BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, M. V. G. B.; VANRADEN, P. M.; VAN TASSEL, C. P.; SOSTENGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L. K.; KIM, E.; WIGGANS, G. R. Análise de associação por todo o genoma para identificar locos relacionados ao lucro líquido, à vida produtiva e ao escore de células somáticas na raça Jersey. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Anais... Maringá: SBZ, 2009.

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.

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2.Imagem marcado/desmarcadoLIU, G. E.; LI, R. W.; SONSTEGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L. K.; SILVA, M. V. G. B.; VAN TASSELL, C. P. Characterization of a novel microdeletion polymorphism on BTA5 in cattle. Animal Genetics v. 39 p. 655-658

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.

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3.Imagem marcado/desmarcadoVENERONI-GOUVEIA, G.; MEIRELLES, S. L.; GROSSI, D. A.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; MATUKUMALLI, L. K.; COUTINHO, L. L.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, H. N.; REGITANO, L. C. A. Whole-genome analysis for backfat thickness in a tropically adapted, composite cattle breed from Brazil. Animal Genetics, p. 1-7, 2011.

Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.

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4.Imagem marcado/desmarcadoVENERONI-GOUVEIA, G.; MEIRELLES, S. L.; GROSSI, D. A.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; MATUKUMALLI, L. K.; COUTINHO, L. L.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, H. N.; REGITANO, L. C. de A. Whole-genome analysis for backfat thickness in a tropically adapted, composite cattle breed from Brazil. Animal Genetics, v.43, p. 518-524. 6p.

Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.

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5.Imagem marcado/desmarcadoVENERONI-GOUVEIA; MEIRELLES, S. L.; GROSSI, D. A.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; MATUKUMALLI, L. K.; COUTINHO, L. L.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, H. N.; REGITANO, L. C. de A. Whole-genome analysis for backfat thickness in a tropically adapted, composite cattle breed from Brazil Animal Genetics, v. 43, n. 3, novembro, 2011.

Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.

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6.Imagem marcado/desmarcadoLIU G. E.; HOU, Y. L.; ZHU, B.; CARDONE, M. F.; JIANG, L.; CELLAMARE, A.; MITRA, A.; ALEXANDER, L. J.; COUTINHO. L. L.; DELL'AQUILA, M. E.; GASBARRE, L. C.; LACALANDRA, G.; LI, R. W.; MATUKUMALLI, L. K.; NONNEMAN, D.; REGITANO, L. C. de A.; SMITH, T. P; SONG, J. Z.; SONSTEGARD, T. S.; Van TASSELL, C. P.; VENTURA, M.; EICHLER, E. E.; McDANELD, T. G.; KEELE, J. W. Analysis of copy number variations among diverse cattle breeds. Genome Research, v. 20, n. 5, p. 693-703, 2010

Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.

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7.Imagem marcado/desmarcadoSNELLING, W. M.; CHIU, R.; SCHEIN, J. E.; HOBBS, M.; ABBEY, C. A.; ADELSON, D. L.; AERTS, J.; BENNETT, G. L.; BOSDET, I. E.; BOUSSAHA, M.; BRAUNING, R.; CAETANO, A. R.; COSTA, M. M.; CRAWFORD, A. M.; DALRYMPLE, B. P.; EGGEN, A.; WIND, A. E. van der; FLORIOT, S.; GAUTIER, M.; GILL, C. A.; GREEN, R. D.; HOST, R.; JANN, O.; JONES, S. J. M.; DAPPES, S. M.; KEELE, J. W.; JONG, P. J. de; LARKIN, D. M.; LEWIN, J. A.; MCEWAN, J. C.; MCKAY, S.; MARRA, M. A.; MATHEWSON, C. A.; MATUKUMALLI, L. K.; MOORE, S. S.; MURDOCH, B.; NICHOLAS, F. W.; OSOEGAWA, K.; ROY, A.; SALIH, H.; SCHIBLE, L.; SCHNAGEL, R. D.; SILVERI, L.; SKOW, L. C.; SMITH, T. P. L.; SONSTEGARD, T. S.; TAYLOR, J.; TELLAM, R.; TASSELL, C. P. van; WILLIAMS, J. L.; WOMACK, J. E.; WYE, N. H.; YANG, G.; ZHAO, S. A physical map of the bovine genome. Genome Biology, 8, p. R165, 2007.

Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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Registro Completo

Biblioteca(s):  Embrapa Pecuária Sudeste.
Data corrente:  04/10/2010
Data da última atualização:  30/08/2013
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Circulação/Nível:  A - 1
Autoria:  LIU G. E.; HOU, Y. L.; ZHU, B.; CARDONE, M. F.; JIANG, L.; CELLAMARE, A.; MITRA, A.; ALEXANDER, L. J.; COUTINHO. L. L.; DELL'AQUILA, M. E.; GASBARRE, L. C.; LACALANDRA, G.; LI, R. W.; MATUKUMALLI, L. K.; NONNEMAN, D.; REGITANO, L. C. de A.; SMITH, T. P; SONG, J. Z.; SONSTEGARD, T. S.; Van TASSELL, C. P.; VENTURA, M.; EICHLER, E. E.; McDANELD, T. G.; KEELE, J. W.
Afiliação:  GEORGE E. LIU; YALI HOU; BIN ZHU; MARIA FRANCESCA CARDONE; LU JIANG; ANGELO CELLAMARE; APRATIM MITRA; LEESON J. ALEXANDER; LUIZ L. COUTINHO; MARIA ELENA DELL'AQUILA; LOU C. GASBARRE; GIANNI LACALANDRA; ROBERT W. LI; LAKSHMI K. MATUKUMALLI; DAN NONNEMAN; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; TIM P. L. SMITH; JIUZHOU SONG; TAD S. SONSTEGARD; CURT P. Van TASSELL; MARIO VENTURA; EVAN E. EICHLER; TARA G. McDANELD; JOHN W. KEELE.
Título:  Analysis of copy number variations among diverse cattle breeds.
Ano de publicação:  2010
Fonte/Imprenta:  Genome Research, v. 20, n. 5, p. 693-703, 2010
Idioma:  Português
Conteúdo:  Genomic structural variation is an important and abundant source of genetic and phenotypic variation. Here, we describe the first systematic and genome-wide analysis of copy number variations (CNVs) in modern domesticated cattle using array comparative genomic hybridization (array CGH), quantitative PCR (qPCR), and fluorescent in situ hybridization (FISH). The array CGH panel included 90 animals from 11 Bos taurus, three Bos indicus, and three composite breeds for beef, dairy, or dual purpose. We identified over 200 candidate CNV regions (CNVRs) in total and 177 within known chromosomes, which harbor or are adjacent to gains or losses. These 177 high-confidence CNVRs cover 28.1 megabases or similar to 1.07% of the genome. Over 50% of the CNVRs (89/177) were found in multiple animals or breeds and analysis revealed breed-specific frequency differences and reflected aspects of the known ancestry of these cattle breeds. Selected CNVs were further validated by independent methods using qPCR and FISH. Approximately 67% of the CNVRs (119/177) completely or partially span cattle genes and 61% of the CNVRs (108/177) directly overlap with segmental duplications. The CNVRs span about 400 annotated cattle genes that are significantly enriched for specific biological functions, such as immunity, lactation, reproduction, and rumination. Multiple gene families, including ULBP, have gone through ruminant lineage-specific gene amplification. We detected and confirmed marked differences in t... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Gene-expression; Genome-wide association; Inbred mouse strains; Segmental duplications; Structural variation.
Categoria do assunto:  G Melhoramento Genético
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CPPSE19517 - 1UPCSP - PPPROCI-2010.00077LIU2010.00077
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