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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
10/03/2008 |
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Data da última atualização: |
14/09/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DINIZ, F. M.; IYENGAR, A.; LIMA, P. S. da C.; MACLEAN, N.; BENTZEN, P. |
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Afiliação: |
FABIO MENDONCA DINIZ, CPAMN; ARATI IYENGAR; PAULO SARMANHO DA COSTA LIMA, CPAMN; NORMAN MACLEAN; PAUL BENTZEN. |
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Título: |
Application of a double-enrichment procedure for microsatellite isolation and the use tailed primers for high throughput genotyping. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, São Paulo, v. 30, n. 2, p. 380-384, mar. 2007. |
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ISSN: |
1415-4757 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The number of microsatellite loci and their allelic diversity contribute to increase accuracy and informativity of genetic estimates, however, the isolation of microsatellite loci is not only laborious but also quite expensive. We used (GATA)n and (GACA)n tetranucleotide probes and single- and double-enrichment hybridization to construct and screen a genomic library with an increased proportion of DNA fragments containing repeat motifs. Repeats were found using both types of hybridization but the double-enrichment procedure recovered sequences of which 100% contained (GATA)n and (GACA)n motifs. Microsatellite loci primers were then designed with an M13R-tail or CAG-tag to produce scorable PCR products with minimal stutter. The approach used in this study suggests that double-enrichment is a worthwhile strategy when isolating repeat motifs from eukaryotic genomes. Moreover, the use of tailed microsatellite primers provides increased resolution for compound microsatellite loci, with a significant decrease in costs. |
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Palavras-Chave: |
Banda polimórfica; double-enrichment; double-hybridization; Enriquecimento duplo; Hibridação dupla; Microssatélite; stutter bands; tailed microsatellite primer. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/65872/1/Application-21449.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 13 | |
| 1. |  | GHINI, R.; HAMADA, E.; GONÇALVES, R. R. V.; GASPAROTTO, L.; PEREIRA, J. C. R. Risk analysis of climate change on black sigatoka in banana in Brazil. In: Journal of Plant Pathology, Pisa, v.90, n.2, supl., p.S2.105, Aug. 2008. ICPP 2008 - 9. International Congress of Plant Pathology, 2008, Torino. Abstracts of invited and offered papers.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Meio Ambiente. |
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| 2. | | AGUILA, J. S. D.; COPATTI, A. S.; ROSSAROLLA, M. D.; TOMAZETTI, T. C.; MONTEIRO, A. de M.; AGUILA, L. S. H. D. Ácido salicílico e armazenamento refrigerado em laranjas 'salustiana'. In: CONGRESO IBEROAMERICANO DE TECNOLOGÍA POSTCOSECHA Y AGROEXPORTACIONES, 7., 2012, La plata - Argentina. Resumenes... AITEP, La Plata - Argentina, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 7. | | ARRIEL, N. H. C.; FIRMINO, P. de T.; BELTRÃO, N. E. de M.; SOARES, J. J.; ARAÚJO, A. E. de; SILVA, A. C.; FERREIRA, G. B. A cultura do gergelim. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica; Campina Grande: Embrapa Algodão, 2007. 72 p. il. (Coleção Plantar, 50).| Tipo: Autoria/Organização/Edição de Livros |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 8. | | OLIVEIRA, M. C. de S.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; SILVA, A. M.; NÉO, T. A.; OLIVEIRA, H. N. de. Detecção molecular de Babesia bigemina em bovinos e em fêmeas de Boophilus microplus provenientes de área endêmica do Estado de São Paulo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VETERINÁRIA, 32., 2005, Uberlândia. Resumos... Uberlândia: UFU, 2005. Disponível em: http:/19_10_m/a6/00019.htm . Acesso em: 21 de dezembro de 2005.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 9. | | ROCHA, W. S. D.; MARTINS, C. E.; SOUZA SOBRINHO, F.; SANTOS, A. M. B.; ALENCAR, C. A. B.; DERESZ, F.; MIGUEL, P. S. B.; ARAÚJO, J. P. M.; OLIVEIRA, A. V.; SOUZA, R. C. V. Produtividade de silagem e índice de área foliar de sorgo consorciado com Brachiaria decumbens e Solteiro em diferentes lâminas de irrigação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MILHO E SORGO. 27. 2008, Resumos. Londrina. ABMS, 2008. p. 450| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 10. | | ROLLA, C. M. de P. Qualidade total: e tempo de mudar. Londrina: EMBRAPA-CNPSo, 1995. 1 fita de vídeo, (19:55 mim), son., color., VHS, NTSC. Produtora: EMATER-Parana - Escritorio Regional de Londrina; Distribuidora: EMATER-Parana.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 12. | | DELABONA, P. da S.; LIMA, D. J.; ROBL, D.; RABELO, S. C.; FARINAS, C. S.; PRADELLA, J. G. da C. Enhanced cellulase production by Trichoderma harzianum by cultivation on glycerol followed by induction on cellulosic substrates. Journal of industrial microbiology & biotechnology, [S. l.], v. 43, n. 5, p. 617-626, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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