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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Rondônia. |
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Data corrente: |
26/07/2011 |
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Data da última atualização: |
03/11/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
GIACHETTO, P. F.; OKURA, V. K.; IBELLI, A. M. G.; SALMAN, A. K. D.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; Vagner Katsumi Okura, UNICAMP; Adriana Mércia Guaratini Ibelli, UFSCar; ANA KARINA DIAS SALMAN, CPAF-RO; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Identificação de mecanismos envolvidos na resposta de bovinos ao carrapato Rhipicephalus microplus. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 48., 2011, Belém. O desenvolvimento da produção animal e a responsabilidade frente a novos desafios: anais. Belém: SBZ, 2011. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O objetivo desse trabalho foi identificar grupos de genes envolvidos na resposta de bovinos à infestação artificial com o carrapato Rhipicephalus microplus, por meio da construção de redes gênicas. Dados de um experimento com microarranjos, provenientes da hibridização de amostras de pele de fêmeas cruzadas Senepol x Nelore, Angus x Nelore e Nelore, obtidas antes (A) e (D) após a infestação artificial com o carrapato, foram analisados por meio de uma metodologia de construção de redes baseada em co-expressão gênica (WGCNA). Os dados foram pré-processados usando os pacotes affy e gcrma do R/Bioconductor e as redes de co-expressão identificadas separadamente para cada grupo (A e D), pelo pacote R/WGCNA. As redes foram comparadas e os módulos não conservados entre os dois grupos foram identificados a partir de um teste de correlação dos valores de conectividade. Nossa análise identificou 8 módulos de genes co-expressos, sendo um deles (6) não conservado entre os grupos. O modulo 6 (n=85 genes) mostrou-se enrique ido para o processo biológico Proteólise, sugerindo o envolvimento desse processo e dos genes identificados (ADAMTS4, CASP4, C3, CFB, PRSS22 e SPCS3) na resposta dos animais à infestação. |
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Palavras-Chave: |
Expressão gênica; Infestação artificial; Infestação com carrapato; Microarranjos; Redes gênicas. |
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Thesagro: |
Boophilus Microplus. |
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Thesaurus Nal: |
Gene expression; Microarray technology. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/38574/1/Identificacao-de-mecanismos.pdf
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Marc: |
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520 $aO objetivo desse trabalho foi identificar grupos de genes envolvidos na resposta de bovinos à infestação artificial com o carrapato Rhipicephalus microplus, por meio da construção de redes gênicas. Dados de um experimento com microarranjos, provenientes da hibridização de amostras de pele de fêmeas cruzadas Senepol x Nelore, Angus x Nelore e Nelore, obtidas antes (A) e (D) após a infestação artificial com o carrapato, foram analisados por meio de uma metodologia de construção de redes baseada em co-expressão gênica (WGCNA). Os dados foram pré-processados usando os pacotes affy e gcrma do R/Bioconductor e as redes de co-expressão identificadas separadamente para cada grupo (A e D), pelo pacote R/WGCNA. As redes foram comparadas e os módulos não conservados entre os dois grupos foram identificados a partir de um teste de correlação dos valores de conectividade. Nossa análise identificou 8 módulos de genes co-expressos, sendo um deles (6) não conservado entre os grupos. O modulo 6 (n=85 genes) mostrou-se enrique ido para o processo biológico Proteólise, sugerindo o envolvimento desse processo e dos genes identificados (ADAMTS4, CASP4, C3, CFB, PRSS22 e SPCS3) na resposta dos animais à infestação.
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Registro original: |
Embrapa Rondônia (CPAF-RO) |
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| Registros recuperados : 1 | |
| 1. |  | GERHARDT, I. R.; FILIPPI, S. B.; OKURA, V.; COUTINHO, J.; RIAZZATO, A. P.; GUI, K.; VESSALI, N.; PONTES, J. H. M.; CORDEIRO, T.; SILVA, S. M.; GARCIA, A. F.; ARRUDA, P.; et. al. Overexpression of walldof transcription factor increases secondary wall deposition and alters carbon partitioning in poplar. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2011, Arraial d'Ajuda. From genomes do integration and delivery: extended abstracts proceedings. [S.l.]: Embrapa: Veracel: IUFRO, 2011. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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