BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoPEDROSA, F. O. A report on the genome of Herbaspirillum seropedicae strain Z78. In: WANG, Y. P.; LIN, M.; TIAN, Z. X.; ELMERICH, C.; NEWTON, W. E. (Ed.). Biological nitrogen fixation, sustainable agriculture and the environment. Dordrecht: Springer, 2005. p. 111-114. Proceedings of the 14th International Nitrogen Fixation Congress.

Biblioteca(s): Embrapa Soja.

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2.Imagem marcado/desmarcadoRAMOS, H. J. O.; CHAVES, D. F. S.; PEREIRA, L. F. P.; CRUZ, L. M.; FUNGARO, M. H.; CUNHA, M. H. da; OSAKU, C.; PETZL-ERLER, M. L.; AYUB, R. A.; PERALTA, R. M.; MARUR, C. J.; SOUZA, E. M.; VIEIRA, L. G. E.; PEDROSA, F. O. Análise proteômica do estresse hídrico em cafeeiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007.

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3.Imagem marcado/desmarcadoGUIMARÃES, A. P.; DINIZ, A.; CALDEIRA, E.; FAÇANHA, A.; OLIVARES, F. L.; HUERGO, L.; PEDROSA, F. O.; BODDEY, R. M. Aprimoramento da técnica purificação da nitrogenase para quantificação da FBN por abundância natural de 15N. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DOBEREINER, 9., 19 a 23 de outubro de 2009, Seropédica. Ciência no Brasil: desafios, avanços e aplicações. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2009.

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4.Imagem marcado/desmarcadoPEDROSA, F. O.; DOBEREINER, J.; YATES, M. G. Autotrophic growth and N2 fixation by Derxia. An. Acad. Bras. Ci., v.52, n.3, p.651-, 1980.

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5.Imagem marcado/desmarcadoETTO, R. M.; GALVÃO, C. W.; GALVÃO, F.; CURCIO, G. R.; RACHWAL, M. F. G.; PEDROSA, F. O.; CRUZ, L. M.; STEFFENS, M. B. R. Biodiversity of prokaryotes from high-elevation grassland organosols of the Parana State, Brazil. In: ANNUAL MEETING OF SBBQ, 38., 2009, águas de Lindóia. Abstracts. Águas de Lindóia: SBBq, 2009. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Florestas.

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6.Imagem marcado/desmarcadoCHUEIRE, L. M. de O.; BANGEL, E.; FERREIRA, M. C.; GRANGE, L.; CAMPO, R. J.; MOSTASSO, F. L.; ANDRADE, D. de S.; PEDROSA, F. O.; HUNGRIA, M. Classificacao taxonomica, baseada na caracterizacao molecular, das estirpes de rizobio recomendadas para a culturas da soja e do feijoeiro. Londrina: Embrapa Soja, 2000. 32p. (Embrapa Soja. Boletim de Pesquisa, 3).

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7.Imagem marcado/desmarcadoCHUEIRE, L. M. de; BANGEL, E.; FERREIRA, M. G.; GRANGE, L.; CAMPO, R. J.; MOSTASSO, F. L.; ANDRADE, D. de S.; PEDROSA, F. O.; HUNGRIA, M. Classificação taxonômica, baseada na caracterização molecular, das estirpes de rizóbio recomendadas para as culturas da soja e do feijoeiro. Londrina: Embrapa Soja, 2000. 32 p. (Embrapa Soja. Boletim de Pesquisa, 3).

Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.

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8.Imagem marcado/desmarcadoCHUEIRE, L. M. O.; BANGEL, E. V.; MOSTASSO, F. L.; CAMPO, R, J.; PEDROSA, F. O.; HUNGRIA, M. Classificação taxonômica das estirpes de rizóbio recomendadas para as culturas da soja e do feijoeiro braseada no sequenciamento do gene 16S rRNA. Revista Brasileira de Ciência do Solo, Viçosa, v. 27, n. 5. p. 833-840, set./out. 2003.

Biblioteca(s): Embrapa Soja.

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9.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, E. M.; FUNAYAMA, S.; RIGO, L. U.; PEDROSA, F. O. Cloning and characterization of the nifA gene from Herbaspirillum seropedicae strain Z78. Can. J. Microbiol., v.37, p.-, 1991.

Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.

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10.Imagem marcado/desmarcadoVILLETH, G. R.; REIS JÚNIOR, F. B.; TONIETTO, A.; HUERGO, L.; SOUZA, E. M. de; PEDROSA, F. O.; FRANCO, O. L.; MEHTA, A. Comparative proteome analysis of Xanthomonas campestris pv. campestris in the interaction with the susceptible and the resistant cultivars of Brassica oleracea. FEMS Microbiology Letters, v. 298, p. 260-266, 2009.

Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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11.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, E. M. DE; FUNAYAMA, S.; RIGO, L. U.; PEDROSA, F. O. Construction of a gene library of Herbaspirillum seropedicae and characterization of a nifA-like gene. In: Nitrogen Fixation: Hundred Years After., v., p.334-, 1988.

Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.

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12.Imagem marcado/desmarcadoPILEGGI, M.; PEDROSA, F. O. Development of a strategy for the isolation of tissue-specific parameters of Lactuca sativa (lettuce) by PCR. Revista Brasileira de Genetica, Ribeirao Preto, v.19, n.3, p.334, set. 1996. Resumo. Suplemento.

Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças.

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13.Imagem marcado/desmarcadoRAMOS, H. J. O.; ANDRADE, C. A.; RIZZO, L. E.; MELO, J. A. T.; MAGALHÃES, D. M.; HUERGO, L.; C. W. GALVÃO; PEREIRA, L. F. P.; MARRACCINI, P.; CRUZ, L. M.; SOUZA, E. M.; BLOCH, C. J.; PEDROSA, F. O.; VIEIRA, L. G. E. Differential protein expression analysis of Coffea canephora plants under drought stress. In: ANNUAL MEETING OF SBBQ, 37.; CONGRESS OF THE PABMB, 11., 2008, Águas de Lindóia, SP. Abstracts... Águas de Lindóia: SBBq, 2008. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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14.Imagem marcado/desmarcadoLAMMEL, D. R.; BARTH, G.; OVASKAINEN, O.; CRUZ, L. M.; ZANATTA, J. A.; RYO, M.; SOUZA, E. M. de; PEDROSA, F. O. Direct and indirect effects of a pH gradient bring insights into the mechanisms driving prokaryotic community structures. Microbiome, v. 6, article 106, June 2018. 13 p.

Biblioteca(s): Embrapa Florestas.

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15.Imagem marcado/desmarcadoBALDANI, J. I.; CRUZ, L. M.; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de; SCHWAB, S.; TEIXEIRA, K. R. dos S.; SOUZA, E. M.; PEDROSA, F. O.; FARINELLI. Draft genome sequente of six endophytic nittrogen-fixing bacteria with potential biofertilizer application in non-leguminous plants. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN WITH NON-LEGUMES, 12.; INTERNATIONAL INCT SYMPOSIUM ON NITROGEN BIOLOGICAL FIXATION, 2., 03 a 8 de outubro, 2010, Búzios, RJ. Book of abstracts... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010. Slll. 05

Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.

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16.Imagem marcado/desmarcadoPEDROSA, F. O.; YATES, M. G. Effect of chelating agents and nickel ions on hydrogenase activity in Azospirillum brasilense, A. lipoferum and Derxia gummosa. Fems Microbiol. Lett., v.17, n.1, p.101-106, 1983.

Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.

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17.Imagem marcado/desmarcadoBALDANI, V. L.; BALDANI, J. I.; PEDROSA, F. O.; FARIA, S. M.; DOBEREINER, J. Formação de estruturas "nodule-like" em plântulas de trigo tratadas com 2,4 D e inoculadas com Azospirillum spp. In: FEIRA E CONGRESSO NACIONAL DE BIOTECNOLOGIA, 2., 1991, São Paulo. Resumos... São Paulo: Associaçãoo Brasileira de Empresas de Biotecnologia, 1991. p. 59

Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia; Embrapa Trigo.

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18.Imagem marcado/desmarcadoCHEN, L. S.; FIGUEREDO, A.; PEDROSA, F. O.; HUNGRIA, M. Genetic characterization of soybean rhizobia in Paraguay. Applied and Environmental Microbiology, Washington, v.66, n.11, p.5099-5103, Nov. 2000.

Biblioteca(s): Embrapa Soja.

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19.Imagem marcado/desmarcadoHUNGRIA, M.; CAMPO, R. J.; ANDRADE, D. S.; MENDES, I. C.; CHUEIRE, L. M. O.; GRANGE, L.; FERREIRA, M. C.; ALBERTON, O.; KASCHUK, G.; LOUREIRO, M. F.; PEDROSA, F. O. Genetic diversity of symbiotic rhizobia in brazilian soils. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR, 31., 2002, Caxambu. Programa e resumos. São Paulo : SBBq, 2002. p.29.

Biblioteca(s): Embrapa Soja.

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20.Imagem marcado/desmarcadoPEDROSA, F. O.; MONTEIRO, R. A.; WASSEM, R.; CRUZ, L. M.; AYUB, R. A.; COLAUTO, N. B.; FERNANDEZ, M. A.; FUNGARO, M. H. P; GRISARD, E. C.; CUNHA, M. H. da; MADEIRA, H. M. F.; NODARI, R. O.; OSAKU, C. A.; PETZLERLER, M. L.; TERENZI, H.; VIEIRA, L G. E.; STEFFENS, M. B. R.; WEISS, V. A.; PEREIRA, L. F. P.; ALMEIDA, M. I. M.; ALVEZ, L. R.; MARIN, A.; ARAUJO, L. M.; BALSANELLI, E.; BAURA, V. A.; CHUBATSU, L. S.; FAORO, H.; FAVETTI, A.; FRIEDERMANN, G.; GLIENKE, C.; KARP, S.; KAVA-CORDEIRO, V.; RAITTZ R, T.; RAMOS, H. J. O.; RIBEIRO, E. M. S. F.; RIGO, L. U.; ROCHA, S. N.; SCHWAB, S.; SILVA, A. G.; SOUZA, E. M.; TANDRA-SFEIR, M. Z.; TORRES, R. A.; DABUL, A. N. G.; SOARES, M. A. M.; GASQUES, L. S.; GIMENES, C. C. T.; VALLE, J. S.; CIFERRI, R. R.; CORREA, L. C.; MURACE, N. K.; PAMPHILE, J. A.; PATUSSI, E. V.; PRIOLI, A. J.; PRIOLI, S. M. A.; ROCHA, C. L. M. S. C.; ARANTES, O. M. N.; FURLANETO, M. C.; GODOY, L. P.; OLIVEIRA, C. E. C.; SATORI, D.; VILAS-BOAS, L. A.; WARANABE, M. A. E.; DAMBROS, B. P.; GUERRA, M. P.; MATHIONI, S. M.; SANTOS, K. L.; STEINDEL, M.; VERNAL, J.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; CAMPO, R. J.; NICOLÁS, M. F.; PEREIRA-FERRARI, L.; SILVA, J. L. C.; GIOPPO, N. M. R.; MARGARIDO, V. P.; MENCK-SOARES, M. A.; PINTO, F. G. S.; SIMÃO R. C. G.; TAKAHASHI, E. K.; YATES, M. G.; SOUZA, E. M. Genome of herbaspirillum seropedicae strain SmR1, a specialized diazotrophic endophyte of tropical grasses. PLoS Genetics, v. 7, n. 5, p. 1-10, may 2011.

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Biblioteca(s):  Embrapa Café; Embrapa Soja.
Data corrente:  10/08/2011
Data da última atualização:  17/04/2018
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Circulação/Nível:  A - 1
Autoria:  PEDROSA, F. O.; MONTEIRO, R. A.; WASSEM, R.; CRUZ, L. M.; AYUB, R. A.; COLAUTO, N. B.; FERNANDEZ, M. A.; FUNGARO, M. H. P.; GRISARD, E. C.; HUNGRIA, M.; MADEIRA, H. M. F.; NODARI, R. O.; OSAKU, C. A.; PETZL-ERLER, M. L.; TERENZI, H.; VIEIRA, L. G. E.; STEFFENS, M. B. R.; WEISS, V. A.; PEREIRA, L. F. P.; ALMEIDA, M. I. M.; ALVES, L. R.; MARIN, A.; ARAUJO, L. M.; BALSANELLI, E.; BAURA, V. A.; CHUBATSU, L. S.; FAORO, H.; FAVETTI, A.; FRIEDERMANN, G.; GLIENKE, C.; KARP, S.; KAVA-CORDEIRO, V.; RAITTZ, R. T.; RAMOS, H. J. O.; RIBEIRO, E. M. S. F.; RIGO, L. U.; ROCHA, S. N.; SCHWAB, S.; SILVA, A. G.; SOUZA, E. M.; MICHELLE Z. TADRA-SFEIR; TORRES, R. A.; DABUL, A. N. G.; SOARES, M. A. M.; GASQUES, L. S.; GIMENES, C. C. T.; VALLE, J. S.; CIFERRI, R. R.; CORREA, L. C.; MURACE, N. K.; PAMPHILE, J. A.; PATUSSI, E. V.; PRIOLI, A. J.; PRIOLI, S. M. A.; ROCHA, C. L. M. S. C.; ARANTES, O. M. N.; FURLANETO, M. C.; GODOY, L. P.; OLIVEIRA, C. E. C.; SATORI, D.; VILAS-BOAS, L. A.; WATANABE, M. A. E.; DAMBROS, B. P.; GUERRA, M. P.; MATHIONI, S. M.; SANTOS, K. L.; STEINDEL, M.; VERNAL, J.; BARCELLOS, F. G.; CAMPO, R. J.; CHUEIRE, L. M. O.; NICOLÁS, M. F.; PEREIRA-FERRARI, L.; SILVA, J. L. da C.; GIOPPO, N. M. R.; MARGARIDO, V. P.; MENCK-SOARES, M. A.; PINTO, F. G. S.; SIMÃO, R. de C. G.; TAKAHASHI, E. K.; YATES, M. G.; SOUZA, E. M.
Afiliação:  FÁBIO O. PEDROSA, UFPR; ROSE ADELE MONTEIRO, UFPR; ROSELI WASSEM, UFPR; LEONARDO M. CRUZ, UFPR; RICARDO A. AYUB, UEPG; NELSON B. COLAUTO, Universidade Paranaense, Umuarama.; MARIA APARECIDA FERNANDEZ, UEM; MARIA HELENA P. FUNGARO, UEL; EDMUNDO C. GRISARD, UFSC; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO; HUMBERTO M. F. MADEIRA8,, PUC Curitiba; RUBENS O. NODARI, UFSC; CLARICE A. OSAKU, UNIOESTE; MARIA LUIZA PETZL-ERLER, UFPR; HERNÁN TERENZI, UFSC; LUIZ G. E. VIEIRA, IAPAR; MARIA BERENICE R. STEFFENS, UFPR; VINICIUS A. WEISS, UFPR; LUIZ F. P. PEREIRA, IAPAR; MARINA I. M. ALMEIDA, UFPR; LYSANGELA R. ALVES, UFPR; ANELIS MARIN, UFPR; LUIZA MARIA ARAUJO, UFPR; EDUARDO BALSANELLI, UFPR; VALTER A. BAURA, UFPR; LEDA S. CHUBATSU, UFPR; HELISSON FAORO, UFPR; AUGUSTO FAVETTI, UFPR; GERALDO FRIEDERMANN, UFPR; CHIRLEI GLIENKE, UFPR; SUSAN KARP, UFPR; VANESSA KAVA-CORDEIRO, UFPR; ROBERTO T. RAITTZ, UFPR; HUMBERTO J. O. RAMOS, UFPR; ENILZE MARIA S. F. RIBEIRO, UFPR; LIU UN RIGO, UFPR; SAUL N. ROCHA, UFPR; STEFAN SCHWAB, UFPR; ANILDA G. SILVA, UFPR; ELIEL M. SOUZA, UFPR; TADRA-SFEIR, M. Z., UFPR; RODRIGO A. TORRES, UFPR; AUDREI N. G. DABUL, UEPG; MARIA ALBERTINA M. SOARES, UEPG; LUCIANO S. GASQUES, Universidade Paranaense, Umuarama; CIELA C. T. GIMENES, Universidade Paranaense, Umuarama.; JULIANA S. VALLE, Universidade Paranaense, Umuarama.; RICARDO R. CIFERRI, UEM; LUIZ C. CORREA, UEM; NORMA K. MURACE, UEM; JOÃO A. PAMPHILE, UEM; ELIANA VALÉRIA PATUSSI, UEM; ALBERTO J. PRIOLI, UEM; SONIA MARIA A. PRIOLI, UEM; CARMEM LÚCIA M. S. C. ROCHA, UEM; OLÍVIA MÁRCIA N. ARANTES, UEL; MÁRCIA CRISTINA FURLANETO, UEL; LEANDRO P. GODOY, UEL; CARLOS E. C. OLIVEIRA, UEL; DANIELE SATORI, UEL; LAURIVAL A. VILAS-BOAS, UEL; MARIA ANGÉLICA E. WATANABE, UEL; BIBIANA PAULA DAMBROS, UFSC; MIGUEL P. GUERRA, UFSC; SANDRA MARISA MATHIONI, UFSC; KARINE LOUISE SANTOS, UFSC; MARIO STEINDEL, UFSC; JAVIER VERNAL, UFSC; FERNANDO G. BARCELLOS, CNPSo - Pós-graduando; RUBENS J. CAMPO, CNPSo - Pesquisador aposentado; LIGIA MARIA DE OLIVEIRA CHUEIRE, CNPSO; MARISA FABIANA NICOLÁS, CNPSo - Pós-graduanda; LILIAN PEREIRA-FERRARI, PUC Curitiba-PR; JOSÉ L. DA CONCEICÃO SILVA, UNIOESTE; NEREIDA M. R. GIOPPO, UNIOESTE; VLADIMIR P. MARGARIDO, UNIOESTE; MARIA AMÉLIA MENCK-SOARES, UNIOESTE; FABIANA GISELE S. PINTO, UNIOESTE; RITA DE CÁSSIA G. SIMÃO, UNIOESTE; ELIZABETE K. TAKAHASHI, IAPAR; MARSHALL G. YATES, UFPR; EMANUEL M. SOUZA, UFPR.
Título:  Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a specialized diazotrophic endophyte of tropical grasses.
Ano de publicação:  2011
Fonte/Imprenta:  PLoS Genetics, v. 7, n. 5, p. 1-10, may 2011.
DOI:  10.1371/journal.pgen.1002064
Idioma:  Inglês
Português
Conteúdo:  The molecular mechanisms of plant recognition, colonization, and nutrient exchange between diazotrophic endophytes and plants are scarcely known. Herbaspirillum seropedicae is an endophytic bacterium capable of colonizing intercellular spaces of grasses such as rice and sugar cane. The genome of H. seropedicae strain SmR1 was sequenced and annotated by The Parana´ State Genome Programme?GENOPAR. The genome is composed of a circular chromosome of 5,513,887 bp and contains a total of 4,804 genes. The genome sequence revealed that H. seropedicae is a highly versatile microorganism with capacity to metabolize a wide range of carbon and nitrogen sources and with possession of four distinct terminal oxidases. The genome contains a multitude of protein secretion systems, including type I, type II, type III, type V, and type VI secretion systems, and type IV pili, suggesting a high potential to interact with host plants. H. seropedicae is able to synthesize indole acetic acid as reflected by the four IAA biosynthetic pathways present. A gene coding for ACC deaminase, which may be involved in modulating the associated plant ethylene-signaling pathway, is also present. Genes for hemagglutinins/ hemolysins/adhesins were found and may play a role in plant cell surface adhesion. These features may endow H. seropedicae with the ability to establish an endophytic life-style in a large number of plant species.
Palavras-Chave:  Colonization; Fixação nitrogênio; Nutrient; Plant recognition.
Thesagro:  Genoma; Graminea tropical.
Thesaurus NAL:  Genome; Grasses; Herbaspirillum seropedicae; Nitrogen fixation.
Categoria do assunto:  --
G Melhoramento Genético
URL:  http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/39544/1/plos-genetics.pdf
http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/42912/1/Genome-of-herbaspirillum.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Soja (CNPSO)
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