BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoURBINATI, I. Assinaturas de seleção em bovinos da raça Canchim. 2014. 65 p. Dissertação (Mestrado) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Universidade Estadual Paulista, Jaboticabal. Orientador: Danísio Prado Munari, Coorientadores: Roberto Hiroshi Higa e Marcos Eli Buzanskas.

Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.

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2.Imagem marcado/desmarcadoURBINATI, I.; HIGA, R. H.; MOKRY, F. B. Amostragem de indivíduos representativos em uma população de animais da raça Canchim aparentados e genotipados. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 7., 2011, Campinas. Resumos... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. p. 13-15.

Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.

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3.Imagem marcado/desmarcadoURBINATI, I.; MOKRY, F. B.; MUNARI, D. P.; HIGA, R. H. Análises preliminares de controle de qualidade em um banco de dados de SNP genotipados em alta densidade para futuros estudos de assinaturas de seleção em bovinos da raça Canchim. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 9., 2013, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 86-89.

Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária.

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4.Imagem marcado/desmarcadoCHUD, T. C. S.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL. F. S.; URBINATI, I.; CARVALHEIRO, R.; REGITANO, L. C. de A.; MARCONDES, C. R.; MINARI, D. P. Accuracy of genotype imputation in Canchim cattle using FImpute and Beagle software., In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Abstract... Guarujá:[ s.n.], 2013. AB.20.

Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.

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5.Imagem marcado/desmarcadoMOKRY, F. B.; LIMA, A. O. de; URBINATI, I.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; HIGA, R. H.; REGITANO, L. C. de A. Associação de SNPs com características de carcaça em uma população da raça Canchim. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012. SBMA 2012.

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Informática Agropecuária; Embrapa Pecuária Sudeste.

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6.Imagem marcado/desmarcadoNASCIMENTO, G. B.; SAVEGNAGO, R. P.; URBINATI, I.; BERNARDES, P. A.; FERRAUDO, A. S.; SCHMIDT, G. S.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. The use of artificial neural networks to explore the relationship between breeding values of egg production with other phenotypic measurements in hens of a white leghorn population. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 58., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... Foz do Iguaçú: SBG, 2012. p. 38.

Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.

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7.Imagem marcado/desmarcadoBUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. A.; VENTURA, R. V.; CHUD, T. C. S.; URBINATI, I.; MEIRELLES, S. L. C.; MOKRY, F. B.; SCHENKEL, F. S.; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P. Genome-wide association study on long-yearling scrotal circumference in Canchim cattle. In:WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings...Vancouver: WCGALP: Amarican Society of Animal Science, 2014.

Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.

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8.Imagem marcado/desmarcadoURBINATI, I.; STAFUZZA, N. B.; OLIVEIRA, M. T.; CHUD, T. C. S.; HIGA, R. H.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; BUZANSKAS, M. E.; MUNARI, D. P. Selection signatures in Canchim beef cattle Journal of Animal Science and Biotechnology, v. 7, p. 1-9, 2016. Na publicação: Luciana Correia de Almeida Regitano.

Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária; Embrapa Pecuária Sudeste.

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9.Imagem marcado/desmarcadoMOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; LIMA, A. O. de; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. G. B.; CARDOSO, F. F.; NICIURA, S. C. M.; OLIVEIRA, M. M. de; URBINATI, I.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide association study for backfat thickness in Canchim beef cattle using Random Forest approach. BMC Genetics, London, v. 14, n. 47, 2013.

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.

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10.Imagem marcado/desmarcadoMOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; LIMA, A. O. de; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. G. B. da; CARDOSO, F. F.; OLIVEIRA, M. M. de; URBINATI, I.; NICIURA, S. C. M.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide association study for backfat thickness in Canchim beef cattle using Random Forest approach. BMC Genetics, London v. 14, n. 47, 2013. 11 p.

Biblioteca(s): Embrapa Informática Agropecuária; Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul.

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Registro Completo

Biblioteca(s):  Embrapa Informática Agropecuária; Embrapa Pecuária Sudeste.
Data corrente:  17/06/2016
Data da última atualização:  20/03/2017
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Circulação/Nível:  B - 3
Autoria:  URBINATI, I.; STAFUZZA, N. B.; OLIVEIRA, M. T.; CHUD, T. C. S.; HIGA, R. H.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; BUZANSKAS, M. E.; MUNARI, D. P.
Afiliação:  ISMAEL URBINATI, Unesp Jaboticabal; NEDENIA BONVINO STAFUZZA, Unesp Jaboticabal; MARCOS TÚLIO OLIVEIRA, Unesp Jaboticabal; TATIANE CRISTINA SELEGUIM CHUD, Unesp Jaboticabal; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; MARCOS ELI BUZANSKAS, Unesp Jaboticabal; DANÍSIO PRADO MUNARI, Unesp Jaboticabal.
Título:  Selection signatures in Canchim beef cattle
Ano de publicação:  2016
Fonte/Imprenta:  Journal of Animal Science and Biotechnology, v. 7, p. 1-9, 2016.
DOI:  10.1186/s40104-016-0089-5
Idioma:  Inglês
Notas:  Na publicação: Luciana Correia de Almeida Regitano.
Conteúdo:  Background: Recent technological advances in genomics have allowed the genotyping of cattle through single nucleotide polymorphism (SNP) panels. High-density SNP panels possess greater genome coverage and are useful for the identification of conserved regions of the genome due to selection, known as selection signatures (SS). The SS are detectable by different methods, such as the extended haplotype homozygosity (EHH); and the integrated haplotype score (iHS), which is derived from the EHH. The aim of this study was to identify SS regions in Canchim cattle (composite breed), genotyped with high-density SNP panel. Results: A total of 687,655 SNP markers and 396 samples remained for SS analysis after the genotype quality control. The iHS statistic for each marker was transformed into piHS for better interpretation of the results. Chromosomes BTA5 and BTA14 showed piHS>5, with 39 and nine statistically significant SNPs (P<0.00001), respectively. For the candidate selection regions, iHS values were computed across the genome and averaged within non-overlapping windows of 500 Kb. We have identified genes that play an important role in metabolism, melanin biosynthesis (pigmentation), and embryonic and bone development. Conclusions: The observation of SS indicates that the selection processes performed in Canchim, as well as in the founder breeds (i.e. Charolais), are maintaining specific genomic regions, particularly on BTA5 and BTA14. These selection signatures regions could be a... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Extended haplotype homozygosity; Genômica; Polimorfismo de nucleotídeo único; SNP.
Thesagro:  Cruzamento; Cruzamento Animal; Gado de corte; Genótipo.
Thesaurus NAL:  Beef cattle; Composite breeds; Genomics; Quantitative trait loci; Single nucleotide polymorphism.
Categoria do assunto:  G Melhoramento Genético
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL:  http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/153785/1/AP-Selection-Urbinati.pdf
http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/144539/1/Urbinati-JASB-2016.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Informática Agropecuária (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPTIA19098 - 1UPCAP - DD
CPPSE23539 - 1UPCAP - DDPROCI-2016.00005URB2016.00005
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