Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
18/10/2019 |
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Data da última atualização: |
23/10/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PEREIRA, L. F. P.; SCHENK, J. C. M.; MALUF, M. P.; SANT'ANA, G. C.; NOGUEIRA, L.; PEREIRA, L. A.; SILVA, B. S. R. da; GUIMARÃES, P. de S.; GUERREIRO FILHO, O.; PADILHA, L. |
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Afiliação: |
LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, CNPCa; Juliana C. M. Schenk, Bolsista CNPq/INCT/Embrapa Café/IAC; MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa; Gustavo C. Sant'ana, Tropical Melhoramento & Genética - TMG; Livia Nogueira, Universidade Estadual de Londrina - UEL. Bolsista CAPES; Ligia A. Pereira, Bolsista Consórcio Pesquisa Café/CPG; Bruna S. R. da Silva, Bolsista Consórcio Pesquisa Café/DSc; Paula de S. Guimarães, Bolsista Consórcio Pesquisa Café/CPG; Oliveiro Guerreiro Filho, Instituto Agronômico Campinas - IAC. Bolsista CNPq DT; LILIAN PADILHA, CNPCa. |
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Título: |
Marcadores SNP avaliados em cultivares de Café Arábica. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, Inovação e Sustentabilidade dos Cafés do Brasil. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2019. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Título em inglês: SNP markers assessed in Arabica coffee cultivars. |
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Conteúdo: |
A demanda crescente por cafés especiais e a an a t t a a a mais a participação de produtores neste segmento. Além da origem, da sustentabilidade na produção e da avaliação a diferenciados quant a a t n a a rastreabilidade da produção a a n a exigências a a a t a do produto. Dentro deste processo, a crescente demanda pelo atestado da pureza varietal vem exigindo o desenvolvimento de ferramentas que possam garantir a diferenciação inequívoca do produto comercial, e que viabilizem sua proteção intelectual. Assim, nosso objetivo foi desenvolver marcadores SNP, identificados em análises de genotipagem pelo sequenciamento (GBS), voltados à discriminação de cultivares de café arábica. Quarenta e oito cultivares foram genotipadas pelo sequenciamento em plataforma Illumina e 192.730 TAGs foram alinhadas ao genoma de Coffea arabica, gentilmente cedido pelo Consórcio Internacional de Sequenciamento do Genoma do Arabica (ACGC). Após o alinhamento ao genoma de referência de C. arabica e aplicação dos filtros de qualidade, 1.181 SNP foram obtidos e utilizados para identificar a relação entre os cultivares através da análise de componentes principais (PCA). Esses marcadores confirmaram a estreita base genética das variedades de C. arabica, e foram eficientes em separar os grupos dos Bourbons das demais cultivares, em especial, de Catuaí e Mundo Novo. Um conjunto de 18 marcadores SNP com elevado conteúdo informativo foram anotados e estão sendo validados para confirmar seu potencial para análises de pureza varietal e genética das cultivares comercializadas no país. MenosA demanda crescente por cafés especiais e a an a t t a a a mais a participação de produtores neste segmento. Além da origem, da sustentabilidade na produção e da avaliação a diferenciados quant a a t n a a rastreabilidade da produção a a n a exigências a a a t a do produto. Dentro deste processo, a crescente demanda pelo atestado da pureza varietal vem exigindo o desenvolvimento de ferramentas que possam garantir a diferenciação inequívoca do produto comercial, e que viabilizem sua proteção intelectual. Assim, nosso objetivo foi desenvolver marcadores SNP, identificados em análises de genotipagem pelo sequenciamento (GBS), voltados à discriminação de cultivares de café arábica. Quarenta e oito cultivares foram genotipadas pelo sequenciamento em plataforma Illumina e 192.730 TAGs foram alinhadas ao genoma de Coffea arabica, gentilmente cedido pelo Consórcio Internacional de Sequenciamento do Genoma do Arabica (ACGC). Após o alinhamento ao genoma de referência de C. arabica e aplicação dos filtros de qualidade, 1.181 SNP foram obtidos e utilizados para identificar a relação entre os cultivares através da análise de componentes principais (PCA). Esses marcadores confirmaram a estreita base genética das variedades de C. arabica, e foram eficientes em separar os grupos dos Bourbons das demais cultivares, em especial, de Catuaí e Mundo Novo. Um conjunto de 18 marcadores SNP com elevado conteúdo informativo foram anotados e estão sendo validados para confirmar seu potencial para an... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Cultivar discrimination; Discriminação de cultivar; GBS. |
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Thesagro: |
Coffea Arábica. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/1113242/1/MarcadoresSNPavaliados.pdf
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Marc: |
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500 $aTítulo em inglês: SNP markers assessed in Arabica coffee cultivars.
520 $aA demanda crescente por cafés especiais e a an a t t a a a mais a participação de produtores neste segmento. Além da origem, da sustentabilidade na produção e da avaliação a diferenciados quant a a t n a a rastreabilidade da produção a a n a exigências a a a t a do produto. Dentro deste processo, a crescente demanda pelo atestado da pureza varietal vem exigindo o desenvolvimento de ferramentas que possam garantir a diferenciação inequívoca do produto comercial, e que viabilizem sua proteção intelectual. Assim, nosso objetivo foi desenvolver marcadores SNP, identificados em análises de genotipagem pelo sequenciamento (GBS), voltados à discriminação de cultivares de café arábica. Quarenta e oito cultivares foram genotipadas pelo sequenciamento em plataforma Illumina e 192.730 TAGs foram alinhadas ao genoma de Coffea arabica, gentilmente cedido pelo Consórcio Internacional de Sequenciamento do Genoma do Arabica (ACGC). Após o alinhamento ao genoma de referência de C. arabica e aplicação dos filtros de qualidade, 1.181 SNP foram obtidos e utilizados para identificar a relação entre os cultivares através da análise de componentes principais (PCA). Esses marcadores confirmaram a estreita base genética das variedades de C. arabica, e foram eficientes em separar os grupos dos Bourbons das demais cultivares, em especial, de Catuaí e Mundo Novo. Um conjunto de 18 marcadores SNP com elevado conteúdo informativo foram anotados e estão sendo validados para confirmar seu potencial para análises de pureza varietal e genética das cultivares comercializadas no país.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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