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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Clima Temperado. Para informações adicionais entre em contato com cpact.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Clima Temperado. |
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Data corrente: |
11/03/2021 |
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Data da última atualização: |
11/03/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GARCIA, N.; DA-SILVA, C. J.; COCCO, K. L. T.; POMAGUALLI, D.; OLIVEIRA, F. K. DE; SILVA, J. V. L. DA; OLIVEIRA, A. C. B. de; AMARANTE, L. DO. |
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Afiliação: |
NATÁLIA GARCIA, UFPEL; CRISTIANE JOVELINA DA-SILVA, UFPEL; KASSIA LUIZA TEIXEIRA COCCO, UFPEL; DARWIN POMAGUALLI, UFPEL; FABIANE KLETKE DE OLIVEIRA, UFPEL; JOÃO VICTOR LEMOS DA SILVA, UFPEL; ANA CLAUDIA BARNECHE DE OLIVEIRA, CPACT; LUCIANO DO AMARANTE, UFPEL. |
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Título: |
Waterlogging tolerance of five soybean genotypes through different physiological and biochemical mechanisms. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Environmental and Experimental Botany, v. 172, 103975, 2020. |
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Páginas: |
8 p. |
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ISSN: |
0098-8472 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Waterlogging is a serious environmental threat that limits crop growth and yield in low-lying, rainfed areas many regions across the globe. Here we investigated the effects of waterlogging and subsequent re-oxygenation on the physiology and biochemistry of three soybean [Glycine max (L.) Merrill] genotypes (PELBR10-6000, PELBR11-6028, and PELBR11-6042) and two cultivars (TEC IRGA 6070 and BMX Potência). Plants were grown under greenhouse conditions until the V4 stage when they were subjected to waterlogging for seven days. The water was then drained and plants were allowed to recover for another seven days. Overall, all genotypes suppressed waterlogging stress with distinct mechanisms. Waterlogged PELBR10-6000 surpassed control plant levels of CO2 assimilation rate and readily responded to the energy lack induced by hypoxia by activating the fermentative enzymes and alanine aminotransferase. Similar mechanisms were observed in BMX Potência, which restored metabolism to control levels at the end of the recovery. PELBR11-6028 and PELBR11-6042 activated the antioxidant defenses, and TEC IRGA 6070 did not delay flowering. |
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Thesagro: |
Água; Glycine Max; Manejo de Água; Stress. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Registro original: |
Embrapa Clima Temperado (CPACT) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
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Data corrente: |
08/05/2017 |
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Data da última atualização: |
06/05/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
FAJARDO, T. V. M.; VANNI, M. F.; NICKEL, O. |
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Afiliação: |
THOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV; MARCOS FERNANDO VANNI, CNPUV; OSMAR NICKEL, CNPUV. |
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Título: |
Absolute quantification of viruses by TaqMan real-time RT-PCR in grapevines. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Ciência Rural, Santa Maria, v. 47, n. 6, e20161063, 2017. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The absolute quantification determines the absolute amount of a targeted nucleic acid expressed as a copy number or concentration. The knowledge of virus concentrations in commercial crops possesses high relevance to ensure a reliable diagnosis. The objective of this study was to perform an absolute quantification of five viruses in infected grapevines (Vitis spp.). Different known amounts of the standard sample (cloned viral cDNA or in vitro transcribed viral RNA) were quantified by TaqMan RT-qPCR. Based on these data, standard curves were generated plotting Ct values (threshold cycle) against the log of the standard sample amount. Infected grapevine samples were evaluated to determine virus titers, which were highly variable. This result may contribute to improve virus diagnosis by accurately quantifying virus titre variations in grapevines. Key words: RT-qPCR, GRSPaV, GVA, GVD, GLRaV-3 and -4. RESUMO: A quantificação absoluta determina a quantidade absoluta de um ácido nucleico alvo expressa como número de cópias ou concentração. O conhecimento das concentrações virais em culturas comerciais tem grande relevância para assegurar um diagnóstico confiável. O objetivo deste trabalho foi realizar uma quantificação absoluta de cinco vírus em videiras infectadas (Vitis spp.). Diferentes quantidades conhecidas da amostra padrão (cDNA viral clonado ou RNA viral transcrito in vitro) foram quantificadas por RT-qPCR TaqMan. A partir destes dados, curvas padrão foram geradas plotando-se os valores de Ct (ciclo limiar) contra o log da quantidade da amostra padrão. Amostras de videiras infectadas foram avaliadas visando-se determinar os títulos virais que foram bastante variáveis. Este resultado contribui para melhorar o diagnóstico viral ao quantificar com precisão variações no título viral em videiras. Palavras-chave: RT-qPCR, GRSPaV, GVA, GVD, GLRaV-3 e -4. A quantificação absoluta determina a quantidade absoluta de um ácido nucleico alvo expressa como número de cópias ou concentração. O conhecimento das concentrações virais em culturas comerciais tem grande relevância para assegurar um diagnóstico confiável. O objetivo deste trabalho foi realizar uma quantificação absoluta de cinco vírus em videiras infectadas (Vitis spp.). Diferentes quantidades conhecidas da amostra padrão (cDNA viral clonado ou RNA viral transcrito in vitro) foram quantificadas por RT-qPCR TaqMan. A partir destes dados, curvas padrão foram geradas plotando-se os valores de Ct (ciclo limiar) contra o log da quantidade da amostra padrão. Amostras de videiras infectadas foram avaliadas visando-se determinar os títulos virais que foram bastante variáveis. Este resultado contribui para melhorar o diagnóstico viral ao quantificar com precisão variações no título viral em videiras. Palavras-chave: RT-qPCR, GRSPaV, GVA, GVD, GLRaV-3 e -4. MenosThe absolute quantification determines the absolute amount of a targeted nucleic acid expressed as a copy number or concentration. The knowledge of virus concentrations in commercial crops possesses high relevance to ensure a reliable diagnosis. The objective of this study was to perform an absolute quantification of five viruses in infected grapevines (Vitis spp.). Different known amounts of the standard sample (cloned viral cDNA or in vitro transcribed viral RNA) were quantified by TaqMan RT-qPCR. Based on these data, standard curves were generated plotting Ct values (threshold cycle) against the log of the standard sample amount. Infected grapevine samples were evaluated to determine virus titers, which were highly variable. This result may contribute to improve virus diagnosis by accurately quantifying virus titre variations in grapevines. Key words: RT-qPCR, GRSPaV, GVA, GVD, GLRaV-3 and -4. RESUMO: A quantificação absoluta determina a quantidade absoluta de um ácido nucleico alvo expressa como número de cópias ou concentração. O conhecimento das concentrações virais em culturas comerciais tem grande relevância para assegurar um diagnóstico confiável. O objetivo deste trabalho foi realizar uma quantificação absoluta de cinco vírus em videiras infectadas (Vitis spp.). Diferentes quantidades conhecidas da amostra padrão (cDNA viral clonado ou RNA viral transcrito in vitro) foram quantificadas por RT-qPCR TaqMan. A partir destes dados, curvas padrão foram geradas plotando-... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
GLRaV-3; GRSPaV; GVA; GVD; RT-qPCR; Videira. |
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Thesagro: |
Uva; Virus. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/159589/1/CR-Absolute-quatification-virus-RT-qPCR-2017.pdf
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Marc: |
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520 $aThe absolute quantification determines the absolute amount of a targeted nucleic acid expressed as a copy number or concentration. The knowledge of virus concentrations in commercial crops possesses high relevance to ensure a reliable diagnosis. The objective of this study was to perform an absolute quantification of five viruses in infected grapevines (Vitis spp.). Different known amounts of the standard sample (cloned viral cDNA or in vitro transcribed viral RNA) were quantified by TaqMan RT-qPCR. Based on these data, standard curves were generated plotting Ct values (threshold cycle) against the log of the standard sample amount. Infected grapevine samples were evaluated to determine virus titers, which were highly variable. This result may contribute to improve virus diagnosis by accurately quantifying virus titre variations in grapevines. Key words: RT-qPCR, GRSPaV, GVA, GVD, GLRaV-3 and -4. RESUMO: A quantificação absoluta determina a quantidade absoluta de um ácido nucleico alvo expressa como número de cópias ou concentração. O conhecimento das concentrações virais em culturas comerciais tem grande relevância para assegurar um diagnóstico confiável. O objetivo deste trabalho foi realizar uma quantificação absoluta de cinco vírus em videiras infectadas (Vitis spp.). Diferentes quantidades conhecidas da amostra padrão (cDNA viral clonado ou RNA viral transcrito in vitro) foram quantificadas por RT-qPCR TaqMan. A partir destes dados, curvas padrão foram geradas plotando-se os valores de Ct (ciclo limiar) contra o log da quantidade da amostra padrão. Amostras de videiras infectadas foram avaliadas visando-se determinar os títulos virais que foram bastante variáveis. Este resultado contribui para melhorar o diagnóstico viral ao quantificar com precisão variações no título viral em videiras. Palavras-chave: RT-qPCR, GRSPaV, GVA, GVD, GLRaV-3 e -4. A quantificação absoluta determina a quantidade absoluta de um ácido nucleico alvo expressa como número de cópias ou concentração. O conhecimento das concentrações virais em culturas comerciais tem grande relevância para assegurar um diagnóstico confiável. O objetivo deste trabalho foi realizar uma quantificação absoluta de cinco vírus em videiras infectadas (Vitis spp.). Diferentes quantidades conhecidas da amostra padrão (cDNA viral clonado ou RNA viral transcrito in vitro) foram quantificadas por RT-qPCR TaqMan. A partir destes dados, curvas padrão foram geradas plotando-se os valores de Ct (ciclo limiar) contra o log da quantidade da amostra padrão. Amostras de videiras infectadas foram avaliadas visando-se determinar os títulos virais que foram bastante variáveis. Este resultado contribui para melhorar o diagnóstico viral ao quantificar com precisão variações no título viral em videiras. Palavras-chave: RT-qPCR, GRSPaV, GVA, GVD, GLRaV-3 e -4.
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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