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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Clima Temperado; Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
20/02/2014 |
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Data da última atualização: |
05/04/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
NAKAYAMA, T. J.; RODRIGUES, F. A.; NEUMAIER, N.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; FARIAS, J. R. B.; OLIVEIRA, M. C. N. de; BORÉM, A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; EMYGDIO, B. M.; NEPOMUCENO, A. L. |
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Afiliação: |
UEL; CNPSo; NORMAN NEUMAIER, CNPSO; FRANCISMAR CORREA MARCELINO GUIMARÃES, CNPSO; JOSE RENATO BOUCAS FARIAS, CNPSO; MARIA CRISTINA NEVES DE OLIVEIRA, CNPSO; UFV; ANA CLAUDIA BARNECHE DE OLIVEIRA, CPACT; BEATRIZ MARTI EMYGDIO, CPACT; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, SRI. |
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Título: |
Reference genes for quantitative real-time polymerase chain reaction studies in soybean plants under hypoxic conditions. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 1, p. 860-871, 2014. |
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DOI: |
DOI: 10.4238/2014.February.13.4 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Quantitative real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR) is a powerful tool used to measure gene expression. However, because of its high sensitivity, the method is strongly influenced by the quality and concentration of the template cDNA and by the amplification efficiency. Relative quantification is an effective strategy for correcting random and systematic errors by using the expression level of reference gene(s) to normalize the expression level of the genes of interest. To identify soybean reference genes for use in studies of flooding stress, we compared 5 candidate reference genes (CRGs) with the NormFinder and GeNorm programs to select the best internal control. The expression stability of the CRGs was evaluated in root tissues from soybean plants subjected to hypoxic conditions. Elongation factor 1-beta and actin-11 were identified as the most appropriate genes for RT-qPCR normalization by both the NormFinder and GeNorm analyses. The expression profiles of the genes for alcohol dehydrogenase 1, sucrose synthase 4, and ascorbate peroxidase 2 were analyzed by comparing different normalizing combinations (including no normalization) of the selected reference genes. Here, we have identified potential genes for use as references for RT-qPCR normalization in experiments with soybean roots growing in O2-depleted environments, such as flooding-stressed plants. |
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Palavras-Chave: |
Endogenous genes; Flooding; Housekeeping genes; Internal control genes. |
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Thesaurus Nal: |
gene expression. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/97888/1/nakayama.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/97827/1/Ana-Claudia.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/112937/1/Reference-genes-soybean-..hypoxic-conditions-Incluido.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
15/03/2000 |
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Data da última atualização: |
11/02/2015 |
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Autoria: |
GRIGOLETTI JUNIOR, A.; ZANON, A.; AUER, C. G.; FOWLER, J. A. P. |
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Afiliação: |
Grigoletti Junior, A.; Auer, C.G.; Fowler, J.A.P., pesquisadores da Embrapa Florestas; Zanon, A. ex-pesquisador da Embrapa Florestas. |
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Título: |
Efeito de fungicidas aplicados nas sementes, na emergência de plântulas de erva-mate (Ilex paraguariensis St. Hil). |
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Ano de publicação: |
1999 |
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Fonte/Imprenta: |
Boletim de Pesquisa Florestal, Colombo, n. 39, p. 31-39, jul./dez. 1999. |
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ISSN: |
1517-6371 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Este trabalho foi realizado com o objetivo de verificar os efeitos de fungos associados à sementes de erva-mate (Ilex paraguariensis St. Hil.) e do controle químico, na emergência de plântulas após a estratificação. As sementes utilizadas neste estudo foram procedentes de Cascavel, PR. Foram aplicados os seguintes fungicidas: Captan 2,25 g Thiabendazol 1,8 g e Thiram 2,1 g por kg de sementes. Após a aplicação dos fungicidas, as sementes foram colocadas para estratificação em areia. Aos 30, 60, 90, 120, 150 e 180 dias, as sementes foram coletadas e avaliadas quanto à percentagem de plântulas normais e população fúngica. A incidência de fungos e o efeito dos tratamentos foram avaliados pelo método do papel-de-filtro. A população fúngica associada às sementes aumentou até os 150 dias de estratificação, com posterior queda. Os fungos mais freqüentes encontrados foram Trichoderma (24,6%) e Fusarium (7,2%). Além destes, outros fungos como Penicillium sp., Aspergillus sp., Curvularia sp., Cladosporium sp., Colletotrichum sp., Chaetomium sp. e Graphium sp. foram detectados, porém com freqüência muito baixa. Somente o fungicida Thiram foi eficiente no controle dos fungos, porém causou a redução da percentagem de emergência de erva-mate. |
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Palavras-Chave: |
Seed. |
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Thesagro: |
Controle Químico; Fungo; Semente. |
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Thesaurus NAL: |
chemical control; fungi. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPF-2009-09/4970/1/grigoletti.pdf
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Marc: |
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520 $aEste trabalho foi realizado com o objetivo de verificar os efeitos de fungos associados à sementes de erva-mate (Ilex paraguariensis St. Hil.) e do controle químico, na emergência de plântulas após a estratificação. As sementes utilizadas neste estudo foram procedentes de Cascavel, PR. Foram aplicados os seguintes fungicidas: Captan 2,25 g Thiabendazol 1,8 g e Thiram 2,1 g por kg de sementes. Após a aplicação dos fungicidas, as sementes foram colocadas para estratificação em areia. Aos 30, 60, 90, 120, 150 e 180 dias, as sementes foram coletadas e avaliadas quanto à percentagem de plântulas normais e população fúngica. A incidência de fungos e o efeito dos tratamentos foram avaliados pelo método do papel-de-filtro. A população fúngica associada às sementes aumentou até os 150 dias de estratificação, com posterior queda. Os fungos mais freqüentes encontrados foram Trichoderma (24,6%) e Fusarium (7,2%). Além destes, outros fungos como Penicillium sp., Aspergillus sp., Curvularia sp., Cladosporium sp., Colletotrichum sp., Chaetomium sp. e Graphium sp. foram detectados, porém com freqüência muito baixa. Somente o fungicida Thiram foi eficiente no controle dos fungos, porém causou a redução da percentagem de emergência de erva-mate.
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650 $afungi
650 $aControle Químico
650 $aFungo
650 $aSemente
653 $aSeed
700 1 $aZANON, A.
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700 1 $aFOWLER, J. A. P.
773 $tBoletim de Pesquisa Florestal, Colombo$gn. 39, p. 31-39, jul./dez. 1999.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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