Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
26/04/2010 |
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Data da última atualização: |
24/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
SILVA, M. V. G. B.; VANRADEN, P. M.; VAN TASSEL, C. P.; SOSTENGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L. K.; KIM, E.; WIGGANS, G. R. |
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Afiliação: |
MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; PAUL M. VANRADEN, USDA; CURT P. VAN TASSEL, USDA; TAD S. SOSTENGARD, USDA; LAKSHMI K. MATUKUMALLI, GEORGE MASON UNIVERSITY; EUI-SOO KIM, USDA; GEORGE R. WIGGANS, USDA. |
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Título: |
Análise de associação por todo o genoma para identificar locos relacionados ao lucro líquido, à vida produtiva e ao escore de células somáticas na raça Jersey. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Anais... Maringá: SBZ, 2009. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Foi realizada uma varredura por todo o genoma de animais da raça Jersey, nos EUA, utilizando marcadores do tipo SNP, visando identificar QTL associados ao lucro líquido, à vida produtiva e ao escore de células somáticas. Os dados usados neste estudo foram provenientes do Animal Improvement Programs Laboratory, USDA/EUA. Amostras de DNA coletadas de 2.380 animais da raça Jersey e as habilidades preditas de transmissão de 2.081 animais, publicadas em fevereiro/2009 (http://greenbook.usjersey.com/), foram utilizadas nas análises. Para a genotipagem dos SNPs foi usado o BovineSNP50 BeadChip da Illumina, com aproximadamente 54.000 SNPs. Todo SNP com call rate (<99%), em desequilíbrio de Hardy-Weinberg (teste exato p<0,01) e com frequência de um dos alelos menor do que 5% foram excluídos das análises finais (30.342 SNP usados). P-values corrigidos pelo teste de Bonferroni iguais a 0,01 foram usados. Para todas as características, SNP significativos foram encontrados em vários cromossomos, especialmente nos BTAs 3, 4, 5, 6, 10, 12, 23 e 25. Os resultados sugerem que as soluções para os efeitos dos marcadores nas avaliações genômicas podem identificar regiões cromossômicas que necessitem ser melhor estudadas. |
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Palavras-Chave: |
Associação por todo genoma. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/711787/1/Analise-de-associacao-por-todo-o-genoma.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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