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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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Data corrente: |
10/01/2014 |
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Data da última atualização: |
16/11/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
RIBEIRO, F. E.; BAUDOUIN, L.; LEBRUN, P.; CHAVES, L. J.; BRONDANI, C.; COSTA, E. F. N.; VENCOVSKY, R. |
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Afiliação: |
FRANCISCO ELIAS RIBEIRO, CPATC; LUC BAUDOUIN, CIRAD; PATRICIA LEBRUN, CIRAD; LAZARO JOSE CHAVES, UFG; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; EMILIANO FERNANDES NASSAU COSTA, CPATC; ROLAND VENCOVSKY, ESALQ. |
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Título: |
Genetic diversity in Brazilian tall coconut populations by microsatellite markers. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 13, n. 4, p. 356-362, dez. 2013. |
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DOI: |
10.1590/S1984-70332013000400006 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The tall coconut palm was introduced in Brazil in 1553, originating from the island of Cape Verde. The aim of the present study was to evaluate the genetic diversity of ten populations of Brazilian tall coconut by 13 microsatellite markers. Samples were collected from 195 individuals of 10 different populations. A total of 68 alleles were detected, with an average of 5.23 alleles per locus. The mean expected and observed heterozygosity value was 0.459 and 0.443, respectively. The number of alleles per population ranged from 36 to 48, with a mean of 40.9 alleles. We observed the formation of two groups, the first formed by the populations of Baía Formosa, Georgino Avelino and São José do Mipibu, and the second by the populations of Japoatã, Pacatuba and Praia do Forte. These results reveal a high level of genetic diversity in the Brazilian populations. |
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Palavras-Chave: |
Genetic variability; Molecular markers. |
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Thesagro: |
Coco; Cocos Nucifera; Marcador molecular; Variação genética. |
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Categoria do assunto: |
--
S Ciências Biológicas |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/166798/1/CNPAF-2013-cbab.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Corte. Para informações adicionais entre em contato com cnpgc.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
15/03/2010 |
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Data da última atualização: |
15/03/2010 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
BARICHELLO, F.; ALENCAR, M. M. de; TORRES JUNIOR, R. A. de A. |
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Afiliação: |
F. BARICHELLO, FCAV-UNESP – ESTAGIÁRIA CPPSE.; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; ROBERTO AUGUSTO DE A TORRES JUNIOR, CNPGC. |
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Título: |
Efeito dos parâmetros do amostrador de Gibbs sobre o valor genético de escores visuais simulados. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 4., 2008, Campo Grande, MS. Anais [da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2008. 1 CD-ROM. Editores técnicos Valdemir Antônio Laura, Paulo Henrique Nogueira Biscola. |
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Páginas: |
1 p. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O Amostrador de Gibbs (AG) é a ferramenta de inferência bayesiana mais usada no melhoramento animal. Ele gera amostras auto-correlacionadas da distribuição
de interesse. Neste contexto é importante determinar o descarte inicial (DI) e o intervalo de retirada (IR) de amostras de forma a evitar a influência dos valores
iniciais e o dispêndio com o armazenamento de amostras. Os objetivos deste trabalho foram avaliar o efeito do tamanho da cadeia (TC), do DI e do IR sobre os
valores genéticos aditivos direto (VA) e materno (VM) no estudo de características avaliadadas por escores visuais. Os dados utilizados foram obtidos por simulação
a partir de um rebanho com 40 touros e 1.200 fêmeas acompanhado por 20 anos. A herdabilidade utilizada na simulação foi 0,25. Os valores genéticos foram
estimados considerando modelo linear completo por meio do AG. Foram testadas TC de 700.000, 300.000 e 50.000 ciclos, respectivamente, DI de 40, 15 e 5% do
TC, respectivamente, IR que correspondiam a uma amostra final com 0,1%; 1,0% e 10% do TC. Foram utilizadas todas as combinações de TC, DI e IR com duas
repetições cada. Foi calculada, para cada repetição, a correlação entre os VA e VM estimados e os verdadeiros, dentro de categoria animal (touro, vaca e
produto). As correlações dos VA de touro e produto não sofreram influência dos parâmetros estudados. As correlações dos VM de touro e produto foram inferiores
para cadeia pequena. Para a correlação dos VA e VM de vaca houve efeito da interação TC*IR e DI*IR. Os valores “grande” e “médio” se equivaleram, sendo que
os resultados menos satisfatórios foram encontrados com os parâmetros “pequenos”. Isto permite afirmar que para estimar adequadamente VM, são
necessárias cadeias de 300.000 ciclos, podendo ser adotado um DI pequeno e IR longo para otimizar o uso dos recursos computacionais. MenosO Amostrador de Gibbs (AG) é a ferramenta de inferência bayesiana mais usada no melhoramento animal. Ele gera amostras auto-correlacionadas da distribuição
de interesse. Neste contexto é importante determinar o descarte inicial (DI) e o intervalo de retirada (IR) de amostras de forma a evitar a influência dos valores
iniciais e o dispêndio com o armazenamento de amostras. Os objetivos deste trabalho foram avaliar o efeito do tamanho da cadeia (TC), do DI e do IR sobre os
valores genéticos aditivos direto (VA) e materno (VM) no estudo de características avaliadadas por escores visuais. Os dados utilizados foram obtidos por simulação
a partir de um rebanho com 40 touros e 1.200 fêmeas acompanhado por 20 anos. A herdabilidade utilizada na simulação foi 0,25. Os valores genéticos foram
estimados considerando modelo linear completo por meio do AG. Foram testadas TC de 700.000, 300.000 e 50.000 ciclos, respectivamente, DI de 40, 15 e 5% do
TC, respectivamente, IR que correspondiam a uma amostra final com 0,1%; 1,0% e 10% do TC. Foram utilizadas todas as combinações de TC, DI e IR com duas
repetições cada. Foi calculada, para cada repetição, a correlação entre os VA e VM estimados e os verdadeiros, dentro de categoria animal (touro, vaca e
produto). As correlações dos VA de touro e produto não sofreram influência dos parâmetros estudados. As correlações dos VM de touro e produto foram inferiores
para cadeia pequena. Para a correlação dos VA e VM de vaca houve efeito da interação TC... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Amostrador de Gibbs; Inferência bayesiana. |
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Thesagro: |
Melhoramento Genético Animal. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
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300 $a1 p.$c1 CD-ROM.
520 $aO Amostrador de Gibbs (AG) é a ferramenta de inferência bayesiana mais usada no melhoramento animal. Ele gera amostras auto-correlacionadas da distribuição de interesse. Neste contexto é importante determinar o descarte inicial (DI) e o intervalo de retirada (IR) de amostras de forma a evitar a influência dos valores iniciais e o dispêndio com o armazenamento de amostras. Os objetivos deste trabalho foram avaliar o efeito do tamanho da cadeia (TC), do DI e do IR sobre os valores genéticos aditivos direto (VA) e materno (VM) no estudo de características avaliadadas por escores visuais. Os dados utilizados foram obtidos por simulação a partir de um rebanho com 40 touros e 1.200 fêmeas acompanhado por 20 anos. A herdabilidade utilizada na simulação foi 0,25. Os valores genéticos foram estimados considerando modelo linear completo por meio do AG. Foram testadas TC de 700.000, 300.000 e 50.000 ciclos, respectivamente, DI de 40, 15 e 5% do TC, respectivamente, IR que correspondiam a uma amostra final com 0,1%; 1,0% e 10% do TC. Foram utilizadas todas as combinações de TC, DI e IR com duas repetições cada. Foi calculada, para cada repetição, a correlação entre os VA e VM estimados e os verdadeiros, dentro de categoria animal (touro, vaca e produto). As correlações dos VA de touro e produto não sofreram influência dos parâmetros estudados. As correlações dos VM de touro e produto foram inferiores para cadeia pequena. Para a correlação dos VA e VM de vaca houve efeito da interação TC*IR e DI*IR. Os valores “grande” e “médio” se equivaleram, sendo que os resultados menos satisfatórios foram encontrados com os parâmetros “pequenos”. Isto permite afirmar que para estimar adequadamente VM, são necessárias cadeias de 300.000 ciclos, podendo ser adotado um DI pequeno e IR longo para otimizar o uso dos recursos computacionais.
650 $aMelhoramento Genético Animal
653 $aAmostrador de Gibbs
653 $aInferência bayesiana
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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