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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
14/02/2017 |
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Data da última atualização: |
18/12/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ALMEIDA, I. F. de; CRUZ, C. D.; RESENDE, M. D. V. de. |
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Afiliação: |
ÍSIS FERNANDA DE ALMEIDA, Instituto Federal do Triângulo Mineiro; COSME DAMIÃO CRUZ, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF. |
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Título: |
Validação e correção de fenótipos na seleção genômica ampla. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 51, n. 12, p. 1973-1982, dez. 2016. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Título em ingles: Validation and phenotypic correction in genome-wide selection. |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da distribuição dos efeitos de QTL, do tipo de população de validação e da correção dos fenótipos sobre a acurácia da seleção genômica ampla. Duas populações de irmãos completos, com 500 indivíduos, foram simuladas, tendo-se considerado, genotipicamente, 1.000 locos marcadores ? 100 ligados a QTL. Os efeitos de QTL apresentaram distribuição uniforme ou exponencial. Na validação 1, uma amostra com 100 indivíduos constituiu a população de validação; na
validação 2, aplicou-se a validação cruzada, com amostra de 100 indivíduos em cinco repetições; e na 3, uma segunda geração constituiu a população de validação. As metodologias de análise utilizadas foram RR-Blup e Blasso, com modelos mistos para correção dos fenótipos. Sem correção fenotípica, a distribuição exponencial proporcionou maiores acurácias, e o método Blasso foi mais acurado com essa distribuição; enquanto o RRBlup foi mais acurado com a distribuição uniforme. Nesse cenário sem correção, as validações 1 e 3 foram mais acuradas. Com correção, as distribuições exponencial e uniforme produziram acurácias similares, e o método Blasso mostrou-se mais acurado para ambas. Nesse cenário, as validações 1 e 2 foram mais acuradas.
No geral, o método RR-Blup foi mais acurado, e o Blasso menos viciado. |
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Palavras-Chave: |
Acurácia; Blasso; Genotipagem em larga escala; Large-scale genotyping; RR-Blup. |
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Thesagro: |
Marcador molecular. |
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Thesaurus Nal: |
Accuracy; Genetic markers. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/155551/1/Validacao-e-correcao-de-fenotipos.pdf
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Marc: |
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520 $aO objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da distribuição dos efeitos de QTL, do tipo de população de validação e da correção dos fenótipos sobre a acurácia da seleção genômica ampla. Duas populações de irmãos completos, com 500 indivíduos, foram simuladas, tendo-se considerado, genotipicamente, 1.000 locos marcadores ? 100 ligados a QTL. Os efeitos de QTL apresentaram distribuição uniforme ou exponencial. Na validação 1, uma amostra com 100 indivíduos constituiu a população de validação; na validação 2, aplicou-se a validação cruzada, com amostra de 100 indivíduos em cinco repetições; e na 3, uma segunda geração constituiu a população de validação. As metodologias de análise utilizadas foram RR-Blup e Blasso, com modelos mistos para correção dos fenótipos. Sem correção fenotípica, a distribuição exponencial proporcionou maiores acurácias, e o método Blasso foi mais acurado com essa distribuição; enquanto o RRBlup foi mais acurado com a distribuição uniforme. Nesse cenário sem correção, as validações 1 e 3 foram mais acuradas. Com correção, as distribuições exponencial e uniforme produziram acurácias similares, e o método Blasso mostrou-se mais acurado para ambas. Nesse cenário, as validações 1 e 2 foram mais acuradas. No geral, o método RR-Blup foi mais acurado, e o Blasso menos viciado.
650 $aAccuracy
650 $aGenetic markers
650 $aMarcador molecular
653 $aAcurácia
653 $aBlasso
653 $aGenotipagem em larga escala
653 $aLarge-scale genotyping
653 $aRR-Blup
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700 1 $aRESENDE, M. D. V. de
773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 51, n. 12, p. 1973-1982, dez. 2016.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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| Registros recuperados : 21 | |
| 3. |  | SILVA JUNIOR, J. F. da; LEDO, A. da S.; XAVIER, F. R. S.; FERRAZ, L. G. B.; LEDO, C. A. da S.; MUSSER, R. dos S. Avaliação agronômica de genótipos de bananeira no Vale do Rio Siriji, Pernambuco. Revista Brasileira de Ciências Agrárias, Recife, v. 7, n. 4, p. 620-625, out./dez., 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 4. | | COSTA, C. dos S. R.; SOUZA, E. M. de C.; COSTA, A. E. da S.; LIMA NETO, F. P.; LIMA, M. A. C. de; MUSSER, R. dos S. Avaliação de híbridos entre as cultivares Tommy Atkins e Palmer, em um ciclo de produção. Revista RG News, v. 7, n. 2, p. 33, 2021. Edição Especial do 5º Simpósio Rede de Recursos Genéticos Vegetais do Nordeste, Mossoró, Nov. 2021.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 6. | | VERSLYPE, N. I.; CALDAS, R. M. de S.; NASCIMENTO, A. C. A. do; MUSSER, R. dos S.; CHAVES, A. R. de M.; LEAO, P. C. de S. Classificação de porta-enxertos de videira tolerantes à seca usando aprendizagem de máquinas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 6., 2020. Recursos genéticos e bioeconomia: inovação para um futuro sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2020.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 7. | | COSTA, C. dos S. R.; SOUZA, E. M. de C.; COSTA, A. E. da S.; LIMA NETO, F. P.; LIMA, M. A. C. de; MUSSER, R. dos S. Caracterização de acessos de mangueira quanto à qualidade pós-colheita dos frutos. Revista RG News, v. 7, n. 2, p. 48, 2021. Edição Especial do 5º Simpósio Rede de Recursos Genéticos Vegetais do Nordeste, Mossoró, Nov. 2021.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 9. | | SILVA JUNIOR, J. F. da; XAVIER, F. R. S.; LEDO, C. A. da S.; NEVES JUNIOR, J. S.; MOTA, D. M. da; SCHMITZ, H.; MUSSER, R. dos S. Variabilidade em populações naturais de mangabeira do litoral de Pernambuco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 19., 2006, Cabo Frio. Frutas do Brasil: saúde para o mundo: palestras e resumos. Cabo Frio: Sociedade Brasileira de Fruticultura; Campos dos Goytacazes: Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, 2006. p. 383.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 10. | | SILVA, A. G. da; FELINTO FILHO, E. F.; MUSSER, R. dos S.; COSTA, C. dos S. R.; CHAVES, A. R. de M. Vine rootstocks under water deficit: response in biomass, biochemical variables and gas exchange. In: INTERNATIONAL TABLE GRAPE SYMPOSIUM, 10., 2023, Somerset West. Book of posters & abstracts... Somerset West: South African Society for Enology and Viticulture: The South African Table Grape Industry, 2023. p. 67.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 12. | | SILVA JÚNIOR, J. F. dA; LÉDO, A. da S.; XAVIER, F. R. S.; LÉDO, C. A. da S.; SILVA, S. de O. e; FERRAZ, L; G. B.; SÁ, V. A. de L.; NEVES JÚNIOR, J. S.; MUSSER, R. dos S. Avaliação de cultivares e híbridos de bananeira em área de encosta no Vale do Rio siriji, PE (1º ciclio). Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2008. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Comunicado Técnico, 77).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 13. | | SILVA, F. G. da; MUSSER, R. dos S.; SILVA, M. M. da; LEAO, P. C. de S.; ARAÚJO, J. V. de; ARAÚJO, J. B. de; RAMOS, R. da S. Agronomic aptitude and quality of vinifera grapes in a non-traditional of culture region in the Agreste of Pernambuco States. Journal of Experimental Agriculture International, v. 39, n. 3, p. 1-10, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 14. | | SILVA JUNIOR, J. F. da; XAVIER, F. R. S.; LEDO, C. A. da S.; NEVES JÚNIOR, J. S.; MOTA, D. M. da; SCHMITZ, H.; MUSSER, R. dos S.; LEDO, A. da S. Variabilidade em populações naturais de mangabeira do litoral de Pernambuco. Magistra, Cruz das Almas, v, 19, n. 4, p. 373-378, out./dez. 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 15. | | SILVA JUNIOR, J. F. da; XAVIER, F. R. S.; LEDO, C. A. da S.; NEVES JUNIOR, J. S.; MOTA, D. M. da; SCHMITZ, H.; MUSSER, R. dos S.; LEDO, A. da S. Variabilidade em populações naturais de mangabeira do Litoral de Pernambuco. Magistra, Cruz das Almas, v. 19, n. 4, p. 373-378, out/dez. 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 16. | | SILVA, A. G. da; FELINTO FILHO, E. F.; ULISSES, C.; MUSSER, R. dos S.; COSTA, C. dos S. R.; CHAVES, A. R. de M.; LEAO, P. C. de S. Grapevine rootstocks under water deficit: biomass, biochemical, and gas exchange attributes. Revista Caatinga, v. 37, e11870, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 17. | | COSTA, C. dos S. R.; LIMA, M. A. C. de; LIMA NETO, F. P.; COSTA, A. E. da S.; VILVERT, J. C.; MARTINS, L. S. S.; MUSSER, R. dos S. Genetic parameters and selection of mango genotypes using the FAI-BLUP multitrait index. Scientia Horticulturae, v. 317, 112049, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 18. | | XAVIER, F. R. S.; SILVA JÚNIOR, J. F. da; LÉDO, C. A. da S.; LÉDO, A. da S.; FERRAZ, L. G. B.; SILVA, S. de O. e; SÁ, V. A. de L. E; NEVES JÚNIOR, J. S.; MUSSER, R, dos S. Avaliação de cultivares e híbridos de bananeira em área de encosta no vale do rio Siriji, PE (1º ciclo). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HOTRICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável. Vitória: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008. Melhoramento genético - bioestatistica. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 19. | | SILVA JUNIOR, J. F. da; XAVIER, F. R. S.; LEDO, C. A. da S.; LÉDO, A. da S.; FERRAZ, L. G. B.; SILVA, S. de O. e; SÁ, V. A. de L. e; NEVES JUNIOR, J. S.; MUSSER, R. dos S. Avaliação de cultivares e híbridos de bananeira em área de Várzea no Vale do Rio Siriji, PE (1º ciclo). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável: anais. Vitória: INCAPER: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 20. | | SILVA JÚNIOR, J. F. da; XAVIER, F. S. R.; LÉDO, C. A. da S.; LÉDO, A. da S.; FERRAZ, L. G. B.; SILVA, S. de O. e; SÁ, V. A. de L. e; NEVES JÚNIOR, J. S.; MUSSER, R. dos S. Avaliação de cultivares e híbridos de bananeira em área de várzea no vale do rio Siriji, PE (1º ciclo). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HOTRICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável. Vitória: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008. Melhoramento genético - bioestatistica. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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