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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
03/11/2014 |
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Data da última atualização: |
05/04/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BARROS-CARVALHO, G. A.; PASCHOAL, A. R.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; HUNGRIA, M. |
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Afiliação: |
GESIELE ALMEIDA BARROS DE CARVALHO, CNPq - bolsista; ALEXANDRE ROSSI PASCHOAL, UTFPR; FRANCISMAR CORRÊA MARCELINO-GUIMARÃES, CNPSO; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO. |
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Título: |
Prediction of potential novel microRNAs in soybean when in symbiosis. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 4, p. 8519-8529, 2014. |
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ISSN: |
1676-5680 |
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DOI: |
10.4238/2014.October.20.28 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
MicroRNAs (miRNAs) are small molecules, noncoding proteins that are involved in many biological processes, especially in plants; among these processes is nodulation in the legume. Biological nitrogen fixation is a key process, with critical importance to the soybean crop. This study aimed to identify the potential of novel miRNAs to act during the root nodulation process. We utilized a set of transcripts that were differentially expressed in soybean roots 10 days after inoculation with Bradyrhizobium japonicum, which were obtained in a previous study, and performed a set of computational analyses that led us to select new miRNAs potentially involved in nodulation. Among these analyses, the set of transcripts were submitted to an in silico annotation of noncoding RNAs, including a search of similarity against miRNA public databases, ab initio tools for miRNA identification, structural search against miRNA families, prediction of the secondary structure of miRNA precursors, and prediction of the sequences of mature miRNAs. Subsequently, we applied filter procedures based on miRNA selections described in the literature (e.g., free energy value). In the next step, a manual curation inspection of the annotation was performed and the top candidates were selected and used for prediction of potential target genes, which were later checked manually in the database of the soybean genome. This prediction led us to the identification of 9 potential new miRNAs; among these, 4 were conserved in other plants. Moreover, we predicted their target genes might play important roles in the regulation of nodulation. MenosMicroRNAs (miRNAs) are small molecules, noncoding proteins that are involved in many biological processes, especially in plants; among these processes is nodulation in the legume. Biological nitrogen fixation is a key process, with critical importance to the soybean crop. This study aimed to identify the potential of novel miRNAs to act during the root nodulation process. We utilized a set of transcripts that were differentially expressed in soybean roots 10 days after inoculation with Bradyrhizobium japonicum, which were obtained in a previous study, and performed a set of computational analyses that led us to select new miRNAs potentially involved in nodulation. Among these analyses, the set of transcripts were submitted to an in silico annotation of noncoding RNAs, including a search of similarity against miRNA public databases, ab initio tools for miRNA identification, structural search against miRNA families, prediction of the secondary structure of miRNA precursors, and prediction of the sequences of mature miRNAs. Subsequently, we applied filter procedures based on miRNA selections described in the literature (e.g., free energy value). In the next step, a manual curation inspection of the annotation was performed and the top candidates were selected and used for prediction of potential target genes, which were later checked manually in the database of the soybean genome. This prediction led us to the identification of 9 potential new miRNAs; among these, 4 were conser... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Soja. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/110912/1/Prediction-of-potential-novel-microRNAs-in-soybean-when-in-symbiosis.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados; Embrapa Trigo. |
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Data corrente: |
12/09/2022 |
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Data da última atualização: |
05/07/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
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Autoria: |
SOARES SOBRINHO, J.; FRONZA, V.; CHAGAS, J. H.; ALBRECHT, J. C.; SCHEEREN, P. L.; CASTRO, R. L. de. |
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Afiliação: |
JOAQUIM SOARES SOBRINHO, CNPT; VANOLI FRONZA, CNPT; JORGE HENRIQUE CHAGAS, CNPT; JULIO CESAR ALBRECHT, CPAC; PEDRO LUIZ SCHEEREN, CNPT; RICARDO LIMA DE CASTRO, CNPT. |
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Título: |
Resposta de genótipos de trigo às diferenças de ambientes de clima tropical e temperado em Minas Gerais. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2022. |
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Páginas: |
32 p. |
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Série: |
(Embrapa Trigo. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 104) |
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ISSN: |
1677-8901 |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
ODS 2. |
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Conteúdo: |
A fronteira para expansão da cultura do trigo representada pelo Brasil Central
concentra sua maior área em regiões de clima tropical. No entanto, parte
desta área, localizada principalmente no estado de Minas Gerais, é caracterizada
pela ocorrência de clima temperado. Em dois locais (Coromandel e
Uberaba), de clima tropical, e dois (Madre de Deus de Minas e São Gonçalo
do Sapucaí) de clima temperado, foi avaliado o comportamento de 35 genótipos
de trigo. As temperaturas mais baixas do clima temperado foram
capazes de mitigar os efeitos da brusone e do déficit hídrico, pela menor
incidência da doença e pela redução na evapotranspiração, respectivamente,
proporcionando rendimento de grãos significativamente maior que nos locais
de clima tropical. Assim, a Região Homogênea de Adaptação de Cultivares
de Trigo 4 (quente e seca - Cerrado), que abrange parte dos estados de SP,
MS, MT e BA e os estados de MG e GO e o DF, deveria ser subdividida em
pelo menos duas regiões, separando as regiões Campo das Vertentes, Zona da Mata e Sul/Sudoeste de Minas Gerais e Sudeste de São Paulo, onde predominam o clima temperado e o Bioma Mata Atlântica.
Termos para indexação: cultivares, região homogênea de adaptação, rendimento de grãos, brusone, ciclo.
Response of wheat genotypes to the tropical and temperate climate environment differences in the Minas Gerais State
The frontier for expansion of the wheat crop represented by Central Brazil concentrates its largest area in regions with tropical climate. However, part of this area, located mainly in the State of Minas Gerais, is characterized by the occurrence of temperate climate. In two (Coromandel and Uberaba) tropical and two (Madre de Deus de Minas and São Gonçalo do Sapucaí) temperate places, the performance of 35 wheat genotypes was tested. The lower temperatures of the temperate climate were able to mitigate the effects of wheat blast and water deficit, due to the lower incidence of the disease and the reduction in evapotranspiration, respectively, providing significantly higher grain yield than in tropical climate locations. Thus, the Homogeneous Region of Adaptation of Wheat Cultivars 4 (hot and dry - Cerrado), which covers part of the states of São Paulo, Mato Grosso do Sul, Mato Grosso, and Bahia, and the states of Minas Gerais and Goiás, and the Federal District, should be subdivided into at least two regions, separating the regions Campo das Vertentes, Zona da Mata, and the South/Southwest of Minas Gerais and Southeast of São Paulo, where the temperate climate and the Atlantic Forest Biome predominate.
Index terms: cultivars, homogeneus region of adaptation, grain yield, wheat blast, cycle. MenosA fronteira para expansão da cultura do trigo representada pelo Brasil Central
concentra sua maior área em regiões de clima tropical. No entanto, parte
desta área, localizada principalmente no estado de Minas Gerais, é caracterizada
pela ocorrência de clima temperado. Em dois locais (Coromandel e
Uberaba), de clima tropical, e dois (Madre de Deus de Minas e São Gonçalo
do Sapucaí) de clima temperado, foi avaliado o comportamento de 35 genótipos
de trigo. As temperaturas mais baixas do clima temperado foram
capazes de mitigar os efeitos da brusone e do déficit hídrico, pela menor
incidência da doença e pela redução na evapotranspiração, respectivamente,
proporcionando rendimento de grãos significativamente maior que nos locais
de clima tropical. Assim, a Região Homogênea de Adaptação de Cultivares
de Trigo 4 (quente e seca - Cerrado), que abrange parte dos estados de SP,
MS, MT e BA e os estados de MG e GO e o DF, deveria ser subdividida em
pelo menos duas regiões, separando as regiões Campo das Vertentes, Zona da Mata e Sul/Sudoeste de Minas Gerais e Sudeste de São Paulo, onde predominam o clima temperado e o Bioma Mata Atlântica.
Termos para indexação: cultivares, região homogênea de adaptação, rendimento de grãos, brusone, ciclo.
Response of wheat genotypes to the tropical and temperate climate environment differences in the Minas Gerais State
The frontier for expansion of the wheat crop represented by Central Brazil concentrates its largest area in regions with tropical... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Clima Tropical; Grão; Região Temperada; Rendimento; Trigo; Variedade. |
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Thesaurus NAL: |
Cultivars; Grain yield; Wheat. |
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Categoria do assunto: |
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1146349/1/BPD104-online.pdf
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Marc: |
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100 1 $aSOARES SOBRINHO, J.
245 $aResposta de genótipos de trigo às diferenças de ambientes de clima tropical e temperado em Minas Gerais.$h[electronic resource]
260 $aPasso Fundo: Embrapa Trigo$c2022
300 $a32 p.
490 $a(Embrapa Trigo. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 104)
500 $aODS 2.
520 $aA fronteira para expansão da cultura do trigo representada pelo Brasil Central concentra sua maior área em regiões de clima tropical. No entanto, parte desta área, localizada principalmente no estado de Minas Gerais, é caracterizada pela ocorrência de clima temperado. Em dois locais (Coromandel e Uberaba), de clima tropical, e dois (Madre de Deus de Minas e São Gonçalo do Sapucaí) de clima temperado, foi avaliado o comportamento de 35 genótipos de trigo. As temperaturas mais baixas do clima temperado foram capazes de mitigar os efeitos da brusone e do déficit hídrico, pela menor incidência da doença e pela redução na evapotranspiração, respectivamente, proporcionando rendimento de grãos significativamente maior que nos locais de clima tropical. Assim, a Região Homogênea de Adaptação de Cultivares de Trigo 4 (quente e seca - Cerrado), que abrange parte dos estados de SP, MS, MT e BA e os estados de MG e GO e o DF, deveria ser subdividida em pelo menos duas regiões, separando as regiões Campo das Vertentes, Zona da Mata e Sul/Sudoeste de Minas Gerais e Sudeste de São Paulo, onde predominam o clima temperado e o Bioma Mata Atlântica. Termos para indexação: cultivares, região homogênea de adaptação, rendimento de grãos, brusone, ciclo. Response of wheat genotypes to the tropical and temperate climate environment differences in the Minas Gerais State The frontier for expansion of the wheat crop represented by Central Brazil concentrates its largest area in regions with tropical climate. However, part of this area, located mainly in the State of Minas Gerais, is characterized by the occurrence of temperate climate. In two (Coromandel and Uberaba) tropical and two (Madre de Deus de Minas and São Gonçalo do Sapucaí) temperate places, the performance of 35 wheat genotypes was tested. The lower temperatures of the temperate climate were able to mitigate the effects of wheat blast and water deficit, due to the lower incidence of the disease and the reduction in evapotranspiration, respectively, providing significantly higher grain yield than in tropical climate locations. Thus, the Homogeneous Region of Adaptation of Wheat Cultivars 4 (hot and dry - Cerrado), which covers part of the states of São Paulo, Mato Grosso do Sul, Mato Grosso, and Bahia, and the states of Minas Gerais and Goiás, and the Federal District, should be subdivided into at least two regions, separating the regions Campo das Vertentes, Zona da Mata, and the South/Southwest of Minas Gerais and Southeast of São Paulo, where the temperate climate and the Atlantic Forest Biome predominate. Index terms: cultivars, homogeneus region of adaptation, grain yield, wheat blast, cycle.
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