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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
14/02/2017 |
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Data da última atualização: |
18/12/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ALMEIDA, I. F. de; CRUZ, C. D.; RESENDE, M. D. V. de. |
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Afiliação: |
ÍSIS FERNANDA DE ALMEIDA, Instituto Federal do Triângulo Mineiro; COSME DAMIÃO CRUZ, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF. |
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Título: |
Validação e correção de fenótipos na seleção genômica ampla. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 51, n. 12, p. 1973-1982, dez. 2016. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Título em ingles: Validation and phenotypic correction in genome-wide selection. |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da distribuição dos efeitos de QTL, do tipo de população de validação e da correção dos fenótipos sobre a acurácia da seleção genômica ampla. Duas populações de irmãos completos, com 500 indivíduos, foram simuladas, tendo-se considerado, genotipicamente, 1.000 locos marcadores ? 100 ligados a QTL. Os efeitos de QTL apresentaram distribuição uniforme ou exponencial. Na validação 1, uma amostra com 100 indivíduos constituiu a população de validação; na
validação 2, aplicou-se a validação cruzada, com amostra de 100 indivíduos em cinco repetições; e na 3, uma segunda geração constituiu a população de validação. As metodologias de análise utilizadas foram RR-Blup e Blasso, com modelos mistos para correção dos fenótipos. Sem correção fenotípica, a distribuição exponencial proporcionou maiores acurácias, e o método Blasso foi mais acurado com essa distribuição; enquanto o RRBlup foi mais acurado com a distribuição uniforme. Nesse cenário sem correção, as validações 1 e 3 foram mais acuradas. Com correção, as distribuições exponencial e uniforme produziram acurácias similares, e o método Blasso mostrou-se mais acurado para ambas. Nesse cenário, as validações 1 e 2 foram mais acuradas.
No geral, o método RR-Blup foi mais acurado, e o Blasso menos viciado. |
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Palavras-Chave: |
Acurácia; Blasso; Genotipagem em larga escala; Large-scale genotyping; RR-Blup. |
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Thesagro: |
Marcador molecular. |
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Thesaurus Nal: |
Accuracy; Genetic markers. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/155551/1/Validacao-e-correcao-de-fenotipos.pdf
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Marc: |
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650 $aAccuracy
650 $aGenetic markers
650 $aMarcador molecular
653 $aAcurácia
653 $aBlasso
653 $aGenotipagem em larga escala
653 $aLarge-scale genotyping
653 $aRR-Blup
700 1 $aCRUZ, C. D.
700 1 $aRESENDE, M. D. V. de
773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 51, n. 12, p. 1973-1982, dez. 2016.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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