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| Registros recuperados : 8.623 | |
| 1. |  | COSTA, N. P.; KRZYZANOWSKI, F. C.; HENNING, A. A.; PEREIRA, J. E. Afericao do metodo alternativo do teste de tetrazolio para avaliacao da qualidade de sementes de diversos genotipos de soja. Informativo ABRATES, Curitiba, v.9, n.1/2, p.78, jul./ago. 1999. Numero Especial, ref. 096. Resumo apresentado no XI Congresso Brasileiro de Sementes.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 2. | | GEOVO, J. D. C.; TORRES, J. A.; GIROTO, A. S.; ROCHA, F. C. N.; GARCIA, M. M.; SILVA, G. T. S. T.; SOUZA, J. R. C.; OLIVEIRA, J. A. de; RIBEIRO, C.; NOGUEIRA, A. E. Evaluation of the activity and selectivity of mesoporous composites of MCM-41 and CuO in the CO2 photoreduction process. Journal of Photochemistry & Photobiology, A: Chemistry, v. 439, 114631, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 3. | | ALBRECHT, J. C.; ANDRADE, J. M. V. de; SOUSA, C. N. A. de; FRONZA, V.; BRAZ, A. J. B. P.; YAMANAKA, C. H.; VANDERLEI, J. C. Trigo Embrapa 41: nova cultivar para os triticultores de Minas Gerais, Goiás e Distrito Federal. Planaltina, DF: EMBRAPA-CPAC, 1997. 15 p. (EMBRAPA-CPAC. Documentos, 67).| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Cerrados; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Soja; Embrapa Trigo; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 4. | | ALBRECHT, J. C.; ANDRADE, J. M. V. de; SOUSA, C. N. A. de; FRONZA, V.; BRAZ, A. J. B. P.; YAMANAKA, C. H.; VANDERLEI, J. C. Embrapa 41 - nova cultivar de trigo para Minas Gerais, Goias e Distrito Federal. In: REUNIAO NACIONAL DE PESQUISA DE TRIGO, 18., 1999, Passo Fundo, RS. Anais. Passo Fundo: Embrapa Trigo, 1999. v.1. p.292-298.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 5. | | LIMA, F. A. M.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; SIMPLICIO, A. A.; PONCE DE LEON, F. A. Traditional system of goat management. I. Pre-weaning growth performance of the SRD (NON-DESCRIPT) goats. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 18, n. 5, p. 557-563, maio, 1983.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 7. | | ZANINE, A. M.; DIAS, P. F.; PINTO, L. F. B.; SOUTO, S. M.; FERREIRA, D. J.; ALMEIDA, J. C. Efeito de diferentes doses de chorume bovino no pH e composição mineral de um planossolo cultivado com gramíneas dos gêneros Cynodon e Digitaria. Pasturas Tropicales, Cali, v. 26, n. 2, p. 37-41, 2003.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 8. | | ALVES, G. C.; MACEDO, A. V. de M.; REIS JUNIOR, F. B. dos; URQUIAGA, S.; REIS, V. M. Plant growth promotion by four species of the genus Burkhoderia. Plant and Soil, Dordrecht, v. 399, n. 1-2, p. 373-387, February 2016. Título: Burkhoderia [i. e. Burkholderia].| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 9. | | ALVES, G. C.; MACEDO, A. V. de M.; REIS JUNIOR, F. B. dos; URQUIAGA, S.; REIS, V. M. Plant growth promotion by four species of the genus Burkhoderia. Plant and Soil, Dordrecht, v. 399, n. 1-2, p. 373-387, February 2016. Título: (Burkhoderia [i. e. Burkholderia].| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 10. | | PEIXOTO, R. M.; ANDRIOLI, A.; PINHEIRO, R. R.; SOUZA, K. C. de; ARAÚJO, J. F.; SOUSA, A. L. M. de; LOPES, A. K. C.; SOUZA, S. C. R. Immune response dynamics of recent and chronic small ruminant lentivirus infection in the male reproductive system. Semina: Ciências Agrárias, v. 44, n. 1, p. 185-202, jan./fev. 2023. Título em português: Dinâmica da resposta imunológica da infecção recente e crônica por lentivírus de pequenos ruminantes no sistema reprodutor de machos.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 11. | | FERNANDES, A. C.; SILVA, V. H. da; GOES, C. P.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C.; REZENDE, F. M. de; COUTINHO, L. L. Genome-wide detection of CNVs and their association with performance traits in broilers. BMC Genomics, v. 22, n. 354, 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 13. | | LARACH, J. O. I. (coord.). Aptidão agrícola das terras do Estado de Mato Grosso. Rio de Janeiro: EMBRAPA-SNLCS, 1989. 42 p. (EMBRAPA-SNLCS. Boletim de pesquisa, 41). Acompanha 1 mapa, escala 1:1.300.000 e 3 mapas, escala 1:2.600.000. Autores: Jorge Olmos Iturri Larach, Chyoso Hirano, Cesar da Silva Chagas, Fernando Cezar Saraiva do Amaral, Nilson Rendeiro Pereira, Waldir de Carvalho Junior.| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 15. | | SANTOS, M. do C. S. dos; TABOSA, J. N.; DIAS, F. M.; FREITAS, E. V. de; LIRA, M. de A. Comportamento de clones de capim-elefante e de híbridos de capim-elefante x milheto no semi-árido do nordeste do Brasil. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 29, n. 10, p. 1609-1615. out. 1994. Título em inglês: Performance of elephant grass and elephant grass x pearl millet hybrids in the Semi-arid Region of Northeast Brazil.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 18. | | FERNANDES, F. D.; CARVALHO, M. A.; RAMOS, A. K. B.; BRAGA, G. J.; FONSECA, C. E. L. da; LEDO, F. J. da S.; MACHADO, J. C. Biomassa de genótipos de Capim-Elefante para produção de energia. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2020. 17 p. (Embrapa Cerrados. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 358).| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Gado de Leite. |
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| Registros recuperados : 8.623 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
03/08/2021 |
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Data da última atualização: |
03/08/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
FERNANDES, A. C.; SILVA, V. H. da; GOES, C. P.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C.; REZENDE, F. M. de; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
ANNA CAROLINA FERNANDES, ESALQ; VINICIUS HENRIQUE DA SILVA, ESALQ; CAROLINA PURCELL GOES, ESALQ; GABRIEL COSTA MONTEIRO MOREIRA, University of Liège; THAIS FERNANDA GODOY, ESALQ; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA; FERNANDA MARCONDES REZENDE, University of Florida; LUIZ LEHMANN COUTINHO, ESALQ. |
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Título: |
Genome-wide detection of CNVs and their association with performance traits in broilers. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 22, n. 354, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1186/s12864-021-07676-1 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract Background: Copy number variations (CNVs) are a major type of structural genomic variants that underlie genetic architecture and phenotypic variation of complex traits, not only in humans, but also in livestock animals. We identified CNVs along the chicken genome and analyzed their association with performance traits. Genome-wide CNVs were inferred from Affymetrix® high density SNP-chip data for a broiler population. CNVs were concatenated into segments and association analyses were performed with linear mixed models considering a genomic relationship matrix, for birth weight, body weight at 21, 35, 41 and 42 days, feed intake from 35 to 41 days, feed conversion ratio from 35 to 41 days and, body weight gain from 35 to 41 days of age. Results: We identified 23,214 autosomal CNVs, merged into 5042 distinct CNV regions (CNVRs), covering 12.84% of the chicken autosomal genome. One significant CNV segment was associated with BWG on GGA3 (q-value = 0.00443); one significant CNV segment was associated with BW35 (q-value = 0.00571), BW41 (q-value = 0.00180) and BW42 (q-value = 0.00130) on GGA3, and one significant CNV segment was associated with BW on GGA5 (q-value = 0.00432). All significant CNV segments were verified by qPCR, and a validation rate of 92.59% was observed. These CNV segments are located nearby genes, such as KCNJ11, MyoD1 and SOX6, known to underlie growth and development. Moreover, gene-set analyses revealed terms linked with muscle physiology, cellular processes regulation and potassium channels. Conclusions: Overall, this CNV-based GWAS study unravels potential candidate genes that may regulate performance traits in chickens. Our findings provide a foundation for future functional studies on the role of specific genes in regulating performance in chickens. Keywords: GWAS, Performance, CNVs, QTLs, qPCR MenosAbstract Background: Copy number variations (CNVs) are a major type of structural genomic variants that underlie genetic architecture and phenotypic variation of complex traits, not only in humans, but also in livestock animals. We identified CNVs along the chicken genome and analyzed their association with performance traits. Genome-wide CNVs were inferred from Affymetrix® high density SNP-chip data for a broiler population. CNVs were concatenated into segments and association analyses were performed with linear mixed models considering a genomic relationship matrix, for birth weight, body weight at 21, 35, 41 and 42 days, feed intake from 35 to 41 days, feed conversion ratio from 35 to 41 days and, body weight gain from 35 to 41 days of age. Results: We identified 23,214 autosomal CNVs, merged into 5042 distinct CNV regions (CNVRs), covering 12.84% of the chicken autosomal genome. One significant CNV segment was associated with BWG on GGA3 (q-value = 0.00443); one significant CNV segment was associated with BW35 (q-value = 0.00571), BW41 (q-value = 0.00180) and BW42 (q-value = 0.00130) on GGA3, and one significant CNV segment was associated with BW on GGA5 (q-value = 0.00432). All significant CNV segments were verified by qPCR, and a validation rate of 92.59% was observed. These CNV segments are located nearby genes, such as KCNJ11, MyoD1 ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
CNVs; Copy number variations; Desempenho zootécnico; GWAS; QPCR; QTLs. |
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Thesagro: |
Gallus Domesticus; Genética Animal; Performance. |
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Thesaurus NAL: |
Animal genetics; Animal performance; Gallus gallus; Genome-wide association study; Quantitative polymerase chain reaction; Quantitative trait loci. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/224781/1/final9547.pdf
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Marc: |
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001 2133197
005 2021-08-03
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520 $aAbstract Background: Copy number variations (CNVs) are a major type of structural genomic variants that underlie genetic architecture and phenotypic variation of complex traits, not only in humans, but also in livestock animals. We identified CNVs along the chicken genome and analyzed their association with performance traits. Genome-wide CNVs were inferred from Affymetrix® high density SNP-chip data for a broiler population. CNVs were concatenated into segments and association analyses were performed with linear mixed models considering a genomic relationship matrix, for birth weight, body weight at 21, 35, 41 and 42 days, feed intake from 35 to 41 days, feed conversion ratio from 35 to 41 days and, body weight gain from 35 to 41 days of age. Results: We identified 23,214 autosomal CNVs, merged into 5042 distinct CNV regions (CNVRs), covering 12.84% of the chicken autosomal genome. One significant CNV segment was associated with BWG on GGA3 (q-value = 0.00443); one significant CNV segment was associated with BW35 (q-value = 0.00571), BW41 (q-value = 0.00180) and BW42 (q-value = 0.00130) on GGA3, and one significant CNV segment was associated with BW on GGA5 (q-value = 0.00432). All significant CNV segments were verified by qPCR, and a validation rate of 92.59% was observed. These CNV segments are located nearby genes, such as KCNJ11, MyoD1 and SOX6, known to underlie growth and development. Moreover, gene-set analyses revealed terms linked with muscle physiology, cellular processes regulation and potassium channels. Conclusions: Overall, this CNV-based GWAS study unravels potential candidate genes that may regulate performance traits in chickens. Our findings provide a foundation for future functional studies on the role of specific genes in regulating performance in chickens. Keywords: GWAS, Performance, CNVs, QTLs, qPCR
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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| Registros recuperados : 909 | |
| 1. | | 2650645, INTERNATIONAL JOURNAL OF PEST MANAGEMENT, London-Inglaterra
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados; Embrapa Florestas; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Semiárido; Embrapa Soja. MenosCatálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados; Embrapa Florestas; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Semiárido... Mostrar Todas | |
| 2. | | 5150104, JOURNAL OF AGRICULTURAL ECONOMICS RESEARCH, USDA-Economic Research Service, Washington-DC
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Pantanal; Embrapa Semiárido; Embrapa Soja. | |
| 3. | | 5151317, RICE BIOTECHNOLOGY QUARTERLY, Rockfeller Foundation, West Lafayette-IN
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Trigo. | |
| 4. | | 0901462, CORTE, Sindicato Nacional dos Pecuaristas de Gado de Corte, Sao Paulo-SP
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Pantanal; Embrapa Semiárido. | |
| 5. | | 1100096, INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOMETEOROLOGY, International Society of Biometeorology, Ottawa-Canada
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Pantanal. | |
| 6. | | 0904647, BOLETIM DE PESQUISA FLORESTAL, Embrapa Florestas, Clombo, PR.
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Florestas; Embrapa Pantanal. | |
| 7. | | 1100008, AGRICULTURE (MONTREAL), Corporation des Agronomes de la Province de Quebec, Montreal, Canada, CA
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Cerrados; Embrapa Semiárido. | |
| 8. | | 0900788, ATUALIDADES AGROVETERINARIAS, Chacaras e Quintais, Sao Paulo, SP
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Acre; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Cerrados; Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Pantanal; Embrapa Semiárido. | |
| 9. | | 5150700, ANNUAL REVIEW OF PLANT PHYSIOLOGY AND PLANT MOLECULAR BIOLOGY, Annual Reviews Inc., Palo Alto, Calif., US
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Agrobiologia; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Florestas; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Hortaliças; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Pantanal; Embrapa Semiárido; Embrapa Soja; Embrapa Trigo; Embrapa Uva e Vinho. MenosCatálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Agrobiologia; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Florestas; Embrapa Gado de Leite... Mostrar Todas | |
| 10. | | 0901305, BRAZILIAN ARCHIVES OF BIOLOGY AND TECHNOLOGY, Instituto de Tecnologia do Parana - TECPAR, Curitiba-PR
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Acre; Embrapa Florestas; Embrapa Instrumentação; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Semiárido; Embrapa Soja; Embrapa Suínos e Aves. |  |
| 11. | | 2600094, ICID BULLETIN, International Commission on Irrigation and Drainage, New Delhi-India
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Cerrados; Embrapa Hortaliças; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Semiárido. | |
| 12. | | 5150293, TEXAS VETERINARY MEDICAL JOURNAL, Texas Veterinary Medical Association, Austin-TX
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Suínos e Aves. | |
| 13. | | 0900712, ANUARIO ESTATISTICO DE PERNAMBUCO, Instituto de Desenvolvimento de Pernambuco, Recife, PE
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Semiárido. | |
| 14. | | 5151333, JOURNAL OF EUKARYOTIC MICROBIOLOGY, Society of Protozoologists, Lawrende-KS
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pantanal; Embrapa Suínos e Aves. | |
| 16. | | 0600643, TASMANIAN JOURNAL OF AGRICULTURE, Department of Agriculture, Hobart-Australia
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Cerrados. | |
| 17. | | 0904317, REVISTA DO PRODUTOR, Embrapa Pecuária Sul, Bagé - RS
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Acre; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Uva e Vinho. | |
| 18. | | 0904664, REVISTA DO PRODUTOR RURAL DO PARANÁ, Sindicato Rural de Guarapuava, PR., Guarapuava, PR.
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Acre; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Uva e Vinho. | |
| 20. | | 5150105, ANIMAL NUTRITION AND HEALTH, San Francisco-CA
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Suínos e Aves. | |
| Registros recuperados : 909 | |
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