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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Meio-Norte. |
Data corrente: |
10/03/2008 |
Data da última atualização: |
14/09/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
DINIZ, F. M.; IYENGAR, A.; LIMA, P. S. da C.; MACLEAN, N.; BENTZEN, P. |
Afiliação: |
FABIO MENDONCA DINIZ, CPAMN; ARATI IYENGAR; PAULO SARMANHO DA COSTA LIMA, CPAMN; NORMAN MACLEAN; PAUL BENTZEN. |
Título: |
Application of a double-enrichment procedure for microsatellite isolation and the use tailed primers for high throughput genotyping. |
Ano de publicação: |
2007 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, São Paulo, v. 30, n. 2, p. 380-384, mar. 2007. |
ISSN: |
1415-4757 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The number of microsatellite loci and their allelic diversity contribute to increase accuracy and informativity of genetic estimates, however, the isolation of microsatellite loci is not only laborious but also quite expensive. We used (GATA)n and (GACA)n tetranucleotide probes and single- and double-enrichment hybridization to construct and screen a genomic library with an increased proportion of DNA fragments containing repeat motifs. Repeats were found using both types of hybridization but the double-enrichment procedure recovered sequences of which 100% contained (GATA)n and (GACA)n motifs. Microsatellite loci primers were then designed with an M13R-tail or CAG-tag to produce scorable PCR products with minimal stutter. The approach used in this study suggests that double-enrichment is a worthwhile strategy when isolating repeat motifs from eukaryotic genomes. Moreover, the use of tailed microsatellite primers provides increased resolution for compound microsatellite loci, with a significant decrease in costs. |
Palavras-Chave: |
Banda polimórfica; double-enrichment; double-hybridization; Enriquecimento duplo; Hibridação dupla; Microssatélite; stutter bands; tailed microsatellite primer. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/65872/1/Application-21449.pdf
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Marc: |
LEADER 01914naa a2200277 a 4500 001 1065872 005 2023-09-14 008 2007 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1415-4757 100 1 $aDINIZ, F. M. 245 $aApplication of a double-enrichment procedure for microsatellite isolation and the use tailed primers for high throughput genotyping.$h[electronic resource] 260 $c2007 520 $aThe number of microsatellite loci and their allelic diversity contribute to increase accuracy and informativity of genetic estimates, however, the isolation of microsatellite loci is not only laborious but also quite expensive. We used (GATA)n and (GACA)n tetranucleotide probes and single- and double-enrichment hybridization to construct and screen a genomic library with an increased proportion of DNA fragments containing repeat motifs. Repeats were found using both types of hybridization but the double-enrichment procedure recovered sequences of which 100% contained (GATA)n and (GACA)n motifs. Microsatellite loci primers were then designed with an M13R-tail or CAG-tag to produce scorable PCR products with minimal stutter. The approach used in this study suggests that double-enrichment is a worthwhile strategy when isolating repeat motifs from eukaryotic genomes. Moreover, the use of tailed microsatellite primers provides increased resolution for compound microsatellite loci, with a significant decrease in costs. 653 $aBanda polimórfica 653 $adouble-enrichment 653 $adouble-hybridization 653 $aEnriquecimento duplo 653 $aHibridação dupla 653 $aMicrossatélite 653 $astutter bands 653 $atailed microsatellite primer 700 1 $aIYENGAR, A. 700 1 $aLIMA, P. S. da C. 700 1 $aMACLEAN, N. 700 1 $aBENTZEN, P. 773 $tGenetics and Molecular Biology, São Paulo$gv. 30, n. 2, p. 380-384, mar. 2007.
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Unidades Centrais. |
Data corrente: |
23/03/2011 |
Data da última atualização: |
16/09/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 2 |
Autoria: |
PACHECO, L. P.; LEANDRO, W. M.; MACHADO, P. L. O. de A.; ASSIS, R. L. de; COBUCCI, T.; MADARI, B. E.; PETTER, F. A. |
Afiliação: |
LEANDRO PEREIRA PACHECO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; WILSON MOZENA LEANDRO, UFG; PEDRO LUIZ OLIVEIRA DE A MACHADO, CNPAF; RENATO LARA DE ASSIS, INSTITUTO FEDERAL GOIANO; TARCISIO COBUCCI, CNPAF; BEATA EMOKE MADARI, CNPAF; FABIANO ANDRÉ PETTER, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ. |
Título: |
Produção de fitomassa e acúmulo e liberação de nutrientes por plantas de cobertura na safrinha. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, DF, v. 46, n. 1, p. 17-25, jan. 2011. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho de plantas de cobertura quanto à fitomassa, ao acúmulo e à liberação de nutrientes, durante a entressafra, em um Latossolo Vermelho distroférrico, no Cerrado. O experimento foi realizado em Santo Antônio de Goiás e Rio Verde, GO, de novembro de 2007 a outubro de 2008. O delineamento experimental foi o de blocos ao acaso, em esquema de parcelas subdivididas no tempo, com as plantas de cobertura avaliadas nas parcelas principais e com os períodos de coleta de fitomassa nas subparcelas, com quatro repetições. As espécies avaliadas foram: Urochloa brizantha, U. ruziziensis, Pennisetum glaucum e U. ruziziensis + Cajanus cajan e, como referência, pousio com vegetação espontânea. As épocas de coleta foram seis em Santo Antônio de Goiás e cinco em Rio Verde, a partir da data de dessecação do P. glaucum, aos 60 dias após a semeadura. O P. glaucum apresentou as maiores quantidades de fitomassa seca no início da entressafra, enquanto as outras coberturas apresentaram acúmulos significativos de fitomassa e nutrientes no final da entressafra. |
Palavras-Chave: |
Braquiária; Feijão-guandu; Fitomassa; Guandu bean; Integração lavoura-pecuária; No?tillage. |
Thesagro: |
Brachiaria; Cerrado; Decomposição; Guandu; Milheto; Planta de cobertura; Plantio Direto. |
Thesaurus NAL: |
Degradation. |
Categoria do assunto: |
-- X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/30753/1/pab46.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/168643/1/Producao-de-fitomassa-e-acumulo.pdf
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Marc: |
LEADER 02119naa a2200361 a 4500 001 1882280 005 2022-09-16 008 2011 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aPACHECO, L. P. 245 $aProdução de fitomassa e acúmulo e liberação de nutrientes por plantas de cobertura na safrinha. 260 $c2011 520 $aO objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho de plantas de cobertura quanto à fitomassa, ao acúmulo e à liberação de nutrientes, durante a entressafra, em um Latossolo Vermelho distroférrico, no Cerrado. O experimento foi realizado em Santo Antônio de Goiás e Rio Verde, GO, de novembro de 2007 a outubro de 2008. O delineamento experimental foi o de blocos ao acaso, em esquema de parcelas subdivididas no tempo, com as plantas de cobertura avaliadas nas parcelas principais e com os períodos de coleta de fitomassa nas subparcelas, com quatro repetições. As espécies avaliadas foram: Urochloa brizantha, U. ruziziensis, Pennisetum glaucum e U. ruziziensis + Cajanus cajan e, como referência, pousio com vegetação espontânea. As épocas de coleta foram seis em Santo Antônio de Goiás e cinco em Rio Verde, a partir da data de dessecação do P. glaucum, aos 60 dias após a semeadura. O P. glaucum apresentou as maiores quantidades de fitomassa seca no início da entressafra, enquanto as outras coberturas apresentaram acúmulos significativos de fitomassa e nutrientes no final da entressafra. 650 $aDegradation 650 $aBrachiaria 650 $aCerrado 650 $aDecomposição 650 $aGuandu 650 $aMilheto 650 $aPlanta de cobertura 650 $aPlantio Direto 653 $aBraquiária 653 $aFeijão-guandu 653 $aFitomassa 653 $aGuandu bean 653 $aIntegração lavoura-pecuária 653 $aNo?tillage 700 1 $aLEANDRO, W. M. 700 1 $aMACHADO, P. L. O. de A. 700 1 $aASSIS, R. L. de 700 1 $aCOBUCCI, T. 700 1 $aMADARI, B. E. 700 1 $aPETTER, F. A. 773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, DF$gv. 46, n. 1, p. 17-25, jan. 2011.
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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