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Registros recuperados : 52 | |
5. | | LACERDA, C. L.; FARIAS, M. de O.; SILVEIRA, A. D.; BARROS, L. M.; SCIVITTARO, W. B. Efluxo de gases de efeito estufa no cultivo de soja em terras baixas: efeito da época e das operações de preparo do solo. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA CLIMA TEMPERADO, 6., 2016, Pelotas. Ciência: Empreendedorismo e inovação: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 177-179 Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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8. | | SILVEIRA, A. D.; FARIAS, M. de O.; BARROS, L. M.; JARDIM, T. M.; SCIVITTARO, W. B. Emissões de gases de efeito estufa em Planossolo durante a entressafra em função do manejo do solo e cultura antecedente. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA CLIMA TEMPERADO, 6., 2016, Pelotas. Ciência: Empreendedorismo e inovação: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2016. 292 p. Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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11. | | KLUMB, E. K.; SCIVITTARO, W. B.; SILVA, P. S.; MELLO, D. C.; SILVEIRA, A. D. Absorção de macronutrientes pelo arroz irrigado por aspersão. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 21.; MOSTRA CIENTÍFICA, 4., 2012, Pelotas. [Anais.]. Pelotas: UFPel, 2012. 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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12. | | LEVANDOSKI, A, P.; FARIAS, M. de O.; SILVEIRA, A. D.; SCIVITTARO, W. B. Caracterização de genótipos de arroz irrigado quanto à tolerância à salinidade na fase vegetativa. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 22.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 15., 2013, Pelotas. [Anais.]. Pelotas: UFPel, 2013. Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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14. | | SCIVITTARO, W. B.; SILVEIRA, A. D.; VEÇOZZI, T. A.; JARDIM, T. M.; SOUSA, R. O. Uso de rotação de culturas como estratégia mitigadora de emissões de gases de efeito estufa em terras baixas. In: CONFERENCIA INTERNACIONAL DE ARROZ PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, 13., 2018, Piura, Peru. Resumos... Piura, Peru: Fondo Latinoamericano para Arroz de Riego - FLAR, 2018 Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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16. | | CASTILHOS, R. M. V.; SCIVITTARO, W. B.; SOUSA, R. O. de; SILVEIRA, A. D.; FARIAS, M. de O. Aavaliação da tolerância de genótipos de arroz à salinidade da água de irrigação na fase vegetativa. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. FertBio 2014. Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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17. | | KLUMB, E. K.; SILVA, P. S.; MELLO, D. C.; LAVANDOSKI, A. P.; SILVEIRA, A. D.; SCIVITTARO, W. B. Absorção de fósforo e potássio pelo arroz irrigado por inundação do solo e aspersão. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA CLIMA TEMPERADO, 4., 2012, Pelotas. Ciência e inovação para 2050: qual o futuro que queremos? Resumos e palestras... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2012. 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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18. | | VEÇOZZI, T. A.; SCIVITTARO, W. B.; SOUSA, R. O. de; SILVEIRA, A. D.; GUEVARA, M. D. F. Relação entre emissão de gases de efeito estufa e produtividade de grãos em arroz irrigado: efeito de fertilizantes nitrogenados estabilizados. In: CONFERENCIA INTERNACIONAL DE ARROZ PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, 13., 2018, Piura, Peru. Resumos... Piura, Peru: Fondo Latinoamericano para Arroz de Riego - FLAR, 2018 Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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19. | | SILVEIRA, A. D.; LEVANDOSKI, A, P.; FARIAS, M. de O.; MELLO, D. C. de; SCIVITTARO, W. B. Influência do manejo da água nas emissões de gases de efeito estufa em lavoura de arroz irrigado. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 22.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 15., 2013, Pelotas. [Anais.]. Pelotas: UFPel, 2013. Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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Registros recuperados : 52 | |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
26/12/2018 |
Data da última atualização: |
24/01/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
B - 3 |
Autoria: |
ALMEIDA, A. L.; SCHETTINO, V. J.; BARBOSA, T. J. R.; FREITAS, P. F.; GUIMARÃES, P. G. S.; ARBEX, W. A. |
Afiliação: |
WAGNER ANTONIO ARBEX, CNPGL. |
Título: |
Relative scalability of NoSQL databases for genotype data manipulation. |
Ano de publicação: |
2018 |
Fonte/Imprenta: |
Revista de Informática Teórica e Aplicada, v. 25, n. 2, p. 93-100, 2018. |
DOI: |
10.22456/2175-2745.79334 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract Genotype data manipulation is one of the greatest challenges in bioinformatics and genomics mainly because of high dimensionality and unbalancing characteristics. These peculiarities explains why Relational Database Management Systems (RDBMSs), the "de facto" standard storage solution, have not been presented as the best tools for this kind of data. However, Big Data has been pushing the development of modern database systems that might be able to overcome RDBMSs deficiencies. In this context, we extended our previous works on the evaluation of relative performance among NoSQLs engines from different families, adapting the schema design in order to achieve better performance based on its conclusions, thus being able to store more SNP markers for each individual. Using Yahoo! Cloud Serving Benchmark (YCSB) benchmark framework, we assessed each database system over hypothetical SNP sequences. Results indicate that although Tarantool has the best overall throughput, MongoDB is less impacted by the increase of SNP markers per individual. |
Palavras-Chave: |
Data Science; Database; NoSQL; SNP. |
Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; Genotype. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/189325/1/Artigo-RevInfTeorApl-Arbex-Relative.pdf
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Marc: |
LEADER 01813naa a2200265 a 4500 001 2102528 005 2023-01-24 008 2018 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.22456/2175-2745.79334$2DOI 100 1 $aALMEIDA, A. L. 245 $aRelative scalability of NoSQL databases for genotype data manipulation.$h[electronic resource] 260 $c2018 520 $aAbstract Genotype data manipulation is one of the greatest challenges in bioinformatics and genomics mainly because of high dimensionality and unbalancing characteristics. These peculiarities explains why Relational Database Management Systems (RDBMSs), the "de facto" standard storage solution, have not been presented as the best tools for this kind of data. However, Big Data has been pushing the development of modern database systems that might be able to overcome RDBMSs deficiencies. In this context, we extended our previous works on the evaluation of relative performance among NoSQLs engines from different families, adapting the schema design in order to achieve better performance based on its conclusions, thus being able to store more SNP markers for each individual. Using Yahoo! Cloud Serving Benchmark (YCSB) benchmark framework, we assessed each database system over hypothetical SNP sequences. Results indicate that although Tarantool has the best overall throughput, MongoDB is less impacted by the increase of SNP markers per individual. 650 $aBioinformatics 650 $aGenotype 653 $aData Science 653 $aDatabase 653 $aNoSQL 653 $aSNP 700 1 $aSCHETTINO, V. J. 700 1 $aBARBOSA, T. J. R. 700 1 $aFREITAS, P. F. 700 1 $aGUIMARÃES, P. G. S. 700 1 $aARBEX, W. A. 773 $tRevista de Informática Teórica e Aplicada$gv. 25, n. 2, p. 93-100, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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