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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
15/10/2019 |
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Data da última atualização: |
13/11/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
TORRES, L. G.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, K C. F.; SILVA, F. F. e; OLIVEIRA, E. J. de. |
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Afiliação: |
LÍVIA GOMES TORRES, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; CAMILA FERREIRA AZEVEDO, UFV; FABYANO FONSECA E SILVA, UFV; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
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Título: |
Genomic selection for productive traits in biparental cassava breeding populations. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
PLoS ONE, v. 14, n. 7, e0220245, July 2019. 20 p. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1371/ journal.pone.0220245 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Cassava improvement using traditional breeding strategies is slow due to the species? long breeding cycle. However, the use of genomic selection can lead to a shorter breeding cycle. This study aimed to estimate genetic parameters for productive traits based on pedigree (pedigree and phenotypic information) and genomic (markers and phenotypic information) analyses using biparental crosses at different stages of selection. A total of 290 clones were genotyped and phenotyped for fresh root yield (FRY), dry matter content (DMC), dry yield (DY), fresh shoot yield (FSY) and harvest index (HI). The clones were evaluated in clonal evaluation trials (CET), preliminary yield trials (PYT), advanced yield trials (AYT) and uniform yield trials (UYT), from 2013 to 2018 in ten locations. The breeding stages were analyzed as follows: one stage (CET), two stages (CET and PYT), three stages (CET, PYT and AYT) and four stages (CET, PYT, AYT and UYT). The genomic predictions were analyzed via k-fold cross-validation based on the genomic best linear unbiased prediction (GBLUP) considering a model with genetic additive effects and genotype × location interactions. Genomic and pedigree accuracies were moderate to high (0.56?0.72 and 0.62?0.78, respectively) for important starch-related traits such as DY and FRY; when considering one breeding stage (CET) with the aim of early selection, the genomic accuracies ranged from 0.60 (DMC) to 0.71 (HI). Moreover, the correlations between the genomic estimation breeding values of one-stage genomic analysis and the estimated breeding values of the four-stage (full data set) pedigree analysis were high for all traits as well as for a selection index including all traits. The results indicate great possibilities for genomic selection in cassava, especially for selection early in the breeding cycle (saving time and effort). MenosCassava improvement using traditional breeding strategies is slow due to the species? long breeding cycle. However, the use of genomic selection can lead to a shorter breeding cycle. This study aimed to estimate genetic parameters for productive traits based on pedigree (pedigree and phenotypic information) and genomic (markers and phenotypic information) analyses using biparental crosses at different stages of selection. A total of 290 clones were genotyped and phenotyped for fresh root yield (FRY), dry matter content (DMC), dry yield (DY), fresh shoot yield (FSY) and harvest index (HI). The clones were evaluated in clonal evaluation trials (CET), preliminary yield trials (PYT), advanced yield trials (AYT) and uniform yield trials (UYT), from 2013 to 2018 in ten locations. The breeding stages were analyzed as follows: one stage (CET), two stages (CET and PYT), three stages (CET, PYT and AYT) and four stages (CET, PYT, AYT and UYT). The genomic predictions were analyzed via k-fold cross-validation based on the genomic best linear unbiased prediction (GBLUP) considering a model with genetic additive effects and genotype × location interactions. Genomic and pedigree accuracies were moderate to high (0.56?0.72 and 0.62?0.78, respectively) for important starch-related traits such as DY and FRY; when considering one breeding stage (CET) with the aim of early selection, the genomic accuracies ranged from 0.60 (DMC) to 0.71 (HI). Moreover, the correlations between the genomic estim... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Melhoramento genético. |
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Thesagro: |
Mandioca. |
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Thesaurus Nal: |
Cassava; Plant breeding. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/204427/1/2019-M.Deon-PO-Genomic.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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| 221. |  | CHAIMSOHN, F. P.; CURCIO, G. R.; DEDECECK, R.; RACHWAL, M. F. G.; OLIVEIRA, E. A. de; GOMES, E. P.; BENASSI, D. A. SILVA, F. de A. E. Avaliação de bracatinga comum (Mimosa scabrella) e Bracatinga-de-Campo Mourão (M. flocculosa) em cambissolo alico para recuperação de áreas erodidas / degradadas. In: SIMPOSIO BRASILEIRO DE RECUPERACAO DE AREAS DEGRADADAS, 3., 1997, Ouro Preto. Do substrato ao solo: trabalhos voluntarios. Vicosa: Sociedade Brasileira de Recuperacao de Areas Degradadas: Universidade Federal de Vicosa, Departamento de Solos, 1997. p.350-354.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 222. | | MORAES, A. de; RIOS, E. de; MEDRADO, R. D.; SILVA, H. A. da; OLIVEIRA, E. B. de; HACK, E.; SIQUEIRA JUNIOR, L. A. de. Atributos do solo em sistema de integração lavoura-pecuária de leite na Região de Campos Gerais - Paraná. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL INTEGRAÇÃO LAVOURA-PECUÁRIA, 2007, Curitiba. Simpósio... [Curitiba]: UFPR; [S.l.]: UFRGS; [S.l.]: Ohio State University, 2007. 3 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 223. | | COIMBRA, C. H. G.; LUSTOSA, S. B. C.; DEISS, L.; MORAES, A. de; OLIVEIRA, E. B. de; MONTEIRO, A. L. G. Aries Guineagrass (Megathyrsus maximus Jacq cv. Aries) pasture establishment without chemical control in an environmentally protected area. African Journal of Agricultural Research, v. 14, n. 12, p. 659-665, Mar. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 224. | | AGUIAR, A. V. de; SHIMIZU, J. Y.; OLIVEIRA, E. B. de; SOUSA, V. A. de; MENDES, C.; GERONASSO, G.; MURARA JUNIOR, M. Cooperative research effort for the production of pine solid wood and resin in Brazil. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 39, (nesp), e201902043, 2019. p. 174. Edição especial dos resumos do IUFRO World Congress, 25., 2019, Curitiba.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 225. | | DITTRICH, J. R.; CARVALHO, P. C. de F.; MORAES, A. de; OLIVEIRA, E. B. de; DITTRICH, R. L.; OIKAWA, M.; SOUZA, F. T. V. de; SANTOS, F. dos. Comportamento ingestivo de equinos em pastejo sobre diferentes dosséis. Ciência Animal Brasileira, v. 8, n. 1, p. 87-94, jan./mar. 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 226. | | OLIVA, E. V.; REISSMANN, C. B.; STURION, J. A.; GAIAD, S.; WISNIEWSKI, C.; OLIVEIRA, E. B. de; OLISZESKI, A.; MIAQUI, D. P. Concentração de Micronutrientes, Al e Na em Procedências de Erva-Mate (Ilex paraguariensis St. Hil.) cultivadas em LATOSSOLO VERMELHO Distrófico. CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado. Conquistas e desafios da ciência do solo brasileira. [Porto Alegre]: UFRGS Solos: SBCS, Núcleo Regional Sul, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 228. | | ZANETTI, E. A.; OLIVEIRA, E. B. de; SOUZA, D. M. de; HOSOKAWA, R. T; SIQUEIRA, J. D. P.; XIMENES, F.; BATISTA, E. R. The carbon market and de harvested wood products potential within Latin America. In: CONGRESO FORESTAL MUNDIAL, 13., 2009, Buenos Aires. Desarrollo forestal: equilibrio vital. Argentina: FAO, 2009. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 229. | | OLIVEIRA, E. B. de; SOUSA, L. P. de; SANTOS, L. M. F.; GOBOR, D.; MORIS, A. C.; MAXIMIANO, G. A.; TINA, V. S. O Eucalipto para restauração florestal com renda para propriedades rurais familiares. In: OLIVEIRA, E. B. de; PINTO JUNIOR, J. E. (Ed.). O eucalipto e a Embrapa: quatro décadas de pesquisa e desenvolvimento. Brasília, DF: Embrapa, 2021. cap. 15. p. 667-683. il. color.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Florestas. |
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| 230. | | NIVA, C. C.; CEZAR, R. M.; FONSECA, P. M.; ZAGATTO, M. R. G.; OLIVEIRA, E. M.; BUSH, E. F.; CLASEN, L. A.; BROWN, G. G. Enchytraeid abundance in Araucaria Mixed Forest determined by cold and hot wet extraction. Brazilian Journal of Biology, São Carlos, v. 75, n. 4, supl. 1, p. 169-175, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 231. | | NIVA, C. C.; CÉSAR, R. M.; FONSECA, P. M. da; ZAGATTO, M. R.; OLIVEIRA, E.; CLASEN, L. V.; BROWN, G. G. Enchytraeid abundance in mixed Araucaria forest determined using four methods (cold and hot extraction, handsorting, formol application). In: INTERNATIONAL OLIGOCHAETE TAXONOMY MEETING, 6., 2013, Palmeira de Faro, Portugal. Book of abstracts. [Braga]: University of Minho, CBMA, 2013. p. 40.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 232. | | BARROS, Y. J.; MELO, V. de F.; SAUTTER, K. D.; BUSCHLE, B.; OLIVEIRA, E. B. de; AZEVEDO, J. C. R. de; SOUZA, L. C. de P.; KUMMER, L. Indicadores de qualidade de solos em área de mineração e metalurgia de chumbo. II - Mesofauna e plantas. Revista Brasileira de Ciência do Solo, v. 34, p. 1413-1426, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 233. | | BARROS, Y. J.; MELO, V. de F.; DIONÍSIO, J. A.; OLIVEIRA, E. B. de; CARON, L.; KUMMER, L.; AZEVEDO, J. C. R. de; SOUZA, L. C. de P. Indicadores de qualidade de solos em área de mineração e metalurgia de chumbo. I - Microrganismos. Revista Brasileira de Ciência do Solo, v. 34, p. 1397-1411, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 234. | | QUEIROZ, D. L. de; CAMARGO, J. M. M.; DEDECEK, R. A.; OLIVEIRA, E. B. de; ZANOL, K. M. R.; MELIDO, R. C. N.; BURCKHARDT, D. H. Effect of silicon application to Eucalyptus camaldulensis on the population of Glycaspis brimblecombei (Hemiptera: Aphalaridae). Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 36, n. 86, p. 85-94, abr./jun. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 235. | | PORFIRIO-DA-SILVA, V.; MORAES, A. de; MOLETTA, J. L.; PONTES, L. da S.; OLIVEIRA, E. B. de; PELISSARI, A.; CARVALHO, P. C. de F. Danos causados por bovinos em diferentes espécies arbóreas recomendadas para sistemas silvipastoris. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 32, n. 70, p. 183-192, abr./jun. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
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| 237. | | CARVALHO, A. P. de; MENEGOL, O.; OLIVEIRA, E. B. de; MACHADO, S. do A.; POTTER, R. O.; FASOLO, P. J.; FERREIRA, C. A.; BARTOSZECK, A. Efeitos de característica do solo sobre a capacidade produtiva de Pinus taeda. Boletim de Pesquisa Florestal, Colombo, n. 39, p. 51-66, jul./dez. 1999.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 238. | | CAMARGO, J. M. M.; MORAES, J. C.; OLIVEIRA, E. B. de; PENTEADO, S. do R. C.; CARVALHO, R. C. Z. de. Efeito da aplicação do silício em plantas de Pinus taeda L., sobre a biologia e morfologia de Cinara atlantica (Wilson) ( Hemiptera:Aphididae). Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v. 32, n. 6, p. 1767-1774, nov./dez. 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
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| 239. | | CARVALHO, A. P. de; MENEGOL, O.; OLIVEIRA, E. B. de; MACHADO, S. A.; POTTER, R. O.; FASOLO, P. J.; FERREIRA, C. A.; BARTOSZECK, A. Efectos de las características del suelo sobre la capacidad productiva de Pinus taeda L. In: CONGRESO LATINOAMERICANO IUFRO, 1., 1998, Valdivia, Chile. El manejo sustentable de los recursos forestales, desafio del siglo XXI: actas. [S.l.]: CONAF: IUFRO, 1998. 9 p. 1 CD-ROM. Tema 1.: Establecimiento, manejo y protección de plantaciones.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 240. | | DAVID, H. C.; ARCE, J. E.; OLIVEIRA, E. B. de; PÉLLICO NETTO, S.; MIRANDA, R. O. V. de; EBLING, A. A. Economic analysis and revenue optimization in management regimes of Pinus taeda. Revista Ceres, Viçosa, MG, v. 64, n. 3, p. 222-231, Maio/Jun. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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