. | | JAYME, D. G.; RAPOSO, V. S.; GONÇALVES, L. C.; TOMICH, T. R.; JAYME, C. G.; TEIXEIRA, A. DE M. Conservação de forrageiras. Caderno de Ciencias Agrarias, v. 4, n. 10, p. 54-68, 2012| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 3. | | MAURICIO, R. M.; PEREIRA, L. G. R.; GONCALVES, L. C.; TOMICH, T. R.; RODRIGUES, J. A. S.; RODRIGUEZ, N. M.; PIRES, D. A. de A.; JAYME, C. G. Avaliação das silagens de girassol (híbrido M734) obtidas em diferentes épocas de ensilagem pela técnica in vitro semi-automática de produção de gases. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 39., 2002, Recife. A produção animal e a sociedade brasileira: anais. Recife: UFRPE: SBZ, 2002. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 4. | | MARTINS, P. C.; CAMPOS, M. M.; JAYME, C. G.; MACHADO, F. S.; TOMICH, T. R.; PEREIRA, L. G. R.; SILVA, R. B. e; ARAÚJO, W. L. de P. Levantamento das técnicas zootécnicas utilizadas na criação de bezerras leiteiras no município de Rio Pomba, MG. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 15., 2015, Juiz de Fora, MG. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2015. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 176.). 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 5. | | GUIMARAES JUNIOR, R.; GONCALVES, L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; JAYME, C. G.; RODRIGUEZ, N. M.; BORGES, I.; BORGES, A. L. C. C.; SALIBA, E. de O. S. Consumo e digestibilidade aparente da matéria seca e da proteína bruta das silagens de três genótipos de milheto (Pennisetum glaucum) NPM-1, BRS-1501, CMS-3 em ovinos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNICA, 38., 2001, Piracicaba. Anais... Piracicaba: FEALQ, 2001. p. 1096-1097.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 6. | | JAYME, D. G.; GONÇALVES, L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; RODRIGUEZ, N. M.; BORGES, I.; BORGES, A. L. C. C.; PEREIRA, L. G. R.; JAYME, C. G. Qualidade das silagens de seis genótipos de girassol (Helianthus annuus L.). In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 38., 2001, Piracicaba. A produção animal na visão dos brasileiros: anais. Piracicaba: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2001.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 7. | | CAMPOS, W. E.; SATURNINO, H. M.; SOUSA, B. M. de; BORGES, I.; GONÇALVES, L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; JAYME, C. G. Avaliação da degradabilidade in situ da fibra detergente neutro e fibra detergente ácido de quatro genótipos de sorgo (Sorghum bicolor L. Moench) com diferentes teores de tanino. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 38., 2001, Piracicaba. A produção animal na visão dos brasileiros: anais. Piracicaba: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2001.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 8. | | TOMICH, T. R.; JAYME, C. G.; JAYME, D. G.; FERREIRA, D. A.; GONCALVES, L. C.; PINTO, R. G.; RIBEIRO, C. G. M.; RODRIGUES, J. A. S. Composição química de vinte e cinco híbridos de sorgo com capim-sudão (Sorghum bicolor x Sorghum sudanense) utilizados para produção de forragem. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 39., 2002, Recife. A produção animal e a sociedade brasileira: anais. Recife: UFRPE: SBZ, 2002. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 9. | | PEREIRA, L. G. R.; GONÇALVES, L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; RODRIGUEZ, N. M.; BORGES, I.; BORGES, A. L. C. C.; TOMICH, T. R.; JAYME, C. G. Frações fibrosas das silagens de seis genótipos de girassol (Helianthus annuus L.) em diferentes períodos de fermentação. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 38., 2001, Piracicaba. A produção animal na visão dos brasileiros: anais. Piracicaba: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2001.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 10. | | COSTA, I. C.; MARTINS, P. C.; LIMA, J. A. M.; MAURÍCIO, R. M.; MACHADO, F. S.; PEREIRA, L. G. R.; TOMICH, T. R.; COELHO, S. G.; JAYME, C. G.; CAMPOS, M. M. Associação entre índices de eficiência alimentar em novilhas F1 Holandês x Gir. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 18., 2016, Juiz de Fora, MG. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2016. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 197).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 11. | | RIBEIRO, M. H. S.; OLIVEIRA FILHO, C. A. A. de; MACHADO, F. S.; FERREIRA, A. L.; PEREIRA, L. G. R.; CAMPOS, M. M.; JAYME, C. G.; TOMICH, T. R. Digestibilidade e desempenho de novilhas Holandês, Gir e mestiças 1/2 Holandês x 1/2 Gir mantidas em diferentes níveis de ingestão de alimentos. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 18., 2016, Juiz de Fora, MG. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2016. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 197).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 12. | | FARIA JÚNIOR, W. G. de; COLODO, J. C. N.; JAYME, C. G.; FARIA, W. G. de; GONÇALVES, L. C.; BORGES, I.; RODRIGUES, J. A. dos S.; RODRIGUEZ, N. M.; BORGES, A. L. da C. C.; SALIBA, E. de O. S. Digestibilidade "in vitro" Daisy II (ANKOM): comparação de meios. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE CAPRINOS E OVINOS DE CORTE, 3; FEIRA NACIONAL DO AGRONEGÓCIO DA CAPRINO-OVINOCULTURA DE CORTE, 2007, João Pessoa. Anais... João Pessoa: EMEPA-PB, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 13. | | PIRES, D. A. de A.; GONÇALVES, L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; JAYME, D. G.; GUIMARAES JUNIOR, R.; RODRIGUEZ, N. M.; BORGES, I.; BORGES, A. L. C. C.; JAYME, C. G.; BOTELHO, P. R. F.; LIMA, L. O. B. Degradabilidade in situ das frações fibrosas da silagem de sorgo. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, v. 8, n. 2, 175-185, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
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| 14. | | PIRES, D. A. de A.; GONÇALVES, L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; JAYME, D. G.; GUIMARAES JUNIOR, R.; RODRIGUEZ, N. M.; BORGES, I.; BORGES, A. L. C. C.; JAYME, C. G.; BOTELHO, P. R. F.; LIMAS, L. O. B. Degradabilidade in situ das frações fibrosas da silagem de sorgo. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 8, n. 2, p. 175-185, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 15. | | PIRES, D. A. A.; GONCALVES, L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; RODRIGUEZ, N. M.; BORGES, I.; BORGES, A. L. C. C.; SALIBA, E. de O. S.; TOMICH, T. R.; JAYME, C. G. Consumo e digestibilidade aparente da matéria seca das silagens de quatro genótipos de sorgo (Sorghum bicolor (L.) Moench) em ovinos. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 38., 2001, Piracicaba, SP. Anais... Piracicaba: FEALQ, 2001. p. 1283-1284.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 16. | | PIRES, D. A. A.; GONCALVES, L. C.; BORGES, I.; RODRIGUEZ, N. M.; BORGES, A. L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; SALIBA, E. O. S.; JAYME, D. G.; GUIMARAES JUNIOR, R.; JAYME, C. G. Consumo e digestibilidade da matéria seca, proteína bruta, energia bruta e balanço de nitrogênio de silagens de sorgo ("Sorghum bicolor" (L.)) com e sem tanino nos grãos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 41., 2004, Campo Grande, MS. A produção animal e a segurança alimentar: anais dos simpósios e dos resumos. Campo Grande, MS: SBZ: Embrapa Gado de Corte, 2004. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 17. | | COSTA, I. C.; CAMPOS, M. M.; JAYME, C. G.; LIMA, J. A. M.; FONSECA, A. P.; MACHADO, F. S.; PEREIRA, L. G. R.; TOMICH, T. R.; BORGES, A. M.; ALVES, B. R. C. Escores visuais e suas associações com eficiência alimentar e reprodutiva em novilhas F1 Holandês-Gir. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 19., 2017, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2017. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 200.). 1 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 18. | | JAYME, D. G.; GONÇALVES, L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; PIRES, D. A. A.; GUIMARAES JUNIOR, R.; RODRIGUEZ, N. M.; BORGES, I.; BORGES, A. L. C. C.; SALIBA, E. O. S.; JAYME C. G. Qualidade das silagens de genótipos de girassol (Helianthus annuus) confeiteiros e produtores de óleo. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, Belo Horizonte, v. 59, n. 5, p. 1287-1293, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 19. | | PIRES, D. A. de A.; GUIMARAES JUNIOR, R.; JAYME, D. G.; GONÇALVES, L. C.; RODRIGUES, J. A. S.; RODRIGUEZ, N. M.; BORGES, I.; BORGES, A. L. C. C.; JAYME, C. G. Qualidade e valor nutritivo das silagens de três híbridos de sorgo (Sorghum bicolor L.) colhidos em diferentes estádios de maturação. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 5, n. 2, p. 241-256, 2006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 20. | | MARTINS, P. C.; CAMPOS, M. M.; MACHADO, F. S.; TOMICH, T. R.; PEREIRA, L. G. R.; JAYME, C. G.; COSTA, I. C.; LAGE, C. F. de A.; RIBAS, M. N.; CAVALCANTI, L. F. L. Validação do sistema integrado de monitoramento do consumo individual de água para bovinos jovens. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 15., 2015, Juiz de Fora, MG Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2015. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 176.). 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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