BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoMOLINA, J. C. Expressão gênica em raízes de soja durante o déficit hídrico. 2004. 84 f. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Londrina, Londrina.

Biblioteca(s): Embrapa Soja.

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2.Imagem marcado/desmarcadoGUIMARÃES, J. A. C.; MOLINA, J. C. F. (Org.). Aspectos jurídicos e éticos da informação digital. Marília, SP: Fundepe, 2008. 160 p.

Biblioteca(s): Área de Informação da Sede.

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3.Imagem marcado/desmarcadoMOLINA, J. C.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; NEPOMUCENO, A. L. Indução de dessecação em plantas cultivadas em solução nutritiva. Brazilian Journal of Plant Physiology, Campinas, v.15, p.383, 2003. Suplemento.

Biblioteca(s): Embrapa Soja.

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4.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, F. A.; SANTOS, R. dos; CAMPOS, C. I. de; MOLINA, J. C. Utilização de resíduos e derivados de madeira para confecção de uma guitarra elétrica. Scientia Forestalis, Piracicaba, v. 39, n. 90, p. 186- 190, jun. 2011.

Biblioteca(s): Embrapa Florestas.

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5.Imagem marcado/desmarcadoMOLINA, J. C.; MODA-CIRINO, V.; FONSECA JÚNIOR, N. da S.; FARIA, R. T. de; DESTRO, D. Response of common bean cultivars and lines to water stress. Crop Breeding and Applied Biotechnology, Londrina, v. 1, n. 4, p. 363-371, Dec. 2001.

Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.

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6.Imagem marcado/desmarcadoMORALES, A. M. R.; MOLINA, J. C.; LEMOS, N. G.; FUGANTI, R.; NEPOMUCENO, A. L.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; BINNECK, E. Análise dos genes expressos em raízes de soja submetidas a déficit hídrico. In: SIMPOSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIFIL, 12., 2004, Londrina. Resumos... Londrina: UniFil, 2004. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Soja.

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7.Imagem marcado/desmarcadoLEMOS, N. G.; MOLINA, J. C.; STOLF, R.; MORALES, A. M. R.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E, FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Expressão de aquaporinas e outros genes em raízes de soja sob condições de deficiência hídrica. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA , 49., 2003, Águas de Lindóia. A dupla hélice do DNA: [resumos]. [S. l.]: SBG, 2003. 1 CD-ROM. Resumo Área GP pdf. 069.

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8.Imagem marcado/desmarcadoMOLINA, J. C.; LEMOS, N. G.; MORALES, A. M.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Expressão gênica em raízes de soja durante o déficit hídrico. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA , 49., 2003, Águas de Lindóia. A dupla hélice do DNA: [resumos]. [S. l.]: SBG, 2003. 1 CD-ROM. Resumo Área GP pdf. 068.

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9.Imagem marcado/desmarcadoMOLINA, J. C.; LEMOS, N. G.; MORALES, A. M.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A. da; LEMOS, E.; SILVA, J. F. V.; ARIAS, C. A. A.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Funcional genomics of soybean roots. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 7.; INTERNATIONAL SOYBEAN PROCESSING AND UTILIZATION CONFERENCE, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 3., 2004, Foz do Iguassu. Abstracts of contributed papers and posters. Londrina: Embrapa Soybean, 2004. p. 256-257. (Embrapa Soja. Documentos, 228). Editado por Flávio Moscardi, Clara Beatriz Hoffmann-Campo, Odilon Ferreira Saraiva, Paulo Roberto Galerani, Francisco Carlos Krzyzanowski, Mercedes Concordia Carrão-Panizzi.

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10.Imagem marcado/desmarcadoLEMOS, N. G.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NAKASHIMA, K.; MOLINA, J. C.; STOLF, R.; MORALES, A. M. R.; LUGLE, S. M.; SILVEIRA, C. A. de; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Introduction of genes that confer drought stress tolerance in soybean [Glycine max (L.) Merril] by biobalistic. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 7.; INTERNATIONAL SOYBEAN PROCESSING AND UTILIZATION CONFERENCE, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 3., 2004, Foz do Iguassu. Abstracts of contributed papers and posters. Londrina: Embrapa Soybean, 2004. p. 256. (Embrapa Soja. Documentos, 228). Editado por Flávio Moscardi, Clara Beatriz Hoffmann-Campo, Odilon Ferreira Saraiva, Paulo Roberto Galerani, Francisco Carlos Krzyzanowski, Mercedes Concordia Carrão-Panizzi.

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11.Imagem marcado/desmarcadoSTOLF, R.; MEDRI, M. E.; BROGIN, R. L.; MOLINA, J. C.; SILVEIRA, C. A. da; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; LEMOS, N. G.; PIOTTO, E. C. S.; DIAS, J.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Tolerance to drought in Glycine max (L.) Merril: ecophysiological aspects. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 7.; INTERNATIONAL SOYBEAN PROCESSING AND UTILIZATION CONFERENCE, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 3., 2004, Foz do Iguassu. Abstracts of contributed papers and posters. Londrina: Embrapa Soybean, 2004. p. 185. (Embrapa Soja. Documentos, 228). Editado por Flávio Moscardi, Clara Beatriz Hoffmann-Campo, Odilon Ferreira Saraiva, Paulo Roberto Galerani, Francisco Carlos Krzyzanowski, Mercedes Concordia Carrão-Panizzi.

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12.Imagem marcado/desmarcadoSTOLF, R.; LEMOS, E. G. M.; CARARETO-ALVES, L. M.; KISHI, L.; PEREIRA, R. M.; MARCONDES, J.; PAIVA, A. A. R.; BINNECK, E.; POLIZEL, A. M.; MARIN, S. R. R.; YAMANAKA, N.; MOLINA, J. C.; FARIASJ. R. B.; NEPOMUCENO, A. L. Caracterização fisiológica e expressão gênica por microarranjos de DNA em duas cultivares de soja durante déficit hídrico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 4., 2006, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2006. p.46. Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Simone Ery Grosskopf.

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13.Imagem marcado/desmarcadoBINNECK, E.; SILVA, J. F. V.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ARIAS, C. A. A.; ALMEIDA, A. M. R.; MARIN, S. R. R.; WENDLAND, A.; SILVEIRA, C. A. da; MOLINA, J. C.; LEMOS, N. G.; FUGANTI, R.; STOLF, R.; NEPOMUCENO, A. L. Bioinformatics tools for sequence analysis and annotation applied to soybean functional genome. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 7.; INTERNATIONAL SOYBEAN PROCESSING AND UTILIZATION CONFERENCE, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 3., 2004, Foz do Iguassu. Abstracts of contributed papers and posters. Londrina: Embrapa Soybean, 2004. p. 248-249. (Embrapa Soja. Documentos, 228). Editado por Flávio Moscardi, Clara Beatriz Hoffmann-Campo, Odilon Ferreira Saraiva, Paulo Roberto Galerani, Francisco Carlos Krzyzanowski, Mercedes Concordia Carrão-Panizzi.

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14.Imagem marcado/desmarcadoNEPOMUCENO, A. L.; SILVA, J. F. V.; LEMOS, E. G. M.; BINNECK, E.; CARNEIRO, N.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; BASSOI, M. C.; ALMEIDA, A. M. R.; MORALES, A.; BENEVENTI, M. A.; GIACOMINI, N.; STOLF, R.; FUGANTI, R.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ARIAS, C. A. A.; MOLINA, J. C.; WENDLAND, A. Genômica funcional em plantas de soja submetidas a estresses bióticos e abióticos. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 25., 2003, Uberaba. Resumos... Londrina: Embrapa Soja: EPAMIG: Fundação Triângulo, 2003. p. 113-114. (Embrapa Soja. Documentos, 209). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Boas de Campos Leite.

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15.Imagem marcado/desmarcadoNEPOMUCENO, A. L.; SILVA, J. F. V.; LEMOS, E.; BINNECK, E.; CARNEIRO, N.; MARIN, S. R.; SILVEIRA, C. A.; BASSOI, M. C.; ALMEIDA, A. M.; MORALES, A.; BENEVENTI, M. A.; GIACOMINI, N.; STOLF, R.; FUGANTI, R.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ARIAS, C. A.; MOLINA, J. C.; WENDLAND, A. Genômica Funcional: Tolerância à seca e resistência a nematóides em soja. Brazilian Journal of Plant Physiology, Campinas, v.15, p.80, 2003. Suplemento. Resumo apresentado no IX Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal, Atibaia, 2003.

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16.Imagem marcado/desmarcadoNEPOMUCENO, A. L.; SILVA, J. F. V.; LEMOS, E. G. M.; BINNECK, E.; CARNEIRO, N.; MARIN, S. R.; SILVEIRA, C. A; WENDLAND, A.; BASSOI, M. C.; ALMIEDA, A. M.; MORAES, A.; BENEVENTI, M. A.; GIACOMINI, N.; STOLF, R.; FUGANTI, R.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ARIAS, C. A.; MOLINA, J. C. Genoma funcional de raízes de soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE NEMATOLOGIA, 24., 2003, Petrolina. [ Anais...]. Petrolina: Sociedade Brasileira de Nematologia: Embrapa Semi-Árido, 2003. p. 53-55. Editado por Wellington Antonio Moreira, Lúcia Helena Piedade Kiill.

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17.Imagem marcado/desmarcadoBINNECK, E.; SILVA, J. F. V.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ARIAS, C. A. A.; ALMEIDA, A. M. R.; MARIN, S. R. R.; WENDLAND, A.; SILVEIRA, C. A. da; MOLINA, J. C.; LEMOS, N. G.; FUGANTI, R.; STOLF, R.; NEPOMUCENO, A. L. VSQual: a visual system to assist the DNA sequencing quality control. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 7.; INTERNATIONAL SOYBEAN PROCESSING AND UTILIZATION CONFERENCE, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 3., 2004, Foz do Iguassu. Abstracts of contributed papers and posters. Londrina: Embrapa Soybean, 2004. p. 249-250. (Embrapa Soja. Documentos, 228). Editado por Flávio Moscardi, Clara Beatriz Hoffmann-Campo, Odilon Ferreira Saraiva, Paulo Roberto Galerani, Francisco Carlos Krzyzanowski, Mercedes Concordia Carrão-Panizzi.

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18.Imagem marcado/desmarcadoBINNECK, E.; MORALES, A. M. R.; ALMEIDA, A. M. R.; ARIAS, C. A. A.; SILVEIRA, C. A.; SILVA, J. F. V.; FARIAS, J. R. B.; MOLINA, J. C.; PEDROSO, J. C.; BRETON, M. C.; LEMOS, N. G.; NEUMAIER, N.; MARTINS, P. K.; FUGANTI, R.; STOLF, R.; MARIN, S. R. R.; NEPOMUCENO, A. L. A visual system for DNA sequencing quality control. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOINFOMATICS AND COMPUTATION BIOLOGY, 1., 2003, Ribeirão Preto. Resumos... [S.l.]: CBAB - Centro Brasileiro-Argentino de Biotecnologia, 2003. p. 47.

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Biblioteca(s):  Embrapa Soja.
Data corrente:  07/04/2004
Data da última atualização:  27/07/2007
Autoria:  BINNECK, E.; SILVA, J. F. V.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ARIAS, C. A. A.; ALMEIDA, A. M. R.; MARIN, S. R. R.; WENDLAND, A.; SILVEIRA, C. A. da; MOLINA, J. C.; LEMOS, N. G.; FUGANTI, R.; STOLF, R.; NEPOMUCENO, A. L.
Título:  Bioinformatics tools for sequence analysis and annotation applied to soybean functional genome.
Ano de publicação:  2004
Fonte/Imprenta:  In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 7.; INTERNATIONAL SOYBEAN PROCESSING AND UTILIZATION CONFERENCE, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 3., 2004, Foz do Iguassu. Abstracts of contributed papers and posters. Londrina: Embrapa Soybean, 2004.
Páginas:  p. 248-249.
Série:  (Embrapa Soja. Documentos, 228).
Idioma:  Inglês
Notas:  Editado por Flávio Moscardi, Clara Beatriz Hoffmann-Campo, Odilon Ferreira Saraiva, Paulo Roberto Galerani, Francisco Carlos Krzyzanowski, Mercedes Concordia Carrão-Panizzi.
Conteúdo:  Worldwide functional genomics studies are making an important role on biotechnology for the identification of genes that can be use in the improvement of specific biological processes in plants. Large-scale gene discovery projects like that depend on high accuracy of the data. The data should not only be trustworthy but should be correctly annotated for various features it contains. In this work we report a bioinformatics system designed to process and annotate the expressed sequence tags (ESTs) obtained by the project Functional Genome of Soybean Roots at Embrapa Soybean (http://www.cnpso.embrapa.br/bioinformatica). The system is made of Perl and PHP scripts, which performs the automated sequence analysis and support the annotation process based on a MySQL database. Various Perl scripts was written to assist the sequence analysis process that includes basecalling, clustering and assembling the reads, filtering of contaminating, repetitive and low quality sequences, identification of sequence features, BLASTing and reports generation. BLAST (Altschul et al., 1997, Nucleic Acids Res. 25:3389-3402) outputs are processed and disposed on a way that is easily accessed by the personal that performs the massive handle of the data for annotation. Also, PHP scripts was written to make a friendly annotation interface through dynamical Web pages that perform the database operations needed for the complete annotation of the genes, whish comprise data retrieval aided by query searches li... Mostrar Tudo
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Soja (CNPSO)
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CNPSO23752 - 1UMTPL - --RF 633.34072W927a
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