| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
|
Data corrente: |
02/07/2021 |
|
Data da última atualização: |
02/07/2021 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
PAZ VENTERO, M.; CUADRAT, R. R. C.; VIDAL, I.; ANDRADE, B. G. N.; MOLINA-PARDINES, C.; HARI-MORENO, J. M.; COUTINHO, F. H.; MERINO, E.; REGITANO, L. C. de A.; SILVEIRA, C. B.; AFLI, H.; LÓPEZ-PÉREZ, M.; RODRÍGUEZ, J. C. |
|
Afiliação: |
MARIA PAZ VENTERO, ISABIAL; RAFAEL R. C. CUADRAT, German Institute of Human Nutrition Potsdam-Rehbrücke; INMACULADA VIDAL, ISABIAL; BRUNO G. N. ANDRADE, Munster Technological University; CARMEN MOLINA-PARDINES, ISABIAL; JOSE M. HARO-MORENO, Universidad Miguel Hernández; FELIPE H. COUTINHO, Universidad Miguel Hernández; ESPERANZA MERINO, ISABIAL; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; CYNTHIA B. SILVEIRA, University of Miami; HAITHEM AFLI, Munster Technological University; MARIO LÓPEZ-PÉREZ, ISABIAL; JUAN CARLOS RODRÍGUEZ, ISABIAL. |
|
Título: |
Nasopharyngeal microbial communities of patients infected with SARS-CoV-2 that developed COVID-19. |
|
Ano de publicação: |
2021 |
|
Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Microbiology, v.12, 637430, mar. 2021 |
|
Páginas: |
10 p. |
|
DOI: |
10.3389/fmicb.2021.637430 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Background: SARS-CoV-2 is an RNA virus causing COVID-19. The clinical characteristics and epidemiology of COVID-19 have been extensively investigated, however, only one study so far focused on the patient?s nasopharynx microbiota. In this study we investigated the nasopharynx microbial community of patients that developed different severity levels of COVID-19. We performed 16S ribosomal DNA sequencing from nasopharyngeal swab samples obtained from SARS-CoV-2 positive (56) and negative (18) patients in the province of Alicante (Spain) in their first visit to the hospital. Positive SARS-CoV-2 patients were observed and later categorized in mild (symptomatic without hospitalization), moderate (hospitalization), and severe (admission to ICU). We compared the microbiota diversity and OTU composition among severity groups and built bacterial co-abundance networks for each group. Results: Statistical analysis indicated differences in the nasopharyngeal microbiome of COVID19 patients. 62 OTUs were found exclusively in SARS-CoV-2 positive patients, mostly classified as members of the phylum Bacteroidota (18) and Firmicutes (25). OTUs classified as Prevotella were found to be significantly more abundant in patients that developed more severe COVID-19. Furthermore, co-abundance analysis indicated a loss of network complexity among samples from patients that later developed more severe symptoms. Conclusion: Our study shows that the nasopharyngeal microbiome of COVID-19 patients showed differences in the composition of specific OTUs and complexity of co-abundance networks. Taxa with differential abundances among groups could serve as biomarkers for COVID-19 severity. Nevertheless, further studies with larger sample sizes should be conducted to validate these results. MenosBackground: SARS-CoV-2 is an RNA virus causing COVID-19. The clinical characteristics and epidemiology of COVID-19 have been extensively investigated, however, only one study so far focused on the patient?s nasopharynx microbiota. In this study we investigated the nasopharynx microbial community of patients that developed different severity levels of COVID-19. We performed 16S ribosomal DNA sequencing from nasopharyngeal swab samples obtained from SARS-CoV-2 positive (56) and negative (18) patients in the province of Alicante (Spain) in their first visit to the hospital. Positive SARS-CoV-2 patients were observed and later categorized in mild (symptomatic without hospitalization), moderate (hospitalization), and severe (admission to ICU). We compared the microbiota diversity and OTU composition among severity groups and built bacterial co-abundance networks for each group. Results: Statistical analysis indicated differences in the nasopharyngeal microbiome of COVID19 patients. 62 OTUs were found exclusively in SARS-CoV-2 positive patients, mostly classified as members of the phylum Bacteroidota (18) and Firmicutes (25). OTUs classified as Prevotella were found to be significantly more abundant in patients that developed more severe COVID-19. Furthermore, co-abundance analysis indicated a loss of network complexity among samples from patients that later developed more severe symptoms. Conclusion: Our study shows that the nasopharyngeal microbiome of COVID-19 patients showed d... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Coronavirus; COVID 19; NGS next generation sequencing; SARS CoV 2. |
|
Thesaurus Nal: |
Microbiome; Prevotella. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/224271/1/NasopharyngealMicrobialCommunities.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02818naa a2200361 a 4500
001 2132766
005 2021-07-02
008 2021 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.3389/fmicb.2021.637430$2DOI
100 1 $aPAZ VENTERO, M.
245 $aNasopharyngeal microbial communities of patients infected with SARS-CoV-2 that developed COVID-19.$h[electronic resource]
260 $c2021
300 $a10 p.
520 $aBackground: SARS-CoV-2 is an RNA virus causing COVID-19. The clinical characteristics and epidemiology of COVID-19 have been extensively investigated, however, only one study so far focused on the patient?s nasopharynx microbiota. In this study we investigated the nasopharynx microbial community of patients that developed different severity levels of COVID-19. We performed 16S ribosomal DNA sequencing from nasopharyngeal swab samples obtained from SARS-CoV-2 positive (56) and negative (18) patients in the province of Alicante (Spain) in their first visit to the hospital. Positive SARS-CoV-2 patients were observed and later categorized in mild (symptomatic without hospitalization), moderate (hospitalization), and severe (admission to ICU). We compared the microbiota diversity and OTU composition among severity groups and built bacterial co-abundance networks for each group. Results: Statistical analysis indicated differences in the nasopharyngeal microbiome of COVID19 patients. 62 OTUs were found exclusively in SARS-CoV-2 positive patients, mostly classified as members of the phylum Bacteroidota (18) and Firmicutes (25). OTUs classified as Prevotella were found to be significantly more abundant in patients that developed more severe COVID-19. Furthermore, co-abundance analysis indicated a loss of network complexity among samples from patients that later developed more severe symptoms. Conclusion: Our study shows that the nasopharyngeal microbiome of COVID-19 patients showed differences in the composition of specific OTUs and complexity of co-abundance networks. Taxa with differential abundances among groups could serve as biomarkers for COVID-19 severity. Nevertheless, further studies with larger sample sizes should be conducted to validate these results.
650 $aMicrobiome
650 $aPrevotella
653 $aCoronavirus
653 $aCOVID 19
653 $aNGS next generation sequencing
653 $aSARS CoV 2
700 1 $aCUADRAT, R. R. C.
700 1 $aVIDAL, I.
700 1 $aANDRADE, B. G. N.
700 1 $aMOLINA-PARDINES, C.
700 1 $aHARI-MORENO, J. M.
700 1 $aCOUTINHO, F. H.
700 1 $aMERINO, E.
700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
700 1 $aSILVEIRA, C. B.
700 1 $aAFLI, H.
700 1 $aLÓPEZ-PÉREZ, M.
700 1 $aRODRÍGUEZ, J. C.
773 $tFrontiers in Microbiology$gv.12, 637430, mar. 2021
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
|
Data corrente: |
11/11/2003 |
|
Data da última atualização: |
01/06/2015 |
|
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
FRANÇA-NETO, J. B.; ZORATO, M. F.; YUYAMA, M. M.; CARVALHO, P. G. B.; NEPOMUCENO, A. L.; KRZYZANOWSKI, F. C.; COSTA, N. P.; NEUMAIER, N. |
|
Afiliação: |
JOSE DE BARROS FRANCA NETO, CNPSO; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, SRI; FRANCISCO CARLOS KRZYZANOWSKI, CNPSO; NILTON PEREIRA DA COSTA, CNPSo; NORMAN NEUMAIER, CNPSO. |
|
Título: |
Caracterização em fitotron de cultivares de soja quanto ao enrugamento de sementes causado por estresses térmico e hídrico. |
|
Ano de publicação: |
1997 |
|
Fonte/Imprenta: |
Informativo ABRATES, Curitiba, v. 7, n. 1/2, p. 45, jul; /ago. 1997. Número especial, ref. 023. |
|
Idioma: |
Português |
|
Notas: |
Edição do X Congresso Brasileiro de Sementes, 1997. |
|
Conteúdo: |
RESUMO - A expressão da característica do enrugamento pode variar de maneira acentuada com a flutuação das condições climáticas de uma safra para a outra, tornando difícil a padronização de métodos, a nível de campo, para caracterizar cultivares de soja. Para se obter um bom nível de precisão, torna-se necessária a padronização das condições de estresse a que são sujeitas as plantas, principalmente durante a fase de enchimento de grãos. O objetivo desse experimento foi padronizar metodologia para a seleção de genótipos de soja tolerantes ao enrugamento, em condições controladas de temperatura, luz e umidade. Plantas das cultivares Bragg (sensível ao enrugamento), BR-36 (moderadamente sensível) e BR-16 (tolerante) foram submetidas, durante a fase de enchimento de grãos, a condições distintas, simuladas em fitotrons, com dois regimes de temperaturas (elevadas - máxima de 36ºC e amenas - máxima de 28ºC) e duas condições de disponibilidade hídrica do solo: seco (25%UG) e normal (35%UG). Comparando-se os efeitos das altas temperaturas e da baixa disponibilidade hídrica sobre a expressão do enrugamento, verificou se que altas temperaturas apresentaram um efeito mais efetivo do que a baixa disponibilidade hídrica, uma vez que plantas de Bragg e BR-36, submetidas a altas temperaturas, produziram índices expressivos de enrugamento, mesmo quando sujeitas a teores adequados de umidade do solo. BR-16 apresentou índices inexpressivos de enrugamento, mesmo quando submetida aos tratamentos mais estressantes. A caracterização dessas três cultivares no fitotron apresentou grandes vantagens, em relação às avaliações realizadas a campo, principalmente porque permite o controle das condições de estresse. No campo, além de não haver o controle desses fatores, as avaliações estão restritas apenas às épocas mais propícias para a ocorrência de veranicos , as quais devem coincidir com o período de enchimento de grãos, o que nem sempre acontece. Essa metodologia permite que as avaliações possam ser realizadas durante o ano todo, independentemente das condições climáticas externas e também planejar a avaliação de até oito genótipos num período de quatro semanas. MenosRESUMO - A expressão da característica do enrugamento pode variar de maneira acentuada com a flutuação das condições climáticas de uma safra para a outra, tornando difícil a padronização de métodos, a nível de campo, para caracterizar cultivares de soja. Para se obter um bom nível de precisão, torna-se necessária a padronização das condições de estresse a que são sujeitas as plantas, principalmente durante a fase de enchimento de grãos. O objetivo desse experimento foi padronizar metodologia para a seleção de genótipos de soja tolerantes ao enrugamento, em condições controladas de temperatura, luz e umidade. Plantas das cultivares Bragg (sensível ao enrugamento), BR-36 (moderadamente sensível) e BR-16 (tolerante) foram submetidas, durante a fase de enchimento de grãos, a condições distintas, simuladas em fitotrons, com dois regimes de temperaturas (elevadas - máxima de 36ºC e amenas - máxima de 28ºC) e duas condições de disponibilidade hídrica do solo: seco (25%UG) e normal (35%UG). Comparando-se os efeitos das altas temperaturas e da baixa disponibilidade hídrica sobre a expressão do enrugamento, verificou se que altas temperaturas apresentaram um efeito mais efetivo do que a baixa disponibilidade hídrica, uma vez que plantas de Bragg e BR-36, submetidas a altas temperaturas, produziram índices expressivos de enrugamento, mesmo quando sujeitas a teores adequados de umidade do solo. BR-16 apresentou índices inexpressivos de enrugamento, mesmo quando submetida aos tratamento... Mostrar Tudo |
|
Thesagro: |
Soja. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/124928/1/ID-224380001.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 03025nam a2200217 a 4500
001 1444579
005 2015-06-01
008 1997 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aFRANÇA-NETO, J. B.
245 $aCaracterização em fitotron de cultivares de soja quanto ao enrugamento de sementes causado por estresses térmico e hídrico.$h[electronic resource]
260 $aInformativo ABRATES, Curitiba, v. 7, n. 1/2, p. 45, jul; /ago. 1997. Número especial, ref. 023.$c1997
500 $aEdição do X Congresso Brasileiro de Sementes, 1997.
520 $aRESUMO - A expressão da característica do enrugamento pode variar de maneira acentuada com a flutuação das condições climáticas de uma safra para a outra, tornando difícil a padronização de métodos, a nível de campo, para caracterizar cultivares de soja. Para se obter um bom nível de precisão, torna-se necessária a padronização das condições de estresse a que são sujeitas as plantas, principalmente durante a fase de enchimento de grãos. O objetivo desse experimento foi padronizar metodologia para a seleção de genótipos de soja tolerantes ao enrugamento, em condições controladas de temperatura, luz e umidade. Plantas das cultivares Bragg (sensível ao enrugamento), BR-36 (moderadamente sensível) e BR-16 (tolerante) foram submetidas, durante a fase de enchimento de grãos, a condições distintas, simuladas em fitotrons, com dois regimes de temperaturas (elevadas - máxima de 36ºC e amenas - máxima de 28ºC) e duas condições de disponibilidade hídrica do solo: seco (25%UG) e normal (35%UG). Comparando-se os efeitos das altas temperaturas e da baixa disponibilidade hídrica sobre a expressão do enrugamento, verificou se que altas temperaturas apresentaram um efeito mais efetivo do que a baixa disponibilidade hídrica, uma vez que plantas de Bragg e BR-36, submetidas a altas temperaturas, produziram índices expressivos de enrugamento, mesmo quando sujeitas a teores adequados de umidade do solo. BR-16 apresentou índices inexpressivos de enrugamento, mesmo quando submetida aos tratamentos mais estressantes. A caracterização dessas três cultivares no fitotron apresentou grandes vantagens, em relação às avaliações realizadas a campo, principalmente porque permite o controle das condições de estresse. No campo, além de não haver o controle desses fatores, as avaliações estão restritas apenas às épocas mais propícias para a ocorrência de veranicos , as quais devem coincidir com o período de enchimento de grãos, o que nem sempre acontece. Essa metodologia permite que as avaliações possam ser realizadas durante o ano todo, independentemente das condições climáticas externas e também planejar a avaliação de até oito genótipos num período de quatro semanas.
650 $aSoja
700 1 $aZORATO, M. F.
700 1 $aYUYAMA, M. M.
700 1 $aCARVALHO, P. G. B.
700 1 $aNEPOMUCENO, A. L.
700 1 $aKRZYZANOWSKI, F. C.
700 1 $aCOSTA, N. P.
700 1 $aNEUMAIER, N.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
