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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
01/02/2018 |
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Data da última atualização: |
07/11/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GEISTLINGER, L.; SILVA, V. H. da; CESAR, A. S. M.; TIZIOTO, P. C.; WALDRON, L.; ZIMMER, R.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
Ludwig Geistlinger, Bolsista/Embrapa Pecuária Sudeste; Vinicius Henrique da Silva, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Polyana Cristine Tizioto, ESALQ/USP; Levi Waldron, University of New York; Ralf Zimmer, Ludwig Maximilians Universität München; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP. |
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Título: |
Widespread modulation of gene expression by copy number variation in skeletal muscle. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 8, n. 1399, p. 1-11, jan. 2018. |
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DOI: |
10.1038/s41598-018-19782-4 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Copy number variation (CNV) is a frequently observed deviation from the diploid state due to duplication or deletion of genomic regions. Although intensively analyzed for association with diseases and production traits, the specific mechanisms and extent by which such variations affect the phenotype are incompletely understood. We present an integrative study on CNV and genome-wide gene expression in Brazilian Bos indicus cattle. We analyzed CNVs inferred from SNP-chip data for effects on gene expression measured with RNA-seq in skeletal muscle samples of 183 steers. Local effects, where expression changes coincided with CNVs in the respective genes, were restricted to immune genes. Distal effects were attributable to several high-impact CNVs that modulated remote expression in an orchestrated and intertwined fashion. These CNVs were located in the vicinity of major skeletal muscle pathway regulators and associated genes were enriched for proteolysis, autophagy, and muscle structure development. From association analysis between CNVs and several meat quality and production traits, we found CNV-associated expression effects to also manifest at the phenotype level. Based on genome sequences of the population founders, we further demonstrate that CNVs with impact on expression and phenotype are passed on from one generation to another. |
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Palavras-Chave: |
Agricultural genetics; Nellore cattle. |
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Thesaurus Nal: |
gene expression. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
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Data corrente: |
16/03/2023 |
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Data da última atualização: |
16/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
LOBO, C. R.; SILVA, T. P. da; VEIGA, A. D.; ANDRADE, S. R. M. de. |
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Afiliação: |
CAMILA RODRIGUES LOBO, UNIÃO PIONEIRA DE INTEGRAÇÃO SOCIAL; THIAGO PAULO DA SILVA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ADRIANO DELLY VEIGA, CPAC; SOLANGE ROCHA MONTEIRO DE ANDRADE, CPAC. |
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Título: |
Parâmetros morfológicos para seleção de clones tolerantes ao bicho mineiro. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO NACIONAL MULTIDISCIPLINAR EM CIÊNCIA, 2022, Florianóplois. Anais... Florianópolis: Institu Scientia, 2022. |
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Páginas: |
p. 1772-1775 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O Cerrado brasileiro é responsável por 40% da produção nacional de café (Coffea arabica) devido às suas condições favoráveis. Atualmente no cerrado, o principal problema da produção é o bicho mineiro (Lepidoptera lyonetiidae), uma praga foliar prejudicial a cultura.O objetivo do trabalho foi associar os dados de crescimento com o rendimento visando a seleção dos clones tolerantes ao bicho mineiro e mais produtivos. O experimento foi implantado em 2018 com oito clones propagados por embriogênese somática e cinco cultivares altamente produtivas. Nos dois primeiros anos selecionamos clones com maior tolerância ao bicho mineiro. Em 2021,estes genótipos pré-selecionados foram avaliados na altura de plantas, número de ramos produtivos, projeção de copa, vigor vegetativo e produtividade visando selecionar os genótipos mais produtivos. Dentro destes o clone IAC1 destacou-se nos parâmetros morfológicos avaliados e apresentou maior rendimento. Os genótipos serão avaliados por mais dois anos para validar a metodologia de seleção |
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Thesagro: |
Bicho Mineiro; Cerrado; Clone; Coffea Arábica; Embriogénese; Genótipo; Leucoptera Coffeella. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1152412/1/Parametros-morfologicos-selecao-2022.pdf
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Marc: |
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520 $aO Cerrado brasileiro é responsável por 40% da produção nacional de café (Coffea arabica) devido às suas condições favoráveis. Atualmente no cerrado, o principal problema da produção é o bicho mineiro (Lepidoptera lyonetiidae), uma praga foliar prejudicial a cultura.O objetivo do trabalho foi associar os dados de crescimento com o rendimento visando a seleção dos clones tolerantes ao bicho mineiro e mais produtivos. O experimento foi implantado em 2018 com oito clones propagados por embriogênese somática e cinco cultivares altamente produtivas. Nos dois primeiros anos selecionamos clones com maior tolerância ao bicho mineiro. Em 2021,estes genótipos pré-selecionados foram avaliados na altura de plantas, número de ramos produtivos, projeção de copa, vigor vegetativo e produtividade visando selecionar os genótipos mais produtivos. Dentro destes o clone IAC1 destacou-se nos parâmetros morfológicos avaliados e apresentou maior rendimento. Os genótipos serão avaliados por mais dois anos para validar a metodologia de seleção
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Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
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