| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
|
Data corrente: |
20/04/2006 |
|
Data da última atualização: |
17/01/2020 |
|
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
YAMAGISHI, M. E. B.; BEZERRA, G. B. P.; QUINALIA, T.; KUSER, P. R.; HIGA, R. H.; MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; CRUZ, S. A. B.; OLIVEIRA, S. R. M.; NESHICH, G.; RAY, N.; MAIGRET, B. |
|
Afiliação: |
MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; GEORGE B. P. BEZERRA; THIAGO QUINALIA; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; JOSÉ GILBERTO JARDINE, CNPTIA; IVAN MAZONI, CNPTIA; EDGARD HENRIQUE DOS SANTOS, CNPTIA; SÉRGIO APARECIDO BRAGA DA CRUZ, CNPTIA; STANLEY ROBSON DE MEDEIROS OLIVEIRA, CNPTIA; GORAN NESHICH, CNPTIA; NICHOLAS RAY, Inria Lorraine; BERNARD MAIGRET, Universite Henri Poincare. |
|
Título: |
An interative protein interface surface Java Viewer. |
|
Ano de publicação: |
2005 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. |
|
Páginas: |
p. 17. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
X-meeting 2005. Presented posters. |
|
Conteúdo: |
More than 50% of protein structures deposited in the PDB database have two or more chains according to the PDB Metrics1 software. Therefore, there are a plenty of protein complexes in the PDB database. It is important to understand the physical-chemical forces that are involved in protein complexes aggregation. In order to facilitate this analyze, it would be desirable to get two protein chains and visualize their contact interface surfaces separately, and paint over each one of them a common physical-chemical property that could be important in the complex formation. Using weighted Delaunay triangulation and marching tetrahedra algorithms from the CGAL library these contact interface surfaces were generated and rendered in an Interactive Java Viewer based on JavaView2 library. The surfaces can be rotated, translated, scaled and it is possible to identify from which amino acid a given vertice came from, among other useful features. All the physical-chemical parameters available in Java Protein Dossier - JPD can be used to paint the surfaces facilitating the analyses. |
|
Palavras-Chave: |
Interface; Java. |
|
Thesagro: |
Proteína. |
|
Thesaurus Nal: |
Proteins. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 02099nam a2200337 a 4500
001 1008756
005 2020-01-17
008 2005 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aYAMAGISHI, M. E. B.
245 $aAn interative protein interface surface Java Viewer.$h[electronic resource]
260 $aIn: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional$c2005
300 $ap. 17.
500 $aX-meeting 2005. Presented posters.
520 $aMore than 50% of protein structures deposited in the PDB database have two or more chains according to the PDB Metrics1 software. Therefore, there are a plenty of protein complexes in the PDB database. It is important to understand the physical-chemical forces that are involved in protein complexes aggregation. In order to facilitate this analyze, it would be desirable to get two protein chains and visualize their contact interface surfaces separately, and paint over each one of them a common physical-chemical property that could be important in the complex formation. Using weighted Delaunay triangulation and marching tetrahedra algorithms from the CGAL library these contact interface surfaces were generated and rendered in an Interactive Java Viewer based on JavaView2 library. The surfaces can be rotated, translated, scaled and it is possible to identify from which amino acid a given vertice came from, among other useful features. All the physical-chemical parameters available in Java Protein Dossier - JPD can be used to paint the surfaces facilitating the analyses.
650 $aProteins
650 $aProteína
653 $aInterface
653 $aJava
700 1 $aBEZERRA, G. B. P.
700 1 $aQUINALIA, T.
700 1 $aKUSER, P. R.
700 1 $aHIGA, R. H.
700 1 $aMANCINI, A. L.
700 1 $aJARDINE, J. G.
700 1 $aMAZONI, I.
700 1 $aSANTOS, E. H. dos
700 1 $aCRUZ, S. A. B.
700 1 $aOLIVEIRA, S. R. M.
700 1 $aNESHICH, G.
700 1 $aRAY, N.
700 1 $aMAIGRET, B.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
|
Data corrente: |
05/01/2007 |
|
Data da última atualização: |
29/08/2019 |
|
Tipo da produção científica: |
Capítulo em Livro Técnico-Científico |
|
Autoria: |
CARVALHO, A. P. de; SANTOS, H. G. dos; GOMES, I. A.; OLIVEIRA, J. B. de; LUMBRERAS, J. F.; ANJOS, L. H. C. dos; COELHO, M. R.; JACOMINE, P. K. T.; FASOLO, P. J.; CUNHA, T. J. F.; OLIVEIRA, V. A. de. |
|
Afiliação: |
TONY JARBAS FERREIRA CUNHA, CPATSA. |
|
Título: |
Horizontes diagnósticos superficiais. Horizontes diagnósticos subsuperficiais. |
|
Ano de publicação: |
2006 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: SANTOS, H. G. dos; JACOMINE, P. K. T.; ANJOS, L. H. C. dos; OLIVEIRA, V. A. de; OLIVEIRA, J. B. de; COELHO, M. R.; LUMBRERAS, J. F.; CUNHA, T. J. F. (Ed.). Sistema brasileiro de classificação de solos. 2. ed. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2006. |
|
Páginas: |
cap. 2. p.45-65. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
Horizontes diagnósticos superficiais: Horizonte hístico; Horizonte A chernozêmico; Horizonte A proeminente; Horizonte A húmico; Horizonte A antrópico; Horizonte A fraco; Horizonte Amoderado;. Horizontes diagnósticos subsuperficiais: Horizonte B textural; Horizonte B latossólico; Horizonte B incipiente; Horizonte B nítico; Horizonte B espódico; Horizonte B plânico; Horizonte álbico; Horizonte plíntico; Horizonte concrecionário; Horizonte litoplíntico; Horizonte Glei; Horizonte Cálcico; Horizonte Pretocálcico; Horizonte Sulfúrico; Horizonte Vértico; Fragipã; Duripã. |
|
Palavras-Chave: |
Classificação; Diagnóstico superficial; Nível categórico; Subsuperficial. |
|
Thesagro: |
Nomenclatura; Solo. |
|
Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
|
URL: |
https://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/bitstream/doc/158062/1/HorizontesDiagnosticosSuperficiais.HorizontesDiagnosticosSubsuperficiais.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01701naa a2200325 a 4500
001 1158062
005 2019-08-29
008 2006 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aCARVALHO, A. P. de
245 $aHorizontes diagnósticos superficiais. Horizontes diagnósticos subsuperficiais.
260 $c2006
300 $acap. 2. p.45-65.
520 $aHorizontes diagnósticos superficiais: Horizonte hístico; Horizonte A chernozêmico; Horizonte A proeminente; Horizonte A húmico; Horizonte A antrópico; Horizonte A fraco; Horizonte Amoderado;. Horizontes diagnósticos subsuperficiais: Horizonte B textural; Horizonte B latossólico; Horizonte B incipiente; Horizonte B nítico; Horizonte B espódico; Horizonte B plânico; Horizonte álbico; Horizonte plíntico; Horizonte concrecionário; Horizonte litoplíntico; Horizonte Glei; Horizonte Cálcico; Horizonte Pretocálcico; Horizonte Sulfúrico; Horizonte Vértico; Fragipã; Duripã.
650 $aNomenclatura
650 $aSolo
653 $aClassificação
653 $aDiagnóstico superficial
653 $aNível categórico
653 $aSubsuperficial
700 1 $aSANTOS, H. G. dos
700 1 $aGOMES, I. A.
700 1 $aOLIVEIRA, J. B. de
700 1 $aLUMBRERAS, J. F.
700 1 $aANJOS, L. H. C. dos
700 1 $aCOELHO, M. R.
700 1 $aJACOMINE, P. K. T.
700 1 $aFASOLO, P. J.
700 1 $aCUNHA, T. J. F.
700 1 $aOLIVEIRA, V. A. de
773 $tIn: SANTOS, H. G. dos; JACOMINE, P. K. T.; ANJOS, L. H. C. dos; OLIVEIRA, V. A. de; OLIVEIRA, J. B. de; COELHO, M. R.; LUMBRERAS, J. F.; CUNHA, T. J. F. (Ed.). Sistema brasileiro de classificação de solos. 2. ed. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2006.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
