|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Suínos e Aves. Para informações adicionais entre em contato com cnpsa.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
Data corrente: |
31/03/2015 |
Data da última atualização: |
29/06/2015 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
PACCHION, R. G.; CARVALHO, F. M.; THOMPSON, C. E.; FAUSTINO, A. L. F.; NICOLINI, F.; PEREIRA, T. S.; SILVA, R. C. B.; CANTAO, M. E.; GERBER, A.; VASCONCELOS, A. T. R.; AGNEZ-LIMA, L. F. |
Afiliação: |
RALFO G. PACCHION, UFRN/Departamento de Genética e Biologia Celular; FABÍOLA M. CARVALHO, Laboratório Nacional de Computação Científica; CLAUDIA E. THOMPSON, UFRGS; ANDRE, L. F. FAUSTINO, UFRN/Departamento de Genética e Biologia Celular; FERNANDA NICOLINI, UFRN/Departamento de Genética e Biologia Celular; TATIANA S. PEREIRA, UFRN/Departamento de Genética e Biologia Celular; RITA C. B. SILVA, UFRN/Departamento de Genética e Biologia Celular; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; ALEXANDRA GERBER, Laboratório Nacional de Computação Científica; ANA T. R. VASCONCELOS, Laboratório Nacional de Computação Científica; LUCYMARA F. AGNEZ-LIMA, UFRN/Departamento de Genética e Biologia Celular. |
Título: |
Taxonomic and functional profiles of soil samples from Atlantic Forest and caatinga biomes in northeastern Brazil. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
MicrobiologyOpen, Brussels, v. 3, n. 3, p. 299-315, 2014. DOI: 10.1002/mbo3.169. |
DOI: |
10.1002/mbo3.169 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Although microorganisms play crucial roles in ecosystems, metagenomic analyses of soil samples are quite scarce, especially in the Southern Hemisphere. In this work, the microbial diversity of soil samples from an Atlantic Forest and Caatinga was analyzed using a metagenomic approach. Proteobacteria and Actinobacteria were the dominant phyla in both samples. Among which, a significant proportion of stress-resistant bacteria associated to organic matter degradation was found. Sequences related to metabolism of amino acids, nitrogen, and DNA and stress resistance were more frequent in Caatinga soil, while the forest sample showed the highest occurrence of hits annotated in phosphorous metabolism, defense mechanisms, and aromatic compound degradation subsystems. The principal component analysis (PCA) showed that our samples are close to the desert metagenomes in relation to taxonomy, but are more similar to rhizosphere microbiota in relation to the functional profiles. The data indicate that soil characteristics affect the taxonomic and functional distribution; these characteristics include low nutrient content, high drainage (both are sandy soils), vegetation, and exposure to stress. In both samples, a rapid turnover of organic matter with low greenhouse gas emission was suggested by the functional profiles obtained, reinforcing the importance of preserving natural areas. |
Palavras-Chave: |
Bioinformática. |
Thesagro: |
Microbiologia do solo. |
Thesaurus Nal: |
Metagenomics; Soil biology. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02321naa a2200301 a 4500 001 2012489 005 2015-06-29 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1002/mbo3.169$2DOI 100 1 $aPACCHION, R. G. 245 $aTaxonomic and functional profiles of soil samples from Atlantic Forest and caatinga biomes in northeastern Brazil.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aAlthough microorganisms play crucial roles in ecosystems, metagenomic analyses of soil samples are quite scarce, especially in the Southern Hemisphere. In this work, the microbial diversity of soil samples from an Atlantic Forest and Caatinga was analyzed using a metagenomic approach. Proteobacteria and Actinobacteria were the dominant phyla in both samples. Among which, a significant proportion of stress-resistant bacteria associated to organic matter degradation was found. Sequences related to metabolism of amino acids, nitrogen, and DNA and stress resistance were more frequent in Caatinga soil, while the forest sample showed the highest occurrence of hits annotated in phosphorous metabolism, defense mechanisms, and aromatic compound degradation subsystems. The principal component analysis (PCA) showed that our samples are close to the desert metagenomes in relation to taxonomy, but are more similar to rhizosphere microbiota in relation to the functional profiles. The data indicate that soil characteristics affect the taxonomic and functional distribution; these characteristics include low nutrient content, high drainage (both are sandy soils), vegetation, and exposure to stress. In both samples, a rapid turnover of organic matter with low greenhouse gas emission was suggested by the functional profiles obtained, reinforcing the importance of preserving natural areas. 650 $aMetagenomics 650 $aSoil biology 650 $aMicrobiologia do solo 653 $aBioinformática 700 1 $aCARVALHO, F. M. 700 1 $aTHOMPSON, C. E. 700 1 $aFAUSTINO, A. L. F. 700 1 $aNICOLINI, F. 700 1 $aPEREIRA, T. S. 700 1 $aSILVA, R. C. B. 700 1 $aCANTAO, M. E. 700 1 $aGERBER, A. 700 1 $aVASCONCELOS, A. T. R. 700 1 $aAGNEZ-LIMA, L. F. 773 $tMicrobiologyOpen, Brussels$gv. 3, n. 3, p. 299-315, 2014. DOI: 10.1002/mbo3.169.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 21 | |
3. |  | BALIEIRO, G.; FERREIRA, J. A.; VIANA, A. C.; MONTEIRO, M. A. R.; CRUZ, J. C. Produção de forragem hidropônica de milho com diferentes substratos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 37., 2000, Viçosa. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2000.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
8. |  | ACOSTA, A.; VASCONCELLOS, J. H.; CRUZ, J. C.; MONTEIRO, M. A. R.; MENON, J. C. M. Resultados preliminares da campanha nacional de produção de sementes de milho em comunidades rurais na região Sul do Brasil. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO MILHO, 45.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO SORGO, 28., 2000, Pelotas. Anais. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2000. p. 775-780. (Embrapa Clima Temperado. Documentos,70).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
9. |  | MONTEIRO, M. A. R.; CRUZ, J. C.; OLIVEIRA, A. C. de; RAMALHO, M. A. P.; PINHO, R. G. von. Desempenho de cultivares de milho para produção de grãos no Estado de Minas Gerais. Ciencia e Agrotecnologia, Lavras, v. 24, n. 4, p. 881-888, out./dez. 2000.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
10. |  | MONTEIRO, M. A. R.; LOUREIRO, J. E.; CRUZ, J. C.; TAKEUCHI, S. M.; PEREIRA FILHO, I. A.; NOCE, M. A. Avaliação de cultivares de milho na região central de Minas Gerais. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 25.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 1., 2004, Cuiabá, MT. Da agricultura familiar ao agronegócio: tecnologia, competitividade e sustentabilidade: [resumos expandidos]. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Cuiabá: Empaer, 2004. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
11. |  | CRUZ, J. C.; PEREIRA FILHO, I. A.; GUISCEM, J. M.; COELHO, A. M.; MONTEIRO, M. A. R. Influência da adubação nitrogenada e do ambiente na produção de grãos de variedades de milho. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 24., 2002, Florianópolis, SC. Meio ambiente e a nova agenda para o agronegócio de milho e sorgo: [resumos expandidos]. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Florianópolis: Epagri, 2002. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
12. |  | MONTEIRO, M. A. R.; PEREIRA FILHO, I. A.; GAMA, E. E. G.; KARAM, D.; CRUZ, J. C. Avaliação preliminar de híbridos triplos de milho visando o consumo verde. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 24., 2002, Florianópolis, SC. Meio ambiente e a nova agenda para o agronegócio de milho e sorgo: [resumos expandidos]. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Florianópolis: Epagri, 2002. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
13. |  | TEIXEIRA, F. F.; VASCONCELLOS, J. H.; ANDRADE, R. V.; NOVOTNY, E. H.; NETTO, D. A. M.; MONTEIRO, M. A. R. Avaliação de acessos de germoplasma de milho quanto a qualidade da palha para artesanato. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 25.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 1., 2004, Cuiabá, MT. Da agricultura familiar ao agronegócio: tecnologia, competitividade e sustentabilidade: [resumos expandidos]. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Cuiabá: Empaer, 2004. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
14. |  | TEIXEIRA, F. F.; VASCONCELLOS, J. H.; ANDRADE, R. V. de; SANTOS, M. X. dos; NETTO, D. A. M.; NOVOTNY, E. H.; MONTEIRO, M. A. R. Desempenho de variedades de milho quanto à qualidade da palha para artesanato. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 6, n. 1, p. 84-94, 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
15. |  | CRUZ, J. C.; MONTEIRO, M. A. R.; OLIVEIRA, A. C. de; PEREIRA FILHO, I. A.; CHAVEZ, W. A.; RODRIGUES, J. M. U. Avaliação de cultivares de milho sob efeito residual de adubação em áreas cultivadas com horticultura. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 22., 1998, Recife. Globalização e segurança alimentar: anais. Recife: ABMS, 1998. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
16. |  | NOCE, M. A.; ALBEMAZ, W. M.; CRUZ, J. C.; GONTIJO NETO, M. M.; PEREIRA FILHO, I. A.; MORAIS, F. A. de; MONTEIRO, M. A. R. Cultivares de milho para a produção de grãos e forragem, na região Central de Minas Gerais. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2006. 6 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Comunicado Técnico, 134).Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
17. |  | NOCE, M. A.; ALBERNAZ, W. M.; CRUZ, J. C.; GONTIJO NETO, M. M.; PEREIRA FILHO, I. A.; MORAIS, F. A. de; MONTEIRO, M. A. R. Cultivares de milho para a produção de grãos e forragem na região Central de Minas Gerais. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 2.; SIMPÓSIO SOBRE COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, 1., 2006, Belo Horizonte. Inovação para sistemas integrados de produção: trabalhos apresentados. [Sete Lagoas]: ABMS, 2006. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
18. |  | TEIXEIRA, F. F.; VASCONCELOS, J. H.; ANDRADE, R. V.; SANTOS, M. X.; NETTO, D. A. M.; PADILHA, L.; NOVOTNY, E. H.; MONTEIRO, M. A. R. Avaliação de variedades quanto a palha de milho para artesanato. In: SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, SIRGEALC, 5., 2005, Montevideo, Uruguay. Resúmenes... Montevideo: Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria: Universidad de la República, Facultad de Agronomía, 2005. p. 95.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
19. |  | CRUZ, J. C.; MONTEIRO, M. A. R.; LOUREIRO, J. E.; PEREIRA FILHO, I. A.; NOCE, M. A.; VIANA, A. C.; ALBERNAZ, W. M. Avaliação de cultivares de milho na região de Sete Lagoas, MG. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2005. 6 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Circular técnica, 65).Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
20. |  | GUIMARAES, P. E. de O.; PACHECO, C. A. P.; PAES, M. C. D.; SANTOS, M. X. dos; PARENTONI, S. N.; GAMA, E. E. G. e; MEIRELLES, W. F.; RIBEIRO, P. H. E.; MONTEIRO, M. A. R. BR 473: variedade de milho amarela com qualidade protéica melhorada (QPM). Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2004. 4 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Comunicado técnico, 105).Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
Registros recuperados : 21 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|