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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
28/09/2017 |
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Data da última atualização: |
21/12/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CONRADO, A. C.; ARRUDA, H.; STANTON, D. W. S.; JAMES, S. W.; KILLE, P.; BROWN, G. G.; SILVA, E. da; DUPONT, E.; TAHERI, S.; MORGAN, A. J.; SIMÕES, N.; RODRIGUES, A.; MONTIEL, R.; CUNHA, L. |
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Afiliação: |
Ana C. Conrado, UFPR; Hugo Arruda, Departamento de Biologia, Universidade dos Açores, Ponta Delgada, Portugal; David W.G. Stanton, Cardiff School of Biosciences, Cardiff University, Museum Avenue; Samuel W. James, University of Management, Sustainable Living Dept., Fairfield; Peter Kille, Cardiff School of Biosciences, Cardiff University, Museum Avenue; GEORGE GARDNER BROWN, CNPF; Elodie da Silva, Bolsista da Embrapa Florestas; Lise Dupont, Université Paris Est Créteil, Institut d’écologie et des sciences; Shabnam Taheri, Université Paris Est Créteil, Institut d’écologie et des sciences; Andrew J. Morgan, Cardiff School of Biosciences, Cardiff University, Museum Avenue; Nelson Simões, Departamento de Biologia, Universidade dos Açores, Ponta Delgada, Portugal; Universidade dos Açores, Ponta Delgada, Portugal. (CVARG); Rafael Montiel, Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad, Unidad de Genómica Avanzada, México; Luis Cunha, Bolsista da Embrapa Florestas. |
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Título: |
The complete mitochondrial DNA sequence of the pantropical earthworm Pontoscolex corethrurus (Rhinodrilidae, Clitellata): mitogenome characterization and phylogenetic positioning. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
ZooKeys, v. 688, Aug. 2017. |
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Páginas: |
13 p. |
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DOI: |
10.3897/zookeys.688.13721.suppl1 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Publicado na PeerJ Preprints em 3 mar. 2017. |
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Conteúdo: |
Pontoscolex corethrurus (Müller, 1857) plays an important role in tropical soil ecosystems and has been widely used as an animal model for a large variety of ecological studies, in particular due to its common presence and generally high abundance in human-disturbed tropical soils. In this study we describe the complete mitochondrial genome of the peregrine earthworm P. corethrurus. This is the first record of a mitochondrial genome within the Rhinodrilidae family. Its mitochondrial genome is 14 835 bp in length containing 37 genes (13 protein-coding genes (PCG), 2 rRNA genes and 22 tRNA genes). It has the same gene content and structure as in other sequenced earthworms, but unusual among invertebrates it has several overlapping open reading frames. All genes are encoded on the same strand. Most of the PCGs use ATG as the start codon except for ND3, which uses GTG as the start codon. The A+T content of the mitochondrial genome is 59.9% (31.8% A, 28.1% T, 14.6% G, and 25.6% for C). The annotated genome sequence has been deposited in GenBank under the accession number KT988053. |
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Palavras-Chave: |
Açores; Earthworm; Peregrine species; Rhinodrilidae. |
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Thesagro: |
Genoma; Minhoca; Mitocôndria. |
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Thesaurus Nal: |
Azores; Mitochondria; Mitochondrial genome; Pontoscolex corethrurus. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/164497/1/2017-G.Brown-Zookeys-The-Complete.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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| Registros recuperados : 10 | |
| 1. |  | SANTOS, A.; SILVA, E. da; CUNHA, L.; STANTON, D.; KILLE, P.; DECAËNS, T.; JAMES, S. W.; BARTZ, M. L. C.; BROWN, G. G.; TERRA PRETO DE ÍNDIO NETWORK. Abundância, biomassa e riqueza de minhocas em áreas de Terra Preta de Índio (TPI) em Manaus e Iranduba (AM). In: ENCONTRO LATINO-AMERICANO DE ECOLOGIA E TAXONOMIA DE OLIGOQUETAS, 5; SIMPÓSIO ENGENHEIROS EDÁFICOS, FERTILIDADE DO SOLO E TERRA PRETA DE ÍNDIO (TPI), 2015, Curitiba. Anais. [S.l.]: Federação Brasileira de plantio direto de irrigação, 2015. p. 107. Disponível online. Resumo. 5° ELAETAO.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 2. | | JAMES, S. W.; BARTZ, M. L. C.; STANTON, D. W. G.; CONRADO, A. C.; DUPONT, L.; TAHERI, S.; SILVA, E. da; CUNHA, L.; BROWN, G. G. A neotype for Pontoscolex corethrurus (Müller, 1857) (Clitellata). Zootaxa, v. 4545, n. 1, p. 124-132, Jan. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 3. | | CONRADO, A. C.; ARRUDA, H.; STANTON, D. W. S.; JAMES, S. W.; KILLE, P.; BROWN, G. G.; SILVA, E. da; DUPONT, E.; TAHERI, S.; MORGAN, A. J.; SIMÕES, N.; RODRIGUES, A.; MONTIEL, R.; CUNHA, L. The complete mitochondrial DNA sequence of the pantropical earthworm Pontoscolex corethrurus (Rhinodrilidae, Clitellata): mitogenome characterization and phylogenetic positioning. ZooKeys, v. 688, Aug. 2017. 13 p. Publicado na PeerJ Preprints em 3 mar. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 4. | | CUNHA, L.; BROWN, G. G.; STANTON, D. W. G.; SILVA, E. da; HANSEL, F. A.; JORGE, G.; MCKEY, D.; VIDAL-TORRADO, P.; MACEDO, R. S.; VELASQUEZ, E.; JAMES, S. W.; LAVELLE, P.; KILLE, P. Soil animals and pedogenesis: the role of earthworms in anthropogenic soils. Soil Science, v. 181, n. 3/4, p. 110-125, Mar./Apr. 2016. Participação da Terra Preta de Índio Network.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Florestas. |
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| 5. | | SILVA, E. da; JAMES, S.; ROSA, M. da; BARTZ, M.; STANTON, D.; BUSCH, E.; SCHUHLI, G. S. e; CUNHA, L.; BARETTA, D.; DECAENS, T.; KILLE, P.; BROWN, G. G. Use of DNA barcoding for Brazilian earthworm biodiversity assessment: untangling taxonomy for conservation. In: INTERNATIONAL OLIGOCHAETE TAXONOMY MEETING, 7., 2016, Paimpont. Taxonomy, phygeny and ecology of earthworm's communities. [Rennes]: Université de Rennes, [2016]. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 6. | | TAHERI, S.; AMES, S.; ROY, V.; DECAËNS, T.; WILLIAMS, B. W.; ANDERSON, F.; ROUGERIE, R.; CHANG, C.-H.; BROWN, G. G.; CUNHA, L.; STANTON, D. W. G.; SILVA, E. da; CHEN, J-H.; LEMMON, A. R.; LEMMON, E. M.; BARTZ, M.; BARETTA, D.; BAROIS, I.; LAPIED, E.; COULIS, M.; DUPONT, L. Complex taxonomy of the "brush tail" peregrine earthworm Pontoscolex corethrurus. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 124, p. 60-70, July 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 7. | | CUNHA, L.; BARTZ, M.; DEMETRIO, W.; SILVA, T.; JAMES, S.; SILVA, E. da; STANTON, D.; CONRADO, A. C.; DECAENS, T.; LAVELLE, P.; SANTOS, A.; NADOLNY, H.; VELÁSQUEZ, E.; ZANGERLÉ, A.; TAPIA-CORAL, S.; FERREIRA, T.; MAIA, L.; SEGALLA, R.; CLEMENT, C.; MUNIZ, A. W.; KILLE, P.; BROWN, G. G.; TPI NETWORK. Earthworms and Amazonian Dark Earths: improving understanding of the relationships between soil management, biodiversity and function. In: INTERNATIONAL OLIGOCHAETE TAXONOMY MEETING, 7., 2016, Paimpont. Taxonomy, phygeny and ecology of earthworm's communities. [Rennes]: Université de Rennes, [2016]. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 8. | | CONRADO, A. C.; DEMETRIO, W. C.; STANTON, D. W. G.; BARTZ, M. L. C.; JAMES, S. W.; SANTOS, A.; SILVA, E. da; FERREIRA, T.; ACIOLI, A. N. S.; FERREIRA, A. C.; MAIA, L. S.; SILVA, T. A. C.; LAVELLE, P.; VELASQUEZ, E.; TAPIA-CORAL, S. C.; MUNIZ, A. W.; SEGALLA, R. F.; DECAËNS, T.; NADOLNY, H. S.; PEÑA-VENEGAS, C.; PASINI, A.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; TPI NETWORK; KILLE, P.; BROWN, G. G.; CUNHA, L. Amazonian earthworm biodiversity is heavily impacted by ancient and recent human disturbance. Science of the Total Environment, v. 895, art. 165087, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Florestas. |
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| 9. | | BROWN, G. G.; BARTZ, M.; JAMES, S.; CUNHA, L.; SILVA, E. da; FEIJOO, A.; ROSA, M.; SILVA, T.; STANTON, D.; KILLE, P.; BARETTA, D.; DECAENS, T.; LAVELLE, P.; SANTOS, A.; NADOLNY, H.; FERREIRA, T.; DEMETRIO, W.; CARDOSO, G.; TAHERI, S.; DUPONT, L.; GORTE, T.; BRAGA, L.; TSAI, S.; ZAGATTO, M.; FERREIRA, S.; PASINI, A.; STEFFEN, G.; STEFFEN, R.; ANTONIOLLI, Z.; DRUMOND, M. A.; SILVA, R. da; CARVALHO, M. R.; ESTEVES, E.; CHUBATSU, L.; HERNANDEZ, L.; ROUSSEAU, G.; SANTOS, B.; MARTINS, M.; SCHUHLI, G. S. e. Earthworm taxonomy, biology and ecology. An overview of recent advances (2013-2016) in Brazil. In: INTERNATIONAL OLIGOCHAETE TAXONOMY MEETING, 7., 2016, Paimpont. Taxonomy, phygeny and ecology of earthworm's communities. [Rennes]: Université de Rennes, [2016]. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 10. | | DEMETRIO, W. C.; CONRADO, A. C.; ACIOLI, A. N. S.; FERREIRA, A. C.; BARTZ, M. L. C.; JAMES, S. W.; SILVA, E. da; MAIA, L. S.; MARTINS, G. C.; MACEDO, R. S.; STANTON, D. W. G.; LAVELLE, P.; VELASQUEZ, E.; ZANGERLÉ, A.; BARBOSA, R.; TAPIA-CORAL, S. C.; MUNIZ, A. W.; SANTOS, A.; FERREIRA, T.; SEGALLA, R. F.; DECAËNS, T.; NADOLNY, H. S.; PEÑA-VENEGAS, C. P.; MAIA, C. M. B. F.; PASINI, A.; MOTA, A. F.; TAUBE JÚNIOR, P. S.; SILVA, T. A. C.; REBELLATO, L.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; NEVES, E. G.; LIMA, H. P.; FEITOSA, R. M.; TORRADO, P. V.; McKEY, D.; CLEMENT, C. R.; SHOCK, M. P.; TEIXEIRA, W. G.; MOTTA, A. C. V.; MELO, V. F.; DIECKOW, J.; GARRASTAZU, M. C.; CHUBATSU, L. S.; KILLE, P.; BROWN, G. G.; CUNHA, L. A "dirty" footprint: macroinvertebrate diversity in Amazonian Anthropic soils. Global Change Biology, v. 27, n. 19, p. 4575-4591, Oct. 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Florestas; Embrapa Solos. |
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