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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
26/12/2018 |
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Data da última atualização: |
24/01/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CARVALHO, V. P.; SANT'ANNA, I. C.; NASCIMENTO, M.; NASCIMENTO, A. C. C.; CRUZ, C. D.; ARBEX, W. A.; OLIVEIRA, F. C.; SILVA, F. F. |
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Afiliação: |
V. P. CARVALHO; I. C. SANT'ANNA; M. NASCIMENTO; A. C. C. NASCIMENTO; C. D. CRUZ; WAGNER ANTONIO ARBEX, CNPGL; F. C. OLIVEIRA; F. F. SILVA. |
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Título: |
Support vector machines applied to the genetic classification problem of hybrid populations with high degrees of similarity. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 17, n. 4, gmr18122, 2018. |
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Páginas: |
10 p. |
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DOI: |
10.4238/gmr18122 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
ABSTRACT Selection of appropriate genitors in breeding programs increases gains due to the variability found in the divergent groups; this allows quantification of the existing variability, saving time and resources. There are many methods for quantification and evaluation of diversity in population studies, among which we highlight methods that are based on multivariate statistical analyses, such as linear discriminant analysis (LDA) and cluster analysis. Here we propose and evaluate the use of Support Vector machine (SVM) and Artificial Neural Network (ANN) in an attempt to solve the problem of genetic classification of hybrid populations with high degrees of similarity. The results obtained, in terms of the apparent error rate (APER), were compared with those obtained using ANN analysis and LDA. In general, the lowest APER values were associated with scenarios with low degrees of genetic similarity between populations. Specifically, the best results obtained through SVM (ranging from 14.44 to 67.41%) were observed when the exponential radial base kernel function was used. The APERs obtained by the ANN were even lower than those of the linear discriminant function. |
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Palavras-Chave: |
Computational Intelligence; Multivariate approach. |
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Thesaurus Nal: |
Breeding. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
LEADER 02004naa a2200265 a 4500
001 2102505
005 2023-01-24
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245 $aSupport vector machines applied to the genetic classification problem of hybrid populations with high degrees of similarity.$h[electronic resource]
260 $c2018
300 $a10 p.
520 $aABSTRACT Selection of appropriate genitors in breeding programs increases gains due to the variability found in the divergent groups; this allows quantification of the existing variability, saving time and resources. There are many methods for quantification and evaluation of diversity in population studies, among which we highlight methods that are based on multivariate statistical analyses, such as linear discriminant analysis (LDA) and cluster analysis. Here we propose and evaluate the use of Support Vector machine (SVM) and Artificial Neural Network (ANN) in an attempt to solve the problem of genetic classification of hybrid populations with high degrees of similarity. The results obtained, in terms of the apparent error rate (APER), were compared with those obtained using ANN analysis and LDA. In general, the lowest APER values were associated with scenarios with low degrees of genetic similarity between populations. Specifically, the best results obtained through SVM (ranging from 14.44 to 67.41%) were observed when the exponential radial base kernel function was used. The APERs obtained by the ANN were even lower than those of the linear discriminant function.
650 $aBreeding
653 $aComputational Intelligence
653 $aMultivariate approach
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700 1 $aNASCIMENTO, M.
700 1 $aNASCIMENTO, A. C. C.
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700 1 $aARBEX, W. A.
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700 1 $aSILVA, F. F.
773 $tGenetics and Molecular Research$gv. 17, n. 4, gmr18122, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
22/11/2006 |
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Data da última atualização: |
04/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
SILVA, A. F.; FARIA, C. M. B. de; DUENHAS, L. H.; SANTOS, J. G. dos. |
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Afiliação: |
ALINEAUREA FLORENTINO SILVA, CPATSA; CLEMENTINO MARCOS BATISTA DE FARIA, CPATSA; LUIZA HELENA DUENHAS, CPATSA. |
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Título: |
Avaliação de compostos orgânicos preparados com bagaço de cana, esterco caprino e resíduos de vinícola. |
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Ano de publicação: |
2006 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICIRRIZAS, 11; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9,; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6,. Bonito, 2006. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Série: |
(Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82). |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Este trabalho teve o objetivo de avaliar diferentes compostos orgânicos oriundos de resíduos de uma vinícola no desenvolvimento do milho cultivado em vaso. |
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Palavras-Chave: |
Bagaço de cana; Esterco caprino; Fertbio 2006; Resíduo de vinícola. |
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Thesagro: |
Adubação Verde; Caprino; Composto Orgânico. |
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Thesaurus NAL: |
Goats. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CPATSA/34340/1/OPB1007.pdf
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Marc: |
LEADER 01203nam a2200265 a 4500
001 1157890
005 2024-04-04
008 2006 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aSILVA, A. F.
245 $aAvaliação de compostos orgânicos preparados com bagaço de cana, esterco caprino e resíduos de vinícola.
260 $aIn: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICIRRIZAS, 11; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9,; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6,. Bonito, 2006. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste$c2006
300 $c1 CD-ROM.
490 $a(Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).
520 $aEste trabalho teve o objetivo de avaliar diferentes compostos orgânicos oriundos de resíduos de uma vinícola no desenvolvimento do milho cultivado em vaso.
650 $aGoats
650 $aAdubação Verde
650 $aCaprino
650 $aComposto Orgânico
653 $aBagaço de cana
653 $aEsterco caprino
653 $aFertbio 2006
653 $aResíduo de vinícola
700 1 $aFARIA, C. M. B. de
700 1 $aDUENHAS, L. H.
700 1 $aSANTOS, J. G. dos
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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