02336nam a2200217 a 450000100080000000500110000800800410001910000230006024501540008326001440023752015480038165300230192965300390195265300170199165300120200870000190202070000190203970000170205870000210207570000220209619750722014-01-07       2013    bl uuuu     u00u1 u    #d1 aSILVA, B. S. R. da  aIdentificação e caracterização de microssatélites de Coffea arabica a partir de dados de sequenciamento de RNA e de BACS.h[electronic resource]  aIn: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 8., 2013, Salvador. Sustentabilidade e inclusão Social. Brasília, DF: Embrapa Caféc2013  aO café é uma das principais commodities agrícolas mundiais, sendo consumido regularmente por 40% de toda população. As espécies, Coffea arabica L. e Coffea canephora P. são as de maior importância respondendo por 65% e 35% da produção mundial, respectivamente. Em C. arabica , o desenvolvimento de novas cultivares é demorado, podendo levar mais de 20 anos para finalização dos trabalhos. Além disso, estreita base genética de C. arabica dificulta a obtenção de cultivares resistentes a várias pragas e doenças, assim como uma maior tolerância a estresses abióticos. A utilização de marcadores moleculares para análise da diversidade e seleção de genótipos representa uma importante ferramenta para auxiliar o melhoramento e tentar diminuir esses problemas. Neste trabalho foi realizada identificação e análise in silico de SSR?s a partir de dados de RNA-seq de Iapar 59 e de sequências de BACs de Hibrido de Timor 832/2 (CaHT). Para Iapar 59 foram analisados 77 contigs, encontrados 39 SSR?s e desenhados 21 pares de oligonucleotídeos. Para CaHT foram analisados também 77 contigs, encontrados 35 SSR?s e desenhados 29 pares de oligonucleotídeos. Os motivos com maior frequência foram di, tri e tetranucleotídeos, sendo (AT) no motivo mais frequente entre os dois genótipos. Esta busca de sequências repetitivas é de grande importância para futura validação e aumento desses marcadores para estudos de diversidade genética, mapeamento, e a ssociação com características agronômicas de interesse.  aAnálise in silico  aCromossomo artificial de bactéria  aMarcador SSR  aRNA-seq1 aCAÇÃO, S. B.1 aIVAMOTO, S. T.1 aSILVA, J. C.1 aDOMINGUES, D. S.1 aPEREIRA, L. F. P.